Dizi hizalaması (Turkish Wikipedia)

Analysis of information sources in references of the Wikipedia article "Dizi hizalaması" in Turkish language version.

refsWebsite

Global rank Turkish rank

26nih.gov

4^th place

11^th place

26doi.org

2^nd place

4^th place

13web.archive.org

1^st place

9oxfordjournals.org

1,389^th place

1,393^rd place

4archive.org

6^th place

3archive.today

14^th place

20^th place

2pnas.org

1,293^rd place

1,064^th place

2elsevier.com

610^th place

764^th place

1sciencemag.org

857^th place

573^rd place

1proteinscience.org

low place

1cornell.edu

332^nd place

550^th place

1ualberta.ca

3,600^th place

9,400^th place

1repec.org

4,270^th place

4,523^rd place

archive.org

Chothia C, Lesk AM. (Nisan 1986). "The relation between the divergence of sequence and structure in proteins". EMBO J. 5 (4). ss. 823-6. PMC 1166865 $2. PMID 3709526.
Felsenstein J. (2004). Inferring Phylogenies. Sinauer Associates: Sunderland, MA. ISBN 0-87893-177-5.
Blazewicz J, Bryja M, Figlerowicz M; ve diğerleri. (Haziran 2009). "Whole genome assembly from 454 sequencing output via modified DNA graph concept". Comput Biol Chem. 33 (3). ss. 224-30. doi:10.1016/j.compbiolchem.2009.04.005. PMID 19477687.
Abbott A., Tsay A. (2000). "Sequence Analysis and Optimal Matching Methods in Sociology, Review and Prospect". Sociological Methods and Research. Cilt 29. ss. 3-33. doi:10.1177/0049124100029001001.

archive.today

Brudno M, Malde S, Poliakov A, Do CB, Couronne O, Dubchak I, Batzoglou S (2003). "Glocal alignment: finding rearrangements during alignment". Bioinformatics. Cilt 19 Suppl 1. ss. i54-62. doi:10.1093/bioinformatics/btg1005. PMID 12855437. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Karplus K, Barrett C, Hughey R. (1998). "Hidden Markov models for detecting remote protein homologies". Bioinformatics. 14 (10). ss. 846-856. doi:10.1093/bioinformatics/14.10.846. PMID 9927713. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O (1999). "BAliBASE: a benchmark alignment database for the evaluation of multiple alignment programs". Bioinformatics. Cilt 15. ss. 87-8. doi:10.1093/bioinformatics/15.1.87. PMID 10068696. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

cornell.edu

cs.cornell.edu

Barzilay R, Lee L. (2002). "Bootstrapping Lexical Choice via Multiple-Sequence Alignment" (PDF). Proceedings of the Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing (EMNLP). Cilt 10. ss. 164-171. doi:10.3115/1118693.1118715. 6 Ocak 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

