Folding@home (Italian Wikipedia)

Robin Roychaudhuri, Mingfeng Yang, Minako M. Hoshi e David B. Teplow, Amyloid β-Protein Assembly and Alzheimer Disease, in Journal of Biological Chemistry, vol. 284, n. 8, 2009, pp. 4749-4753, DOI:10.1074/jbc.R800036200, PMC 3837440, PMID 18845536.
M. Hollstein, D. Sidransky, B. Vogelstein e C. Harris, P53 mutations in human cancers, in Science, vol. 253, n. 5015, 1991, pp. 49-53, DOI:10.1126/science.1905840, PMID 1905840.
Aron M. Levin, Darren L. Bates, Aaron M. Ring, Carsten Krieg, Jack T. Lin, Leon Su, Ignacio Moraga, Miro E. Raeber, Gregory R. Bowman, Paul Novick, Vijay S. Pande, C. Garrison Fathman, Onur Boyman e K. Christopher Garcia, Exploiting a natural conformational switch to engineer an interleukin-2 'superkine', in Nature, vol. 484, n. 7395, 2012, pp. 529-533, DOI:10.1038/nature10975, PMC 3338870, PMID 22446627.
Frank Rauch e Francis H. Glorieux, Osteogenesis imperfecta, in The Lancet, vol. 363, n. 9418, 2004, pp. 1377-1385, DOI:10.1016/S0140-6736(04)16051-0, PMID 15110498.
Alfonso Gautieri, Sebastien Uzel, Simone Vesentini, Alberto Redaelli e Markus J. Buehler, Molecular and Mesoscale Mechanisms of Osteogenesis Imperfecta Disease in Collagen Fibrils, in Biophysical Journal, vol. 97, n. 3, 2009, pp. 857-865, DOI:10.1016/j.bpj.2009.04.059, PMC 2718154, PMID 19651044.
Hana Robson Marsden, Itsuro Tomatsu e Alexander Kros, Model systems for membrane fusion, in Chem. Soc. Rev, vol. 40, n. 3, 2011, pp. 1572-1585, DOI:10.1039/c0cs00115e, PMID 21152599.
M. Shirts e V. S. Pande, COMPUTING: Screen Savers of the World Unite!, in Science, vol. 290, n. 5498, 2000, pp. 1903-1904, DOI:10.1126/science.290.5498.1903, PMID 17742054.
D. E. Shaw, P. Maragakis, K. Lindorff-Larsen, S. Piana, R. O. Dror, M. P. Eastwood, J. A. Bank, J. M. Jumper, J. K. Salmon, Y. Shan e W. Wriggers, Atomic-Level Characterization of the Structural Dynamics of Proteins, in Science, vol. 330, n. 6002, 2010, pp. 341-346, DOI:10.1126/science.1187409, PMID 20947758.

bakerlab.org (Global: low place; Italian: low place)

boinc.bakerlab.org

Gen_X_Accord, Vijay Pande (11 giugno 2006). "Folding@home vs. Rosetta@home". Rosetta@home forums. University of Washington. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

benthamscience.com (Global: low place; Italian: low place)

Vittorio Bellotti and Monica Stoppini (2009). "Protein Misfolding Diseases" Archiviato il 22 febbraio 2014 in Internet Archive.. The Open Biology Journal 2: 228–234.

biophysics.org (Global: low place; Italian: low place)

"Biophysical Society Names Five 2012 Award Recipients". Biophysics.org. Biophysical Society. 17 agosto 2011. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 20 settembre, 2012.

boarddigger.com (Global: low place; Italian: low place)

Rattledagger, Vijay Pande (1º aprile 2005). "Folding@home client for BOINC in beta "soon"" Archiviato il 17 settembre 2012 in Internet Archive.. Boarddigger.com. AnandTech. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

boincstats.com (Global: low place; Italian: low place)

"BOINC Combined Credit Overview". BOINCstats.com. BOINC Stats. URL consultato 20 settembre, 2012.

books.google.com (Global: 3^rd place; Italian: 10^th place)

Fratzl, Peter (2008). Collagen: structure and mechanics, ISBN [978-0-387-73905-2. Estratto 17 marzo 2012.

castroller.com (Global: low place; Italian: low place)

"Futures in Biotech 27: Folding@home at 1.3 Petaflops"(Interview, webcast). Castroller.com. CastRoller. 28 dicembre 2007. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

cnet.com (Global: 447^th place; Italian: 753^rd place)

news.cnet.com

Shankland, Stephen (22 marzo 2002). "Google takes on supercomputing". CNet News. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

cnn.com (Global: 36^th place; Italian: 94^th place)

edition.cnn.com

David E. Williams (20 ottobre 2006). "PlayStation's serious side: Fighting disease". CNN. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

copernicus-computing.org (Global: low place; Italian: low place)

Sander Pronk, Iman Pouya, Per Larsson, Peter Kasson, and Erik Lindahl (17 novembre 2011). "Copernicus Download". copernicus-computing.org. Copernicus. dall'originale il 12 ottobre 2012. Estratto 2 ottobre 2012.

doi.org (Global: 2^nd place; Italian: 3^rd place)

