SARS-CoV-2-virusmuunnokset (Finnish Wikipedia)

Analysis of information sources in references of the Wikipedia article "SARS-CoV-2-virusmuunnokset" in Finnish language version.

refsWebsite

Global rank Finnish rank

13who.int

195^th place

238^th place

13doi.org

2^nd place

10^th place

10yle.fi

380^th place

2^nd place

8cov-lineages.org

low place

8nih.gov

4^th place

12^th place

7thl.fi

low place

262^nd place

5web.archive.org

1^st place

5theguardian.com

12^th place

22^nd place

5sciencemag.org

857^th place

545^th place

4hs.fi

647^th place

3^rd place

4is.fi

1,310^th place

5^th place

4europa.eu

68^th place

51^st place

4virological.org

low place

4bbc.com

20^th place

29^th place

3laakarilehti.fi

low place

382^nd place

3cdc.gov

218^th place

595^th place

3nature.com

234^th place

201^st place

3medrxiv.org

low place

3gisaid.org

low place

3nytimes.com

7^th place

20^th place

3ssi.dk

low place

3nextstrain.org

low place

2worldcat.org

5^th place

9^th place

2semanticscholar.org

11^th place

2,329^th place

2biorxiv.org

5,061^st place

7,783^rd place

2cnn.com

28^th place

67^th place

2publishing.service.gov.uk

1,877^th place

5,782^nd place

2timesofisrael.com

571^st place

843^rd place

2reuters.com

49^th place

126^th place

1academie-sciences.fr

7,547^th place

low place

1github.com

383^rd place

1,185^th place

1sciencespeaksblog.org

low place

1washington.edu

1,067^th place

1,143^rd place

1bbc.co.uk

8^th place

14^th place

1cmmid.github.io

low place

1cevo-public.github.io

low place

1gov.uk

432^nd place

633^rd place

1washingtonpost.com

34^th place

151^st place

1sacoronavirus.co.za

low place

1japantoday.com

3,795^th place

8,473^rd place

1newscientist.com

774^th place

622^nd place

1zdf.de

1,243^rd place

low place

1twitter.com

23^rd place

206^th place

1repubblica.it

78^th place

1,646^th place

1tirol.gv.at

7,970^th place

low place

1apnews.com

129^th place

643^rd place

1sum.dk

low place

1niid.go.jp

low place

1independent.co.uk

36^th place

102^nd place

1ncdc.gov.ng

low place

1rivm.nl

low place

1businessinsider.com

140^th place

310^th place

1aftenposten.no

1,779^th place

1,607^th place

1irishtimes.com

266^th place

1,276^th place

1independent.ie

315^th place

815^th place

1irishexaminer.com

1,164^th place

3,964^th place

1forbes.com

54^th place

127^th place

1wionews.com

2,596^th place

3,944^th place

1telegraph.co.uk

30^th place

62^nd place

academie-sciences.fr

comptes-rendus.academie-sciences.fr

Anna Zhukova, Luc Blassel, et al.: Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2. Comptes Rendus Biologies, 24.11.2020, s. 1–20. PubMed:33274614 doi:10.5802/crbiol.29 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

aftenposten.no

En ny variant av koronaviruset er oppdaget i Norge. Hva vet vi om den? Määritä julkaisu!18 February 2021. Aftenposten. Artikkelin verkkoversio. (norja)

apnews.com

Cara Anna: Africa CDC: New virus variant appears to emerge in Nigeria. Määritä julkaisu!24.12.2020. The Associated Press, apnews.com. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

bbc.co.uk

Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK. BBC News, 20.12.2020. Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

bbc.com

Gallagher, James: Coronavirus: UK variant 'may be more deadly'. BBC News, 22.1.2021. Artikkelin verkkoversio.
Covid: Vietnam detects new UK-Indian variant, health officials say BBC News. 29.5.2021. Viitattu 30.5.2021. (englanniksi)
New Covid variant: How worried should we be? BBC News. 25.11.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)
Coronavirus variants and mutations: The science explained. BBC News, 6.1.2021. Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

