Позиционная весовая матрица (Russian Wikipedia)

Analysis of information sources in references of the Wikipedia article "Позиционная весовая матрица" in Russian language version.

refsWebsite

Global rank Russian rank

12nih.gov

4^th place

6^th place

9doi.org

2^nd place

3^rd place

6wikipedia.org

low place

4web.archive.org

1^st place

2davetang.org

low place

2worldcat.org

5^th place

1lifesciencessociety.org

low place

1archive.org

6^th place

9^th place

1upf.edu

low place

archive.org

Stormo, G. D. DNA binding sites: representation and discovery (неопр.) // Bioinformatics. — 2000. — 1 January (т. 16, № 1). — С. 16—23. — doi:10.1093/bioinformatics/16.1.16. — PMID 10812473.

davetang.org

"Position weight matrix - Musings from an unlikely candidate". Musings from an unlikely candidate (англ.). 2013-10-01. Архивировано 1 апреля 2017. Дата обращения: 30 апреля 2017.
"Position weight matrix - Musings from an unlikely candidate". Musings from an unlikely candidate (англ.). 2013-10-01. Архивировано 1 апреля 2017. Дата обращения: 31 марта 2017.

doi.org

dx.doi.org

Stormo, Gary D.; Schneider, Thomas D.; Gold, Larry; Ehrenfeucht, Andrzej. Use of the ‘Perceptron’ algorithm to distinguish translational initiation sites in E. coli (англ.) // :en:Nucleic Acids Research|Nucleic Acids Research : journal. — 1982. — Vol. 10, no. 9. — P. 2997—3011. — doi:10.1093/nar/10.9.2997.
Stormo, G. D. DNA binding sites: representation and discovery (неопр.) // Bioinformatics. — 2000. — 1 January (т. 16, № 1). — С. 16—23. — doi:10.1093/bioinformatics/16.1.16. — PMID 10812473.
Sinha, S. On counting position weight matrix matches in a sequence, with application to discriminative motif finding (англ.) // Bioinformatics : journal. — 2006. — 27 July (vol. 22, no. 14). — P. e454—e463. — doi:10.1093/bioinformatics/btl227.
Xia, Xuhua. Position Weight Matrix, Gibbs Sampler, and the Associated Significance Tests in Motif Characterization and Prediction (англ.) // Scientifica : journal. — 2012. — Vol. 2012. — P. 1—15. — doi:10.6064/2012/917540.
Nishida, K.; Frith, M. C.; Nakai, K. Pseudocounts for transcription factor binding sites (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2008. — 23 December (vol. 37, no. 3). — P. 939—944. — doi:10.1093/nar/gkn1019.
Ivan Erill, Michael C O'Neill. A reexamination of information theory-based methods for DNA-binding site identification // BMC Bioinformatics. — 2009-02-11. — Т. 10. — С. 57. — ISSN 1471-2105. — doi:10.1186/1471-2105-10-57.
Kel A. E., et al. MATCHTM: a tool for searching transcription factor binding sites in DNA sequences (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2003. — Vol. 31, no. 13. — P. 3576—3579. — doi:10.1093/nar/gkg585. — PMID 12824369. — PMC 169193.
Beckstette M., et al. Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 7. — P. 389. — doi:10.1186/1471-2105-7-389. — PMID 1635428. — PMC 1635428.
Michael Beckstette, Robert Homann, Robert Giegerich, Stefan Kurtz. Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices // BMC Bioinformatics. — 2006-08-24. — Т. 7. — С. 389. — ISSN 1471-2105. — doi:10.1186/1471-2105-7-389.

lifesciencessociety.org

CSB2007 Learning Position Weight Matrices from Sequence and Expression Data (неопр.). www.lifesciencessociety.org. Дата обращения: 30 апреля 2017. Архивировано 2 декабря 2016 года.

