References analysis of the Wikipedia article "Metabolisme" in the Catalan version

doi.org

dx.doi.org

Friedrich C. «Physiology and genetics of sulfur-oxidizing bacteria». Adv Microb Physiol, 39, 1998, pàg. 235–89. DOI: 10.1016/S0065-2911(08)60018-1. PMID: 9328649.

Smith E., Morowitz H. «Universality in intermediary metabolism». Proc Natl Acad Sci USA, 101, 36, 2004, pàg. 13168–73. DOI: 10.1073/pnas.0404922101. PMID: 15340153.

Ebenhöh O., Heinrich R. «Evolutionary optimization of metabolic pathways. Theoretical reconstruction of the stoichiometry of ATP and NADH producing systems». Bull Math Biol, 63, 1, 2001, pàg. 21–55. DOI: 10.1006/bulm.2000.0197. PMID: 11146883.

Meléndez-Hevia E., Waddell T., Cascante M. «The puzzle of the Krebs citric acid cycle: assembling the pieces of chemically feasible reactions, and opportunism in the design of metabolic pathways during evolution». J Mol Evol, 43, 3, 1996, pàg. 293–303. DOI: 10.1007/BF02338838. PMID: 8703096.

Michie K., Löwe J. «Dynamic filaments of the bacterial cytoskeleton». Annu Rev Biochem, 75, 2006, pàg. 467–92. DOI: 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142452. PMID: 16756499.

Fahy E, Subramaniam S., Brown H., Glass C., Merrill A., Murphy R., Raetz C., Russell D., Seyama Y., Shaw W., Shimizu T., Spener F., van Meer G., VanNieuwenhze M., White S., Witztum J., Dennis E. «A comprehensive classification system for lipids». J Lipid Res, 46, 5, 2005, pàg. 839–61. Arxivat de l'original el 2010-08-24. DOI: 10.1194/jlr.E400004-JLR200. PMID: 15722563 [Consulta: 26 octubre 2008]. Arxivat 2010-08-24 a Wayback Machine.

Hegardt F. «Mitochondrial 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase: a control enzyme in ketogenesis». Biochem J, 338 (Pt 3), 1999, pàg. 569–82. DOI: 10.1042/0264-6021:3380569. PMID: 10051425.

Raman R., Raguram S., Venkataraman G., Paulson J., Sasisekharan R. «Glycomics: an integrated systems approach to structure-function relationships of glycans». Nat Methods, 2, 11, 2005, pàg. 817–24. DOI: 10.1038/nmeth807. PMID: 16278650.

Sierra S., Kupfer B., Kaiser R. «Basics of the virology of HIV-1 and its replication». J Clin Virol, 34, 4, 2005, pàg. 233–44. DOI: 10.1016/j.jcv.2005.09.004. PMID: 16198625.

Wimmer M., Rose «Mechanisms of enzyme-catalyzed group transfer reactions». Annu Rev Biochem, 47, 1978, pàg. 1031–78. DOI: 10.1146/annurev.bi.47.070178.005123. PMID: 354490.

Mitchell P. «The Ninth Sir Hans Krebs Lecture. Compartmentation and communication in living systems. Ligand conduction: a general catalytic principle in chemical, osmotic and chemiosmotic reaction systems». Eur J Biochem, 95, 1, 1979, pàg. 1–20. DOI: 10.1111/j.1432-1033.1979.tb12934.x. PMID: 378655.

Dimroth P., von Ballmoos C., Meier T. «Catalytic and mechanical cycles in F-ATP synthases. Fourth in the Cycles Review Series». EMBO Rep, 7, 3, 2006, pàg. 276–82. DOI: 10.1038/sj.embor.7400646. PMID: 16607397.

Pollak N., Dölle C., Ziegler M. «The power to reduce: pyridine nucleotides—small molecules with a multitude of functions». Biochem J, 402, 2, 2007, pàg. 205–18. DOI: 10.1042/BJ20061638. PMID: 17295611.

Levitan «Modulation of ion channels in neurons and other cells». Annu Rev Neurosci, 11, 1988, pàg. 119–36. DOI: 10.1146/annurev.ne.11.030188.001003. PMID: 2452594.

Dulhunty A. «Excitation-contraction coupling from the 1950s into the new millennium». Clin Exp Pharmacol Physiol, 33, 9, 2006, pàg. 763–72. DOI: 10.1111/j.1440-1681.2006.04441.x. PMID: 16922804.

Husted S., Mikkelsen B., Jensen J., Nielsen N. «Elemental fingerprint analysis of barley (Hordeum vulgare) using inductively coupled plasma mass spectrometry, isotope-ratio mass spectrometry, and multivariate statistics». Anal Bioanal Chem, 378, 1, 2004, pàg. 171–82. DOI: 10.1007/s00216-003-2219-0. PMID: 14551660.

Finney L., O'Halloran T. «Transition metal speciation in the cell: insights from the chemistry of metal ion receptors». Science, 300, 5621, 2003, pàg. 931–6. DOI: 10.1126/science.1085049. PMID: 12738850.