dx.doi.org

Vijay S. Pande, Kyle Beauchamp e Gregory R. Bowman, Everything you wanted to know about Markov State Models but were afraid to ask, in Methods, vol. 52, n. 1, 2010, pp. 99-105, DOI:10.1016/j.ymeth.2010.06.002, PMC 2933958, PMID 20570730.
Vincent A. Voelz, Gregory R. Bowman, Kyle Beauchamp e Vijay S. Pande, Molecular Simulation of ab Initio Protein Folding for a Millisecond Folder NTL9(1−39), in Journal of the American Chemical Society, vol. 132, n. 5, 10 febbraio 2010, pp. 1526-1528, DOI:10.1021/ja9090353, ISSN 0002-7863 (WC · ACNP), PMC 2835335, PMID 20070076.
G. R. Bowman e V. S. Pande, Protein folded states are kinetic hubs, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 107, n. 24, 15 giugno 2010, pp. 10890-10895, DOI:10.1073/pnas.1003962107, ISSN 0027-8424 (WC · ACNP), PMC 2890711, PMID 20534497.
Christopher D. Snow, Houbi Nguyen, Vijay S. Pande e Martin Gruebele, Absolute comparison of simulated and experimental protein-folding dynamics, in Nature, vol. 420, n. 6911, --, pp. 102-106, DOI:10.1038/nature01160, ISSN 0028-0836 (WC · ACNP), PMID 12422224.
Fabrizio Marinelli, Fabio Pietrucci, Alessandro Laio e Stefano Piana, A Kinetic Model of Trp-Cage Folding from Multiple Biased Molecular Dynamics Simulations, in PLoS Computational Biology, vol. 5, n. 8, 7 agosto 2009, pp. e1000452, DOI:10.1371/journal.pcbi.1000452, ISSN 1553-7358 (WC · ACNP), PMC 2711228, PMID 19662155.
So Much More to Know, in Science, vol. 309, n. 5731, 1º luglio 2005, pp. 78b–102b, DOI:10.1126/science.309.5731.78b, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 15994524.
Heath Ecroyd e John A. Carver, Unraveling the mysteries of protein folding and misfolding, in Iubmb Life, vol. 60, n. 12, 2008, pp. 769-774, DOI:10.1002/iub.117, PMID 18767168.
Protein folding: Then and now, in Archives of Biochemistry and Biophysics, vol. 469, n. 1, 2008, pp. 4-19, DOI:10.1016/j.abb.2007.05.014, PMC 2173875, PMID 17585870.
Leila M Luheshi, Damian Crowther, Christopher Dobson (2008). "Protein misfolding and disease: from the test tube to the organism". Current Opinion in Chemical Biology 12 (1): 25–31. doi:10.1016/j.cbpa.2008.02.011
Christopher D. Snow, Eric J. Sorin, Young Min Rhee e Vijay S. Pande, How Well Can Simulation Predict Protein Folding Kinetics and Thermodynamics?, in Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure, vol. 34, 2005, pp. 43-69, DOI:10.1146/annurev.biophys.34.040204.144447, PMID 15869383.
Vijay S. Pande, Ian Baker, Jarrod Chapman, Sidney P. Elmer, Siraj Khaliq, Stefan M. Larson, Young Min Rhee, Michael R. Shirts, Christopher D. Snow, Eric J. Sorin e Bojan Zagrovic, Atomistic protein folding simulations on the submillisecond time scale using worldwide distributed computing, in Biopolymers, vol. 68, n. 1, 2003, pp. 91-109, DOI:10.1002/bip.10219, PMID 12579582.
Gregory R. Bowman, Vincent A. Voelz e Vijay S. Pande, Taming the complexity of protein folding, in Current Opinion in Structural Biology, vol. 21, n. 1, 2011, pp. 4-11, DOI:10.1016/j.sbi.2010.10.006, PMC 3042729, PMID 21081274.
John D. Chodera, William C. Swope, Jed W. Pitera e Ken A. Dill, Long‐Time Protein Folding Dynamics from Short‐Time Molecular Dynamics Simulations, in Multiscale Modeling & Simulation, vol. 5, n. 4, 2006, pp. 1214-1226, DOI:10.1137/06065146X.
Robert B. Best, Atomistic molecular simulations of protein folding, in Current Opinion in Structural Biology, vol. 22, n. 1, 2012, pp. 52-61, DOI:10.1016/j.sbi.2011.12.001, PMID 22257762.
Gregory R. Bowman, Daniel L. Ensign e Vijay S. Pande, Enhanced Modeling via Network Theory: Adaptive Sampling of Markov State Models, in Journal of Chemical Theory and Computation, vol. 6, n. 3, 2010, pp. 787-794, DOI:10.1021/ct900620b, PMC 3637129, PMID 23626502.
K. A. Beauchamp, D. L. Ensign, R. Das e V. S. Pande, Quantitative comparison of villin headpiece subdomain simulations and triplet-triplet energy transfer experiments, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 108, n. 31, 2011, pp. 12734-12739, DOI:10.1073/pnas.1010880108, PMC 3150881, PMID 21768345.
Fred E. Cohen e Jeffery W. Kelly, Therapeutic approaches to protein-misfolding diseases, in Nature, vol. 426, n. 6968, 2003, pp. 905-909, DOI:10.1038/nature02265, PMID 14685252.
C. M. Song, S. J. Lim e J. C. Tong, Recent advances in computer-aided drug design, in Briefings in Bioinformatics, vol. 10, n. 5, 2009, pp. 579-591, DOI:10.1093/bib/bbp023, PMID 19433475.
D. Lucent, V. Vishal e V. S. Pande, Protein folding under confinement: A role for solvent, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 104, n. 25, 2007, pp. 10430-10434, DOI:10.1073/pnas.0608256104, PMC 1965530, PMID 17563390.
Vincent A. Voelz, Vijay R. Singh, William J. Wedemeyer, Lisa J. Lapidus e Vijay S. Pande, Unfolded-State Dynamics and Structure of Protein L Characterized by Simulation and Experiment, in Journal of the American Chemical Society, vol. 132, n. 13, 2010, pp. 4702-4709, DOI:10.1021/ja908369h, PMC 2853762, PMID 20218718.
Caroline Hadley, Biologists think bigger, in EMBO Reports, vol. 5, n. 3, 2004, pp. 236-238, DOI:10.1038/sj.embor.7400108, PMC 1299019, PMID 14993921.
G. Brent Irvine, Omar M. El-Agnaf, Ganesh M. Shankar e Dominic M. Walsh, Protein Aggregation in the Brain: The Molecular Basis for Alzheimer's and Parkinson's Diseases, in Molecular Medicine, vol. 14, 7–8, 2008, pp. 451-464, DOI:10.2119/2007-00100.Irvine, PMC 2274891, PMID 18368143.
Claudio Soto e Lisbell D. Estrada, Protein Misfolding and Neurodegeneration, in Archives of Neurology, vol. 65, n. 2, 2008, pp. 184-9, DOI:10.1001/archneurol.2007.56, PMID 18268186.
Robin Roychaudhuri, Mingfeng Yang, Minako M. Hoshi e David B. Teplow, Amyloid β-Protein Assembly and Alzheimer Disease, in Journal of Biological Chemistry, vol. 284, n. 8, 2009, pp. 4749-4753, DOI:10.1074/jbc.R800036200, PMC 3837440, PMID 18845536.
Nicholas W. Kelley, V. Vishal, Grant A. Krafft e Vijay S. Pande, Simulating oligomerization at experimental concentrations and long timescales: A Markov state model approach, in The Journal of Chemical Physics, vol. 129, n. 21, 2008, p. 214707, DOI:10.1063/1.3010881, PMC 2674793, PMID 19063575.
Jayakumar Rajadas, Corey W. Liu, Paul Novick, Nicholas W. Kelley, Mohammed Inayathullah, Melburne C. Lemieux e Vijay S. Pande, Rationally Designed Turn Promoting Mutation in the Amyloid-β Peptide Sequence Stabilizes Oligomers in Solution, in PLOS ONE, vol. 6, n. 7, 2011, pp. e21776, DOI:10.1371/journal.pone.0021776, PMC 3142112, PMID 21799748.
Aabgeena Naeem e Naveed Ahmad Fazili, Defective Protein Folding and Aggregation as the Basis of Neurodegenerative Diseases: The Darker Aspect of Proteins, in Cell Biochemistry and Biophysics, vol. 61, n. 2, 2011, pp. 237-250, DOI:10.1007/s12013-011-9200-x, PMID 21573992.
Gregory R. Bowman, Xuhui Huang e Vijay S. Pande, Network models for molecular kinetics and their initial applications to human health, in Cell Research, vol. 20, n. 6, 2010, pp. 622-630, DOI:10.1038/cr.2010.57, PMC 4441225, PMID 20421891.
Paul A. Novick, Dahabada H. Lopes, Kim M. Branson, Alexandra Esteras-Chopo, Isabella A. Graef, Gal Bitan e Vijay S. Pande, Design of β-Amyloid Aggregation Inhibitors from a Predicted Structural Motif, in Journal of Medicinal Chemistry, vol. 55, n. 7, 2012, pp. 3002-3010, DOI:10.1021/jm201332p, PMC 3766731, PMID 22420626.
Francis O. Walker, Huntington's disease, in The Lancet, vol. 369, n. 9557, 2007, pp. 218-228, DOI:10.1016/S0140-6736(07)60111-1, PMID 17240289.
Nicholas W. Kelley, Xuhui Huang, Stephen Tam, Christoph Spiess, Judith Frydman e Vijay S. Pande, The Predicted Structure of the Headpiece of the Huntingtin Protein and its Implications on Huntingtin Aggregation, in Journal of Molecular Biology, vol. 388, n. 5, 2009, pp. 919-927, DOI:10.1016/j.jmb.2009.01.032, PMC 2677131, PMID 19361448.
Susan W. Liebman e Stephen C. Meredith, Protein folding: Sticky N17 speeds huntingtin pile-up, in Nature Chemical Biology, vol. 6, n. 1, 2010, pp. 7-8, DOI:10.1038/nchembio.279, PMID 20016493.
M. Hollstein, D. Sidransky, B. Vogelstein e C. Harris, P53 mutations in human cancers, in Science, vol. 253, n. 5015, 1991, pp. 49-53, DOI:10.1126/science.1905840, PMID 1905840.
Lillian T. Chong, Christopher D. Snow, Young Min Rhee e Vijay S. Pande, Dimerization of the p53 Oligomerization Domain: Identification of a Folding Nucleus by Molecular Dynamics Simulations, in Journal of Molecular Biology, vol. 345, n. 4, 2005, pp. 869-878, DOI:10.1016/j.jmb.2004.10.083, PMID 15588832.
Lillian T. Chong, William C. Swope, Jed W. Pitera e Vijay S. Pande, Kinetic Computational Alanine Scanning: Application to p53 Oligomerization, in Journal of Molecular Biology, vol. 357, n. 3, 2006, pp. 1039-1049, DOI:10.1016/j.jmb.2005.12.083, PMID 16457841.
Mauro B. Almeida, José Luiz Martins Do Nascimento, Anderson Manoel Herculano e Maria Elena Crespo-López, Molecular chaperones: Toward new therapeutic tools, in Biomedicine & Pharmacotherapy, vol. 65, n. 4, 2011, pp. 239-243, DOI:10.1016/j.biopha.2011.04.025, PMID 21737228.