biorxiv.org

Hadfield, J.; Megill, C; Bell, S.M.; Huddleston, J.; Potter, B.; Callender, C.: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Bioinformatics, May 2018, 34. vsk, nro 23, s. 4121–4123. PubMed:29790939 PubMed Central:6247931 doi:10.1093/bioinformatics/bty407 Artikkelin verkkoversio.
———: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Määritä julkaisu!November 2017. doi:10.1101/224048 S2CID:196637131 Artikkelin verkkoversio.
Anthony P. West Jr., Christopher O. Barnes, Zhi Yang, Pamela J. Bjorkman: SARS-CoV-2 lineage B.1.526 emerging in the New York region detected by software utility created to query the spike mutational landscape (vertaisarvioimaton ennakkojulkaisu, doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.14.431043)+medrxiv.org. 2.2021. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

businessinsider.com

A coronavirus variant with a mutation that 'likely helps it escape' antibodies is already in at least 11 countries, including the US. Määritä julkaisu!16.2.2021. Business Insider. Artikkelin verkkoversio.

cdc.gov

SARS-CoV-2 Variants 31.1.2021, updated. cdc.gov. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)
CDC: Emerging SARS-CoV-2 Variants Centers for Disease Control and Prevention. Viitattu 4.1.2021. (englanniksi) Artikkeli sisältää tekstiä tästä tekijänoikeuksiltaan vapaasta lähteestä.
CDC: Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Centers for Disease Control and Prevention. 11.2.2020. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)

cevo-public.github.io

Theoretical Biology, Institute for Integrative Biology (IBZ), ETH Zürich: Covid Dashboard: SARS-CoV-2 Variants of Concern in Switzerland (B.1.1.7 Variant - International Comparison) x.2.2021. ETH Zürich via Github. Viitattu 28.2.2021. (englanniksi)

cmmid.github.io

Estimated transmissibility and severity of novel SARS-CoV-2 Variant of Concern 202012/01 in England 23.12.2020. CMMID Repository, Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases (CMMID). London School of Hygiene & Tropical Medicine (LSHTM). Viitattu 28.2.2021.

cnn.com

Jacqueline Howard CNN: WHO's new naming system for coronavirus variants uses Greek alphabet CNN. Viitattu 1.6.2021.
Christina Maxouris: What we know about the Omicron variant CNN. Viitattu 27.11.2021.

cov-lineages.org

PANGO lineages-Lineage B.1.1.28 cov-lineages.org. Viitattu 4.2.2021. (englanniksi)
Lineages cov-lineages.org. Viitattu 24 December 2020.
P1 cov-lineages.org. Viitattu 21.12.2021.
B.1.1.7 report cov-lineages.org. Viitattu 29.1.2021.
P.2 Cov-lineages.org. Viitattu 21.12.2021.
B.1.525 Rambaut Group, University of Edinburgh. 15 February 2021. PANGO Lineages. Viitattu 16 February 2021.
P.3 Cov-lineages.org. Viitattu 21.12.2021.
B.1.617.1 Cov-lineages.org. Viitattu 21.12.2021.

doi.org

dx.doi.org

E. Alm, E. K. Broberg, et. al.: Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020. Euro Surveillance, 2020, 25. vsk, nro 32. PubMed:32794443 PubMed Central:7427299 doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410 (englanniksi)
A Rambaut et al: A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology, 2020, 5. vsk, nro 11, s. 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5 ISSN 2058-5276 Artikkelin verkkoversio.
Anna Zhukova, Luc Blassel, et al.: Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2. Comptes Rendus Biologies, 24.11.2020, s. 1–20. PubMed:33274614 doi:10.5802/crbiol.29 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Wenjuan Zhang, Brian Davis, et al.: Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA. Määritä julkaisu!2021. doi:10.1101/2021.01.18.21249786 S2CID:231646931 Artikkelin verkkoversio.
Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes. Bulletin of the World Health Organization, June 2020, 98. vsk, nro 7, s. 495–504. ”We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.” PubMed:32742035 PubMed Central:7375210 doi:10.2471/BLT.20.253591 ISSN 0042-9686 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Hadfield, J.; Megill, C; Bell, S.M.; Huddleston, J.; Potter, B.; Callender, C.: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Bioinformatics, May 2018, 34. vsk, nro 23, s. 4121–4123. PubMed:29790939 PubMed Central:6247931 doi:10.1093/bioinformatics/bty407 Artikkelin verkkoversio.
———: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Määritä julkaisu!November 2017. doi:10.1101/224048 S2CID:196637131 Artikkelin verkkoversio.
Ewen Callaway: Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert. Nature, 25.11.2021. doi:10.1038/d41586-021-03552-w Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Kai Kupferschmidt: New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines. Science, 15 January 2021. American Association for the Advancement of Science. doi:10.1126/science.abg6028 Artikkelin verkkoversio.
Kai Kupferschmidt: New mutations raise specter of 'immune escape'. Science, January 22, 2021, 371. vsk, nro 6527, s. 329–330. PubMed:33479129 doi:10.1126/science.371.6527.329 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Voloch, Carolina M.; et al. (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil" full text (see figure 5). Retrieved 15 January 2021. doi:10.1101/2020.12.23.20248598 – via medRxiv.

