התקצוב ממשיך גם כיום. בשנת 2001 התקציב של 'אגודת אכסניות נוער' היה 33,800,000 ש"ח. בדיון בכנסת על שינויים בתקציב לקראת 2011 נאמר: "הפנייה נועדה להעברת 5.8 מיליון שקלים מתקציב משרד התיירות לתקציב משרד החינוך בהתאם לתוכנית החומש לפיתוח אגודת אכסניות הנוער לשנים 2010 עד 2014".
"בבתי ההארחה ואכסניות הנוער ברחבי הארץ מוצעות תוכניות חינוכיות המיועדות לתלמידים, חיילים, סגלי הוראה, תיירים ומבוגרים. התוכניות מציעות חוויה מרתקת ומוחשית המותאמת למיקום הגאוגרפי וההיסטורי של כל אכסניה, תוך מתן מענה חינוכי משלים לשירותי האירוח והלינה. הפעילויות מתקיימות גם בשעות הערב." (ב דף הבית של אגודת אכסניות הנוער בישראל תחת הכותרת "תוכניות חינוכיות")
אנ"א פועלת בשני תחומים עיקריים:
1. מתן שירותי לינה, כלכלה, אירוח, תיירות, ארגון והדרכת טיולים ליחידים, משפחות וקבוצות, הן מהארץ והן מחו"ל, במחירים נוחים. 2. טיפוח הכרת הארץ ואהבתה באמצעות ארגון סמינרים בנושאי חברה, טבע, וחינוך לפלורליזם וסובלנות. (מטרות האגודה באתר האגודה)