Aron M. Levin, Darren L. Bates, Aaron M. Ring, Carsten Krieg, Jack T. Lin, Leon Su, Ignacio Moraga, Miro E. Raeber, Gregory R. Bowman, Paul Novick, Vijay S. Pande, C. Garrison Fathman, Onur Boyman e K. Christopher Garcia, Exploiting a natural conformational switch to engineer an interleukin-2 'superkine', in Nature, vol. 484, n. 7395, 2012, pp. 529-533, DOI:10.1038/nature10975, PMC 3338870, PMID 22446627.
Frank Rauch e Francis H. Glorieux, Osteogenesis imperfecta, in The Lancet, vol. 363, n. 9418, 2004, pp. 1377-1385, DOI:10.1016/S0140-6736(04)16051-0, PMID 15110498.
Alfonso Gautieri, Sebastien Uzel, Simone Vesentini, Alberto Redaelli e Markus J. Buehler, Molecular and Mesoscale Mechanisms of Osteogenesis Imperfecta Disease in Collagen Fibrils, in Biophysical Journal, vol. 97, n. 3, 2009, pp. 857-865, DOI:10.1016/j.bpj.2009.04.059, PMC 2718154, PMID 19651044.
Sanghyun Park, Randall J. Radmer, Teri E. Klein e Vijay S. Pande, A new set of molecular mechanics parameters for hydroxyproline and its use in molecular dynamics simulations of collagen-like peptides, in Journal of Computational Chemistry, vol. 26, n. 15, 2005, pp. 1612-1616, DOI:10.1002/jcc.20301, PMID 16170799.
Hana Robson Marsden, Itsuro Tomatsu e Alexander Kros, Model systems for membrane fusion, in Chem. Soc. Rev, vol. 40, n. 3, 2011, pp. 1572-1585, DOI:10.1039/c0cs00115e, PMID 21152599.
P. M. Kasson, A. Zomorodian, S. Park, N. Singhal, L. J. Guibas e V. S. Pande, Persistent voids: A new structural metric for membrane fusion, in Bioinformatics, vol. 23, n. 14, 2007, pp. 1753-1759, DOI:10.1093/bioinformatics/btm250, PMID 17488753.
Peter M. Kasson, Daniel L. Ensign e Vijay S. Pande, Combining Molecular Dynamics with Bayesian Analysis to Predict and Evaluate Ligand-Binding Mutations in Influenza Hemagglutinin, in Journal of the American Chemical Society, vol. 131, n. 32, 2009, pp. 11338-11340, DOI:10.1021/ja904557w, PMC 2737089, PMID 19637916.
Guha Jayachandran, Michael R. Shirts, Sanghyun Park e Vijay S. Pande, Parallelized-over-parts computation of absolute binding free energy with docking and molecular dynamics, in The Journal of Chemical Physics, vol. 125, n. 8, 2006, p. 084901, DOI:10.1063/1.2221680, PMID 16965051.
G. R. Bowman e P. L. Geissler, Equilibrium fluctuations of a single folded protein reveal a multitude of potential cryptic allosteric sites, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 109, n. 29, 2012, pp. 11681-11686, DOI:10.1073/pnas.1209309109, PMC 3406870, PMID 22753506.
P. M. Petrone, C. D. Snow, D. Lucent e V. S. Pande, Side-chain recognition and gating in the ribosome exit tunnel, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 105, n. 43, 2008, pp. 16549-16554, DOI:10.1073/pnas.0801795105, PMC 2575457, PMID 18946046.
Michael Gross, Folding research recruits unconventional help, in Current Biology, vol. 22, n. 2, 2012, pp. R35–R38, DOI:10.1016/j.cub.2012.01.008.
Adam L. Beberg, Daniel L. Ensign, Guha Jayachandran, Siraj Khaliq e Vijay S. Pande, Folding@home: Lessons from eight years of volunteer distributed computing, in 2009 IEEE International Symposium on Parallel & Distributed Processing, 2009, pp. 1-8, DOI:10.1109/IPDPS.2009.5160922, ISBN 978-1-4244-3751-1.
Carsten Kutzner, David Van Der Spoel, Martin Fechner, Erik Lindahl, Udo W. Schmitt, Bert L. De Groot e Helmut Grubmüller, Speeding up parallel GROMACS on high-latency networks, in Journal of Computational Chemistry, vol. 28, n. 12, 2007, pp. 2075-2084, DOI:10.1002/jcc.20703, PMID 17405124.
Berk Hess, Carsten Kutzner, David Van Der Spoel e Erik Lindahl, GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation, in Journal of Chemical Theory and Computation, vol. 4, n. 3, 2008, pp. 435-447, DOI:10.1021/ct700301q, PMID 26620784.
Accelerating molecular dynamic simulation on graphics processing units, in Journal of Computational Chemistry, vol. 30, n. 6, 2009, pp. 864-872, DOI:10.1002/jcc.21209, PMC 2724265, PMID 19191337.
Phineus R. L. Markwick e J. Andrew McCammon, Studying functional dynamics in bio-molecules using accelerated molecular dynamics, in Physical Chemistry Chemical Physics, vol. 13, n. 45, 2011, pp. 20053-65, DOI:10.1039/C1CP22100K, PMID 22015376.
M. Shirts e V. S. Pande, COMPUTING: Screen Savers of the World Unite!, in Science, vol. 290, n. 5498, 2000, pp. 1903-1904, DOI:10.1126/science.290.5498.1903, PMID 17742054.
John D. Owens, David Luebke, Naga Govindaraju, Mark Harris, Jens Krüger, Aaron E. Lefohn e Timothy J. Purcell, A Survey of General-Purpose Computation on Graphics Hardware, in Computer Graphics Forum, vol. 26, 2007, pp. 80-113, DOI:10.1111/j.1467-8659.2007.01012.x.
Peter Eastman e Vijay Pande, OpenMM: A Hardware-Independent Framework for Molecular Simulations, in Computing in Science & Engineering, vol. 12, n. 4, 2010, pp. 34-39, DOI:10.1109/MCSE.2010.27, PMC 4486654, PMID 26146490.
Imran S. Haque e Vijay S. Pande, Hard Data on Soft Errors: A Large-Scale Assessment of Real-World Error Rates in GPGPU, in 2010 10th IEEE/ACM International Conference on Cluster, Cloud and Grid Computing, 2010, pp. 691-696, DOI:10.1109/CCGRID.2010.84, ISBN 978-1-4244-6987-1.
Travis Desell, Anthony Waters, Malik Magdon-Ismail, Boleslaw K. Szymanski, Carlos A. Varela, Matthew Newby, Heidi Newberg, Andreas Przystawik e David Anderson (2009). "Accelerating the MilkyWay@Home volunteer computing project with GPUs". 8th International Conference on Parallel Processing and Applied Mathematics (PPAM 2009) Part I. pp. 276–288. doi:10.1.1.158.7614. ISBN 978-3-642-14389-2.
Edgar Luttmann, Daniel L. Ensign, Vishal Vaidyanathan, Mike Houston, Noam Rimon, Jeppe Øland, Guha Jayachandran, Mark Friedrichs e Vijay S. Pande, Accelerating molecular dynamic simulation on the cell processor and Playstation 3, in Journal of Computational Chemistry, vol. 30, n. 2, 2009, pp. 268-274, DOI:10.1002/jcc.21054, PMID 18615421.
Daniel L. Ensign, Peter M. Kasson e Vijay S. Pande, Heterogeneity Even at the Speed Limit of Folding: Large-scale Molecular Dynamics Study of a Fast-folding Variant of the Villin Headpiece, in Journal of Molecular Biology, vol. 374, n. 3, 2007, pp. 806-816, DOI:10.1016/j.jmb.2007.09.069, PMC 3689540, PMID 17950314.
Marc F. Lensink, Raúl Méndez e Shoshana J. Wodak, Docking and scoring protein complexes: CAPRI 3rd Edition, in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, vol. 69, n. 4, 2007, pp. 704-718, DOI:10.1002/prot.21804, PMID 17918726.
Gregory R. Bowman e Vijay S. Pande, Simulated tempering yields insight into the low-resolution Rosetta scoring functions, in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, vol. 74, n. 3, 2009, pp. 777-788, DOI:10.1002/prot.22210, PMID 18767152.
Gregory R. Bowman e Vijay S. Pande, The Roles of Entropy and Kinetics in Structure Prediction, in PLOS ONE, vol. 4, n. 6, 2009, pp. e5840, DOI:10.1371/journal.pone.0005840, PMC 2688754, PMID 19513117.
Thomas J. Lane, Gregory R. Bowman, Kyle Beauchamp, Vincent A. Voelz e Vijay S. Pande, Markov State Model Reveals Folding and Functional Dynamics in Ultra-Long MD Trajectories, in Journal of the American Chemical Society, vol. 133, n. 45, 2011, pp. 18413-18419, DOI:10.1021/ja207470h, PMC 3227799, PMID 21988563.
David E. Shaw, Kevin J. Bowers, Edmond Chow, Michael P. Eastwood, Douglas J. Ierardi, John L. Klepeis, Jeffrey S. Kuskin, Richard H. Larson, Kresten Lindorff-Larsen, Paul Maragakis, Mark A. Moraes, Ron O. Dror, Stefano Piana, Yibing Shan, Brian Towles, John K. Salmon, J. P. Grossman, Kenneth M. MacKenzie, Joseph A. Bank, Cliff Young, Martin M. Deneroff e Brannon Batson, Millisecond-scale molecular dynamics simulations on Anton, in Proceedings of the Conference on High Performance Computing Networking, Storage and Analysis - SC '09, 2009, p. 1, DOI:10.1145/1654059.1654099, ISBN 978-1-60558-744-8.
D. E. Shaw, P. Maragakis, K. Lindorff-Larsen, S. Piana, R. O. Dror, M. P. Eastwood, J. A. Bank, J. M. Jumper, J. K. Salmon, Y. Shan e W. Wriggers, Atomic-Level Characterization of the Structural Dynamics of Proteins, in Science, vol. 330, n. 6002, 2010, pp. 341-346, DOI:10.1126/science.1187409, PMID 20947758.
David E. Shaw, Jack C. Chao, Michael P. Eastwood, Joseph Gagliardo, J. P. Grossman, C. Richard Ho, Douglas J. Lerardi, István Kolossváry, John L. Klepeis, Timothy Layman, Christine McLeavey, Martin M. Deneroff, Mark A. Moraes, Rolf Mueller, Edward C. Priest, Yibing Shan, Jochen Spengler, Michael Theobald, Brian Towles, Stanley C. Wang, Ron O. Dror, Jeffrey S. Kuskin, Richard H. Larson, John K. Salmon, Cliff Young, Brannon Batson e Kevin J. Bowers, Anton, a special-purpose machine for molecular dynamics simulation, in Communications of the ACM, vol. 51, n. 7, 2008, p. 91, DOI:10.1145/1364782.1364802.
Ron O. Dror, Robert M. Dirks, J.P. Grossman, Huafeng Xu e David E. Shaw, Biomolecular Simulation: A Computational Microscope for Molecular Biology, in Annual Review of Biophysics, vol. 41, 2012, pp. 429-452, DOI:10.1146/annurev-biophys-042910-155245, PMID 22577825.

