References analysis of the Wikipedia article "LTR ретротранспозон" in the Russian version

doi.org

Baucom, RS (November 2009). "Exceptional diversity, non-random distribution, and rapid evolution of retroelements in the B73 maize genome". PLOS Genetics. 5 (11): e1000732. doi:10.1371/journal.pgen.1000732. PMID 19936065.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

"Long terminal repeat retrotransposons of Mus musculus". Genome Biol. 5 (3): R14. 2004. doi:10.1186/gb-2004-5-3-r14. PMID 15003117.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

"The Sinbad retrotransposon from the genome of the human blood fluke, Schistosoma mansoni, and the distribution of related Pao-like elements". BMC Evol. Biol. 5 (1): 20. 2005. doi:10.1186/1471-2148-5-20. PMID 15725362.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

Sandmeyer, Suzanne B (2010). "Function of a retrotransposon nucleocapsid protein". RNA Biology. 7 (6): 642—654. doi:10.4161/rna.7.6.14117. ISSN 1547-6286. PMID 21189452.

GAO, XIANG (December 2003). "Translational recoding signals between gag and pol in diverse LTR retrotransposons". RNA. 9 (12): 1422—1430. doi:10.1261/rna.5105503. ISSN 1355-8382. PMID 14623998.

Wicker, T (July 2007). "Genome-wide comparative analysis of copia retrotransposons in Triticeae, rice, and Arabidopsis reveals conserved ancient evolutionary lineages and distinct dynamics of individual copia families". Genome Research. 17 (7): 1072—81. doi:10.1101/gr.6214107. PMID 17556529.

Llorens, C (2009-11-02). "Network dynamics of eukaryotic LTR retroelements beyond phylogenetic trees". Biology Direct. 4: 41. doi:10.1186/1745-6150-4-41. PMID 19883502.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

Laten, HM (1998-06-09). "SIRE-1, a copia/Ty1-like retroelement from soybean, encodes a retroviral envelope-like protein". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (12): 6897—902. Bibcode:1998PNAS...95.6897L. doi:10.1073/pnas.95.12.6897. PMID 9618510.

Bousios, A (February 2012). "The turbulent life of Sirevirus retrotransposons and the evolution of the maize genome: more than ten thousand elements tell the story". The Plant Journal. 69 (3): 475—88. doi:10.1111/j.1365-313x.2011.04806.x. PMID 21967390.

Kapitonov, VV (1999). "Molecular paleontology of transposable elements from Arabidopsis thaliana". Genetica. 107 (1—3): 27—37. doi:10.1023/a:1004030922447. PMID 10952195.

Weber, B (February 2010). "The Ty1-copia families SALIRE and Cotzilla populating the Beta vulgaris genome show remarkable differences in abundance, chromosomal distribution, and age". Chromosome Research. 18 (2): 247—63. doi:10.1007/s10577-009-9104-4. PMID 20039119.

Miguel, C (November 2008). "Envelope-like retrotransposons in the plant kingdom: evidence of their presence in gymnosperms (Pinus pinaster)". Journal of Molecular Evolution. 67 (5): 517—25. Bibcode:2008JMolE..67..517M. doi:10.1007/s00239-008-9168-3. PMID 18925379.

Bousios, A (2012-04-30). "MASiVEdb: the Sirevirus Plant Retrotransposon Database". BMC Genomics. 13: 158. doi:10.1186/1471-2164-13-158. PMID 22545773.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

Pélissier, T (November 1995). "Athila, a new retroelement from Arabidopsis thaliana". Plant Molecular Biology. 29 (3): 441—52. doi:10.1007/bf00020976. PMID 8534844.

Wright, DA (June 1998). "Potential retroviruses in plants: Tat1 is related to a group of Arabidopsis thaliana Ty3/gypsy retrotransposons that encode envelope-like proteins". Genetics. 149 (2): 703—15. doi:10.1093/genetics/149.2.703. PMID 9611185.