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

Stormo, G. D. DNA binding sites: representation and discovery (неопр.) // Bioinformatics. — 2000. — 1 January (т. 16, № 1). — С. 16—23. — doi:10.1093/bioinformatics/16.1.16. — PMID 10812473.
Ivan Erill, Michael C O'Neill. A reexamination of information theory-based methods for DNA-binding site identification // BMC Bioinformatics. — 2009-02-11. — Т. 10. — С. 57. — ISSN 1471-2105. — doi:10.1186/1471-2105-10-57.
Kel A. E., et al. MATCHTM: a tool for searching transcription factor binding sites in DNA sequences (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2003. — Vol. 31, no. 13. — P. 3576—3579. — doi:10.1093/nar/gkg585. — PMID 12824369. — PMC 169193.
Beckstette M., et al. Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 7. — P. 389. — doi:10.1186/1471-2105-7-389. — PMID 1635428. — PMC 1635428.
Jones D. T. Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices (англ.) // J Mol Biol^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 292. — P. 195—202. — PMID 10493868.
Pollastri, G. & McLysaght, A. Porter: a new, accurate server for protein secondary structure prediction (англ.) // Bioinformatics : journal. — 2005. — Vol. 21. — P. 1719—1720. — PMID 15585524.
Rost, B. Review: protein secondary structure prediction continues to rise (англ.) // J Struct Biol^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 134. — P. 204—218. — PMID 11551180.
Adamczak, R.; Porollo, A. & Meller, J. Accurate prediction of solvent accessibility using neural networks-based regression (англ.) // Proteins : journal. — 2004. — Vol. 56. — P. 753—767. — PMID 15281128.
Pollastri, G.; Martin, A. J. M.; Mooney, C. & Vullo, A. Accurate prediction of protein secondary structure and solvent accessibility by consensus combiners of sequence and structure information (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 8. — P. 201. — PMID 17570843. — PMC 1913928.
Pollastri, G.; Baldi, P.; Fariselli, P. & Casadio, R. Improved prediction of the number of residue contacts in proteins by recurrent neural networks (англ.) // Bioinformatics : journal. — 2001. — Vol. 17. — P. Suppl 1 : S234—S242. — PMID 11473014.
Shandar Ahmad and Akinori Sarai. PSSM-based prediction of DNA binding sites in proteins (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 6. — P. 33. — PMID 15720719. — PMC 550660.
Michael Beckstette, Robert Homann, Robert Giegerich, Stefan Kurtz. Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices // BMC Bioinformatics. — 2006-08-24. — Т. 7. — С. 389. — ISSN 1471-2105. — doi:10.1186/1471-2105-7-389.

upf.edu

bioinformatica.upf.edu

Guigo, Roderic An Introduction to Position Specific Scoring Matrices (неопр.). http://bioinformatica.upf.edu. Дата обращения: 29 апреля 2015. Архивировано 28 ноября 2012 года.

web.archive.org

CSB2007 Learning Position Weight Matrices from Sequence and Expression Data (неопр.). www.lifesciencessociety.org. Дата обращения: 30 апреля 2017. Архивировано 2 декабря 2016 года.
"Position weight matrix - Musings from an unlikely candidate". Musings from an unlikely candidate (англ.). 2013-10-01. Архивировано 1 апреля 2017. Дата обращения: 30 апреля 2017.
Guigo, Roderic An Introduction to Position Specific Scoring Matrices (неопр.). http://bioinformatica.upf.edu. Дата обращения: 29 апреля 2015. Архивировано 28 ноября 2012 года.
"Position weight matrix - Musings from an unlikely candidate". Musings from an unlikely candidate (англ.). 2013-10-01. Архивировано 1 апреля 2017. Дата обращения: 31 марта 2017.

wikipedia.org

en.wikipedia.org

Stormo, Gary D.; Schneider, Thomas D.; Gold, Larry; Ehrenfeucht, Andrzej. Use of the ‘Perceptron’ algorithm to distinguish translational initiation sites in E. coli (англ.) // :en:Nucleic Acids Research|Nucleic Acids Research : journal. — 1982. — Vol. 10, no. 9. — P. 2997—3011. — doi:10.1093/nar/10.9.2997.
Beckstette M., et al. Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 7. — P. 389. — doi:10.1186/1471-2105-7-389. — PMID 1635428. — PMC 1635428.
Jones D. T. Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices (англ.) // J Mol Biol^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 292. — P. 195—202. — PMID 10493868.
Rost, B. Review: protein secondary structure prediction continues to rise (англ.) // J Struct Biol^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 134. — P. 204—218. — PMID 11551180.
Pollastri, G.; Martin, A. J. M.; Mooney, C. & Vullo, A. Accurate prediction of protein secondary structure and solvent accessibility by consensus combiners of sequence and structure information (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 8. — P. 201. — PMID 17570843. — PMC 1913928.
Shandar Ahmad and Akinori Sarai. PSSM-based prediction of DNA binding sites in proteins (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 6. — P. 33. — PMID 15720719. — PMC 550660.

worldcat.org

Ivan Erill, Michael C O'Neill. A reexamination of information theory-based methods for DNA-binding site identification // BMC Bioinformatics. — 2009-02-11. — Т. 10. — С. 57. — ISSN 1471-2105. — doi:10.1186/1471-2105-10-57.
Michael Beckstette, Robert Homann, Robert Giegerich, Stefan Kurtz. Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices // BMC Bioinformatics. — 2006-08-24. — Т. 7. — С. 389. — ISSN 1471-2105. — doi:10.1186/1471-2105-7-389.