Cousins R., Liuzzi J., Lichten L. «Mammalian zinc transport, trafficking, and signals». J Biol Chem, 281, 34, 2006, pàg. 24085–9. Arxivat de l'original el 2008-11-05. DOI: 10.1074/jbc.R600011200. PMID: 16793761 [Consulta: 1r novembre 2008]. Arxivat 2008-11-05 a Wayback Machine.

Dunn L., Rahmanto Y., Richardson D. «Iron uptake and metabolism in the new millennium». Trends Cell Biol, 17, 2, 2007, pàg. 93–100. DOI: 10.1016/j.tcb.2006.12.003. PMID: 17194590.

Nealson K., Conrad P. «Life: past, present and future». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 354, 1392, 1999, pàg. 1923–39. DOI: 10.1098/rstb.1999.0532. PMID: 10670014.

Nelson N., Ben-Shem A. «The complex architecture of oxygenic photosynthesis». Nat Rev Mol Cell Biol, 5, 12, 2004, pàg. 971–82. DOI: 10.1038/nrm1525. PMID: 15573135.

Gupta R., Gupta N., Rathi P. «Bacterial lipases: an overview of production, purification and biochemical properties». Appl Microbiol Biotechnol, 64, 6, 2004, pàg. 763–81. DOI: 10.1007/s00253-004-1568-8. PMID: 14966663.

Souba W., Pacitti A. «How amino acids get into cells: mechanisms, models, menus, and mediators». JPEN J Parenter Enteral Nutr, 16, 6, 1992, pàg. 569–78. DOI: 10.1177/0148607192016006569. PMID: 1494216.

Barrett M., Walmsley A., Gould G. «Structure and function of facilitative sugar transporters». Curr Opin Cell Biol, 11, 4, 1999, pàg. 496–502. DOI: 10.1016/S0955-0674(99)80072-6. PMID: 10449337.

Bouché C., Serdy S., Kahn C., Goldfine A. «The cellular fate of glucose and its relevance in type 2 diabetes». Endocr Rev, 25, 5, 2004, pàg. 807–30. Arxivat de l'original el 2012-12-04. DOI: 10.1210/er.2003-0026. PMID: 15466941 [Consulta: 1r novembre 2008].

Sakami W., Harrington H. «Amino acid metabolism». Annu Rev Biochem, 32, 1963, pàg. 355–98. DOI: 10.1146/annurev.bi.32.070163.002035. PMID: 14144484.

Hosler J., Ferguson-Miller S., Mills D. «Energy transduction: proton transfer through the respiratory complexes». Annu Rev Biochem, 75, 2006, pàg. 165–87. DOI: 10.1146/annurev.biochem.75.062003.101730. PMID: 16756489.

Schultz B., Chan S. «Structures and proton-pumping strategies of mitochondrial respiratory enzymes». Annu Rev Biophys Biomol Struct, 30, 2001, pàg. 23–65. DOI: 10.1146/annurev.biophys.30.1.23. PMID: 11340051.

Capaldi R., Aggeler R. «Mechanism of the F(1)F(0)-type ATP synthase, a biological rotary motor». Trends Biochem Sci, 27, 3, 2002, pàg. 154–60. DOI: 10.1016/S0968-0004(01)02051-5. PMID: 11893513.

Friedrich B., Schwartz E. «Molecular biology of hydrogen utilization in aerobic chemolithotrophs». Annu Rev Microbiol, 47, 1993, pàg. 351–83. DOI: 10.1146/annurev.mi.47.100193.002031. PMID: 8257102.

Weber K., Achenbach L., Coates J. «Microorganisms pumping iron: anaerobic microbial iron oxidation and reduction». Nat Rev Microbiol, 4, 10, 2006, pàg. 752–64. DOI: 10.1038/nrmicro1490. PMID: 16980937.

Jetten M., Strous M., van de Pas-Schoonen K., Schalk J., van Dongen U., van de Graaf A., Logemann S., Muyzer G., van Loosdrecht M., Kuenen J. «The anaerobic oxidation of ammonium». FEMS Microbiol Rev, 22, 5, 1998, pàg. 421–37. DOI: 10.1111/j.1574-6976.1998.tb00379.x. PMID: 9990725.

Simon J. «Enzymology and bioenergetics of respiratory nitrite ammonification». FEMS Microbiol Rev, 26, 3, 2002, pàg. 285–309. DOI: 10.1111/j.1574-6976.2002.tb00616.x. PMID: 12165429.

Barea J., Pozo M., Azcón R., Azcón-Aguilar C. «Microbial co-operation in the rhizosphere». J Exp Bot, 56, 417, 2005, pàg. 1761–78. DOI: 10.1093/jxb/eri197. PMID: 15911555.

van der Meer M., Schouten S., Bateson M., Nübel U., Wieland A., Kühl M., de Leeuw J., Sinninghe Damsté J., Ward D. «Diel variations in carbon metabolism by green nonsulfur-like bacteria in alkaline siliceous hot spring microbial mats from Yellowstone National Park». Appl Environ Microbiol, 71, 7, 2005, pàg. 3978–86. DOI: 10.1128/AEM.71.7.3978-3986.2005. PMID: 16000812.