doi.org

Schneider TD, Stephens RM (1990). "Sequence logos: a new way to display consensus sequences". Nucleic Acids Res. Cilt 18. ss. 6097-6100. doi:10.1093/nar/18.20.6097. PMC 332411 $2. PMID 2172928. 12 Mayıs 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Brudno M, Malde S, Poliakov A, Do CB, Couronne O, Dubchak I, Batzoglou S (2003). "Glocal alignment: finding rearrangements during alignment". Bioinformatics. Cilt 19 Suppl 1. ss. i54-62. doi:10.1093/bioinformatics/btg1005. PMID 12855437. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Lipman DJ, Altschul SF, Kececioglu JD (1989). "A tool for multiple sequence alignment". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 86. ss. 4412-5. doi:10.1073/pnas.86.12.4412. PMID 2734293. 10 Eylül 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Higgins DG, Sharp PM (1988). "CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer". Gene. 73 (1). ss. 237-44. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. PMID 3243435. 14 Şubat 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. (1994). "CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice". Nucleic Acids Res. Cilt 22. ss. 4673-80. doi:10.1093/nar/22.22.4673. PMC 308517 $2. PMID 7984417.
Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, Higgins DG, Thompson JD. (2003). "Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs". Nucleic Acids Res. Cilt 31. ss. 3497-500. doi:10.1093/nar/gkg500. PMID 12824352. 27 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Notredame C, Higgins DG, Heringa J. (2000). "T-Coffee: A novel method for fast and accurate multiple sequence alignment". J Mol Biol. 302 (1). ss. 205-17. doi:10.1006/jmbi.2000.4042. PMID 10964570. 17 Ekim 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Hirosawa M, Totoki Y, Hoshida M, Ishikawa M. (1995). "Comprehensive study on iterative algorithms of multiple sequence alignment". Comput Appl Biosci. Cilt 11. ss. 13-8. doi:10.1093/bioinformatics/11.1.13. PMID 7796270. 21 Şubat 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Karplus K, Barrett C, Hughey R. (1998). "Hidden Markov models for detecting remote protein homologies". Bioinformatics. 14 (10). ss. 846-856. doi:10.1093/bioinformatics/14.10.846. PMID 9927713. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Zhang Y, Skolnick J. (2005). "The protein structure prediction problem could be solved using the current PDB library". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 102. ss. 1029-34. doi:10.1073/pnas.0407152101. PMID 15653774. 8 Mart 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Holm L, Sander C (1996). "Mapping the protein universe". Science. Cilt 273. ss. 595-603. doi:10.1126/science.273.5275.595. PMID 8662544.
Taylor WR, Flores TP, Orengo CA. (1994). "Multiple protein structure alignment". Protein Sci. Cilt 3. ss. 1858-70. doi:10.1002/pro.5560031025. PMID 7849601. ^{[ölü/kırık bağlantı]}
Orengo CA, Michie AD, Jones S, Jones DT, Swindells MB, Thornton JM (1997). "CATH--a hierarchic classification of protein domain structures". Structure. Cilt 5. ss. 1093-108. doi:10.1016/S0969-2126(97)00260-8. PMID 9309224.
Shindyalov IN, Bourne PE. (1998). "Protein structure alignment by incremental combinatorial extension (CE) of the optimal path". Protein Eng. Cilt 11. ss. 739-47. doi:10.1093/protein/11.9.739. PMID 9796821. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Newberg LA (2008). "Significance of gapped sequence alignments". J Comput Biolo. Cilt 15. 1187-1194. doi:10.1089/cmb.2008.0125. PMID 18973434.
Eddy SR (2008). "A probabilistic model of local sequence alignment that simplifies statistical significance estimation". PLoS Comput Biol. Cilt 4. ss. e1000069. doi:10.1371/journal.pcbi.1000069. PMID 18516236.
Newberg LA, Lawrence CE (2009). "Exact Calculation of Distributions on Integers, with Application to Sequence Alignment". J Comput Biolo. 16 (1). 1-18. doi:10.1089/cmb.2008.0137. PMID 19119992.
Kim N, Lee C (2008). "Bioinformatics detection of alternative splicing". Methods Mol. Biol. Cilt 452. ss. 179-97. doi:10.1007/978-1-60327-159-2_9. PMID 18566765.
Li JB, Levanon EY, Yoon JK; ve diğerleri. (Mayıs 2009). "Genome-wide identification of human RNA editing sites by parallel DNA capturing and sequencing". Science. 324 (5931). ss. 1210-3. doi:10.1126/science.1170995. PMID 19478186.
Blazewicz J, Bryja M, Figlerowicz M; ve diğerleri. (Haziran 2009). "Whole genome assembly from 454 sequencing output via modified DNA graph concept". Comput Biol Chem. 33 (3). ss. 224-30. doi:10.1016/j.compbiolchem.2009.04.005. PMID 19477687.
Duran C, Appleby N, Vardy M, Imelfort M, Edwards D, Batley J (Mayıs 2009). "Single nucleotide polymorphism discovery in barley using autoSNPdb". Plant Biotechnol. J. 7 (4). ss. 326-33. doi:10.1111/j.1467-7652.2009.00407.x. PMID 19386041.
Abbott A., Tsay A. (2000). "Sequence Analysis and Optimal Matching Methods in Sociology, Review and Prospect". Sociological Methods and Research. Cilt 29. ss. 3-33. doi:10.1177/0049124100029001001.
Barzilay R, Lee L. (2002). "Bootstrapping Lexical Choice via Multiple-Sequence Alignment" (PDF). Proceedings of the Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing (EMNLP). Cilt 10. ss. 164-171. doi:10.3115/1118693.1118715. 6 Ocak 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Prinzie A., D. Van den Poel (2006). "Incorporating sequential information into traditional classification models by using an element/position-sensitive SAM". Decision Support Systems. 42 (2). ss. 508-526. doi:10.1016/j.dss.2005.02.004. 10 Mart 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010. See also Prinzie and Van den Poel's paper Prinzie, A (2007). "Predicting home-appliance acquisition sequences: Markov/Markov for Discrimination and survival analysis for modeling sequential information in NPTB models". Decision Support Systems. 44 (1). ss. 28-45. doi:10.1016/j.dss.2007.02.008. 10 Ekim 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O (1999). "BAliBASE: a benchmark alignment database for the evaluation of multiple alignment programs". Bioinformatics. Cilt 15. ss. 87-8. doi:10.1093/bioinformatics/15.1.87. PMID 10068696. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O. (1999). "A comprehensive comparison of multiple sequence alignment programs". Nucleic Acids Res. Cilt 27. ss. 2682-90. doi:10.1093/nar/27.13.2682. PMID 10373585. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

