References analysis of the Wikipedia article "Estructura de l'ADN" in the Catalan version

doi.org

dx.doi.org

Mandelkern M, Elias J, Eden D, Crothers D «The dimensions of DNA in solution». J Mol Biol, 152, 1, 1981, pàg. 153–61. DOI: 10.1016/0022-2836(81)90099-1. PMID: 7338906.

Gregory S, et al. «The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1». Nature, 441, 7091, 2006, pàg. 315–21. DOI: 10.1038/nature04727. PMID: 16710414.

Watson J, Crick F «Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid» (PDF). Nature, 171, 4356, 1953, pàg. 737–8. DOI: 10.1038/171737a0. PMID: 13054692.

Ghosh A, Bansal M «A glossary of DNA structures from A to Z». Acta Crystallogr D Biol Crystallogr, 59, Pt 4, 2003, pàg. 620–6. DOI: 10.1107/S0907444903003251. PMID: 12657780.

Wing R.; Drew H.; Takano T.; Broka C.; Tanaka S.; Itakura K.; Dickerson R. «Crystal structure analysis of a complete turn of B-DNA». Nature, 287, 5784, 1980, pàg. 755–8. DOI: 10.1038/287755a0. PMID: 7432492.

Pabo C.; Sauer R. «Protein-DNA recognition». Annu Rev Biochem, 53, 1984, pàg. 293–321. DOI: 10.1146/annurev.bi.53.070184.001453. PMID: 6236744.

Clausen-Schaumann H.; Rief M.; Tolksdorf C.; Gaub H. «Mechanical stability of single DNA molecules». Biophys J, 78, 4, 2000, pàg. 1997–2007. DOI: 10.1016/S0006-3495(00)76747-6. PMID: 10733978.

Chalikian T.; Völker J.; Plum G.; Breslauer K. «A more unified picture for the thermodynamics of nucleic acid duplex melting: a characterization by calorimetric and volumetric techniques». Proc Natl Acad Sci USA, 96, 14, 1999, pàg. 7853–8. DOI: 10.1073/pnas.96.14.7853. PMID: 10393911.

de Haseth P.; Helmann J. «Open complex formation by Escherichia coli RNA polymerase: the mechanism of polymerase-induced strand separation of double helical DNA». Mol Microbiol, 16, 5, 1995, pàg. 817–24. DOI: 10.1111/j.1365-2958.1995.tb02309.x. PMID: 7476180.

Isaksson J.; Acharya S.; Barman J.; Cheruku P.; Chattopadhyaya J. «Single-stranded adenine-rich DNA and RNA retain structural characteristics of their respective double-stranded conformations and show directional differences in stacking pattern». Biochemistry, 43, 51, 2004, pàg. 15996–6010. DOI: 10.1021/bi048221v. PMID: 15609994.

Hüttenhofer A.; Schattner P.; Polacek N. «Non-coding RNAs: hope or hype?». Trends Genet, 21, 5, 2005, pàg. 289–97. DOI: 10.1016/j.tig.2005.03.007. PMID: 15851066.

Munroe S. «Diversity of antisense regulation in eukaryotes: multiple mechanisms, emerging patterns». J Cell Biochem, 93, 4, 2004, pàg. 664–71. DOI: 10.1002/jcb.20252. PMID: 15389973.

Makalowska I.; Lin C.; Makalowski W. «Overlapping genes in vertebrate genomes». Comput Biol Chem, 29, 1, 2005, pàg. 1–12. DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2004.12.006. PMID: 15680581.

Johnson Z.; Chisholm S. «Properties of overlapping genes are conserved across microbial genomes». Genome Res, 14, 11, 2004, pàg. 2268–72. DOI: 10.1101/gr.2433104. PMID: 15520290.

Benham C.; Mielke S. «DNA mechanics». Annu Rev Biomed Eng, 7, 2005, pàg. 21–53. DOI: 10.1146/annurev.bioeng.6.062403.132016. PMID: 16004565.

Champoux J. «DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism». Annu Rev Biochem, 70, 2001, pàg. 369–413. DOI: 10.1146/annurev.biochem.70.1.369. PMID: 11395412.

Wang J. «Cellular roles of DNA topoisomerases: a molecular perspective». Nat Rev Mol Cell Biol, 3, 6, 2002, pàg. 430–40. DOI: 10.1038/nrm831. PMID: 12042765.