Tichi M., Tabita F. «Interactive control of Rhodobacter capsulatus redox-balancing systems during phototrophic metabolism». J Bacteriol, 183, 21, 2001, pàg. 6344–54. DOI: 10.1128/JB.183.21.6344-6354.2001. PMID: 11591679.

Allen J., Williams J. «Photosynthetic reaction centers». FEBS Lett, 438, 1–2, 1998, pàg. 5–9. DOI: 10.1016/S0014-5793(98)01245-9. PMID: 9821949.

Nelson N., Ben-Shem A. «The complex architecture of oxygenic photosynthesis». Nat Rev Mol Cell Biol, 5, 12, 2004, pàg. 971–82. DOI: 10.1038/nrm1525. PMID: 15573135.

Munekage Y., Hashimoto M., Miyake C., Tomizawa K., Endo T., Tasaka M., Shikanai T. «Cyclic electron flow around photosystem i is essential for photosynthesis». Nature, 429, 6991, 2004, pàg. 579–82. DOI: 10.1038/nature02598. PMID: 15175756.

Miziorko H., Lorimer G. «Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase». Annu Rev Biochem, 52, 1983, pàg. 507–35. DOI: 10.1146/annurev.bi.52.070183.002451. PMID: 6351728.

Dodd A., Borland A., Haslam R., Griffiths H., Maxwell K. «Crassulacean acid metabolism: plastic, fantastic». J Exp Bot, 53, 369, 2002, pàg. 569–80. DOI: 10.1093/jexbot/53.369.569. PMID: 11886877.

Hügler M., Wirsen C., Fuchs G., Taylor C., Sievert S. «Evidence for autotrophic CO₂ fixation via the reductive tricarboxylic acid cycle by members of the epsilon subdivision of proteobacteria». J Bacteriol, 187, 9, 2005, pàg. 3020–7. DOI: 10.1128/JB.187.9.3020-3027.2005. PMID: 15838028.

Strauss G., Fuchs G. «Enzymes of a novel autotrophic CO2 fixation pathway in the phototrophic bacterium Chloroflexus aurantiacus, the 3-hydroxypropionate cycle». Eur J Biochem, 215, 3, 1993, pàg. 633–43. DOI: 10.1111/j.1432-1033.1993.tb18074.x. PMID: 8354269.

Shively J., van Keulen G., Meijer W. «Something from almost nothing: carbon dioxide fixation in chemoautotrophs». Annu Rev Microbiol, 52, 1998, pàg. 191–230. DOI: 10.1146/annurev.micro.52.1.191. PMID: 9891798.

Boiteux A., Hess B. «Design of glycolysis». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 293, 1063, 1981, pàg. 5–22. DOI: 10.1098/rstb.1981.0056. PMID: 6115423.

Pilkis S, el-Maghrabi M, Claus T «Fructose-2,6-bisphosphate in control of hepatic gluconeogenesis. From metabolites to molecular genetics». Diabetes Care, 13, 6, 1990, pàg. 582–99. DOI: 10.2337/diacare.13.6.582. PMID: 2162755.

Ensign S. «Revisiting the glyoxylate cycle: alternate pathways for microbial acetate assimilation». Mol Microbiol, 61, 2, 2006, pàg. 274–6. DOI: 10.1111/j.1365-2958.2006.05247.x. PMID: 16856935.

Finn P., Dice J. «Proteolytic and lipolytic responses to starvation». Nutrition, 22, 7–8, 2006, pàg. 830–44. DOI: 10.1016/j.nut.2006.04.008. PMID: 16815497.

Kornberg H., Krebs H. «Synthesis of cell constituents from C2-units by a modified tricarboxylic acid cycle». Nature, 179, 4568, 1957, pàg. 988–91. DOI: 10.1038/179988a0. PMID: 13430766.

Rademacher T., Parekh R., Dwek R. «Glycobiology». Annu Rev Biochem, 57, 1988, pàg. 785–838. DOI: 10.1146/annurev.bi.57.070188.004033. PMID: 3052290.

McConville M, Menon A «Recent developments in the cell biology and biochemistry of glycosylphosphatidylinositol lipids (review)». Mol Membr Biol, 17, 1, 2000, pàg. 1–16. DOI: 10.1080/096876800294443. PMID: 10824734.

Chirala S., Wakil S. «Structure and function of animal fatty acid synthase». Lipids, 39, 11, 2004, pàg. 1045–53. DOI: 10.1007/s11745-004-1329-9. PMID: 15726818.

White S., Zheng J., Zhang Y. «The structural biology of type II fatty acid biosynthesis». Annu Rev Biochem, 74, 2005, pàg. 791–831. DOI: 10.1146/annurev.biochem.74.082803.133524. PMID: 15952903.

Ohlrogge J., Jaworski J. «Regulation of fatty acid synthesis». Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol, 48, 1997, pàg. 109–136. DOI: 10.1146/annurev.arplant.48.1.109. PMID: 15012259.

Dubey V., Bhalla R., Luthra R. «An overview of the non-mevalonate pathway for terpenoid biosynthesis in plants». J Biosci, 28, 5, 2003, pàg. 637–46. DOI: 10.1007/BF02703339. PMID: 14517367.

