References analysis of the Wikipedia article "Секвенирование экзома" in the Russian version

doi.org

dx.doi.org

Warr Amanda, Robert Christelle, Hume David, Archibald Alan, Deeb Nader, Watson Mick. Exome Sequencing: Current and Future Perspectives (англ.) // G3: Genes. — 2015. — 2 July (vol. 5, no. 8). — P. 1543—1550. — ISSN 2160-1836. — doi:10.1534/g3.115.018564. [исправить]

Ng Sarah B., Turner Emily H., Robertson Peggy D., Flygare Steven D., Bigham Abigail W., Lee Choli, Shaffer Tristan, Wong Michelle, Bhattacharjee Arindam, Eichler Evan E., Bamshad Michael, Nickerson Deborah A., Shendure Jay. Targeted capture and massively parallel sequencing of 12 human exomes (англ.) // Nature. — 2009. — 16 August (vol. 461, no. 7261). — P. 272—276. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/nature08250. [исправить]

Psifidi Androniki, Dovas Chrysostomos I., Bramis Georgios, Lazou Thomai, Russel Claire L., Arsenos Georgios, Banos Georgios. Comparison of Eleven Methods for Genomic DNA Extraction Suitable for Large-Scale Whole-Genome Genotyping and Long-Term DNA Banking Using Blood Samples (англ.) // PLOS ONE. — 2015. — 30 January (vol. 10, no. 1). — P. e0115960. — ISSN 1932-6203. — doi:10.1371/journal.pone.0115960. [исправить]

Turner Emily H., Ng Sarah B., Nickerson Deborah A., Shendure Jay. Methods for Genomic Partitioning (англ.) // Annual Review of Genomics and Human Genetics. — 2009. — September (vol. 10, no. 1). — P. 263—284. — ISSN 1527-8204. — doi:10.1146/annurev-genom-082908-150112. [исправить]

Mamanova Lira, Coffey Alison J, Scott Carol E, Kozarewa Iwanka, Turner Emily H, Kumar Akash, Howard Eleanor, Shendure Jay, Turner Daniel J. Target-enrichment strategies for next-generation sequencing (англ.) // Nature Methods. — 2010. — February (vol. 7, no. 2). — P. 111—118. — ISSN 1548-7091. — doi:10.1038/nmeth.1419. [исправить]

Kahvejian Avak, Quackenbush John, Thompson John F. What would you do if you could sequence everything? (англ.) // Nature Biotechnology. — 2008. — October (vol. 26, no. 10). — P. 1125—1133. — ISSN 1087-0156. — doi:10.1038/nbt1494. [исправить]

Mertes F., ElSharawy A., Sauer S., van Helvoort J. M. L. M., van der Zaag P. J., Franke A., Nilsson M., Lehrach H., Brookes A. J. Targeted enrichment of genomic DNA regions for next-generation sequencing (англ.) // Briefings in Functional Genomics. — 2011. — 1 November (vol. 10, no. 6). — P. 374—386. — ISSN 2041-2649. — doi:10.1093/bfgp/elr033. [исправить]

Clark Michael J, Chen Rui, Lam Hugo Y K, Karczewski Konrad J, Chen Rong, Euskirchen Ghia, Butte Atul J, Snyder Michael. Performance comparison of exome DNA sequencing technologies (англ.) // Nature Biotechnology. — 2011. — 25 September (vol. 29, no. 10). — P. 908—914. — ISSN 1087-0156. — doi:10.1038/nbt.1975. [исправить]

Seaby Eleanor G., Pengelly Reuben J., Ennis Sarah. Exome sequencing explained: a practical guide to its clinical application (англ.) // Briefings in Functional Genomics. — 2015. — 9 December (vol. 15, no. 5). — P. 374—384. — ISSN 2041-2649. — doi:10.1093/bfgp/elv054. [исправить]

Chilamakuri Chandra Sekhar, Lorenz Susanne, Madoui Mohammed-Amin, Vodák Daniel, Sun Jinchang, Hovig Eivind, Myklebost Ola, Meza-Zepeda Leonardo A. Performance comparison of four exome capture systems for deep sequencing (англ.) // BMC Genomics. — 2014. — Vol. 15, no. 1. — P. 449. — ISSN 1471-2164. — doi:10.1186/1471-2164-15-449. [исправить]