doi.org

Phuoc Truong Nguyen, Ilya Plyusnin, Tarja Sironen, Olli Vapalahti, Ravi Kant, Teemu Smura: HaVoC, a bioinformatic pipeline for reference-based consensus assembly and lineage assignment for SARS-CoV-2 sequences 2021. biorxiv.org (preprint). Viitattu 2021-2-25. (englanniksi)
Anthony P. West Jr., Christopher O. Barnes, Zhi Yang, Pamela J. Bjorkman: SARS-CoV-2 lineage B.1.526 emerging in the New York region detected by software utility created to query the spike mutational landscape (vertaisarvioimaton ennakkojulkaisu, doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.14.431043)+medrxiv.org. 2.2021. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)
Medini K Annavajhala, Hiroshi Mohri, Jason E Zucker, Zizhang Sheng, Pengfei Wang, Angela Gomez-Simmonds, David D Ho, Anne-Catrin Uhlemann: A Novel SARS-CoV-2 Variant of Concern, B.1.526, Identified in New York (vertaisarvioimaton ennakkojulkaisu, doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.23.21252259)+medrxiv.org. 23.2.2021. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

europa.eu

ecdc.europa.eu

Risk assessment on COVID-19, 15 February 2021 15.2.2021. ecdc.europa.eu. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)
Rapid Risk Assessment: Assessing SARS-CoV-2 circulation, variants of concern, non-pharmaceutical interventions and vaccine rollout in the EU/EEA, 16th update European Centre for Disease Prevention and Control. 30.9.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)
ECDC publishes Threat assessment brief - Emergence of SARS-CoV-2 variant B.1.1.529 European Centre for Disease Prevention and Control. 26.11.2021. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
ECDC: Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update ecdc.europa.eu. 21.1.2021. Viitattu 2.2.2021.

forbes.com

William A. Haseltine: A New Covid-19 Variant From Nigeria Raises Increased Concerns For Containment And Vaccination. Määritä julkaisu!24.2.2021. forbes.com. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

gisaid.org

clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature') gisaid.org. 4 July 2020. Viitattu 7 January 2021.
Global phylogeny, updated by Nextstrain 18 January 2021. GISAID. Viitattu 19 January 2021. (englanniksi)
Tracking of variants: VUI202012/01 GR/501Y.V1 (B.1.1.7) GISAID. Viitattu 19 February 2021.

github.com

cov-lineages/pangolin: Software package for assigning SARS-CoV-2 genome sequences to global lineages Github. Viitattu 2 January 2021.

gov.uk

Public Health England: Variants: distribution of cases data gov.uk. 18.2.2021. Viitattu 27.2.2021. (englanniksi)

hs.fi

Koronavirus | Deltamuunnoksesta tuli Suomen valtavirus: Muunnosta jo yli 80 prosentissa tutkituista näytteistä Helsingin Sanomat. 9.7.2021. Viitattu 26.11.2021.
Etelä-Afrikassa tunnistettu koronavirusmuunnos on ”merkittävin tähän asti” Helsingin Sanomat. 25.11.2021. Viitattu 26.11.2021.
Koronavirus | Turussa todettiin Suomen ensimmäinen uuden omikronmuunnoksen aiheuttama tartunta: Mitä muunnoksesta tiedetään? Helsingin Sanomat. 19.5.2022. Viitattu 1.6.2022.
Rokotuskaaos | THL jyrähtää: Rokotuksia ei ole hoidettu parhaalla mahdollisella tavalla Helsingin Sanomat. 7.11.2023. Viitattu 10.11.2023.