Kuzuyama T., Seto H. «Diversity of the biosynthesis of the isoprene units». Nat Prod Rep, 20, 2, 2003, pàg. 171–83. DOI: 10.1039/b109860h. PMID: 12735695.

Grochowski L., Xu H., White R. «Methanocaldococcus jannaschii uses a modified mevalonate pathway for biosynthesis of isopentenyl diphosphate». J Bacteriol, 188, 9, 2006, pàg. 3192–8. DOI: 10.1128/JB.188.9.3192-3198.2006. PMID: 16621811.

Lichtenthaler H. «The 1-Ddeoxy-D-xylulose-5-phosphate pathway of isoprenoid biosynthesis in plants». Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol, 50, 1999, pàg. 47–65. DOI: 10.1146/annurev.arplant.50.1.47. PMID: 15012203.

Schroepfer G. «Sterol biosynthesis». Annu Rev Biochem, 50, 1981, pàg. 585–621. DOI: 10.1146/annurev.bi.50.070181.003101. PMID: 7023367.

Lees N., Skaggs B., Kirsch D., Bard M. «Cloning of the late genes in the ergosterol biosynthetic pathway of Saccharomyces cerevisiae—a review». Lipids, 30, 3, 1995, pàg. 221–6. DOI: 10.1007/BF02537824. PMID: 7791529.

Rudolph F. «The biochemistry and physiology of nucleotides». J Nutr, 124, 1 Suppl, 1994, pàg. 124S–127S. PMID: 8283301. Zrenner R., Stitt M., Sonnewald U., Boldt R. «Pyrimidine and purine biosynthesis and degradation in plants». Annu Rev Plant Biol, 57, 2006, pàg. 805–36. DOI: 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105421. PMID: 16669783.

Stasolla C., Katahira R., Thorpe T., Ashihara H. «Purine and pyrimidine nucleotide metabolism in higher plants». J Plant Physiol, 160, 11, 2003, pàg. 1271–95. DOI: 10.1078/0176-1617-01169. PMID: 14658380.

Smith J. «Enzymes of nucleotide synthesis». Curr Opin Struct Biol, 5, 6, 1995, pàg. 752–7. DOI: 10.1016/0959-440X(95)80007-7. PMID: 8749362.

Testa B., Krämer S. «The biochemistry of drug metabolism—an introduction: part 1. Principles and overview». Chem Biodivers, 3, 10, 2006, pàg. 1053–101. DOI: 10.1002/cbdv.200690111. PMID: 17193224.

Danielson P. «The cytochrome P450 superfamily: biochemistry, evolution and drug metabolism in humans». Curr Drug Metab, 3, 6, 2002, pàg. 561–97. DOI: 10.2174/1389200023337054. PMID: 12369887.

King C., Rios G., Green M., Tephly T. «UDP-glucuronosyltransferases». Curr Drug Metab, 1, 2, 2000, pàg. 143–61. DOI: 10.2174/1389200003339171. PMID: 11465080.

Sheehan D., Meade G., Foley V., Dowd C. «Structure, function and evolution of glutathione transferases: implications for classification of non-mammalian members of an ancient enzyme superfamily». Biochem J, 360, Pt 1, 2001, pàg. 1–16. DOI: 10.1042/0264-6021:3600001. PMID: 11695986.

Galvão T., Mohn W., de Lorenzo V. «Exploring the microbial biodegradation and biotransformation gene pool». Trends Biotechnol, 23, 10, 2005, pàg. 497–506. DOI: 10.1016/j.tibtech.2005.08.002. PMID: 16125262.

Janssen D., Dinkla I., Poelarends G., Terpstra P. «Bacterial degradation of xenobiotic compounds: evolution and distribution of novel enzyme activities». Environ Microbiol, 7, 12, 2005, pàg. 1868–82. DOI: 10.1111/j.1462-2920.2005.00966.x. PMID: 16309386.

Tu B., Weissman J. «Oxidative protein folding in eukaryotes: mechanisms and consequences». J Cell Biol, 164, 3, 2004, pàg. 341–6. DOI: 10.1083/jcb.200311055. PMID: 14757749.

Vertuani S., Angusti A., Manfredini S. «The antioxidants and pro-antioxidants network: an overview». Curr Pharm Des, 10, 14, 2004, pàg. 1677–94. DOI: 10.2174/1381612043384655. PMID: 15134565.

von Stockar U., Liu J. «Does microbial life always feed on negative entropy? Thermodynamic analysis of microbial growth». Biochim Biophys Acta, 1412, 3, 1999, pàg. 191–211. DOI: 10.1016/S0005-2728(99)00065-1. PMID: 10482783.

Demirel Y., Sandler S. «Thermodynamics and bioenergetics». Biophys Chem, 97, 2–3, 2002, pàg. 87–111. DOI: 10.1016/S0301-4622(02)00069-8. PMID: 12050002.

Albert R. «Scale-free networks in cell biology». J Cell Sci, 118, Pt 21, 2005, pàg. 4947–57. DOI: 10.1242/jcs.02714. PMID: 16254242.