extremeoverclocking.com (Global: low place; Italian: low place)

forums.extremeoverclocking.com

"Official Extreme Overclocking Folding@home Team Forum". forums.extremeoverclocking.com. Extreme Overclocking. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

foldingathome.org (Global: low place; Italian: low place)

(EN) Project Timeline – Folding@home, su foldingathome.org. URL consultato il 21 agosto 2018.

foldingforum.org (Global: low place; Italian: low place)

Christian "schwancr" Schwantes (membro del Pande lab) (15 agosto 2011). "Projects 7808 and 7809 to full fah". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 16 ottobre, 2011.
Vijay Pande (25 ottobre 2011). "Re: Suggested Changes to F@h Website". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 25 ottobre 2011.
yslin (membro del Pande lab) (22 luglio 2011). "New project p6871 [Classic]". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 17 marzo 2012.(richiesta registrazione)
Diwakar Shukla (membro del Pande lab) (10 febbraio 2012). "Project 8021 released to beta". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 17 marzo 2012. (È richiesta la registrazione)
TJ Lane (membro del Pande lab) (8 giugno 2011). "Project 7600 in Beta". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 27 settembre 2011. (È richiesta la registrazione)
Gregory Bowman (membro Pande lab). "Project 10125". Folding@home. phpBB Group. Estratto il 2 dicembre 2011. (È richiesta la registrazione)
Peter Kasson (membro del Pande lab) (24 gennaio 2010). "upcoming release of SMP2 cores". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 30 settembre 2011.
Bruce Borden (7 agosto 2011). "Re: Gromacs Cannot Continue Further". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 agosto 2011.
PantherX (1º ottobre 2011). "Re: Project 6803: (Run 4, Clone 66, Gen 255)". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 9 ottobre 2011.
PantherX (31 ottobre 2010). "Troubleshooting Bad WUs". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 agosto 2011.
PantherX (2 settembre 2010). "Re: Can Folding@home damage any part of my PC?". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 25 febbraio, 2012.
Vijay Pande (28 giugno 2008). "Folding@home's End User License Agreement (EULA)". Folding@home. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 15 maggio, 2012.
Joseph Coffland (CEO di Cauldron Development LLC & capo sviluppatore a Folding@home) (13 ottobre 2011). "Re: FAHClient V7.1.38 released (4th Open-Beta)". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 15 ottobre 2011.
"NVIDIA GPU3 Linux/Wine Headless Install Guide". Folding@home. phpBB Group. 8 novembre 2008. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 5 settembre 2011.
Peter Kasson (membro del Pande lab) (15 luglio, 2009). "new release: extra-large work units". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 9 ottobre 2011.
TJ Lane (membro del Pande lab) (6 giugno 2011). "Project 7610 & 7611 in Beta". Folding@home. phpBB Group. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 25 febbraio, 2012. (È richiesta la registrazione)

gizmodo.com (Global: 763^rd place; Italian: 716^th place)

Elaine Chow (18 settembre 2008). "PS3 News Service, Life With Playstation, Now Up For Download". Gizmodo.com. Gizmodo. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

guinnessworldrecords.com (Global: 873^rd place; Italian: 611^th place)

"Most powerful distributed computing network". Guinnessworldrecords.com. Guinness World Records. 16 settembre 2007. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

longecity.org (Global: low place; Italian: low place)

"3 PetaFLOP barrier". longecity.org. Longecity. 19 agosto 2008. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.
"Crossing the 5 petaFLOPS barrier". longecity.org. Longecity. 18 febbraio 2009. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

massey.ac.nz (Global: low place; Italian: low place)

cs-alb-pc3.massey.ac.nz

Dragan Zakic (maggio 2009). "Community Grid Computing — Studies in Parallel and Distributed Systems" Archiviato il 23 marzo 2012 in Internet Archive.. Massey University College of Sciences. Massey University. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

maximumpc.com (Global: low place; Italian: low place)

mah3, Vijay Pande (24 settembre 2004). "F@H project publishes results of cancer related research". MaximumPC.com. Future US, Inc. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 20 settembre, 2012. A nostra conoscenza, questo è il primo programma con risultati a revisione paritaria di un progetto di calcolo distribuito legato al cancro.
Norman Chan (6 aprile, 2009). "Help Maximum PC's Folding Team Win the Next Chimp Challenge!". Maximumpc.com. Future US, Inc. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

mb.com.ph (Global: 1,172^nd place; Italian: 4,466^th place)

Jerry Liao (23 marzo 2007). "The Home Cure: PlayStation 3 to Help Study Causes of Cancer". mb.com. Manila Bulletin Publishing Corporation. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

medicalxpress.com (Global: low place; Italian: low place)