independent.co.uk

Lovett, Samuel: What we know about the new Brazilian coronavirus variant. The Independent, 14 January 2021. London. Artikkelin verkkoversio.

independent.ie

Gabija Gataveckaite: First Irish case of B1525 strain of Covid-19 confirmed as R number increases. Määritä julkaisu!25.2.2021. Irish Independent. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

irishexaminer.com

Michelle McGlynn: Nphet confirm new variant B1525 detected in Ireland as 35 deaths and 613 cases confirmed. Määritä julkaisu!25.2.2021. Irish Examiner. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.2.2021.

irishtimes.com

Cullen, Paul: Coronavirus: Variant discovered in UK and Nigeria found in State for first time. Määritä julkaisu!25.2.2021. The Irish Times. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.2.2021.

is.fi

Koronan virusmuunnokset saivat uudet nimet: WHO kertoi kaksi syytä muutokselle Ilta-Sanomat. 1.6.2021. Viitattu 26.11.2021.
Intiasta löydetty koronan ”tuplamuunnos” leviää nopeasti Ilta-Sanomat. 22.4.2021. Viitattu 25.4.2021.
Miksi omikronvirus on niin huolestuttava? 9 kysymystä ja vastausta uudesta koronamuunnoksesta Ilta-Sanomat. 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021.
Uusi koronavariantti rantautui Suomeen Ilta-Sanomat. 11.12.2023. Viitattu 11.12.2023.

japantoday.com

Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil Japan Today. Viitattu 21.12.2021.

laakarilehti.fi

Anne Seppänen: Koronaviruksen sekvensointia pyritään laajentamaan koko Suomeen laakarilehti.fi. 5.1.2021. Viitattu 26.2.2021.
Anne Seppänen: Ajan pelaaminen koronaviruksen muunnosten kanssa kannattaa laakarilehti.fi. 25.1.2021. Viitattu 26.2.2021.
Hertta Vierula: Uuden Fin-796H-koronavariantin koko genomi on määritetty laakarilehti.fi. 24.2.2021. Viitattu 28.2.2021.

medrxiv.org

Wenjuan Zhang, Brian Davis, et al.: Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA. Määritä julkaisu!2021. doi:10.1101/2021.01.18.21249786 S2CID:231646931 Artikkelin verkkoversio.
Voloch, Carolina M.; et al. (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil" full text (see figure 5). Retrieved 15 January 2021. doi:10.1101/2020.12.23.20248598 – via medRxiv.
Medini K Annavajhala, Hiroshi Mohri, Jason E Zucker, Zizhang Sheng, Pengfei Wang, Angela Gomez-Simmonds, David D Ho, Anne-Catrin Uhlemann: A Novel SARS-CoV-2 Variant of Concern, B.1.526, Identified in New York (vertaisarvioimaton ennakkojulkaisu, doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.23.21252259)+medrxiv.org. 23.2.2021. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

nature.com

Ewen Callaway & Heidi Ledford: How to redesign COVID vaccines so they protect against variants. Määritä julkaisu!29.1.2021. nature.com. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 27.2.2021. (englanniksi)
A Rambaut et al: A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology, 2020, 5. vsk, nro 11, s. 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5 ISSN 2058-5276 Artikkelin verkkoversio.
Ewen Callaway: Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert. Nature, 25.11.2021. doi:10.1038/d41586-021-03552-w Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

ncdc.gov.ng

covid19.ncdc.gov.ng

Statement of variants of SARS-CoV-2 in Nigeria. Määritä julkaisu!19.2.2021. Nigeria CDC, ncdc.gov.ng. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

newscientist.com

#author.fullName}: Delta covid-19 variant (B.1.617) New Scientist. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)