Westerhoff H., Groen A., Wanders R. «Modern theories of metabolic control and their applications (review)». Biosci Rep, 4, 1, 1984, pàg. 1–22. DOI: 10.1007/BF01120819. PMID: 6365197.

Hendrickson W «Transduction of biochemical signals across cell membranes». Q Rev Biophys, 38, 4, 2005, pàg. 321–30. DOI: 10.1017/S0033583506004136. PMID: 16600054.

Cohen P. «The regulation of protein function by multisite phosphorylation—a 25 year update». Trends Biochem Sci, 25, 12, 2000, pàg. 596–601. DOI: 10.1016/S0968-0004(00)01712-6. PMID: 11116185.

Roach P. «Glycogen and its metabolism». Curr Mol Med, 2, 2, 2002, pàg. 101–20. DOI: 10.2174/1566524024605761. PMID: 11949930.

Newgard C., Brady M., O'Doherty R., Saltiel A. «Organizing glucose disposal: emerging roles of the glycogen targeting subunits of protein phosphatase-1». Diabetes, 49, 12, 2000, pàg. 1967–77. DOI: 10.2337/diabetes.49.12.1967. PMID: 11117996.

Romano A., Conway T. «Evolution of carbohydrate metabolic pathways». Res Microbiol, 147, 6–7, 1996, pàg. 448–55. DOI: 10.1016/0923-2508(96)83998-2. PMID: 9084754.

Koch A. «How did bacteria come to be?». Adv Microb Physiol, 40, 1998, pàg. 353–99. DOI: 10.1016/S0065-2911(08)60135-6. PMID: 9889982.

Ouzounis C., Kyrpides N. «The emergence of major cellular processes in evolution». FEBS Lett, 390, 2, 1996, pàg. 119–23. DOI: 10.1016/0014-5793(96)00631-X. PMID: 8706840.

Caetano-Anolles G., Kim H. S., Mittenthal J. E. «The origin of modern metabolic networks inferred from phylogenomic analysis of protein architecture». Proc Natl Acad Sci USA, 104, 22, 2007, pàg. 9358–63. DOI: 10.1073/pnas.0701214104. PMID: 17517598.

Schmidt S., Sunyaev S., Bork P., Dandekar T. «Metabolites: a helping hand for pathway evolution?». Trends Biochem Sci, 28, 6, 2003, pàg. 336–41. DOI: 10.1016/S0968-0004(03)00114-2. PMID: 12826406.

Light S., Kraulis P. «Network analysis of metabolic enzyme evolution in Escherichia coli». BMC Bioinformatics, 5, 2004, pàg. 15. DOI: 10.1186/1471-2105-5-15. PMID: 15113413. Alves R., Chaleil R., Sternberg M. «Evolution of enzymes in metabolism: a network perspective». J Mol Biol, 320, 4, 2002, pàg. 751–70. DOI: 10.1016/S0022-2836(02)00546-6. PMID: 12095253.

Kim H. S., Mittenthal J. E., Caetano-Anolles G. «MANET: tracing evolution of protein architecture in metabolic networks». BMC Bioinformatics, 19, 7, 2006, pàg. 351. DOI: 10.1186/1471-2105-7-351. PMID: 16854231.

Teichmann S. A., Rison S. C., Thornton J. M., Riley M., Gough J., Chothia C «Small-molecule metabolism: an enzyme mosaic». Trends Biotechnol, 19, 12, 2001, pàg. 482–6. DOI: 10.1016/S0167-7799(01)01813-3. PMID: 11711174.

Spirin V., Gelfand M., Mironov A., Mirny L. «A metabolic network in the evolutionary context: multiscale structure and modularity». Proc Natl Acad Sci USA, 103, 23, 2006, pàg. 8774–9. DOI: 10.1073/pnas.0510258103. PMID: 16731630.

Lawrence J. «Common themes in the genome strategies of pathogens». Curr Opin Genet Dev, 15, 6, 2005, pàg. 584–8. DOI: 10.1016/j.gde.2005.09.007. PMID: 16188434. Wernegreen J «For better or worse: genomic consequences of intracellular mutualism and parasitism». Curr Opin Genet Dev, 15, 6, 2005, pàg. 572–83. DOI: 10.1016/j.gde.2005.09.013. PMID: 16230003.

Pál C., Papp B., Lercher M., Csermely P., Oliver S., Hurst L. «Chance and necessity in the evolution of minimal metabolic networks». Nature, 440, 7084, 2006, pàg. 667–70. DOI: 10.1038/nature04568. PMID: 16572170.

Rennie M. «An introduction to the use of tracers in nutrition and metabolism». Proc Nutr Soc, 58, 4, 1999, pàg. 935–44. DOI: 10.1017/S002966519900124X. PMID: 10817161.

Phair R. «Development of kinetic models in the nonlinear world of molecular cell biology». Metabolism, 46, 12, 1997, pàg. 1489–95. DOI: 10.1016/S0026-0495(97)90154-2. PMID: 9439549.

