裸子植物 (Japanese Wikipedia)

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“レピドプテリス”. 北九州市立いのちのたび博物館. 2023年11月10日閲覧。

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浅間一男・西田治文. “ギガントプテリス類”. コトバンク. 『日本大百科全書(ニッポニカ)』. 小学館. 2023年10月23日閲覧。

nii.ac.jp

kaken.nii.ac.jp

山田 2009, p. 4. 山田敏弘 (23 April 2009). 裸子植物と被子植物の胚珠構造の比較に基づく被子植物の起源に関する研究（科学研究費補助金研究成果報告書） (PDF) (Report). 日本学術振興会. pp. 1–4.

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“シダ植物の大森林”. 第42回特別展来て！見て！感激！大化石展. 大阪市立自然史博物館 (2012年). 2023年11月10日閲覧。

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“Name - Gymnospermae Prantl”. legacy.tropicos.org. Tropicos. Missouri Botanical Garden. 2013年11月4日閲覧。

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gakui.dl.itc.u-tokyo.ac.jp

山田 2004. 山田敏弘 (25 March 2004). 外珠皮・心皮の起源と被子植物の進化に関する研究（博士論文要旨） (Report). 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻.

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長谷部 (2020) ではヒノキ類はヒノキ目 Cupressales として扱われるが、Christenhusz et al. (2011)や海老原, 嶋村 & 田村 (2012:319)、Earle (2023) など裸子植物を扱う多くの文献でナンヨウスギ目を分けるのが普通であるため、本項ではそちらに従う。
Cantino et al. (2007) における Apo-Spermatophyta に当たる。
西田 (2017)はパリシア科を球果綱の一群として扱い、目は置かずに扱っている。Pattemore & Rozefelds (2019)でも球果綱 Pinopsida として扱っているが、独立した目 Palissyales Doweld (2001) として扱っている。
針葉樹目 Coniferales に置かれることも^[119]、ヴォルチア綱 Voltziopsida Doweld, 2001 内の独自の目 Cheirolepidiales J.M.Anderson & H.M.Anderson, 2007 または Hirmeriellales Doweld, 2001 に置かれることもある^[120]。
ケイロレピス科 Cheirolepidaceae のタイプ属 Cheirolepis Schimp. (1870) はキク科の現生属 Cheirolepis Boiss. (1849) の後参ホモニム（命名法上。分類学上は Centaurea L. 内の節名として用いられる。）であるため、タハタジャンが Brachyphyllum muensteri Schenk. をタイプとして新属 Cheirolepidium Takht. (1957) を設立した。しかし、Doweld (2020) によると、Cheirolepidium müensteri (Schenk.) Takht. (1957) はICN (2018:Art. 41.5) に基づき、バシオニム Brachyphyllum muensteri Schenk.への直接かつ完全な言及を欠いているため、置換名としては有効に発表されたとみなすことができない。そのうえで、Doweld (2020) は先取権のある Hirmeriella Hörhammer (1933) を使うべきだと主張し、Hirmeriellales 目の Hirmeriellaceae 科に分類している。なお、それとは別に動物にも同名のケイロレピス Cheirolepis（ケイロレピス科 Cheirolepidae）が存在するが、こちらは別々の命名規約に準拠するため問題ない。
Cheirolepis をタイプとする Cheirolepidaceae は Cheirolepis Schenk. が Cheirolepis Boiss. (1849) の後参ホモニムであるため非合法名で、Cheirolepidiaceae Turutanova-Ketova, 1963 が有効である^[120]。
ベネチテス類・Erdtmanithecales・グネツム類はそれぞれ近縁であることが示唆され、合わせてBEG groupと呼ばれている^[137]^[32]。ただし、Rothwell et al. (2009) のようにこれに否定的な主張もあり、Vajda et al. (2017) による赤外分光法を用いた分子的特徴のデータではベネチテス類はニルソニアと類似し、((イチョウ類+チェカノウスキア類)+ソテツ類)のクレードとクラスターを形成し、ナンヨウスギ目（針葉樹類）とは別のクラスターとなることが示されている。
独自の Nilssoniales 目とされることもある^[94]。
Epicycas を含む^[145]。
スタンゲリア科^[114] Stangeriaceae を内包する^[23]。その他 Bowenia はボウェニア科 Boweniaceae とされたこともある^[114]。
スギ科 Taxodiaceae を内包する^[23]。
イヌガヤ科^[70] Cephalotaxaceae を内包する^[23]。
エダハマキ科^[70] Phyllocladaceae を内包する^[23]。