Sulonen Anna-Maija, Ellonen Pekka, Almusa Henrikki, Lepistö Maija, Eldfors Samuli, Hannula Sari, Miettinen Timo, Tyynismaa Henna, Salo Perttu, Heckman Caroline, Joensuu Heikki, Raivio Taneli, Suomalainen Anu, Saarela Janna. Comparison of solution-based exome capture methods for next generation sequencing (англ.) // Genome Biology. — 2011. — Vol. 12, no. 9. — P. R94. — ISSN 1465-6906. — doi:10.1186/gb-2011-12-9-r94. [исправить]

Bodi K., Perera A. G., Adams P. S., Bintzler D., Dewar K., Grove D. S., Kieleczawa J., Lyons R. H., Neubert T. A., Noll A. C., Singh S., Steen R., Zianni M. Comparison of Commercially Available Target Enrichment Methods for Next-Generation Sequencing (англ.) // Journal of Biomolecular Techniques : JBT. — 2013. — July (vol. 24, no. 2). — P. 73—86. — ISSN 1524-0215. — doi:10.7171/jbt.13-2402-002. [исправить]

Quail Michael, Smith Miriam E, Coupland Paul, Otto Thomas D, Harris Simon R, Connor Thomas R, Bertoni Anna, Swerdlow Harold P, Gu Yong. A tale of three next generation sequencing platforms: comparison of Ion torrent, pacific biosciences and illumina MiSeq sequencers (англ.) // BMC Genomics. — 2012. — Vol. 13, no. 1. — P. 341. — ISSN 1471-2164. — doi:10.1186/1471-2164-13-341. [исправить]

Mardis Elaine R. The challenges of big data (англ.) // Disease Models & Mechanisms. — 2016. — 1 May (vol. 9, no. 5). — P. 483—485. — ISSN 1754-8403. — doi:10.1242/dmm.025585. [исправить]

Pengelly Reuben J, Gibson Jane, Andreoletti Gaia, Collins Andrew, Mattocks Christopher J, Ennis Sarah. A SNP profiling panel for sample tracking in whole-exome sequencing studies (англ.) // Genome Medicine. — 2013. — Vol. 5, no. 9. — P. 89. — ISSN 1756-994X. — doi:10.1186/gm492. [исправить]

Volk Amber, Conboy Erin, Wical Beverly, Patterson Marc, Kirmani Salman. Whole-Exome Sequencing in the Clinic: Lessons from Six Consecutive Cases from the Clinician's Perspective (англ.) // Molecular Syndromology. — 2015. — 3 February (vol. 6, no. 1). — P. 23—31. — ISSN 1661-8769. — doi:10.1159/000371598. [исправить]

Ng Sarah B, Buckingham Kati J, Lee Choli, Bigham Abigail W, Tabor Holly K, Dent Karin M, Huff Chad D, Shannon Paul T, Jabs Ethylin Wang, Nickerson Deborah A, Shendure Jay, Bamshad Michael J. Exome sequencing identifies the cause of a mendelian disorder (англ.) // Nature Genetics. — 2009. — 13 November (vol. 42, no. 1). — P. 30—35. — ISSN 1061-4036. — doi:10.1038/ng.499. [исправить]

Choi Murim, Scholl Ute I., Ji Weizhen, Liu Tiewen, Tikhonova Irina R., Zumbo Paul, Nayir Ahmet, Bakkaloğlu Ayșin, Özen Seza, Sanjad Sami, Nelson-Williams Carol, Farhi Anita, Mane Shrikant, Lifton Richard P. Genetic diagnosis by whole exome capture and massively parallel DNA sequencing (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2009. — 27 October (vol. 106, no. 45). — P. 19096—19101. — ISSN 0027-8424. — doi:10.1073/pnas.0910672106. [исправить]

Bilgüvar Kaya, Öztürk Ali Kemal, Louvi Angeliki, Kwan Kenneth Y., Choi Murim, Tatlı Burak, Yalnızoğlu Dilek, Tüysüz Beyhan, Çağlayan Ahmet Okay, Gökben Sarenur, Kaymakçalan Hande, Barak Tanyeri, Bakırcıoğlu Mehmet, Yasuno Katsuhito, Ho Winson, Sanders Stephan, Zhu Ying, Yılmaz Sanem, Dinçer Alp, Johnson Michele H., Bronen Richard A., Koçer Naci, Per Hüseyin, Mane Shrikant, Pamir Mehmet Necmettin, Yalçınkaya Cengiz, Kumandaş Sefer, Topçu Meral, Özmen Meral, Šestan Nenad, Lifton Richard P., State Matthew W., Günel Murat. Whole-exome sequencing identifies recessive WDR62 mutations in severe brain malformations (англ.) // Nature. — 2010. — 22 August (vol. 467, no. 7312). — P. 207—210. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/nature09327. [исправить]

