L’Espagnol Alberto Contador, initialement vainqueur, est déclassé pour dopage (Romain Bonte, « Contador suspendu deux ans », sur France Télévisions Sport, (consulté le )).
Le , le TAS prononce à l'encontre de l'Allemand Jan Ullrich, initialement troisième, une suspension rétroactive de 2 ans à compter du , jour de son audience devant le TAS, et son déclassement de toutes les épreuves auxquelles il a participé entre et la fin de sa carrière en (voir la décision). Il perd ainsi sa place sur le podium du Tour de France 2005, le règlement de l’UCI en vigueur du 1er janvier 2005 au 31 août 2013 réattribue normalement cette troisième place à l’Espagnol Francisco Mancebo, néanmoins la documentation en ligne du Tour de France sur letour.fr a laissé Ullrich troisième et Mancebo quatrième.
Bjarne Riis est retiré du palmarès sur le site letour.fr le 7 juin 2007, après qu'il a avoué avoir pris de l'EPO. Mais les faits étant prescrits, en juillet 2008, son nom est remis par les organisateurs du Tour de France sur la liste des vainqueurs, avec sous son nom mention de ses aveux de dopage, cf. cet article de Sport24.com.