nextstrain.org

Trevor Bedford, Emma B. Hodcroft, Richard A. Neher: Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy (at least one of the following criteria must be met in order to count as a clade in the Nextstrain system (quote from source): "1. A clade reaches >20% global frequency for 2 or more months, 2. A clade reaches >30% regional frequency for 2 or more months, 3. A VOC (‘variant of concern’) is recognized (applies currently [6 January 2021] to 501Y.V1 and 501Y.V2)") 6.1.2021. nextstrain.org. Viitattu 25.2.2021. (englanniksi)
Phylogenetic analysis of SARS-CoV-2 diversity in Europe - Finland (nextstrain.org -verkkosivulla on ilmeinen virhe tekstissä maanimen kohdalla, kun haulla FIN kerättyä aineistoa nimitetään Sveitsiksi (Switzerland). Suomalaisen aineiston julkaisijana useimmiten Teemu Smura et al./ Huslab) nextstrain.org. Viitattu 25.2.2021. (englanniksi)

clades.nextstrain.org

Nextclade (What are the clades?) clades.nextstrain.org. Arkistoitu 19 January 2021. Viitattu 19 January 2021.

nih.gov

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

E. Alm, E. K. Broberg, et. al.: Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020. Euro Surveillance, 2020, 25. vsk, nro 32. PubMed:32794443 PubMed Central:7427299 doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410 (englanniksi)
Anna Zhukova, Luc Blassel, et al.: Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2. Comptes Rendus Biologies, 24.11.2020, s. 1–20. PubMed:33274614 doi:10.5802/crbiol.29 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes. Bulletin of the World Health Organization, June 2020, 98. vsk, nro 7, s. 495–504. ”We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.” PubMed:32742035 PubMed Central:7375210 doi:10.2471/BLT.20.253591 ISSN 0042-9686 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Hadfield, J.; Megill, C; Bell, S.M.; Huddleston, J.; Potter, B.; Callender, C.: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Bioinformatics, May 2018, 34. vsk, nro 23, s. 4121–4123. PubMed:29790939 PubMed Central:6247931 doi:10.1093/bioinformatics/bty407 Artikkelin verkkoversio.
———: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Määritä julkaisu!November 2017. doi:10.1101/224048 S2CID:196637131 Artikkelin verkkoversio.
Kai Kupferschmidt: New mutations raise specter of 'immune escape'. Science, January 22, 2021, 371. vsk, nro 6527, s. 329–330. PubMed:33479129 doi:10.1126/science.371.6527.329 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

ncbi.nlm.nih.gov

E. Alm, E. K. Broberg, et. al.: Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020. Euro Surveillance, 2020, 25. vsk, nro 32. PubMed:32794443 PubMed Central:7427299 doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410 (englanniksi)
Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes. Bulletin of the World Health Organization, June 2020, 98. vsk, nro 7, s. 495–504. ”We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.” PubMed:32742035 PubMed Central:7375210 doi:10.2471/BLT.20.253591 ISSN 0042-9686 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
Hadfield, J.; Megill, C; Bell, S.M.; Huddleston, J.; Potter, B.; Callender, C.: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Bioinformatics, May 2018, 34. vsk, nro 23, s. 4121–4123. PubMed:29790939 PubMed Central:6247931 doi:10.1093/bioinformatics/bty407 Artikkelin verkkoversio.
———: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Määritä julkaisu!November 2017. doi:10.1101/224048 S2CID:196637131 Artikkelin verkkoversio.

niid.go.jp

NIID (National Institute of Infectious Diseases) (12 January 2021). "Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil" (in (englanniksi)). Press release. https://www.niid.go.jp/niid/images/epi/corona/covid19-33-en-210112.pdf. Retrieved 2021-01-14.

nytimes.com

Jonathan Corum & Carl Zimmer: Coronavirus Variants and Mutations nytimes.com. Viitattu 25.2.2021. (englanniksi)
South Africa announces a new coronavirus variant The New York Times. 18.12.2020. Viitattu 1.3.2021. (englanniksi)
Apoorva Mandavilli: A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York, Researchers Report New York Times, nytimes.com. 24.2.2021. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

publishing.service.gov.uk

assets.publishing.service.gov.uk

Meera Chand, Susan Hopkins, et al.: Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01 21.12.2020. Public Health England. Viitattu 27.2.2021.
Peter Horby, Catherine Huntley, et al.: NERVTAG paper on COVID-19 variant of concern B.1.1.7: NERVTAG update note on B.1.1.7 severity (2021-02-11) assets.publishing.service.gov.uk. 11.2.2021. Viitattu 28.2.2021. (englanniksi)

