До конца не ясно, кто был матерью Махмуда. Согласно версии, высказанной турецким историком Гюнханом Бёрекчи, матерью Махмуда была Халиме-султан[66], приходившаяся также матерью будущему султану Мустафе I[67]; по мнению Бёрекчи, она была выслана в Старый дворец после казни сына[68]. Однако другой турецкий историк Феридун Эмеджен в статье о Мехмеде III в «Исламской энциклопедии» и Лесли Пирс, ссылаясь на английского посла Генри Лелло[англ.], писали о том, что мать Махмуда была утоплена в Босфоре в 1603 году[69][70], тогда как Халиме стала валиде-султан при Мустафе в 1617 году[71]. Османист Энтони Олдерсон в своей работе «Структура Османской династии» также пишет, что мать Махмуда была казнена вместе с ним самим[72].