Sterck L., Rombauts S., Vandepoele K., Rouzé P., Van de Peer Y. «How many genes are there in plants (... and why are they there)?». Curr Opin Plant Biol, 10, 2, 2007, pàg. 199–203. DOI: 10.1016/j.pbi.2007.01.004. PMID: 17289424.

Borodina I., Nielsen J. «From genomes to in silico cells via metabolic networks». Curr Opin Biotechnol, 16, 3, 2005, pàg. 350–5. DOI: 10.1016/j.copbio.2005.04.008. PMID: 15961036.

Gianchandani E., Brautigan D., Papin J. «Systems analyses characterize integrated functions of biochemical networks». Trends Biochem Sci, 31, 5, 2006, pàg. 284–91. DOI: 10.1016/j.tibs.2006.03.007. PMID: 16616498.

Duarte N. C., Becker S. A., Jamshidi N. i cols «Global reconstruction of the human metabolic network based on genomic and bibliomic data». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 104, 6, Febrer 2007, pàg. 1777–82. DOI: 10.1073/pnas.0610772104. PMID: 17267599.

Goh K. I., Cusick M. E., Valle D., Childs B., Vidal M., Barabási A. L. «The human disease network». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 104, 21, maig 2007, pàg. 8685–90. DOI: 10.1073/pnas.0701361104. PMC: 1885563. PMID: 17502601.

Lee D. S., Park J., Kay K. A., Christakis N. A., Oltvai Z. N., Barabási A. L. «The implications of human metabolic network topology for disease comorbidity». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 105, 29, juliol 2008, pàg. 9880–9885. DOI: 10.1073/pnas.0802208105. PMID: 18599447.

Thykaer J., Nielsen J. «Metabolic engineering of beta-lactam production». Metab Eng, 5, 1, 2003, pàg. 56–69. DOI: 10.1016/S1096-7176(03)00003-X. PMID: 12749845. González-Pajuelo M., Meynial-Salles I., Mendes F., Andrade J., Vasconcelos I., Soucaille P. «Metabolic engineering of Clostridium acetobutylicum for the industrial production of 1,3-propanediol from glycerol». Metab Eng, 7, 5–6, 2005, pàg. 329–36. DOI: 10.1016/j.ymben.2005.06.001. PMID: 16095939. Krämer M., Bongaerts J., Bovenberg R., Kremer S., Müller U., Orf S., Wubbolts M., Raeven L. «Metabolic engineering for microbial production of shikimic acid». Metab Eng, 5, 4, 2003, pàg. 277–83. DOI: 10.1016/j.ymben.2003.09.001. PMID: 14642355.

Koffas M., Roberge C., Lee K., Stephanopoulos G. «Metabolic engineering». Annu Rev Biomed Eng, 1, 1999, pàg. 535–57. DOI: 10.1146/annurev.bioeng.1.1.535. PMID: 11701499.

Eknoyan G. «Santorio Sanctorius (1561–1636) - founding father of metabolic balance studies». Am J Nephrol, 19, 2, 1999, pàg. 226–33. DOI: 10.1159/000013455. PMID: 10213823.

Dubos J. «Louis Pasteur: Free Lance of Science, Gollancz. Quoted in Manchester K. L. (1995) Louis Pasteur (1822 – 1895)—chance and the prepared mind». Trends Biotechnol, 13, 12, 1951, pàg. 511–515. DOI: 10.1016/S0167-7799(00)89014-9. PMID: 8595136.

Kinne-Saffran E., Kinne R. «Vitalism and synthesis of urea. From Friedrich Wöhler to Hans A. Krebs». Am J Nephrol, 19, 2, 1999, pàg. 290–4. DOI: 10.1159/000013463. PMID: 10213830.

Kornberg H. «Krebs and his trinity of cycles». Nat Rev Mol Cell Biol, 1, 3, 2000, pàg. 225–8. DOI: 10.1038/35043073. PMID: 11252898.

jlr.org

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

Friedrich C. «Physiology and genetics of sulfur-oxidizing bacteria». Adv Microb Physiol, 39, 1998, pàg. 235–89. DOI: 10.1016/S0065-2911(08)60018-1. PMID: 9328649.

Smith E., Morowitz H. «Universality in intermediary metabolism». Proc Natl Acad Sci USA, 101, 36, 2004, pàg. 13168–73. DOI: 10.1073/pnas.0404922101. PMID: 15340153.

Michie K., Löwe J. «Dynamic filaments of the bacterial cytoskeleton». Annu Rev Biochem, 75, 2006, pàg. 467–92. DOI: 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142452. PMID: 16756499.

Hegardt F. «Mitochondrial 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase: a control enzyme in ketogenesis». Biochem J, 338 (Pt 3), 1999, pàg. 569–82. DOI: 10.1042/0264-6021:3380569. PMID: 10051425.

Sierra S., Kupfer B., Kaiser R. «Basics of the virology of HIV-1 and its replication». J Clin Virol, 34, 4, 2005, pàg. 233–44. DOI: 10.1016/j.jcv.2005.09.004. PMID: 16198625.

Wimmer M., Rose «Mechanisms of enzyme-catalyzed group transfer reactions». Annu Rev Biochem, 47, 1978, pàg. 1031–78. DOI: 10.1146/annurev.bi.47.070178.005123. PMID: 354490.

