TopHat (Russian Wikipedia)

Analysis of information sources in references of the Wikipedia article "TopHat" in Russian language version.

refsWebsite

Global rank Russian rank

6nih.gov

4^th place

6^th place

6doi.org

2^nd place

3^rd place

6wikipedia.org

low place

1jhu.edu

699^th place

1,318^th place

1web.archive.org

1^st place

doi.org

dx.doi.org

Trapnell C., Pachter L., Salzberg S. L. TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq. (англ.) // Bioinformatics. — 2009. — Vol. 25, no. 9. — P. 1105—1111. — doi:10.1093/bioinformatics/btp120. — PMID 19289445. [исправить]
Kim D., Langmead B., Salzberg S. L. HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. (англ.) // Nature methods. — 2015. — Vol. 12, no. 4. — P. 357—360. — doi:10.1038/nmeth.3317. — PMID 25751142. [исправить]
Langmead B., Trapnell C., Pop M., Salzberg S. L. Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome. (англ.) // Genome biology. — 2009. — Vol. 10, no. 3. — P. 25. — doi:10.1186/gb-2009-10-3-r25. — PMID 19261174. [исправить]
Li H., Ruan J., Durbin R. Mapping short DNA sequencing reads and calling variants using mapping quality scores. (англ.) // Genome research. — 2008. — Vol. 18, no. 11. — P. 1851—1858. — doi:10.1101/gr.078212.108. — PMID 18714091. [исправить]
Kim D., Salzberg S. L. TopHat-Fusion: an algorithm for discovery of novel fusion transcripts. (англ.) // Genome biology. — 2011. — Vol. 12, no. 8. — P. 72. — doi:10.1186/gb-2011-12-8-r72. — PMID 21835007. [исправить]
Kim D., Pertea G., Trapnell C., Pimentel H., Kelley R., Salzberg S. L. TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions. (англ.) // Genome biology. — 2013. — Vol. 14, no. 4. — P. 36. — doi:10.1186/gb-2013-14-4-r36. — PMID 23618408. [исправить]

jhu.edu

ccb.jhu.edu

TopHat :: Center for Bioinformatics and Computational Biology (неопр.). Дата обращения: 14 апреля 2017. Архивировано 30 апреля 2017 года.

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

Trapnell C., Pachter L., Salzberg S. L. TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq. (англ.) // Bioinformatics. — 2009. — Vol. 25, no. 9. — P. 1105—1111. — doi:10.1093/bioinformatics/btp120. — PMID 19289445. [исправить]
Kim D., Langmead B., Salzberg S. L. HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. (англ.) // Nature methods. — 2015. — Vol. 12, no. 4. — P. 357—360. — doi:10.1038/nmeth.3317. — PMID 25751142. [исправить]
Langmead B., Trapnell C., Pop M., Salzberg S. L. Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome. (англ.) // Genome biology. — 2009. — Vol. 10, no. 3. — P. 25. — doi:10.1186/gb-2009-10-3-r25. — PMID 19261174. [исправить]
Li H., Ruan J., Durbin R. Mapping short DNA sequencing reads and calling variants using mapping quality scores. (англ.) // Genome research. — 2008. — Vol. 18, no. 11. — P. 1851—1858. — doi:10.1101/gr.078212.108. — PMID 18714091. [исправить]
Kim D., Salzberg S. L. TopHat-Fusion: an algorithm for discovery of novel fusion transcripts. (англ.) // Genome biology. — 2011. — Vol. 12, no. 8. — P. 72. — doi:10.1186/gb-2011-12-8-r72. — PMID 21835007. [исправить]
Kim D., Pertea G., Trapnell C., Pimentel H., Kelley R., Salzberg S. L. TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions. (англ.) // Genome biology. — 2013. — Vol. 14, no. 4. — P. 36. — doi:10.1186/gb-2013-14-4-r36. — PMID 23618408. [исправить]

web.archive.org

TopHat :: Center for Bioinformatics and Computational Biology (неопр.). Дата обращения: 14 апреля 2017. Архивировано 30 апреля 2017 года.

wikipedia.org

ru.wikipedia.org

Trapnell C., Pachter L., Salzberg S. L. TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq. (англ.) // Bioinformatics. — 2009. — Vol. 25, no. 9. — P. 1105—1111. — doi:10.1093/bioinformatics/btp120. — PMID 19289445. [исправить]
Kim D., Langmead B., Salzberg S. L. HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. (англ.) // Nature methods. — 2015. — Vol. 12, no. 4. — P. 357—360. — doi:10.1038/nmeth.3317. — PMID 25751142. [исправить]
Langmead B., Trapnell C., Pop M., Salzberg S. L. Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome. (англ.) // Genome biology. — 2009. — Vol. 10, no. 3. — P. 25. — doi:10.1186/gb-2009-10-3-r25. — PMID 19261174. [исправить]
Li H., Ruan J., Durbin R. Mapping short DNA sequencing reads and calling variants using mapping quality scores. (англ.) // Genome research. — 2008. — Vol. 18, no. 11. — P. 1851—1858. — doi:10.1101/gr.078212.108. — PMID 18714091. [исправить]
Kim D., Salzberg S. L. TopHat-Fusion: an algorithm for discovery of novel fusion transcripts. (англ.) // Genome biology. — 2011. — Vol. 12, no. 8. — P. 72. — doi:10.1186/gb-2011-12-8-r72. — PMID 21835007. [исправить]
Kim D., Pertea G., Trapnell C., Pimentel H., Kelley R., Salzberg S. L. TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions. (англ.) // Genome biology. — 2013. — Vol. 14, no. 4. — P. 36. — doi:10.1186/gb-2013-14-4-r36. — PMID 23618408. [исправить]