Leslie A. G.; Arnott S.; Chandrasekaran R, Ratliff RL «Polymorphism of DNA double helices». J. Mol. Biol., 143, 1, 1980, pàg. 49–72. DOI: 10.1016/0022-2836(80)90124-2. PMID: 7441761.

Wahl M.; Sundaralingam M. «Crystal structures of A-DNA duplexes». Biopolymers, 44, 1, 1997, pàg. 45–63. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0282(1997)44:1. PMID: 9097733.

Lu X. J.; Shakked Z.; Olson W. K. «A-form conformational motifs in ligand-bound DNA structures». J. Mol. Biol., 300, 4, 2000, pàg. 819–40. DOI: 10.1006/jmbi.2000.3690. PMID: 10891271.

Rothenburg S.; Koch-Nolte F.; Haag F. «DNA methylation and Z-DNA formation as mediators of quantitative differences in the expression of alleles». Immunol Rev, 184, 2001, pàg. 286–98. DOI: 10.1034/j.1600-065x.2001.1840125.x. PMID: 12086319.

Oh D.; Kim Y.; Rich A. «Z-DNA-binding proteins can act as potent effectors of gene expression in vivo». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2002, pàg. 16666–71. DOI: 10.1073/pnas.262672699. PMID: 12486233.

Greider C.; Blackburn E. «Identification of a specific telomere terminal transferase activity in Tetrahymena extracts». Cell, 43, 2 Pt 1, 1985, pàg. 405–13. DOI: 10.1016/0092-8674(85)90170-9. PMID: 3907856.

Nugent C.; Lundblad V. «The telomerase reverse transcriptase: components and regulation». Genes Dev, 12, 8, 1998, pàg. 1073–85. DOI: 10.1101/gad.12.8.1073. PMID: 9553037.

Wright W-, Tesmer V.; Huffman K.; Levene S.; Shay J. «Normal human chromosomes have long G-rich telomeric overhangs at one end». Genes Dev, 11, 21, 1997, pàg. 2801–9. DOI: 10.1101/gad.11.21.2801. PMID: 9353250.

Burge S.; Parkinson G.; Hazel P.; Todd A.; Neidle S. «Quadruplex DNA: sequence, topology and structure». Nucleic Acids Res, 34, 19, 2006, pàg. 5402–15. DOI: 10.1093/nar/gkl655. PMC: 1636468. PMID: 17012276.

Parkinson G.; Lee M.; Neidle S. «Crystal structure of parallel quadruplexes from human telomeric DNA». Nature, 417, 6891, 2002, pàg. 876–80. DOI: 10.1038/nature755. PMID: 12050675.

Griffith J.; Comeau L.; Rosenfield S.; Stansel R.; Bianchi A.; Moss H.; de Lange T. «Mammalian telomeres end in a large duplex loop». Cell, 97, 4, 1999, pàg. 503–14. DOI: 10.1016/S0092-8674(00)80760-6. PMID: 10338214.

Seeman N. C. «DNA enables nanoscale control of the structure of matter». Q. Rev. Biophys., 38, 4, Novembre 2005, pàg. 363–71. DOI: 10.1017/S0033583505004087. PMID: 16515737.

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

Alberts, Bruce; Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, i Peter Walters. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. Nova York i Londres: Garland Science, 2002. ISBN 0-8153-3218-1. OCLC 145080076 48122761 57023651 69932405.

Mandelkern M, Elias J, Eden D, Crothers D «The dimensions of DNA in solution». J Mol Biol, 152, 1, 1981, pàg. 153–61. DOI: 10.1016/0022-2836(81)90099-1. PMID: 7338906.

Gregory S, et al. «The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1». Nature, 441, 7091, 2006, pàg. 315–21. DOI: 10.1038/nature04727. PMID: 16710414.

Watson J, Crick F «Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid» (PDF). Nature, 171, 4356, 1953, pàg. 737–8. DOI: 10.1038/171737a0. PMID: 13054692.

Ghosh A, Bansal M «A glossary of DNA structures from A to Z». Acta Crystallogr D Biol Crystallogr, 59, Pt 4, 2003, pàg. 620–6. DOI: 10.1107/S0907444903003251. PMID: 12657780.

Pabo C.; Sauer R. «Protein-DNA recognition». Annu Rev Biochem, 53, 1984, pàg. 293–321. DOI: 10.1146/annurev.bi.53.070184.001453. PMID: 6236744.