"Scientists boost potency, reduce side effects of IL-2 protein used to treat cancer". MedicalXpress.com. Medical Xpress. 18 marzo 2012. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 20 settembre, 2012.

n4g.com (Global: low place; Italian: low place)

"Folding@home reach 2 Petaflops". n4g.com. HAVAmedia. 8 maggio 2008. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

nih.gov (Global: 5^th place; Italian: 6^th place)

ncbi.nlm.nih.gov

Vijay S. Pande, Kyle Beauchamp e Gregory R. Bowman, Everything you wanted to know about Markov State Models but were afraid to ask, in Methods, vol. 52, n. 1, 2010, pp. 99-105, DOI:10.1016/j.ymeth.2010.06.002, PMC 2933958, PMID 20570730.
Vincent A. Voelz, Gregory R. Bowman, Kyle Beauchamp e Vijay S. Pande, Molecular Simulation of ab Initio Protein Folding for a Millisecond Folder NTL9(1−39), in Journal of the American Chemical Society, vol. 132, n. 5, 10 febbraio 2010, pp. 1526-1528, DOI:10.1021/ja9090353, ISSN 0002-7863 (WC · ACNP), PMC 2835335, PMID 20070076.
G. R. Bowman e V. S. Pande, Protein folded states are kinetic hubs, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 107, n. 24, 15 giugno 2010, pp. 10890-10895, DOI:10.1073/pnas.1003962107, ISSN 0027-8424 (WC · ACNP), PMC 2890711, PMID 20534497.
Christopher D. Snow, Houbi Nguyen, Vijay S. Pande e Martin Gruebele, Absolute comparison of simulated and experimental protein-folding dynamics, in Nature, vol. 420, n. 6911, --, pp. 102-106, DOI:10.1038/nature01160, ISSN 0028-0836 (WC · ACNP), PMID 12422224.
Fabrizio Marinelli, Fabio Pietrucci, Alessandro Laio e Stefano Piana, A Kinetic Model of Trp-Cage Folding from Multiple Biased Molecular Dynamics Simulations, in PLoS Computational Biology, vol. 5, n. 8, 7 agosto 2009, pp. e1000452, DOI:10.1371/journal.pcbi.1000452, ISSN 1553-7358 (WC · ACNP), PMC 2711228, PMID 19662155.
So Much More to Know, in Science, vol. 309, n. 5731, 1º luglio 2005, pp. 78b–102b, DOI:10.1126/science.309.5731.78b, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 15994524.
Heath Ecroyd e John A. Carver, Unraveling the mysteries of protein folding and misfolding, in Iubmb Life, vol. 60, n. 12, 2008, pp. 769-774, DOI:10.1002/iub.117, PMID 18767168.
Protein folding: Then and now, in Archives of Biochemistry and Biophysics, vol. 469, n. 1, 2008, pp. 4-19, DOI:10.1016/j.abb.2007.05.014, PMC 2173875, PMID 17585870.
Christopher D. Snow, Eric J. Sorin, Young Min Rhee e Vijay S. Pande, How Well Can Simulation Predict Protein Folding Kinetics and Thermodynamics?, in Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure, vol. 34, 2005, pp. 43-69, DOI:10.1146/annurev.biophys.34.040204.144447, PMID 15869383.
Vijay S. Pande, Ian Baker, Jarrod Chapman, Sidney P. Elmer, Siraj Khaliq, Stefan M. Larson, Young Min Rhee, Michael R. Shirts, Christopher D. Snow, Eric J. Sorin e Bojan Zagrovic, Atomistic protein folding simulations on the submillisecond time scale using worldwide distributed computing, in Biopolymers, vol. 68, n. 1, 2003, pp. 91-109, DOI:10.1002/bip.10219, PMID 12579582.
Gregory R. Bowman, Vincent A. Voelz e Vijay S. Pande, Taming the complexity of protein folding, in Current Opinion in Structural Biology, vol. 21, n. 1, 2011, pp. 4-11, DOI:10.1016/j.sbi.2010.10.006, PMC 3042729, PMID 21081274.
Robert B. Best, Atomistic molecular simulations of protein folding, in Current Opinion in Structural Biology, vol. 22, n. 1, 2012, pp. 52-61, DOI:10.1016/j.sbi.2011.12.001, PMID 22257762.
Gregory R. Bowman, Daniel L. Ensign e Vijay S. Pande, Enhanced Modeling via Network Theory: Adaptive Sampling of Markov State Models, in Journal of Chemical Theory and Computation, vol. 6, n. 3, 2010, pp. 787-794, DOI:10.1021/ct900620b, PMC 3637129, PMID 23626502.
K. A. Beauchamp, D. L. Ensign, R. Das e V. S. Pande, Quantitative comparison of villin headpiece subdomain simulations and triplet-triplet energy transfer experiments, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 108, n. 31, 2011, pp. 12734-12739, DOI:10.1073/pnas.1010880108, PMC 3150881, PMID 21768345.
Fred E. Cohen e Jeffery W. Kelly, Therapeutic approaches to protein-misfolding diseases, in Nature, vol. 426, n. 6968, 2003, pp. 905-909, DOI:10.1038/nature02265, PMID 14685252.
C. M. Song, S. J. Lim e J. C. Tong, Recent advances in computer-aided drug design, in Briefings in Bioinformatics, vol. 10, n. 5, 2009, pp. 579-591, DOI:10.1093/bib/bbp023, PMID 19433475.
D. Lucent, V. Vishal e V. S. Pande, Protein folding under confinement: A role for solvent, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 104, n. 25, 2007, pp. 10430-10434, DOI:10.1073/pnas.0608256104, PMC 1965530, PMID 17563390.
Vincent A. Voelz, Vijay R. Singh, William J. Wedemeyer, Lisa J. Lapidus e Vijay S. Pande, Unfolded-State Dynamics and Structure of Protein L Characterized by Simulation and Experiment, in Journal of the American Chemical Society, vol. 132, n. 13, 2010, pp. 4702-4709, DOI:10.1021/ja908369h, PMC 2853762, PMID 20218718.
Caroline Hadley, Biologists think bigger, in EMBO Reports, vol. 5, n. 3, 2004, pp. 236-238, DOI:10.1038/sj.embor.7400108, PMC 1299019, PMID 14993921.
G. Brent Irvine, Omar M. El-Agnaf, Ganesh M. Shankar e Dominic M. Walsh, Protein Aggregation in the Brain: The Molecular Basis for Alzheimer's and Parkinson's Diseases, in Molecular Medicine, vol. 14, 7–8, 2008, pp. 451-464, DOI:10.2119/2007-00100.Irvine, PMC 2274891, PMID 18368143.
Claudio Soto e Lisbell D. Estrada, Protein Misfolding and Neurodegeneration, in Archives of Neurology, vol. 65, n. 2, 2008, pp. 184-9, DOI:10.1001/archneurol.2007.56, PMID 18268186.
Robin Roychaudhuri, Mingfeng Yang, Minako M. Hoshi e David B. Teplow, Amyloid β-Protein Assembly and Alzheimer Disease, in Journal of Biological Chemistry, vol. 284, n. 8, 2009, pp. 4749-4753, DOI:10.1074/jbc.R800036200, PMC 3837440, PMID 18845536.
Nicholas W. Kelley, V. Vishal, Grant A. Krafft e Vijay S. Pande, Simulating oligomerization at experimental concentrations and long timescales: A Markov state model approach, in The Journal of Chemical Physics, vol. 129, n. 21, 2008, p. 214707, DOI:10.1063/1.3010881, PMC 2674793, PMID 19063575.
Jayakumar Rajadas, Corey W. Liu, Paul Novick, Nicholas W. Kelley, Mohammed Inayathullah, Melburne C. Lemieux e Vijay S. Pande, Rationally Designed Turn Promoting Mutation in the Amyloid-β Peptide Sequence Stabilizes Oligomers in Solution, in PLOS ONE, vol. 6, n. 7, 2011, pp. e21776, DOI:10.1371/journal.pone.0021776, PMC 3142112, PMID 21799748.
Aabgeena Naeem e Naveed Ahmad Fazili, Defective Protein Folding and Aggregation as the Basis of Neurodegenerative Diseases: The Darker Aspect of Proteins, in Cell Biochemistry and Biophysics, vol. 61, n. 2, 2011, pp. 237-250, DOI:10.1007/s12013-011-9200-x, PMID 21573992.
Gregory R. Bowman, Xuhui Huang e Vijay S. Pande, Network models for molecular kinetics and their initial applications to human health, in Cell Research, vol. 20, n. 6, 2010, pp. 622-630, DOI:10.1038/cr.2010.57, PMC 4441225, PMID 20421891.
Paul A. Novick, Dahabada H. Lopes, Kim M. Branson, Alexandra Esteras-Chopo, Isabella A. Graef, Gal Bitan e Vijay S. Pande, Design of β-Amyloid Aggregation Inhibitors from a Predicted Structural Motif, in Journal of Medicinal Chemistry, vol. 55, n. 7, 2012, pp. 3002-3010, DOI:10.1021/jm201332p, PMC 3766731, PMID 22420626.
Francis O. Walker, Huntington's disease, in The Lancet, vol. 369, n. 9557, 2007, pp. 218-228, DOI:10.1016/S0140-6736(07)60111-1, PMID 17240289.
Nicholas W. Kelley, Xuhui Huang, Stephen Tam, Christoph Spiess, Judith Frydman e Vijay S. Pande, The Predicted Structure of the Headpiece of the Huntingtin Protein and its Implications on Huntingtin Aggregation, in Journal of Molecular Biology, vol. 388, n. 5, 2009, pp. 919-927, DOI:10.1016/j.jmb.2009.01.032, PMC 2677131, PMID 19361448.
Susan W. Liebman e Stephen C. Meredith, Protein folding: Sticky N17 speeds huntingtin pile-up, in Nature Chemical Biology, vol. 6, n. 1, 2010, pp. 7-8, DOI:10.1038/nchembio.279, PMID 20016493.
M. Hollstein, D. Sidransky, B. Vogelstein e C. Harris, P53 mutations in human cancers, in Science, vol. 253, n. 5015, 1991, pp. 49-53, DOI:10.1126/science.1905840, PMID 1905840.
Lillian T. Chong, Christopher D. Snow, Young Min Rhee e Vijay S. Pande, Dimerization of the p53 Oligomerization Domain: Identification of a Folding Nucleus by Molecular Dynamics Simulations, in Journal of Molecular Biology, vol. 345, n. 4, 2005, pp. 869-878, DOI:10.1016/j.jmb.2004.10.083, PMID 15588832.
Lillian T. Chong, William C. Swope, Jed W. Pitera e Vijay S. Pande, Kinetic Computational Alanine Scanning: Application to p53 Oligomerization, in Journal of Molecular Biology, vol. 357, n. 3, 2006, pp. 1039-1049, DOI:10.1016/j.jmb.2005.12.083, PMID 16457841.
Mauro B. Almeida, José Luiz Martins Do Nascimento, Anderson Manoel Herculano e Maria Elena Crespo-López, Molecular chaperones: Toward new therapeutic tools, in Biomedicine & Pharmacotherapy, vol. 65, n. 4, 2011, pp. 239-243, DOI:10.1016/j.biopha.2011.04.025, PMID 21737228.
Aron M. Levin, Darren L. Bates, Aaron M. Ring, Carsten Krieg, Jack T. Lin, Leon Su, Ignacio Moraga, Miro E. Raeber, Gregory R. Bowman, Paul Novick, Vijay S. Pande, C. Garrison Fathman, Onur Boyman e K. Christopher Garcia, Exploiting a natural conformational switch to engineer an interleukin-2 'superkine', in Nature, vol. 484, n. 7395, 2012, pp. 529-533, DOI:10.1038/nature10975, PMC 3338870, PMID 22446627.
Frank Rauch e Francis H. Glorieux, Osteogenesis imperfecta, in The Lancet, vol. 363, n. 9418, 2004, pp. 1377-1385, DOI:10.1016/S0140-6736(04)16051-0, PMID 15110498.
Alfonso Gautieri, Sebastien Uzel, Simone Vesentini, Alberto Redaelli e Markus J. Buehler, Molecular and Mesoscale Mechanisms of Osteogenesis Imperfecta Disease in Collagen Fibrils, in Biophysical Journal, vol. 97, n. 3, 2009, pp. 857-865, DOI:10.1016/j.bpj.2009.04.059, PMC 2718154, PMID 19651044.
Sanghyun Park, Randall J. Radmer, Teri E. Klein e Vijay S. Pande, A new set of molecular mechanics parameters for hydroxyproline and its use in molecular dynamics simulations of collagen-like peptides, in Journal of Computational Chemistry, vol. 26, n. 15, 2005, pp. 1612-1616, DOI:10.1002/jcc.20301, PMID 16170799.
Hana Robson Marsden, Itsuro Tomatsu e Alexander Kros, Model systems for membrane fusion, in Chem. Soc. Rev, vol. 40, n. 3, 2011, pp. 1572-1585, DOI:10.1039/c0cs00115e, PMID 21152599.
P. M. Kasson, A. Zomorodian, S. Park, N. Singhal, L. J. Guibas e V. S. Pande, Persistent voids: A new structural metric for membrane fusion, in Bioinformatics, vol. 23, n. 14, 2007, pp. 1753-1759, DOI:10.1093/bioinformatics/btm250, PMID 17488753.
Peter M. Kasson, Daniel L. Ensign e Vijay S. Pande, Combining Molecular Dynamics with Bayesian Analysis to Predict and Evaluate Ligand-Binding Mutations in Influenza Hemagglutinin, in Journal of the American Chemical Society, vol. 131, n. 32, 2009, pp. 11338-11340, DOI:10.1021/ja904557w, PMC 2737089, PMID 19637916.
Peter M. Kasson, Vijay S. Pande (2009). "Combining mutual information with structural analysis to screen for functionally important residues in influenza hemagglutinin". Pacific Symposium on Biocomputing: 492–503. PMC 2811693. PMID 19209725.
Guha Jayachandran, Michael R. Shirts, Sanghyun Park e Vijay S. Pande, Parallelized-over-parts computation of absolute binding free energy with docking and molecular dynamics, in The Journal of Chemical Physics, vol. 125, n. 8, 2006, p. 084901, DOI:10.1063/1.2221680, PMID 16965051.
G. R. Bowman e P. L. Geissler, Equilibrium fluctuations of a single folded protein reveal a multitude of potential cryptic allosteric sites, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 109, n. 29, 2012, pp. 11681-11686, DOI:10.1073/pnas.1209309109, PMC 3406870, PMID 22753506.
P. M. Petrone, C. D. Snow, D. Lucent e V. S. Pande, Side-chain recognition and gating in the ribosome exit tunnel, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 105, n. 43, 2008, pp. 16549-16554, DOI:10.1073/pnas.0801795105, PMC 2575457, PMID 18946046.
Carsten Kutzner, David Van Der Spoel, Martin Fechner, Erik Lindahl, Udo W. Schmitt, Bert L. De Groot e Helmut Grubmüller, Speeding up parallel GROMACS on high-latency networks, in Journal of Computational Chemistry, vol. 28, n. 12, 2007, pp. 2075-2084, DOI:10.1002/jcc.20703, PMID 17405124.
Berk Hess, Carsten Kutzner, David Van Der Spoel e Erik Lindahl, GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation, in Journal of Chemical Theory and Computation, vol. 4, n. 3, 2008, pp. 435-447, DOI:10.1021/ct700301q, PMID 26620784.
Accelerating molecular dynamic simulation on graphics processing units, in Journal of Computational Chemistry, vol. 30, n. 6, 2009, pp. 864-872, DOI:10.1002/jcc.21209, PMC 2724265, PMID 19191337.
Phineus R. L. Markwick e J. Andrew McCammon, Studying functional dynamics in bio-molecules using accelerated molecular dynamics, in Physical Chemistry Chemical Physics, vol. 13, n. 45, 2011, pp. 20053-65, DOI:10.1039/C1CP22100K, PMID 22015376.
M. Shirts e V. S. Pande, COMPUTING: Screen Savers of the World Unite!, in Science, vol. 290, n. 5498, 2000, pp. 1903-1904, DOI:10.1126/science.290.5498.1903, PMID 17742054.
Peter Eastman e Vijay Pande, OpenMM: A Hardware-Independent Framework for Molecular Simulations, in Computing in Science & Engineering, vol. 12, n. 4, 2010, pp. 34-39, DOI:10.1109/MCSE.2010.27, PMC 4486654, PMID 26146490.
Edgar Luttmann, Daniel L. Ensign, Vishal Vaidyanathan, Mike Houston, Noam Rimon, Jeppe Øland, Guha Jayachandran, Mark Friedrichs e Vijay S. Pande, Accelerating molecular dynamic simulation on the cell processor and Playstation 3, in Journal of Computational Chemistry, vol. 30, n. 2, 2009, pp. 268-274, DOI:10.1002/jcc.21054, PMID 18615421.
Daniel L. Ensign, Peter M. Kasson e Vijay S. Pande, Heterogeneity Even at the Speed Limit of Folding: Large-scale Molecular Dynamics Study of a Fast-folding Variant of the Villin Headpiece, in Journal of Molecular Biology, vol. 374, n. 3, 2007, pp. 806-816, DOI:10.1016/j.jmb.2007.09.069, PMC 3689540, PMID 17950314.
Marc F. Lensink, Raúl Méndez e Shoshana J. Wodak, Docking and scoring protein complexes: CAPRI 3rd Edition, in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, vol. 69, n. 4, 2007, pp. 704-718, DOI:10.1002/prot.21804, PMID 17918726.
Gregory R. Bowman e Vijay S. Pande, Simulated tempering yields insight into the low-resolution Rosetta scoring functions, in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, vol. 74, n. 3, 2009, pp. 777-788, DOI:10.1002/prot.22210, PMID 18767152.
Gregory R. Bowman e Vijay S. Pande, The Roles of Entropy and Kinetics in Structure Prediction, in PLOS ONE, vol. 4, n. 6, 2009, pp. e5840, DOI:10.1371/journal.pone.0005840, PMC 2688754, PMID 19513117.
Thomas J. Lane, Gregory R. Bowman, Kyle Beauchamp, Vincent A. Voelz e Vijay S. Pande, Markov State Model Reveals Folding and Functional Dynamics in Ultra-Long MD Trajectories, in Journal of the American Chemical Society, vol. 133, n. 45, 2011, pp. 18413-18419, DOI:10.1021/ja207470h, PMC 3227799, PMID 21988563.
D. E. Shaw, P. Maragakis, K. Lindorff-Larsen, S. Piana, R. O. Dror, M. P. Eastwood, J. A. Bank, J. M. Jumper, J. K. Salmon, Y. Shan e W. Wriggers, Atomic-Level Characterization of the Structural Dynamics of Proteins, in Science, vol. 330, n. 6002, 2010, pp. 341-346, DOI:10.1126/science.1187409, PMID 20947758.
Ron O. Dror, Robert M. Dirks, J.P. Grossman, Huafeng Xu e David E. Shaw, Biomolecular Simulation: A Computational Microscope for Molecular Biology, in Annual Review of Biophysics, vol. 41, 2012, pp. 429-452, DOI:10.1146/annurev-biophys-042910-155245, PMID 22577825.