Heymsfield S., Waki M., Kehayias J., Lichtman S., Dilmanian F., Kamen Y., Wang J., Pierson R. «Chemical and elemental analysis of humans in vivo using improved body composition models». Am J Physiol, 261, 2 Pt 1, 1991, pàg. E190–8. PMID: 1872381.

Sychrová H. «Yeast as a model organism to study transport and homeostasis of alkali metal cations». Physiol Res, 53 Suppl 1, 2004, pàg. S91–8. PMID: 15119939.

Levitan «Modulation of ion channels in neurons and other cells». Annu Rev Neurosci, 11, 1988, pàg. 119–36. DOI: 10.1146/annurev.ne.11.030188.001003. PMID: 2452594.

Mahan D., Shields R. «Macro- and micromineral composition of pigs from birth to 145 kilograms of body weight». J Anim Sci, 76, 2, 1998, pàg. 506–12. Arxivat de l'original el 2011-04-30. PMID: 9498359 [Consulta: 1r novembre 2008]. Arxivat 2011-04-30 a Wayback Machine.

Dunn L., Rahmanto Y., Richardson D. «Iron uptake and metabolism in the new millennium». Trends Cell Biol, 17, 2, 2007, pàg. 93–100. DOI: 10.1016/j.tcb.2006.12.003. PMID: 17194590.

Nealson K., Conrad P. «Life: past, present and future». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 354, 1392, 1999, pàg. 1923–39. DOI: 10.1098/rstb.1999.0532. PMID: 10670014.

Nelson N., Ben-Shem A. «The complex architecture of oxygenic photosynthesis». Nat Rev Mol Cell Biol, 5, 12, 2004, pàg. 971–82. DOI: 10.1038/nrm1525. PMID: 15573135.

Häse C., Finkelstein R. «Bacterial extracel·lular zinc-containing metalloproteases». Microbiol Rev, 57, 4, 1993, pàg. 823–37. PMID: 8302217.

Hoyle T. «The digestive system: linking theory and practice». Br J Nurs, 6, 22, 1997, pàg. 1285–91. PMID: 9470654.

Bell G., Burant C., Takeda J., Gould G. «Structure and function of mammalian facilitative sugar transporters». J Biol Chem, 268, 26, 1993, pàg. 19161–4. PMID: 8366068.

Sakami W., Harrington H. «Amino acid metabolism». Annu Rev Biochem, 32, 1963, pàg. 355–98. DOI: 10.1146/annurev.bi.32.070163.002035. PMID: 14144484.

Brosnan J. «Glutamate, at the interface between amino acid and carbohydrate metabolism». J Nutr, 130, 4S Suppl, 2000, pàg. 988S–90S. PMID: 10736367.

Young V., Ajami A. «Glutamine: the emperor or his clothes?». J Nutr, 131, 9 Suppl, 2001, pàg. 2449S–59S; discussion 2486S–7S. PMID: 11533293.

Simon J. «Enzymology and bioenergetics of respiratory nitrite ammonification». FEMS Microbiol Rev, 26, 3, 2002, pàg. 285–309. DOI: 10.1111/j.1574-6976.2002.tb00616.x. PMID: 12165429.

Conrad R. «Soil microorganisms as controllers of atmospheric trace gases (H2, CO, CH4, OCS, N2O, and NO)». Microbiol Rev, 60, 4, 1996, pàg. 609–40. PMID: 8987358.

Barea J., Pozo M., Azcón R., Azcón-Aguilar C. «Microbial co-operation in the rhizosphere». J Exp Bot, 56, 417, 2005, pàg. 1761–78. DOI: 10.1093/jxb/eri197. PMID: 15911555.

Allen J., Williams J. «Photosynthetic reaction centers». FEBS Lett, 438, 1–2, 1998, pàg. 5–9. DOI: 10.1016/S0014-5793(98)01245-9. PMID: 9821949.

Nelson N., Ben-Shem A. «The complex architecture of oxygenic photosynthesis». Nat Rev Mol Cell Biol, 5, 12, 2004, pàg. 971–82. DOI: 10.1038/nrm1525. PMID: 15573135.

Miziorko H., Lorimer G. «Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase». Annu Rev Biochem, 52, 1983, pàg. 507–35. DOI: 10.1146/annurev.bi.52.070183.002451. PMID: 6351728.

Wood H. «Life with CO or CO2 and H2 as a source of carbon and energy». Faseb J, 5, 2, 1991, pàg. 156–63. PMID: 1900793.

Boiteux A., Hess B. «Design of glycolysis». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 293, 1063, 1981, pàg. 5–22. DOI: 10.1098/rstb.1981.0056. PMID: 6115423.

Finn P., Dice J. «Proteolytic and lipolytic responses to starvation». Nutrition, 22, 7–8, 2006, pàg. 830–44. DOI: 10.1016/j.nut.2006.04.008. PMID: 16815497.

Kornberg H., Krebs H. «Synthesis of cell constituents from C2-units by a modified tricarboxylic acid cycle». Nature, 179, 4568, 1957, pàg. 988–91. DOI: 10.1038/179988a0. PMID: 13430766.