Worthey Elizabeth A, Mayer Alan N, Syverson Grant D, Helbling Daniel, Bonacci Benedetta B, Decker Brennan, Serpe Jaime M, Dasu Trivikram, Tschannen Michael R, Veith Regan L, Basehore Monica J, Broeckel Ulrich, Tomita-Mitchell Aoy, Arca Marjorie J, Casper James T, Margolis David A, Bick David P, Hessner Martin J, Routes John M, Verbsky James W, Jacob Howard J, Dimmock David P. Making a definitive diagnosis: Successful clinical application of whole exome sequencing in a child with intractable inflammatory bowel disease (англ.) // Genetics in Medicine. — 2010. — 17 December (vol. 13, no. 3). — P. 255—262. — ISSN 1098-3600. — doi:10.1097/GIM.0b013e3182088158. [исправить]

Raffan Eleanor, Hurst Liam A., Turki Saeed Al, Carpenter Gillian, Scott Carol, Daly Allan, Coffey Alison, Bhaskar Sanjeev, Howard Eleanor, Khan Naz, Kingston Helen, Palotie Aarno, Savage David B., O'Driscoll Mark, Smith Claire, O'Rahilly Stephen, Barroso Inês, Semple Robert K. Early Diagnosis of Werner's Syndrome Using Exome-Wide Sequencing in a Single, Atypical Patient (англ.) // Frontiers in Endocrinology. — 2011. — Vol. 2. — ISSN 1664-2392. — doi:10.3389/fendo.2011.00008. [исправить]

Best Sunayna, Wou Karen, Vora Neeta, Van der Veyver Ignatia B., Wapner Ronald, Chitty Lyn S. Promises, pitfalls and practicalities of prenatal whole exome sequencing (англ.) // Prenatal Diagnosis. — 2017. — 25 July (vol. 38, no. 1). — P. 10—19. — ISSN 0197-3851. — doi:10.1002/pd.5102. [исправить]

Nickerson Sarah, Marquis-Nicholson Renate, Claxton Karen, Ashton Fern, Leong Ivone, Prosser Debra, Love Jennifer, George Alice, Taylor Graham, Wilson Callum, Gardner R., Love Donald. SNP Analysis and Whole Exome Sequencing: Their Application in the Analysis of a Consanguineous Pedigree Segregating Ataxia (англ.) // Microarrays. — 2015. — 23 October (vol. 4, no. 4). — P. 490—502. — ISSN 2076-3905. — doi:10.3390/microarrays4040490. [исправить]

Lee Hane, Deignan Joshua L., Dorrani Naghmeh, Strom Samuel P., Kantarci Sibel, Quintero-Rivera Fabiola, Das Kingshuk, Toy Traci, Harry Bret, Yourshaw Michael, Fox Michelle, Fogel Brent L., Martinez-Agosto Julian A., Wong Derek A., Chang Vivian Y., Shieh Perry B., Palmer Christina G. S., Dipple Katrina M., Grody Wayne W., Vilain Eric, Nelson Stanley F. Clinical Exome Sequencing for Genetic Identification of Rare Mendelian Disorders (англ.) // JAMA. — 2014. — 12 November (vol. 312, no. 18). — P. 1880. — ISSN 0098-7484. — doi:10.1001/jama.2014.14604. [исправить]

Winfield Mark O., Wilkinson Paul A., Allen Alexandra M., Barker Gary L. A., Coghill Jane A., Burridge Amanda, Hall Anthony, Brenchley Rachael C., D’Amore Rosalinda, Hall Neil, Bevan Michael W., Richmond Todd, Gerhardt Daniel J., Jeddeloh Jeffrey A., Edwards Keith J. Targeted re-sequencing of the allohexaploid wheat exome (англ.) // Plant Biotechnology Journal. — 2012. — 18 June (vol. 10, no. 6). — P. 733—742. — ISSN 1467-7644. — doi:10.1111/j.1467-7652.2012.00713.x. [исправить]

