Le 7 octobre 1856, Hecker fut le principal orateur d'un meeting électoral ayant réuni près de 8 000 personnes, principalement d'origine allemande, au théâtre de l'Académie de musique à New York. Au nom de la liberté et du refus de l'esclavagisme, il appela à voter pour John C. Frémont et critiqua avec humour et ténacité la candidature de James Buchanan, candidat démocrate, et celle de Millard Fillmore, candidat du mouvement xénophobe (et, notamment, anti-allemand) des Know Nothing. Gustav Struve, Friedrich Kapp et Friedrich Münch(de) prirent également la parole lors de ce meeting. Cf. « Monster Mass Meeting of German Republicans - Speeches of Frederic Hecker, Gustav Struve, Frederic Munch, etc. », in The New York Times, mercredi 8 octobre 1856.
Il commanda brièvement le 24e R.I. des volontaires de l'Illinois (« Premier régiment Hecker » ou « Hecker Jäger Regiment ») entre le 8 juillet et le 23 décembre 1861, avant de démissionner en raison de désaccords avec certains officiers. Ce régiment a combattu, par la suite, à la bataille de Perryville. Hecker prit ensuite le commandement des mille hommes du 82e R.I. des volontaires de l'Illinois (« Second régiment Hecker ») du 23 octobre 1862 au 4 ou 21 mars 1864. Emil Frey et Edward S. Salomon(de) servirent dans les deux régiments Hecker et prirent part à la bataille de Gettysburg.
Il fit également l'objet d'une chanson parodique, Das Guckkasten-Lied vom großen Hecker. Son auteur, Karl Gottfried Nadler(de), trouva la mort en 1849 des suites d'une agression commise par des partisans d'Hecker.
Un extrait de cette chanson est disponible sur ce site. Les paroles peuvent être consultées sur la Heckerlied(de).
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