nvidia.com (Global: 2,958^th place; Italian: 4,892^nd place)

"NVIDIA Achieves Monumental Folding@home Milestone With Cuda". nvidia.com. NVIDIA Corporation. 26 agosto 2008. URL consultato 20 settembre, 2012.

oadoi.org (Global: 612^th place; Italian: 14^th place)

Christopher D. Snow, Houbi Nguyen, Vijay S. Pande e Martin Gruebele, Absolute comparison of simulated and experimental protein-folding dynamics, in Nature, vol. 420, n. 6911, --, pp. 102-106, DOI:10.1038/nature01160, ISSN 0028-0836 (WC · ACNP), PMID 12422224.
So Much More to Know, in Science, vol. 309, n. 5731, 1º luglio 2005, pp. 78b–102b, DOI:10.1126/science.309.5731.78b, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 15994524.
Heath Ecroyd e John A. Carver, Unraveling the mysteries of protein folding and misfolding, in Iubmb Life, vol. 60, n. 12, 2008, pp. 769-774, DOI:10.1002/iub.117, PMID 18767168.
Christopher D. Snow, Eric J. Sorin, Young Min Rhee e Vijay S. Pande, How Well Can Simulation Predict Protein Folding Kinetics and Thermodynamics?, in Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure, vol. 34, 2005, pp. 43-69, DOI:10.1146/annurev.biophys.34.040204.144447, PMID 15869383.
Vijay S. Pande, Ian Baker, Jarrod Chapman, Sidney P. Elmer, Siraj Khaliq, Stefan M. Larson, Young Min Rhee, Michael R. Shirts, Christopher D. Snow, Eric J. Sorin e Bojan Zagrovic, Atomistic protein folding simulations on the submillisecond time scale using worldwide distributed computing, in Biopolymers, vol. 68, n. 1, 2003, pp. 91-109, DOI:10.1002/bip.10219, PMID 12579582.
John D. Chodera, William C. Swope, Jed W. Pitera e Ken A. Dill, Long‐Time Protein Folding Dynamics from Short‐Time Molecular Dynamics Simulations, in Multiscale Modeling & Simulation, vol. 5, n. 4, 2006, pp. 1214-1226, DOI:10.1137/06065146X.
Robert B. Best, Atomistic molecular simulations of protein folding, in Current Opinion in Structural Biology, vol. 22, n. 1, 2012, pp. 52-61, DOI:10.1016/j.sbi.2011.12.001, PMID 22257762.
Fred E. Cohen e Jeffery W. Kelly, Therapeutic approaches to protein-misfolding diseases, in Nature, vol. 426, n. 6968, 2003, pp. 905-909, DOI:10.1038/nature02265, PMID 14685252.
C. M. Song, S. J. Lim e J. C. Tong, Recent advances in computer-aided drug design, in Briefings in Bioinformatics, vol. 10, n. 5, 2009, pp. 579-591, DOI:10.1093/bib/bbp023, PMID 19433475.
Claudio Soto e Lisbell D. Estrada, Protein Misfolding and Neurodegeneration, in Archives of Neurology, vol. 65, n. 2, 2008, pp. 184-9, DOI:10.1001/archneurol.2007.56, PMID 18268186.
Aabgeena Naeem e Naveed Ahmad Fazili, Defective Protein Folding and Aggregation as the Basis of Neurodegenerative Diseases: The Darker Aspect of Proteins, in Cell Biochemistry and Biophysics, vol. 61, n. 2, 2011, pp. 237-250, DOI:10.1007/s12013-011-9200-x, PMID 21573992.
Francis O. Walker, Huntington's disease, in The Lancet, vol. 369, n. 9557, 2007, pp. 218-228, DOI:10.1016/S0140-6736(07)60111-1, PMID 17240289.
Susan W. Liebman e Stephen C. Meredith, Protein folding: Sticky N17 speeds huntingtin pile-up, in Nature Chemical Biology, vol. 6, n. 1, 2010, pp. 7-8, DOI:10.1038/nchembio.279, PMID 20016493.
Lillian T. Chong, Christopher D. Snow, Young Min Rhee e Vijay S. Pande, Dimerization of the p53 Oligomerization Domain: Identification of a Folding Nucleus by Molecular Dynamics Simulations, in Journal of Molecular Biology, vol. 345, n. 4, 2005, pp. 869-878, DOI:10.1016/j.jmb.2004.10.083, PMID 15588832.
Lillian T. Chong, William C. Swope, Jed W. Pitera e Vijay S. Pande, Kinetic Computational Alanine Scanning: Application to p53 Oligomerization, in Journal of Molecular Biology, vol. 357, n. 3, 2006, pp. 1039-1049, DOI:10.1016/j.jmb.2005.12.083, PMID 16457841.
Mauro B. Almeida, José Luiz Martins Do Nascimento, Anderson Manoel Herculano e Maria Elena Crespo-López, Molecular chaperones: Toward new therapeutic tools, in Biomedicine & Pharmacotherapy, vol. 65, n. 4, 2011, pp. 239-243, DOI:10.1016/j.biopha.2011.04.025, PMID 21737228.
Sanghyun Park, Randall J. Radmer, Teri E. Klein e Vijay S. Pande, A new set of molecular mechanics parameters for hydroxyproline and its use in molecular dynamics simulations of collagen-like peptides, in Journal of Computational Chemistry, vol. 26, n. 15, 2005, pp. 1612-1616, DOI:10.1002/jcc.20301, PMID 16170799.
P. M. Kasson, A. Zomorodian, S. Park, N. Singhal, L. J. Guibas e V. S. Pande, Persistent voids: A new structural metric for membrane fusion, in Bioinformatics, vol. 23, n. 14, 2007, pp. 1753-1759, DOI:10.1093/bioinformatics/btm250, PMID 17488753.
Guha Jayachandran, Michael R. Shirts, Sanghyun Park e Vijay S. Pande, Parallelized-over-parts computation of absolute binding free energy with docking and molecular dynamics, in The Journal of Chemical Physics, vol. 125, n. 8, 2006, p. 084901, DOI:10.1063/1.2221680, PMID 16965051.
Michael Gross, Folding research recruits unconventional help, in Current Biology, vol. 22, n. 2, 2012, pp. R35–R38, DOI:10.1016/j.cub.2012.01.008.
Carsten Kutzner, David Van Der Spoel, Martin Fechner, Erik Lindahl, Udo W. Schmitt, Bert L. De Groot e Helmut Grubmüller, Speeding up parallel GROMACS on high-latency networks, in Journal of Computational Chemistry, vol. 28, n. 12, 2007, pp. 2075-2084, DOI:10.1002/jcc.20703, PMID 17405124.
Berk Hess, Carsten Kutzner, David Van Der Spoel e Erik Lindahl, GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation, in Journal of Chemical Theory and Computation, vol. 4, n. 3, 2008, pp. 435-447, DOI:10.1021/ct700301q, PMID 26620784.
Phineus R. L. Markwick e J. Andrew McCammon, Studying functional dynamics in bio-molecules using accelerated molecular dynamics, in Physical Chemistry Chemical Physics, vol. 13, n. 45, 2011, pp. 20053-65, DOI:10.1039/C1CP22100K, PMID 22015376.
John D. Owens, David Luebke, Naga Govindaraju, Mark Harris, Jens Krüger, Aaron E. Lefohn e Timothy J. Purcell, A Survey of General-Purpose Computation on Graphics Hardware, in Computer Graphics Forum, vol. 26, 2007, pp. 80-113, DOI:10.1111/j.1467-8659.2007.01012.x.
Edgar Luttmann, Daniel L. Ensign, Vishal Vaidyanathan, Mike Houston, Noam Rimon, Jeppe Øland, Guha Jayachandran, Mark Friedrichs e Vijay S. Pande, Accelerating molecular dynamic simulation on the cell processor and Playstation 3, in Journal of Computational Chemistry, vol. 30, n. 2, 2009, pp. 268-274, DOI:10.1002/jcc.21054, PMID 18615421.
Marc F. Lensink, Raúl Méndez e Shoshana J. Wodak, Docking and scoring protein complexes: CAPRI 3rd Edition, in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, vol. 69, n. 4, 2007, pp. 704-718, DOI:10.1002/prot.21804, PMID 17918726.
Gregory R. Bowman e Vijay S. Pande, Simulated tempering yields insight into the low-resolution Rosetta scoring functions, in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, vol. 74, n. 3, 2009, pp. 777-788, DOI:10.1002/prot.22210, PMID 18767152.
David E. Shaw, Jack C. Chao, Michael P. Eastwood, Joseph Gagliardo, J. P. Grossman, C. Richard Ho, Douglas J. Lerardi, István Kolossváry, John L. Klepeis, Timothy Layman, Christine McLeavey, Martin M. Deneroff, Mark A. Moraes, Rolf Mueller, Edward C. Priest, Yibing Shan, Jochen Spengler, Michael Theobald, Brian Towles, Stanley C. Wang, Ron O. Dror, Jeffrey S. Kuskin, Richard H. Larson, John K. Salmon, Cliff Young, Brannon Batson e Kevin J. Bowers, Anton, a special-purpose machine for molecular dynamics simulation, in Communications of the ACM, vol. 51, n. 7, 2008, p. 91, DOI:10.1145/1364782.1364802.
Ron O. Dror, Robert M. Dirks, J.P. Grossman, Huafeng Xu e David E. Shaw, Biomolecular Simulation: A Computational Microscope for Molecular Biology, in Annual Review of Biophysics, vol. 41, 2012, pp. 429-452, DOI:10.1146/annurev-biophys-042910-155245, PMID 22577825.

playstation.com (Global: 857^th place; Italian: 868^th place)

blog.us.playstation.com

Eric Lempel (21 ottobre 2012). "PS3 System Software Update (v4.30)". PlayStation blog. Sony. dall'originale il 21 ottobre 2012. URL consultato 21 ottobre 2012.

playstation.com

"Termination of Life with PlayStation" Archiviato il 13 novembre 2012 in Internet Archive.. Life with PlayStation. Sony. 6 novembre 2012. dall'originale 8 novembre 2012. URL consultato 8 novembre 2012.

post-gazette.com (Global: 819^th place; Italian: 1,764^th place)

old.post-gazette.com

Lou Kesten, Associated Press (26 marzo 2007). "Week in video-game news: 'God of War II' storms the PS2; a PS3 research project" Archiviato il 20 giugno 2012 in Internet Archive.. Post-Gazette.com (Pittsburgh Post-Gazette). dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

psu.edu (Global: 299^th place; Italian: 1,600^th place)

citeseerx.ist.psu.edu

Travis Desell, Anthony Waters, Malik Magdon-Ismail, Boleslaw K. Szymanski, Carlos A. Varela, Matthew Newby, Heidi Newberg, Andreas Przystawik e David Anderson (2009). "Accelerating the MilkyWay@Home volunteer computing project with GPUs". 8th International Conference on Parallel Processing and Applied Mathematics (PPAM 2009) Part I. pp. 276–288. doi:10.1.1.158.7614. ISBN 978-3-642-14389-2.

simtk.org (Global: low place; Italian: low place)

"Greg Bowman awarded the 2010 Kuhn Paradigm Shift Award". simtk.org. SimTK: MSMBuilder. 29 marzo 2010. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 20 settembre, 2012.
"MSMBuilder Source Code Repository". MSMBuilder. simtk.org. 2012. dall'originale il 12 ottobre 2012. URL consultato il 12 maggio 2012.

stanford.edu (Global: 194^th place; Italian: 490^th place)

folding.stanford.edu

Pande lab (2 agosto 2012). "About Folding@home" Archiviato il 16 ottobre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. URL consultato il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (27 luglio 2012). "Recent Results and Research Papers from Folding@home". Folding@home. Stanford University. URL archiviato il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
TJ Lane, Gregory Bowman, Robert McGibbon, Christian Schwantes, Vijay Pande, and Bruce Borden (10 settembre 2012). "Folding@home Simulation FAQ" Archiviato il 13 settembre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
"Folding@home – Awards" Archiviato il 12 luglio 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. agosto 2011. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (30 maggio 2012). "Folding@home Diseases Studied FAQ" Archiviato il 25 agosto 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (2012). "Folding@home Press FAQ" Archiviato il 25 agosto 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (18 agosto 2011). "Folding@home Main FAQ" (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (4 aprile 2009). "Folding@home FLOP FAQ" Archiviato il 20 novembre 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (30 maggio 2012). "PS3 FAQ" Archiviato il 18 agosto 2013 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (20 agosto 2012). "Folding@home Points FAQ" Archiviato il 17 luglio 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (23 luglio 2012). "Folding@home Passkey FAQ" Archiviato il 22 settembre 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (2012). "Folding@home homepage" Archiviato l'8 settembre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. URL il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (11 giugno 2012). "Folding@home SMP FAQ" Archiviato il 22 settembre 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (7 agosto 2012). "Folding@home Frequently Asked Questions (FAQ) Index" Archiviato il 15 luglio 2013 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (19 agosto 2012). "Folding@home Petaflop Initiative" Archiviato il 13 luglio 2012 in Internet Archive.
Pande lab (10 febbraio 2011). "Windows Uniprocessor Client Installation Guide" Archiviato il 20 novembre 2012 in Internet Archive. (Guide). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (30 maggio 2012). "Uninstalling Folding@home Guide" Archiviato il 17 luglio 2012 in Internet Archive. (Guide). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab. "Folding@home Distributed Computing Client" Archiviato il 26 giugno 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (30 maggio 2012). "High Performance FAQ" Archiviato il 19 agosto 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (23 marzo 2012). "Windows (FAH V7) Installation Guide" Archiviato il 28 ottobre 2012 in Internet Archive. (Guide). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.