Clausen-Schaumann H.; Rief M.; Tolksdorf C.; Gaub H. «Mechanical stability of single DNA molecules». Biophys J, 78, 4, 2000, pàg. 1997–2007. DOI: 10.1016/S0006-3495(00)76747-6. PMID: 10733978.

Peter Yakovchuk, Ekaterina Protozanova i Maxim D. Frank-Kamenetskii. Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix. Nucleic Acids Research 2006 34(2):564-574; doi:10.1093/nar/gkj454 PMID: 16449200

Hüttenhofer A.; Schattner P.; Polacek N. «Non-coding RNAs: hope or hype?». Trends Genet, 21, 5, 2005, pàg. 289–97. DOI: 10.1016/j.tig.2005.03.007. PMID: 15851066.

Munroe S. «Diversity of antisense regulation in eukaryotes: multiple mechanisms, emerging patterns». J Cell Biochem, 93, 4, 2004, pàg. 664–71. DOI: 10.1002/jcb.20252. PMID: 15389973.

Makalowska I.; Lin C.; Makalowski W. «Overlapping genes in vertebrate genomes». Comput Biol Chem, 29, 1, 2005, pàg. 1–12. DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2004.12.006. PMID: 15680581.

Johnson Z.; Chisholm S. «Properties of overlapping genes are conserved across microbial genomes». Genome Res, 14, 11, 2004, pàg. 2268–72. DOI: 10.1101/gr.2433104. PMID: 15520290.

Lamb R.; Horvath C. «Diversity of coding strategies in influenza viruses». Trends Genet, 7, 8, 1991, pàg. 261–6. PMID: 1771674.

Benham C.; Mielke S. «DNA mechanics». Annu Rev Biomed Eng, 7, 2005, pàg. 21–53. DOI: 10.1146/annurev.bioeng.6.062403.132016. PMID: 16004565.

Champoux J. «DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism». Annu Rev Biochem, 70, 2001, pàg. 369–413. DOI: 10.1146/annurev.biochem.70.1.369. PMID: 11395412.

Wang J. «Cellular roles of DNA topoisomerases: a molecular perspective». Nat Rev Mol Cell Biol, 3, 6, 2002, pàg. 430–40. DOI: 10.1038/nrm831. PMID: 12042765.

Basu H.; Feuerstein B.; Zarling D.; Shafer R.; Marton L. «Recognition of Z-RNA and Z-DNA determinants by polyamines in solution: experimental and theoretical studies». J Biomol Struct Dyn, 6, 2, 1988, pàg. 299–309. PMID: 2482766.

Leslie A. G.; Arnott S.; Chandrasekaran R, Ratliff RL «Polymorphism of DNA double helices». J. Mol. Biol., 143, 1, 1980, pàg. 49–72. DOI: 10.1016/0022-2836(80)90124-2. PMID: 7441761.

Wahl M.; Sundaralingam M. «Crystal structures of A-DNA duplexes». Biopolymers, 44, 1, 1997, pàg. 45–63. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0282(1997)44:1. PMID: 9097733.

Lu X. J.; Shakked Z.; Olson W. K. «A-form conformational motifs in ligand-bound DNA structures». J. Mol. Biol., 300, 4, 2000, pàg. 819–40. DOI: 10.1006/jmbi.2000.3690. PMID: 10891271.

Nugent C.; Lundblad V. «The telomerase reverse transcriptase: components and regulation». Genes Dev, 12, 8, 1998, pàg. 1073–85. DOI: 10.1101/gad.12.8.1073. PMID: 9553037.

Parkinson G.; Lee M.; Neidle S. «Crystal structure of parallel quadruplexes from human telomeric DNA». Nature, 417, 6891, 2002, pàg. 876–80. DOI: 10.1038/nature755. PMID: 12050675.

Seeman N. C. «DNA enables nanoscale control of the structure of matter». Q. Rev. Biophys., 38, 4, Novembre 2005, pàg. 363–71. DOI: 10.1017/S0033583505004087. PMID: 16515737.

pubmedcentral.nih.gov

profiles.nlm.nih.gov

worldcat.org

Estructura de l'ADN (Catalan Wikipedia)

doi.org

dx.doi.org

genesdev.org

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

pubmedcentral.nih.gov

profiles.nlm.nih.gov

oxfordjournals.org

nar.oxfordjournals.org

qmul.ac.uk

chem.qmul.ac.uk

rcsb.org

rutgers.edu

ndbserver.rutgers.edu

web.archive.org

worldcat.org