Komisja Standaryzacji Nazw Geograficznych (KSNG) na posiedzeniu 10 października 2007 roku ustaliła, że nazwa „Mała Nizina Węgierska” (obok nazwy „Mała Nizina Naddunajska”) odnosi się do obszaru niziny w Austrii, na Słowacji i Węgrzech, przy czym dla obszaru na Węgrzech i w Austrii jako egzonim główny Komisja zaleca nazwę „Mała Nizina Węgierska”, zaś nazwę „Mała Nizina Naddunajska” uznaje za egzonim wariantowy. Dla obszaru niziny położonego na Słowacji egzonimem głównym jest natomiast „Mała Nizina Naddunajska”. Dodatkowo słowacka część niziny nosi nazwę Nizina NaddunajskaProtokół z XXXIII posiedzenia KSNG (plik *.PDF).