Son nom est parvenu sous des formes diverses. La forme d'origine, qu'il utilisait lui-même, est «Wernerius» (nom germanique, «Werner»). Dans les textes du XIIe siècle, on trouve aussi la forme italianisée «Guarnerius», «Gernerius». Les formes «Irnerius» et «Yrnerius», mal expliquées, n'apparaissent qu'à la fin du XIIe siècle. C'est cette dernière forme, posthume, qui a finalement été adoptée (Hermann Fitting, Les commencements de l'école de droit de Bologne, Paris, Arthur Rousseau éditeur, (lire en ligne), p.92).