Rademacher T., Parekh R., Dwek R. «Glycobiology». Annu Rev Biochem, 57, 1988, pàg. 785–838. DOI: 10.1146/annurev.bi.57.070188.004033. PMID: 3052290.

Opdenakker G., Rudd P., Ponting C., Dwek R. «Concepts and principles of glycobiology». Faseb J, 7, 14, 1993, pàg. 1330–7. PMID: 8224606.

Chirala S., Wakil S. «Structure and function of animal fatty acid synthase». Lipids, 39, 11, 2004, pàg. 1045–53. DOI: 10.1007/s11745-004-1329-9. PMID: 15726818.

Ohlrogge J., Jaworski J. «Regulation of fatty acid synthesis». Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol, 48, 1997, pàg. 109–136. DOI: 10.1146/annurev.arplant.48.1.109. PMID: 15012259.

Dubey V., Bhalla R., Luthra R. «An overview of the non-mevalonate pathway for terpenoid biosynthesis in plants». J Biosci, 28, 5, 2003, pàg. 637–46. DOI: 10.1007/BF02703339. PMID: 14517367.

Kuzuyama T., Seto H. «Diversity of the biosynthesis of the isoprene units». Nat Prod Rep, 20, 2, 2003, pàg. 171–83. DOI: 10.1039/b109860h. PMID: 12735695.

Schroepfer G. «Sterol biosynthesis». Annu Rev Biochem, 50, 1981, pàg. 585–621. DOI: 10.1146/annurev.bi.50.070181.003101. PMID: 7023367.

Ibba M., Söll D. «The renaissance of aminoacyl-tRNA synthesis». EMBO Rep, 2, 5, 2001, pàg. 382-7. PMID: 11375928.

Lengyel P., Söll D. «Mechanism of protein biosynthesis». Bacteriol Rev, 33, 2, 1969, pàg. 264–301. PMID: 4896351.

Smith J. «Enzymes of nucleotide synthesis». Curr Opin Struct Biol, 5, 6, 1995, pàg. 752–7. DOI: 10.1016/0959-440X(95)80007-7. PMID: 8749362.

Danielson P. «The cytochrome P450 superfamily: biochemistry, evolution and drug metabolism in humans». Curr Drug Metab, 3, 6, 2002, pàg. 561–97. DOI: 10.2174/1389200023337054. PMID: 12369887.

King C., Rios G., Green M., Tephly T. «UDP-glucuronosyltransferases». Curr Drug Metab, 1, 2, 2000, pàg. 143–61. DOI: 10.2174/1389200003339171. PMID: 11465080.

Davies K. «Oxidative stress: the paradox of aerobic life». Biochem Soc Symp, 61, 1995, pàg. 1–31. PMID: 8660387.

Tu B., Weissman J. «Oxidative protein folding in eukaryotes: mechanisms and consequences». J Cell Biol, 164, 3, 2004, pàg. 341–6. DOI: 10.1083/jcb.200311055. PMID: 14757749.

Sies H. «Oxidative stress: oxidants and antioxidants». Exp Physiol, 82, 2, 1997, pàg. 291–5. PMID: 9129943.

Vertuani S., Angusti A., Manfredini S. «The antioxidants and pro-antioxidants network: an overview». Curr Pharm Des, 10, 14, 2004, pàg. 1677–94. DOI: 10.2174/1381612043384655. PMID: 15134565.

Demirel Y., Sandler S. «Thermodynamics and bioenergetics». Biophys Chem, 97, 2–3, 2002, pàg. 87–111. DOI: 10.1016/S0301-4622(02)00069-8. PMID: 12050002.

Albert R. «Scale-free networks in cell biology». J Cell Sci, 118, Pt 21, 2005, pàg. 4947–57. DOI: 10.1242/jcs.02714. PMID: 16254242.

Brand M. «Regulation analysis of energy metabolism». J Exp Biol, 200, Pt 2, 1997, pàg. 193–202. PMID: 9050227.

Soyer O., Salathé M., Bonhoeffer S. «Signal transduction networks: topology, response and biochemical processes». J Theor Biol, 238, 2, 2006, pàg. 416–25. PMID: 16045939.

Salter M., Knowles R., Pogson C. «Metabolic control». Essays Biochem, 28, 1994, pàg. 1–12. PMID: 7925313.

Westerhoff H., Groen A., Wanders R. «Modern theories of metabolic control and their applications (review)». Biosci Rep, 4, 1, 1984, pàg. 1–22. DOI: 10.1007/BF01120819. PMID: 6365197.

Fell D, Thomas S «Physiological control of metabolic flux: the requirement for multisite modulation». Biochem J, 311 (Pt 1), 1995, pàg. 35–9. PMID: 7575476.

Hendrickson W «Transduction of biochemical signals across cell membranes». Q Rev Biophys, 38, 4, 2005, pàg. 321–30. DOI: 10.1017/S0033583506004136. PMID: 16600054.

Lienhard G, Slot J, James D, Mueckler M «How cells absorb glucose». Sci Am, 266, 1, 1992, pàg. 86–91. PMID: 1734513.