Genome Taxonomy Database (German Wikipedia)
Analysis of information sources in references of the Wikipedia article "Genome Taxonomy Database" in German language version.
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- K Mendler, H Chen, DH Parks, LA Hug, AC Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research. 47. Jahrgang, 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246 (annotree.uwaterloo.ca ( des vom 23. April 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 27. Juli 2022]). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
bergeys.org
- Incorporation of Phylogenomics into BMSAB. In: Bergey's Manual Trust.
doi.org
- Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, D. W. Waite, Christian Rinke, A. Skarshewski, P. A. Chaumeil, Phil Hugenholtz: A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life. In: Nature Biotechnology. 36. Jahrgang, Nr. 10, November 2018, S. 996–1004, doi:10.1038/nbt.4229, PMID 30148503 (englisch). Preprint: doi:10.1101/256800.
- Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, P. A Chaumeil, Christian Rinke, A. J. Mussig, Phil Hugenholtz: A complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea. In: Nature Biotechnology. 38. Jahrgang, Nr. 9, September 2020, ResearchGate:340954053, S. 1079–1086, doi:10.1038/s41587-020-0501-8, PMID 32341564 (englisch). Preprint: doi:10.1101/771964.
- P. A. Chaumeil, A. J. Mussig, Phil Hugenholtz, Donovan H. Parks: GTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database. In: Bioinformatics. 15. November 2019, doi:10.1093/bioinformatics/btz848, PMID 31730192, PMC 7703759 (freier Volltext) – (englisch).
- Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, Francesco Strozzi, Martin Beracochea, Zhou Jason Shi, Katherine S. Pollard, Ekaterina Sakharova, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz, Nicola Segata, Nikos C. Kyrpides, Robert D. Finn: A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome. In: Nature Biotechnology. 20. Juli 2020, doi:10.1038/s41587-020-0603-3, PMID 32690973, PMC 7801254 (freier Volltext) – (englisch).
- Stephen Nayfach, Simon Roux, Rekha Seshadri, Daniel Udwary, Neha Varghese, Frederik Schulz, Dongying Wu, David Paez-Espino, I-Min Chen, Marcel Huntemann, Krishna Palaniappan, Joshua Ladau, Supratim Mukherjee, T. B. K. Reddy, Torben Nielsen, Edward Kirton, José P. Faria, Janaka N. Edirisinghe, Christopher S. Henry, Sean P. Jungbluth, Dylan Chivian, Paramvir Dehal, Elisha M. Wood-Charlson, Adam P. Arkin, Susannah G. Tringe, Axel Visel, Tanja Woyke, Nigel J. Mouncey, Natalia N. Ivanova, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh: A genomic catalog of Earth's microbiomes. In: Nature Biotechnology. 9. November 2020, doi:10.1038/s41587-020-0718-6, PMC 8041624 (freier Volltext).
- K Mendler, H Chen, DH Parks, LA Hug, AC Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research. 47. Jahrgang, 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246 (annotree.uwaterloo.ca ( des vom 23. April 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 27. Juli 2022]). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
ecogenomic.org
gtdb.ecogenomic.org
- GTDB: About. Informationen zu den einzelnen Aktualisierungen finden sich in den entsprechenden Änderungsprotokollen. Bemerkenswerte Änderungen, die eine Veröffentlichung wert sind, finden sich im Abschnitt "Cite GTDB".
nih.gov
ncbi.nlm.nih.gov
- Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, D. W. Waite, Christian Rinke, A. Skarshewski, P. A. Chaumeil, Phil Hugenholtz: A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life. In: Nature Biotechnology. 36. Jahrgang, Nr. 10, November 2018, S. 996–1004, doi:10.1038/nbt.4229, PMID 30148503 (englisch). Preprint: doi:10.1101/256800.
- Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, P. A Chaumeil, Christian Rinke, A. J. Mussig, Phil Hugenholtz: A complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea. In: Nature Biotechnology. 38. Jahrgang, Nr. 9, September 2020, ResearchGate:340954053, S. 1079–1086, doi:10.1038/s41587-020-0501-8, PMID 32341564 (englisch). Preprint: doi:10.1101/771964.
- P. A. Chaumeil, A. J. Mussig, Phil Hugenholtz, Donovan H. Parks: GTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database. In: Bioinformatics. 15. November 2019, doi:10.1093/bioinformatics/btz848, PMID 31730192, PMC 7703759 (freier Volltext) – (englisch).
- Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, Francesco Strozzi, Martin Beracochea, Zhou Jason Shi, Katherine S. Pollard, Ekaterina Sakharova, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz, Nicola Segata, Nikos C. Kyrpides, Robert D. Finn: A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome. In: Nature Biotechnology. 20. Juli 2020, doi:10.1038/s41587-020-0603-3, PMID 32690973, PMC 7801254 (freier Volltext) – (englisch).
- Stephen Nayfach, Simon Roux, Rekha Seshadri, Daniel Udwary, Neha Varghese, Frederik Schulz, Dongying Wu, David Paez-Espino, I-Min Chen, Marcel Huntemann, Krishna Palaniappan, Joshua Ladau, Supratim Mukherjee, T. B. K. Reddy, Torben Nielsen, Edward Kirton, José P. Faria, Janaka N. Edirisinghe, Christopher S. Henry, Sean P. Jungbluth, Dylan Chivian, Paramvir Dehal, Elisha M. Wood-Charlson, Adam P. Arkin, Susannah G. Tringe, Axel Visel, Tanja Woyke, Nigel J. Mouncey, Natalia N. Ivanova, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh: A genomic catalog of Earth's microbiomes. In: Nature Biotechnology. 9. November 2020, doi:10.1038/s41587-020-0718-6, PMC 8041624 (freier Volltext).
redirecter.toolforge.org
- K Mendler, H Chen, DH Parks, LA Hug, AC Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research. 47. Jahrgang, 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246 (annotree.uwaterloo.ca ( des vom 23. April 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 27. Juli 2022]). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
researchgate.net
- Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, P. A Chaumeil, Christian Rinke, A. J. Mussig, Phil Hugenholtz: A complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea. In: Nature Biotechnology. 38. Jahrgang, Nr. 9, September 2020, ResearchGate:340954053, S. 1079–1086, doi:10.1038/s41587-020-0501-8, PMID 32341564 (englisch). Preprint: doi:10.1101/771964.
uwaterloo.ca
annotree.uwaterloo.ca
- K Mendler, H Chen, DH Parks, LA Hug, AC Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research. 47. Jahrgang, 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246 (annotree.uwaterloo.ca ( des vom 23. April 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 27. Juli 2022]). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
web.archive.org
- K Mendler, H Chen, DH Parks, LA Hug, AC Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research. 47. Jahrgang, 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246 (annotree.uwaterloo.ca ( des vom 23. April 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 27. Juli 2022]). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.