Wright, DA (January 2002). "Athila4 of Arabidopsis and Calypso of soybean define a lineage of endogenous plant retroviruses". Genome Research. 12 (1): 122—31. doi:10.1101/gr.196001. PMID 11779837.

Wollrab, C (November 2012). "Evolutionary reshuffling in the Errantivirus lineage Elbe within the Beta vulgaris genome". The Plant Journal. 72 (4): 636—51. doi:10.1111/j.1365-313x.2012.05107.x. PMID 22804913.

Marín, I (July 2000). "Ty3/Gypsy retrotransposons: description of new Arabidopsis thaliana elements and evolutionary perspectives derived from comparative genomic data". Molecular Biology and Evolution. 17 (7): 1040—9. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026385. PMID 10889217.

Gorinsek, B (May 2004). "Evolutionary genomics of chromoviruses in eukaryotes". Molecular Biology and Evolution. 21 (5): 781—98. doi:10.1093/molbev/msh057. PMID 14739248.

Novikova, O (2010-04-08). "Evolutionary genomics revealed interkingdom distribution of Tcn1-like chromodomain-containing Gypsy LTR retrotransposons among fungi and plants". BMC Genomics. 11: 231. doi:10.1186/1471-2164-11-231. PMID 20377908.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

Gao, X (March 2008). "Chromodomains direct integration of retrotransposons to heterochromatin". Genome Research. 18 (3): 359—69. doi:10.1101/gr.7146408. PMID 18256242.

Neumann, P (2011-03-03). "Plant centromeric retrotransposons: a structural and cytogenetic perspective". Mobile DNA. 2 (1): 4. doi:10.1186/1759-8753-2-4. PMID 21371312.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

Weber, B (2013-03-01). "Highly diverse chromoviruses of Beta vulgaris are classified by chromodomains and chromosomal integration". Mobile DNA. 4 (1): 8. doi:10.1186/1759-8753-4-8. PMID 23448600.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

Macas, J (2007-04-01). "Ogre elements--a distinct group of plant Ty3/gypsy-like retrotransposons". Gene. 390 (1—2): 108—16. doi:10.1016/j.gene.2006.08.007. PMID 17052864.

Neumann, P (October 2003). "Highly abundant pea LTR retrotransposon Ogre is constitutively transcribed and partially spliced". Plant Molecular Biology. 53 (3): 399—410. CiteSeerX 10.1.1.551.7542. doi:10.1023/b:plan.0000006945.77043.ce. PMID 14750527.

"A unified classification system for eukaryotic transposable elements". Nat. Rev. Genet. 8 (12): 973—82. December 2007. doi:10.1038/nrg2165. PMID 17984973.

Witte, Claus-Peter Le, Quang Hien Bureau, Thomas Kumar, Amar (2001). "Terminal-repeat retrotransposons in miniature (TRIM) are involved in restructuring plant genomes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (24). The National Academy of Sciences: 13778—13783. Bibcode:2001PNAS...9813778W. doi:10.1073/pnas.241341898. PMID 11717436. Архивировано 7 декабря 2023. Дата обращения: 21 августа 2022.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)

Antonius-Klemola, Kristiina (2006-01-11). "TRIM retrotransposons occur in apple and are polymorphic between varieties but not sports". Theoretical and Applied Genetics. 112 (6): 999—1008. doi:10.1007/s00122-005-0203-0. ISSN 0040-5752. PMID 16404583. Архивировано 7 декабря 2023. Дата обращения: 21 августа 2022.

Gao, Dongying (2014-10-29). "Landscape and evolutionary dynamics of terminal-repeat retrotransposons in miniature (TRIMs) in 48 whole plant genomes". doi:10.1101/010850. Дата обращения: 3 октября 2020. {{cite journal}}: Cite journal требует |journal= (справка)

Kalendar, R. (2008-04-11). "Cassandra retrotransposons carry independently transcribed 5S RNA". Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (15): 5833—5838. Bibcode:2008PNAS..105.5833K. doi:10.1073/pnas.0709698105. ISSN 0027-8424. PMID 18408163.