Henry I. M., Nagalakshmi U., Lieberman M. C., Ngo K. J., Krasileva K. V., Vasquez-Gross H., Akhunova A., Akhunov E., Dubcovsky J., Tai T. H., Comai L. Efficient Genome-Wide Detection and Cataloging of EMS-Induced Mutations Using Exome Capture and Next-Generation Sequencing (англ.) // The Plant Cell. — 2014. — 1 April (vol. 26, no. 4). — P. 1382—1397. — ISSN 1040-4651. — doi:10.1105/tpc.113.121590. [исправить]

Bolon Y.-T., Haun W. J., Xu W. W., Grant D., Stacey M. G., Nelson R. T., Gerhardt D. J., Jeddeloh J. A., Stacey G., Muehlbauer G. J., Orf J. H., Naeve S. L., Stupar R. M., Vance C. P. Phenotypic and Genomic Analyses of a Fast Neutron Mutant Population Resource in Soybean (англ.) // PLANT PHYSIOLOGY. — 2011. — 14 February (vol. 156, no. 1). — P. 240—253. — ISSN 0032-0889. — doi:10.1104/pp.110.170811. [исправить]

Wendler Neele, Mascher Martin, Nöh Christiane, Himmelbach Axel, Scholz Uwe, Ruge-Wehling Brigitte, Stein Nils. Unlocking the secondary gene-pool of barley with next-generation sequencing (англ.) // Plant Biotechnology Journal. — 2014. — 6 July (vol. 12, no. 8). — P. 1122—1131. — ISSN 1467-7644. — doi:10.1111/pbi.12219. [исправить]

Song Shen, Yao Na, Yang Min, Liu Xuexue, Dong Kunzhe, Zhao Qianjun, Pu Yabin, He Xiaohong, Guan Weijun, Yang Ning, Ma Yuehui, Jiang Lin. Exome sequencing reveals genetic differentiation due to high-altitude adaptation in the Tibetan cashmere goat (Capra hircus) (англ.) // BMC Genomics. — 2016. — 18 February (vol. 17, no. 1). — ISSN 1471-2164. — doi:10.1186/s12864-016-2449-0. [исправить]

Biesecker Leslie G. Exome sequencing makes medical genomics a reality (англ.) // Nature Genetics. — 2010. — January (vol. 42, no. 1). — P. 13—14. — ISSN 1061-4036. — doi:10.1038/ng0110-13. [исправить]

Berberich Amanda J., Ho Rosettia, Hegele Robert A. Whole genome sequencing in the clinic: empowerment or too much information? (англ.) // Canadian Medical Association Journal. — 2018. — 2 February (vol. 190, no. 5). — P. E124—E125. — ISSN 0820-3946. — doi:10.1503/cmaj.180076. [исправить]

web.archive.org

Whole Exome Sequencing | Detect exonic variants. www.illumina.com. Дата обращения: 5 мая 2019. Архивировано 3 мая 2019 года.

Пакет FastQC (англ.). Babraham Bioinformatics. Дата обращения: 30 апреля 2015. Архивировано 2 марта 2019 года.

Пакет Trimmomatic (англ.). USADELLAB.org. Дата обращения: 30 апреля 2015. Архивировано 22 апреля 2015 года.

Пакет sicke (англ.). GitHub. Дата обращения: 30 апреля 2015. Архивировано 27 апреля 2015 года.

Программа Bloocoo (англ.). Inria. Дата обращения: 30 апреля 2015. Архивировано 4 марта 2016 года.

Программа Lighter (англ.). GitHub. Дата обращения: 30 апреля 2015. Архивировано 11 июля 2017 года.

Ambry Genetics. Ambry Genetics First to Offer Exome Sequencing Service for Clinical Diagnostics. (англ.). www.prnewswire.com. Дата обращения: 5 мая 2019. Архивировано 16 апреля 2017 года.

DNA Sequencing Costs: Data | NHGRI. www.genome.gov. Дата обращения: 6 мая 2019. Архивировано 6 мая 2019 года.

wikipedia.org

ru.wikipedia.org

worldcat.org

Секвенирование экзома (Russian Wikipedia)

babraham.ac.uk

bioinformatics.babraham.ac.uk

doi.org

dx.doi.org

genome.gov

github.com

illumina.com

inria.fr

gatb.inria.fr

prnewswire.com

usadellab.org

web.archive.org

wikipedia.org

ru.wikipedia.org

worldcat.org