fah-web.stanford.edu

Pande lab. "Project 6871 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 27 settembre 2011.
Pande lab. "Project 180 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 27 settembre 2011.
TJ Lane (membro del Pande lab) (8 giugno 2011). "Project 7600 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 31 marzo 2012.
Pande lab. "Project 10721 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 27 settembre 2011.
Pande lab. "Project 5765 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 2 dicembre 2011.
Pande lab (aggiornato giornalmente). "Client Statistics by OS" Archiviato il 3 settembre 2015 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 28 novembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Folding@home developers. "FAHControl source code repository" Archiviato il 12 dicembre 2012 in Archive.is.. Stanford University. URL consultato 15 ottobre 2012.
aschofield and jcoffland (3 ottobre 2011). "Ticket #736 (Link to GPL in FAHControl)" Archiviato il 28 maggio 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Trac. dall'originale il 12 ottobre 2012. URL consultato il 12 maggio 2012.
Pande lab. "Project 7610 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 26 febbraio 2012.

stanford.edu

Vijay Pande, Stefan Larson (4 marzo 2002). "Genome@home Updates" Archiviato il 16 aprile 2004 in Internet Archive.. 15 aprile 2004. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.
Pande lab. "Folding@home Executive summary" Archiviato il 7 ottobre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 4 ottobre 2011.

biochem218.stanford.edu

William Ito. "A review of recent advances in ab initio protein folding by the Folding@home project". Stanford University. dall'originale il 22 settembre 2012. URL consultato 22 settembre 2012.

team52735.blogspot.com (Global: low place; Italian: low place)

"Increase in 'active' PS3 folders pushes Folding@home past 4 Petaflops!". team52735.blogspot.com. Blogspot. 29 settembre 2008. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.

Google (2007). "Your computer's idle time is too precious to waste". Archiviato dall'originale 11 giugno 2008. URL consultato 31 agosto, 2012.

top500.org (Global: 8,086^th place; Italian: 5,963^rd place)

"TOP500 List — June 2007" Archiviato il 24 giugno 2019 in Internet Archive.. top500.org. Top500. giugno 2007. URL consultato 20 settembre, 2012.
"TOP500 List — November 2008" Archiviato il 24 giugno 2019 in Internet Archive.. top500.org. TOP500. novembre 2008. URL consultato 20 settembre, 2012.

typepad.com (Global: 1,805^th place; Italian: 1,930^th place)

folding.typepad.com

Vijay Pande (June 8, 2012). "FAHcon 2012: Thinking about how far FAH has come". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Vijay Pande (23 aprile 2008). "Folding@home and Simbios". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 9 novembre 2011.
Vijay Pande (18 dicembre 2008). "New FAH results on possible new Alzheimer's drug presented". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 23 settembre 2011.
Vijay Pande (28 settembre 2007). "Nanomedicine center". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 23 settembre 2011.
Vijay Pande (22 dicembre 2009). "Release of new Protomol (Core B4) WUs". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 23 settembre 2011.
Vijay Pande (24 febbraio 2012). "Protein folding and viral infection". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 4 marzo 2012.
Vijay Pande (27 febbraio 2012). "New methods for computational drug design". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 1º aprile 2012.
Gregory Bowman (23 luglio 2012). "Searching for new drug targets". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 27 settembre 2011.
Vijay Pande (18 marzo 2009). "FLOPS". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 11 ottobre 2011.
Vijay Pande (28 novembre 2012). "New server stats reporting page". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 28 novembre 2012. URL consultato 28 novembre 2011.
Vijay Pande (16 settembre 2007). "Crossing the petaFLOPS barrier". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 28 agosto 2011.
Vijay Pande (18 febbraio, 2009). "Folding@home Passes the 5 petaFLOP Mark". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 31 agosto, 2011.
Vijay Pande (5 aprile 2011). "More transparency in testing". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 14 ottobre 2011.
Vijay Pande (25 settembre 2009). "Update on new FAH cores and clients". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 24 febbraio 2012.
Vijay Pande (17 giugno 2009). "How does FAH code development and sysadmin get done?". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 14 ottobre 2011.
Vijay Pande (23 maggio 2008). "GPU news (about GPU1, GPU2, & NVIDIA support)". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 8 settembre 2011.
Vijay Pande (15 aprile, 2008). "Updates to the Download page/GPU2 goes live". Folding@home. typepad.com. Archiviato dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 settembre 2011.
Vijay Pande (11 aprile 2008). "GPU2 open beta going well". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 settembre 2011.
Vijay Pande (24 aprile 2010). "Prepping for the GPU3 rolling: new client and NVIDIA FAH GPU clients will (in the future) need CUDA 2.2 or later". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 8 settembre 2011.
Vijay Pande (18 settembre 2008). "Life with Playstation – a new update to the FAH/PS3 client". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 24 febbraio 2012.
Vijay Pande (15 giugno 2008). "What does the SMP core do?". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 settembre 2011.
Vijay Pande (8 marzo 2008). "New Windows client/core development (SMP and classic clients)". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 30 settembre 2011.
Vijay Pande (7 febbraio 2012). "Update on "bigadv-16", the new bigadv rollout". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 9 febbraio 2012.
Vijay Pande (2 luglio 2011). "Change in the points system for bigadv work units". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 24 febbraio 2012.
Vijay Pande (29 marzo 2011). "Client version 7 now in open beta". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 14 agosto 2011.
Vijay Pande (31 marzo 2011). "Core 16 for ATI released; also note on NVIDIA GPU support for older boards". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 settembre 2011.
Vijay Pande (22 marzo 2012). "Web page revamp and v7 rollout". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 22 marzo 2012.
Vijay Pande (13 ottobre 2011). "Comparison between FAH and Anton's approaches". Folding@home. typepad.com. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 25 febbraio, 2012.

ubuntu.com (Global: 3,845^th place; Italian: 3,300^th place)

help.ubuntu.com

unikuser (7 agosto 2011). "FoldingAtHome". Ubuntu Documentation. help.ubuntu.com. dall'originale il 22 settembre 2012. URL consultato 22 settembre 2012.

unibo.it (Global: 3,746^th place; Italian: 288^th place)

acnpsearch.unibo.it

Vincent A. Voelz, Gregory R. Bowman, Kyle Beauchamp e Vijay S. Pande, Molecular Simulation of ab Initio Protein Folding for a Millisecond Folder NTL9(1−39), in Journal of the American Chemical Society, vol. 132, n. 5, 10 febbraio 2010, pp. 1526-1528, DOI:10.1021/ja9090353, ISSN 0002-7863 (WC · ACNP), PMC 2835335, PMID 20070076.
G. R. Bowman e V. S. Pande, Protein folded states are kinetic hubs, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 107, n. 24, 15 giugno 2010, pp. 10890-10895, DOI:10.1073/pnas.1003962107, ISSN 0027-8424 (WC · ACNP), PMC 2890711, PMID 20534497.
Christopher D. Snow, Houbi Nguyen, Vijay S. Pande e Martin Gruebele, Absolute comparison of simulated and experimental protein-folding dynamics, in Nature, vol. 420, n. 6911, --, pp. 102-106, DOI:10.1038/nature01160, ISSN 0028-0836 (WC · ACNP), PMID 12422224.
Fabrizio Marinelli, Fabio Pietrucci, Alessandro Laio e Stefano Piana, A Kinetic Model of Trp-Cage Folding from Multiple Biased Molecular Dynamics Simulations, in PLoS Computational Biology, vol. 5, n. 8, 7 agosto 2009, pp. e1000452, DOI:10.1371/journal.pcbi.1000452, ISSN 1553-7358 (WC · ACNP), PMC 2711228, PMID 19662155.
So Much More to Know, in Science, vol. 309, n. 5731, 1º luglio 2005, pp. 78b–102b, DOI:10.1126/science.309.5731.78b, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 15994524.

virginia.edu (Global: 1,203^rd place; Italian: 2,801^st place)

bme.virginia.edu

Peter Kasson (2012). "Peter M. Kasson" Archiviato il 3 settembre 2012 in Internet Archive.. Kasson lab. University of Virginia. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 20 settembre, 2012.

web.archive.org (Global: 1^st place; Italian: 1^st place)

