Zaradi pičlih in nenatančnih dokumentarnih dokazov ostajata pozna kariera Muhammada Yūsufa in datum njegove smrti negotova. Po raziskavah Josepha Fletcherja je Muhammad Yūsuf sredi 17. stoletja delal med ljudmi Hui in Salar v današnjih provincah Gansu in Qinghai, nato pa se je vrnil v Altishahr in leta 1653 tam umrl, zastrupljen s strani svojih tekmecev. Po drugi strani pa je predstojnik študija Hui na Kitajskem, Ma Tong, menil, da je Mohamed Jusuf umrl leta 1622 in da je vse pridiganje v Qinghaiju in Gansuju opravljal njegov sin Afāq Khoja.(Lipman, Jonathan Neaman (1998). Familiar strangers: a history of Muslims in Northwest China. Hong Kong University Press. str. 59. ISBN962-209-468-6. Arhivirano iz spletišča dne 9. januarja 2017. Pridobljeno 21. septembra 2016. Lipman's source is: Joseph Fletcher, "The Naqshbandiya in Northwest China", in Beatrcie Manz, ur. (1995). Studies on Chinese and Islamic Inner Asia. London: Variorum.)
Zaradi pičlih in nenatančnih dokumentarnih dokazov ostajata pozna kariera Muhammada Yūsufa in datum njegove smrti negotova. Po raziskavah Josepha Fletcherja je Muhammad Yūsuf sredi 17. stoletja delal med ljudmi Hui in Salar v današnjih provincah Gansu in Qinghai, nato pa se je vrnil v Altishahr in leta 1653 tam umrl, zastrupljen s strani svojih tekmecev. Po drugi strani pa je predstojnik študija Hui na Kitajskem, Ma Tong, menil, da je Mohamed Jusuf umrl leta 1622 in da je vse pridiganje v Qinghaiju in Gansuju opravljal njegov sin Afāq Khoja.(Lipman, Jonathan Neaman (1998). Familiar strangers: a history of Muslims in Northwest China. Hong Kong University Press. str. 59. ISBN962-209-468-6. Arhivirano iz spletišča dne 9. januarja 2017. Pridobljeno 21. septembra 2016. Lipman's source is: Joseph Fletcher, "The Naqshbandiya in Northwest China", in Beatrcie Manz, ur. (1995). Studies on Chinese and Islamic Inner Asia. London: Variorum.)