repubblica.it

napoli.repubblica.it

Covid, un caso di variante Omicron in Campania: isolati tutti i contatti la Repubblica. 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021. (italiaksi)

reuters.com

Reuters: Belgium detects first case of new COVID-19 variant in Europe Reuters. 26.11.2021. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
Stephanie Nebehay: WHO meets to designate new variant, cautions against travel measures Reuters. 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)

rivm.nl

Varianten van het coronavirus SARS-CoV-2 16 February 2021. Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu, RIVM. Viitattu 16 February 2021. (hollanti)

sacoronavirus.co.za

Dr. Zwelini Mkhize: Update on Covid-19 (18th December 2020) sacoronavirus.co.za. 18.12.2020. ”Our clinicians have also warned us that things have changed and that younger, previously healthy people are now becoming very sick.” Viitattu 1.3.2021. (englanniksi)

sciencemag.org

Kai Kupferschmidt: Mutant coronavirus in the United Kingdom sets off alarms but its importance remains unclear sciencemag.org. 20.12.2020. Viitattu 27.2.2021. (englanniksi)
Kai Kupferschmidt: New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines. Science, 15 January 2021. American Association for the Advancement of Science. doi:10.1126/science.abg6028 Artikkelin verkkoversio.
Meredith Wadman: California coronavirus strain may be more infectious—and lethal Science, sciencemag.org. 23.2.2021. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

blogs.sciencemag.org

Derek Lowe: The New Mutations 22 December 2020. American Association for the Advancement of Science. ”I should note here that there's another strain in South Africa that is bringing on similar concerns. This one has eight mutations in the Spike protein, with three of them (K417N, E484K and N501Y) that may have some functional role.” Viitattu 23 December 2020. (englanniksi)

science.sciencemag.org

Kai Kupferschmidt: New mutations raise specter of 'immune escape'. Science, January 22, 2021, 371. vsk, nro 6527, s. 329–330. PubMed:33479129 doi:10.1126/science.371.6527.329 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

sciencespeaksblog.org

IDSA: COVID "Mega-variant" and eight criteria for a template to assess all variants sciencespeaksblog.org. 2.2.2021. Viitattu 27.2.2021. (englanniksi)

semanticscholar.org

api.semanticscholar.org

Wenjuan Zhang, Brian Davis, et al.: Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA. Määritä julkaisu!2021. doi:10.1101/2021.01.18.21249786 S2CID:231646931 Artikkelin verkkoversio.
Hadfield, J.; Megill, C; Bell, S.M.; Huddleston, J.; Potter, B.; Callender, C.: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Bioinformatics, May 2018, 34. vsk, nro 23, s. 4121–4123. PubMed:29790939 PubMed Central:6247931 doi:10.1093/bioinformatics/bty407 Artikkelin verkkoversio.
———: Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Määritä julkaisu!November 2017. doi:10.1101/224048 S2CID:196637131 Artikkelin verkkoversio.

ssi.dk

files.ssi.dk

Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC)i Danmark 27.2.2021. Statens Serum Institut, ssi.dk. Viitattu 28.2.2021. (tanskaksi)
Ria Lassaunière: SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans 11.11.2020. Statens Serum Institut. Arkistoitu 10 November 2020. Viitattu 11 November 2020. (englanniksi)
Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark 18 February 2021. Statens Serum Institut, ssi.dk. Viitattu 18 February 2021. (tanskaksi)

sum.dk

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland 19 November 2020. Sundheds- og Ældreministeriet. ”Sekventeringen af de positive prøver viser samtidig, at der ikke er påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 siden den 15. september, hvorfor Statens Serums Institut vurderer, at denne variant med stor sandsynlighed er døet ud. ("With high probability [...] died out")” Viitattu 16 January 2021.