Pande lab (2 agosto 2012). "About Folding@home" Archiviato il 16 ottobre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. URL consultato il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (27 luglio 2012). "Recent Results and Research Papers from Folding@home". Folding@home. Stanford University. URL archiviato il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
TJ Lane, Gregory Bowman, Robert McGibbon, Christian Schwantes, Vijay Pande, and Bruce Borden (10 settembre 2012). "Folding@home Simulation FAQ" Archiviato il 13 settembre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
"Folding@home – Awards" Archiviato il 12 luglio 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. agosto 2011. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Vittorio Bellotti and Monica Stoppini (2009). "Protein Misfolding Diseases" Archiviato il 22 febbraio 2014 in Internet Archive.. The Open Biology Journal 2: 228–234.
Pande lab (30 maggio 2012). "Folding@home Diseases Studied FAQ" Archiviato il 25 agosto 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (2012). "Folding@home Press FAQ" Archiviato il 25 agosto 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (18 agosto 2011). "Folding@home Main FAQ" (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab. "Project 6871 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 27 settembre 2011.
Pande lab. "Project 180 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 27 settembre 2011.
TJ Lane (membro del Pande lab) (8 giugno 2011). "Project 7600 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. Estratto 31 marzo 2012.
Peter Kasson (2012). "Peter M. Kasson" Archiviato il 3 settembre 2012 in Internet Archive.. Kasson lab. University of Virginia. dall'originale il 20 settembre 2012. Richiamato 20 settembre, 2012.
Pande lab. "Project 10721 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 27 settembre 2011.
Pande lab. "Project 5765 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 2 dicembre 2011.
Pande lab (4 aprile 2009). "Folding@home FLOP FAQ" Archiviato il 20 novembre 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (aggiornato giornalmente). "Client Statistics by OS" Archiviato il 3 settembre 2015 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 28 novembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (30 maggio 2012). "PS3 FAQ" Archiviato il 18 agosto 2013 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Google (2007). "Your computer's idle time is too precious to waste". Archiviato dall'originale 11 giugno 2008. URL consultato 31 agosto, 2012.
Vijay Pande, Stefan Larson (4 marzo 2002). "Genome@home Updates" Archiviato il 16 aprile 2004 in Internet Archive.. 15 aprile 2004. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.
"TOP500 List — June 2007" Archiviato il 24 giugno 2019 in Internet Archive.. top500.org. Top500. giugno 2007. URL consultato 20 settembre, 2012.
Dragan Zakic (maggio 2009). "Community Grid Computing — Studies in Parallel and Distributed Systems" Archiviato il 23 marzo 2012 in Internet Archive.. Massey University College of Sciences. Massey University. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.
"TOP500 List — November 2008" Archiviato il 24 giugno 2019 in Internet Archive.. top500.org. TOP500. novembre 2008. URL consultato 20 settembre, 2012.
Pande lab (20 agosto 2012). "Folding@home Points FAQ" Archiviato il 17 luglio 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (23 luglio 2012). "Folding@home Passkey FAQ" Archiviato il 22 settembre 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (2012). "Folding@home homepage" Archiviato l'8 settembre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. URL il 21 settembre 2012. Richiamato 8 luglio 2013.
Pande lab (11 giugno 2012). "Folding@home SMP FAQ" Archiviato il 22 settembre 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (19 agosto 2012). "Folding@home Gromacs FAQ" (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (7 agosto 2012). "Folding@home Frequently Asked Questions (FAQ) Index" Archiviato il 15 luglio 2013 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (19 agosto 2012). "Folding@home Petaflop Initiative" Archiviato il 13 luglio 2012 in Internet Archive.
Pande lab (10 febbraio 2011). "Windows Uniprocessor Client Installation Guide" Archiviato il 20 novembre 2012 in Internet Archive. (Guide). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (30 maggio 2012). "Uninstalling Folding@home Guide" Archiviato il 17 luglio 2012 in Internet Archive. (Guide). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab. "Folding@home Distributed Computing Client" Archiviato il 26 giugno 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab. "Folding@home Executive summary" Archiviato il 7 ottobre 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Stanford University. dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 4 ottobre 2011.
Rattledagger, Vijay Pande (1º aprile 2005). "Folding@home client for BOINC in beta "soon"" Archiviato il 17 settembre 2012 in Internet Archive.. Boarddigger.com. AnandTech. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.
Pande lab (30 maggio 2012). "High Performance FAQ" Archiviato il 19 agosto 2012 in Internet Archive. (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Pande lab (18 marzo 2011). "ATI FAQ" (FAQ). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
Vijay Pande (15 aprile, 2008). "Updates to the Download page/GPU2 goes live". Folding@home. typepad.com. Archiviato dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 7 settembre 2011.
Lou Kesten, Associated Press (26 marzo 2007). "Week in video-game news: 'God of War II' storms the PS2; a PS3 research project" Archiviato il 20 giugno 2012 in Internet Archive.. Post-Gazette.com (Pittsburgh Post-Gazette). dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 20 settembre, 2012.
"Termination of Life with PlayStation" Archiviato il 13 novembre 2012 in Internet Archive.. Life with PlayStation. Sony. 6 novembre 2012. dall'originale 8 novembre 2012. URL consultato 8 novembre 2012.
Pande lab (23 marzo 2012). "Windows (FAH V7) Installation Guide" Archiviato il 28 ottobre 2012 in Internet Archive. (Guide). Folding@home. Stanford University. Archiviato dall'originale il 21 settembre 2012. URL consultato 8 luglio 2013.
aschofield and jcoffland (3 ottobre 2011). "Ticket #736 (Link to GPL in FAHControl)" Archiviato il 28 maggio 2012 in Internet Archive.. Folding@home. Trac. dall'originale il 12 ottobre 2012. URL consultato il 12 maggio 2012.
Pande lab. "Project 7610 Description" Archiviato il 6 gennaio 2016 in Internet Archive.. Folding@home. dall'originale il 20 settembre 2012. URL consultato 26 febbraio 2012.

webcitation.org (Global: 25^th place; Italian: 46^th place)

Pande lab, Folding@home Open Source FAQ, su folding.stanford.edu, Stanford University, 2 agosto 2012 (archiviato dall'url originale il 21 settembre 2012).

worldcat.org (Global: 4^th place; Italian: 18^th place)

Vincent A. Voelz, Gregory R. Bowman, Kyle Beauchamp e Vijay S. Pande, Molecular Simulation of ab Initio Protein Folding for a Millisecond Folder NTL9(1−39), in Journal of the American Chemical Society, vol. 132, n. 5, 10 febbraio 2010, pp. 1526-1528, DOI:10.1021/ja9090353, ISSN 0002-7863 (WC · ACNP), PMC 2835335, PMID 20070076.
G. R. Bowman e V. S. Pande, Protein folded states are kinetic hubs, in Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 107, n. 24, 15 giugno 2010, pp. 10890-10895, DOI:10.1073/pnas.1003962107, ISSN 0027-8424 (WC · ACNP), PMC 2890711, PMID 20534497.
Christopher D. Snow, Houbi Nguyen, Vijay S. Pande e Martin Gruebele, Absolute comparison of simulated and experimental protein-folding dynamics, in Nature, vol. 420, n. 6911, --, pp. 102-106, DOI:10.1038/nature01160, ISSN 0028-0836 (WC · ACNP), PMID 12422224.
Fabrizio Marinelli, Fabio Pietrucci, Alessandro Laio e Stefano Piana, A Kinetic Model of Trp-Cage Folding from Multiple Biased Molecular Dynamics Simulations, in PLoS Computational Biology, vol. 5, n. 8, 7 agosto 2009, pp. e1000452, DOI:10.1371/journal.pcbi.1000452, ISSN 1553-7358 (WC · ACNP), PMC 2711228, PMID 19662155.
So Much More to Know, in Science, vol. 309, n. 5731, 1º luglio 2005, pp. 78b–102b, DOI:10.1126/science.309.5731.78b, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 15994524.

Folding@home (Italian Wikipedia)

archive.is (Global: 76th place; Italian: 11th place)

archive.org (Global: 6th place; Italian: 2nd place)

bakerlab.org (Global: low place; Italian: low place)

boinc.bakerlab.org

benthamscience.com (Global: low place; Italian: low place)

biophysics.org (Global: low place; Italian: low place)

boarddigger.com (Global: low place; Italian: low place)

boincstats.com (Global: low place; Italian: low place)

books.google.com (Global: 3rd place; Italian: 10th place)

castroller.com (Global: low place; Italian: low place)

cnet.com (Global: 447th place; Italian: 753rd place)

news.cnet.com

cnn.com (Global: 36th place; Italian: 94th place)

edition.cnn.com

copernicus-computing.org (Global: low place; Italian: low place)

doi.org (Global: 2nd place; Italian: 3rd place)

dx.doi.org

extremeoverclocking.com (Global: low place; Italian: low place)

forums.extremeoverclocking.com

foldingathome.org (Global: low place; Italian: low place)

foldingforum.org (Global: low place; Italian: low place)

gizmodo.com (Global: 763rd place; Italian: 716th place)

guinnessworldrecords.com (Global: 873rd place; Italian: 611th place)

longecity.org (Global: low place; Italian: low place)

massey.ac.nz (Global: low place; Italian: low place)

cs-alb-pc3.massey.ac.nz

maximumpc.com (Global: low place; Italian: low place)

mb.com.ph (Global: 1,172nd place; Italian: 4,466th place)

medicalxpress.com (Global: low place; Italian: low place)

n4g.com (Global: low place; Italian: low place)

nih.gov (Global: 5th place; Italian: 6th place)

ncbi.nlm.nih.gov

nvidia.com (Global: 2,958th place; Italian: 4,892nd place)

oadoi.org (Global: 612th place; Italian: 14th place)

playstation.com (Global: 857th place; Italian: 868th place)

blog.us.playstation.com

playstation.com

post-gazette.com (Global: 819th place; Italian: 1,764th place)

old.post-gazette.com

psu.edu (Global: 299th place; Italian: 1,600th place)

citeseerx.ist.psu.edu

simtk.org (Global: low place; Italian: low place)

stanford.edu (Global: 194th place; Italian: 490th place)

folding.stanford.edu

fah-web.stanford.edu

stanford.edu

biochem218.stanford.edu

team52735.blogspot.com (Global: low place; Italian: low place)

toolbar.google.com (Global: low place; Italian: low place)

top500.org (Global: 8,086th place; Italian: 5,963rd place)

typepad.com (Global: 1,805th place; Italian: 1,930th place)

folding.typepad.com

ubuntu.com (Global: 3,845th place; Italian: 3,300th place)

help.ubuntu.com

unibo.it (Global: 3,746th place; Italian: 288th place)

acnpsearch.unibo.it

virginia.edu (Global: 1,203rd place; Italian: 2,801st place)

bme.virginia.edu

web.archive.org (Global: 1st place; Italian: 1st place)

webcitation.org (Global: 25th place; Italian: 46th place)

worldcat.org (Global: 4th place; Italian: 18th place)

archive.is (Global: 76^th place; Italian: 11^th place)

archive.org (Global: 6^th place; Italian: 2^nd place)

books.google.com (Global: 3^rd place; Italian: 10^th place)

cnet.com (Global: 447^th place; Italian: 753^rd place)

cnn.com (Global: 36^th place; Italian: 94^th place)

doi.org (Global: 2^nd place; Italian: 3^rd place)

gizmodo.com (Global: 763^rd place; Italian: 716^th place)

guinnessworldrecords.com (Global: 873^rd place; Italian: 611^th place)

mb.com.ph (Global: 1,172^nd place; Italian: 4,466^th place)

nih.gov (Global: 5^th place; Italian: 6^th place)

nvidia.com (Global: 2,958^th place; Italian: 4,892^nd place)

oadoi.org (Global: 612^th place; Italian: 14^th place)

playstation.com (Global: 857^th place; Italian: 868^th place)

post-gazette.com (Global: 819^th place; Italian: 1,764^th place)

psu.edu (Global: 299^th place; Italian: 1,600^th place)

stanford.edu (Global: 194^th place; Italian: 490^th place)

top500.org (Global: 8,086^th place; Italian: 5,963^rd place)

typepad.com (Global: 1,805^th place; Italian: 1,930^th place)

ubuntu.com (Global: 3,845^th place; Italian: 3,300^th place)

unibo.it (Global: 3,746^th place; Italian: 288^th place)

virginia.edu (Global: 1,203^rd place; Italian: 2,801^st place)

web.archive.org (Global: 1^st place; Italian: 1^st place)

webcitation.org (Global: 25^th place; Italian: 46^th place)

worldcat.org (Global: 4^th place; Italian: 18^th place)