Maiwald, Sophie (2020-10-03). "The Cassandra retrotransposon landscape in sugar beet (Beta vulgaris) and related Amaranthaceae: Recombination and re-shuffling lead to a high structural variability". Annals of Botany (англ.). 127 (1): 91—109. doi:10.1093/aob/mcaa176. ISSN 0305-7364. PMID 33009553.

dx.doi.org

harvard.edu

ui.adsabs.harvard.edu

nature.com

Thomas Wicker, François Sabot, Aurélie Hua-Van, Jeffrey L. Bennetzen, Pierre Capy. A unified classification system for eukaryotic transposable elements (англ.) // Nature Reviews Genetics. — 2007-12. — Vol. 8, iss. 12. — P. 973–982. — ISSN 1471-0064 1471-0056, 1471-0064. — doi:10.1038/nrg2165. Архивировано 2 августа 2022 года.

nih.gov

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

Sandmeyer, Suzanne B (2010). "Function of a retrotransposon nucleocapsid protein". RNA Biology. 7 (6): 642—654. doi:10.4161/rna.7.6.14117. ISSN 1547-6286. PMID 21189452.

GAO, XIANG (December 2003). "Translational recoding signals between gag and pol in diverse LTR retrotransposons". RNA. 9 (12): 1422—1430. doi:10.1261/rna.5105503. ISSN 1355-8382. PMID 14623998.

Kapitonov, VV (1999). "Molecular paleontology of transposable elements from Arabidopsis thaliana". Genetica. 107 (1—3): 27—37. doi:10.1023/a:1004030922447. PMID 10952195.

Pélissier, T (November 1995). "Athila, a new retroelement from Arabidopsis thaliana". Plant Molecular Biology. 29 (3): 441—52. doi:10.1007/bf00020976. PMID 8534844.

Gorinsek, B (May 2004). "Evolutionary genomics of chromoviruses in eukaryotes". Molecular Biology and Evolution. 21 (5): 781—98. doi:10.1093/molbev/msh057. PMID 14739248.

Gao, X (March 2008). "Chromodomains direct integration of retrotransposons to heterochromatin". Genome Research. 18 (3): 359—69. doi:10.1101/gr.7146408. PMID 18256242.

Macas, J (2007-04-01). "Ogre elements--a distinct group of plant Ty3/gypsy-like retrotransposons". Gene. 390 (1—2): 108—16. doi:10.1016/j.gene.2006.08.007. PMID 17052864.

"A unified classification system for eukaryotic transposable elements". Nat. Rev. Genet. 8 (12): 973—82. December 2007. doi:10.1038/nrg2165. PMID 17984973.

web.archive.org

What is Transposon's Target Site Duplication (TSD)? (22 мая 2019). Дата обращения: 21 августа 2022. Архивировано 11 июня 2021 года.

worldcat.org

Sandmeyer, Suzanne B (2010). "Function of a retrotransposon nucleocapsid protein". RNA Biology. 7 (6): 642—654. doi:10.4161/rna.7.6.14117. ISSN 1547-6286. PMID 21189452.

GAO, XIANG (December 2003). "Translational recoding signals between gag and pol in diverse LTR retrotransposons". RNA. 9 (12): 1422—1430. doi:10.1261/rna.5105503. ISSN 1355-8382. PMID 14623998.

LTR ретротранспозон (Russian Wikipedia)

archive.org

doi.org

doi.org

dx.doi.org

geneticeducation.co.in

harvard.edu

ui.adsabs.harvard.edu

nature.com

nih.gov

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

psu.edu

citeseerx.ist.psu.edu

web.archive.org

worldcat.org