telegraph.co.uk

Peta Thornycroft, Will Brown: Will the ‘Nu’ variant bypass vaccines? South African experts say it will take ‘weeks’ to find out The Telegraph. 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)

theguardian.com

Omicron’s full impact will be felt in countries where fewer are vaccinated the Guardian. 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
Suspected Omicron Covid cases found in Germany and Czech Republic the Guardian. 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
B.1.1.529 Covid variant ‘most worrying we’ve seen’, says top UK medical adviser the Guardian. 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)
Scientists warn of new Covid variant with high number of mutations the Guardian. 24.11.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)
Lucy Campbell (now); Martin Belam, Samantha Lock (earlier), Daniel Boffey, Kate Connolly, Tobi Thomas: Covid live: first European case of B.1.1.529 variant identified in Belgium The Guardian. 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)

thl.fi

COVID-19-epidemian hybridistrategian seuranta – tilannearvioraportti 24.2.2021 (pdf) 24.2.2021. thl.fi. Viitattu 25.2.2021.
COVID-19-epidemian hybridistrategian seurantaErilliskatsaus, vaihtuva teemaMuuntuneiden koronavirusten seuranta 17.2.2021. thl.fi. Viitattu 1.3.2021. (suomeksi)
Terveyden ja hyvinvoinnin laitos: COVID-19-epidemian hybridistrategian seuranta – tilannearvioraportti 9.2.2022. Kuvaaja 10 s.15: Tartuntatautirekisteriin kirjatut koronaviruslinjat. https://thl.fi/documents/533963/5860112/COVID-19-epidemian+hybridistrategian+seurantaraportti+9.2.2022.pdf (Arkistoitu – Internet Archive)
Muuntuneet koronavirukset Terveyden ja hyvinvoinnin laitos. Arkistoitu 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021.
Uusi huolestuttava koronavirusmuunnos omikron (B.1.1.529) Terveyden ja hyvinvoinnin laitos. Arkistoitu 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021.
Koronavirusmuunnokset jätevedessä Terveyden ja hyvinvoinnin laitos. Viitattu 21.4.2022.
Koronaviruksen jätevesiseuranta: omikronin uusimmat alalinjat yleisimpiä koronavirusmuunnoksia Suomessa Terveyden ja hyvinvoinnin laitos. Viitattu 11.8.2022.

timesofisrael.com

Israel detects its first case of new, highly mutated COVID-19 strain www.timesofisrael.com. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
Israel detects its first case of new, highly mutated COVID-19 strain www.timesofisrael.com. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)

tirol.gv.at

Amt der Tiroler Landesregierung: Ein Verdachtsfall auf Virus-Mutation B.1.1.529 Land Tirol. Viitattu 27.11.2021. (saksaksi)

twitter.com

https://twitter.com/sajidjavid/status/1464594748795146240 Twitter. Viitattu 27.11.2021.

virological.org

Andrew Rambaut, Nick Loman, et al.: Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations 2020. Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. Viitattu 20.12.2021. (englanniksi)
Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings virological.org. Viitattu 12.1.2021.
Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria. Määritä julkaisu!2020-12. virological.org. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)
Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings virological.org. 12.1.2021. Viitattu 23.1.2021. (englanniksi)

washington.edu

globalhealth.washington.edu

New COVID-19 In-Depth Report: Summary of SARS-CoV-2 Novel Variants 8.2.2021. washington.edu. Viitattu 26.2.2021. (englanniksi)

washingtonpost.com

Lesley Wroughton, Max Bearak: South Africa coronavirus: Second wave fueled by new strain, teen 'rage festivals' The Washington Post, washingtonpost.com. 18.12.2020. Viitattu 1.3.2021. (englanniksi)

web.archive.org

Nextclade (What are the clades?) clades.nextstrain.org. Arkistoitu 19 January 2021. Viitattu 19 January 2021.
Terveyden ja hyvinvoinnin laitos: COVID-19-epidemian hybridistrategian seuranta – tilannearvioraportti 9.2.2022. Kuvaaja 10 s.15: Tartuntatautirekisteriin kirjatut koronaviruslinjat. https://thl.fi/documents/533963/5860112/COVID-19-epidemian+hybridistrategian+seurantaraportti+9.2.2022.pdf (Arkistoitu – Internet Archive)
Muuntuneet koronavirukset Terveyden ja hyvinvoinnin laitos. Arkistoitu 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021.
Uusi huolestuttava koronavirusmuunnos omikron (B.1.1.529) Terveyden ja hyvinvoinnin laitos. Arkistoitu 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021.
Ria Lassaunière: SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans 11.11.2020. Statens Serum Institut. Arkistoitu 10 November 2020. Viitattu 11 November 2020. (englanniksi)

who.int

Statement on the sixth meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee regarding the coronavirus disease (COVID-19) pandemic 15.1.2021. who.int. Viitattu 25.2.2021. (englanniksi)
Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes. Bulletin of the World Health Organization, June 2020, 98. vsk, nro 7, s. 495–504. ”We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.” PubMed:32742035 PubMed Central:7375210 doi:10.2471/BLT.20.253591 ISSN 0042-9686 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
WHO Headquarters: ”3.6 Considerations for virus naming and nomenclature”, SARS-CoV-2 genomic sequencing for public health goals: Interim guidance, 8 January 2021, s. 6. World Health Organization, 8 January 2021. Teoksen verkkoversio. (englanniksi)
Tracking SARS-CoV-2 variants www.who.int. Viitattu 1.6.2021. (englanniksi)
Tracking SARS-CoV-2 variants www.who.int. Viitattu 1.6.2021. (englanniksi)
SARS-CoV-2 Variants 31.12.2020. who.int. Viitattu 25.2.2021. (englanniksi)
Tracking SARS-CoV-2 variants www.who.int. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)
COVID-19 Weekly epidemiological update - 25 February 2021 (pdf) 25.2.2021. who.int. Viitattu 28.2.2021. (englanniksi)
Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern www.who.int. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark 6 November 2020. World Health Organization. Viitattu 16 January 2021.
Tracking SARS-CoV-2 variants www.who.int. Viitattu 26.11.2021. (englanniksi)
Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern www.who.int. Viitattu 27.11.2021. (englanniksi)
https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/

wionews.com

Covid-19: Lambda Variant may be more resistant to vaccines than other strains WION. Viitattu 21.12.2021.

worldcat.org

A Rambaut et al: A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology, 2020, 5. vsk, nro 11, s. 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5 ISSN 2058-5276 Artikkelin verkkoversio.
Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes. Bulletin of the World Health Organization, June 2020, 98. vsk, nro 7, s. 495–504. ”We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.” PubMed:32742035 PubMed Central:7375210 doi:10.2471/BLT.20.253591 ISSN 0042-9686 Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

yle.fi

Johannes Blom ja Meeri Niinistö: Suomesta löytyi uusi koronavariantti 17.2.2021. yle.fi. Viitattu 26.2.2021.
Pauliina Happo ja Meeri Niinistö: Suomessa todettu 14 uutta, muuntunutta koronavirustartuntaa – 4.1.2021. yle.fi. Viitattu 26.2.2021.
Intian virusmuunnoksesta on löytynyt yksittäisiä tapauksia Euroopassa Yle Uutiset. Viitattu 25.4.2021.
Mikä ihmeen B.1.1.529? Uusi eteläafrikkalainen virusmuunnos leviää ärhäkästi Yle Uutiset. 26.11.2021. Viitattu 26.11.2021.
Eteläafrikkalainen koronamuunnos sai nimekseen omikron Yle Uutiset. 26.11.2021. Viitattu 27.11.2021.
Etelä-Afrikasta saapuneet lentomatkustajat eristettiin Amsterdamissa Yle Uutiset. 27.11.2021. Viitattu 27.11.2021.
Koronaviruksen uutta krakenmuunnosta löytyi ensimmäistä kertaa Suomesta Yle Uutiset. 13.1.2023. Viitattu 15.1.2023.
Suomeen saapunut uusi omikronmuunnos XBB.1.5 on tähänastisista tarttuvin Yle Uutiset. 14.1.2023. Viitattu 15.1.2023.
Uusi koronamuunnos EG.5 eli ”Eris” on levinnyt myös Suomeen Yle Uutiset. 11.8.2023. Viitattu 13.8.2023.

areena.yle.fi

Johannes Blom ja Tarja Sironen (haastateltavat): Ylen aamu: Virusmuunnos, variantti, mutaatio (videotallenne, kesto 14 minuuttia 57 sekuntia) 5.2.2021. areena.yle.fi. Viitattu 26.2.2021.

zdf.de

Neue Corona-Variante: Bayern meldet zwei Omikron-Fälle www.zdf.de. Viitattu 27.11.2021. (saksaksi)