elsevier.com

linkinghub.elsevier.com

Higgins DG, Sharp PM (1988). "CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer". Gene. 73 (1). ss. 237-44. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. PMID 3243435. 14 Şubat 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Notredame C, Higgins DG, Heringa J. (2000). "T-Coffee: A novel method for fast and accurate multiple sequence alignment". J Mol Biol. 302 (1). ss. 205-17. doi:10.1006/jmbi.2000.4042. PMID 10964570. 17 Ekim 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

"Ng PC, Henikoff S. Predicting deleterious amino acid substitutions. Genome Res. 2001 May;11(5):863-74". 26 Eylül 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Schneider TD, Stephens RM (1990). "Sequence logos: a new way to display consensus sequences". Nucleic Acids Res. Cilt 18. ss. 6097-6100. doi:10.1093/nar/18.20.6097. PMC 332411 $2. PMID 2172928. 12 Mayıs 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Brudno M, Malde S, Poliakov A, Do CB, Couronne O, Dubchak I, Batzoglou S (2003). "Glocal alignment: finding rearrangements during alignment". Bioinformatics. Cilt 19 Suppl 1. ss. i54-62. doi:10.1093/bioinformatics/btg1005. PMID 12855437. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Wang L, Jiang T. (1994). "On the complexity of multiple sequence alignment". J Comput Biol. Cilt 1. ss. 337-48. PMID 8790475.
Lipman DJ, Altschul SF, Kececioglu JD (1989). "A tool for multiple sequence alignment". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 86. ss. 4412-5. doi:10.1073/pnas.86.12.4412. PMID 2734293. 10 Eylül 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Higgins DG, Sharp PM (1988). "CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer". Gene. 73 (1). ss. 237-44. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. PMID 3243435. 14 Şubat 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. (1994). "CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice". Nucleic Acids Res. Cilt 22. ss. 4673-80. doi:10.1093/nar/22.22.4673. PMC 308517 $2. PMID 7984417.
Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, Higgins DG, Thompson JD. (2003). "Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs". Nucleic Acids Res. Cilt 31. ss. 3497-500. doi:10.1093/nar/gkg500. PMID 12824352. 27 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Notredame C, Higgins DG, Heringa J. (2000). "T-Coffee: A novel method for fast and accurate multiple sequence alignment". J Mol Biol. 302 (1). ss. 205-17. doi:10.1006/jmbi.2000.4042. PMID 10964570. 17 Ekim 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Hirosawa M, Totoki Y, Hoshida M, Ishikawa M. (1995). "Comprehensive study on iterative algorithms of multiple sequence alignment". Comput Appl Biosci. Cilt 11. ss. 13-8. doi:10.1093/bioinformatics/11.1.13. PMID 7796270. 21 Şubat 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Karplus K, Barrett C, Hughey R. (1998). "Hidden Markov models for detecting remote protein homologies". Bioinformatics. 14 (10). ss. 846-856. doi:10.1093/bioinformatics/14.10.846. PMID 9927713. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Chothia C, Lesk AM. (Nisan 1986). "The relation between the divergence of sequence and structure in proteins". EMBO J. 5 (4). ss. 823-6. PMC 1166865 $2. PMID 3709526.
Zhang Y, Skolnick J. (2005). "The protein structure prediction problem could be solved using the current PDB library". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 102. ss. 1029-34. doi:10.1073/pnas.0407152101. PMID 15653774. 8 Mart 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Holm L, Sander C (1996). "Mapping the protein universe". Science. Cilt 273. ss. 595-603. doi:10.1126/science.273.5275.595. PMID 8662544.
Taylor WR, Flores TP, Orengo CA. (1994). "Multiple protein structure alignment". Protein Sci. Cilt 3. ss. 1858-70. doi:10.1002/pro.5560031025. PMID 7849601. ^{[ölü/kırık bağlantı]}
Orengo CA, Michie AD, Jones S, Jones DT, Swindells MB, Thornton JM (1997). "CATH--a hierarchic classification of protein domain structures". Structure. Cilt 5. ss. 1093-108. doi:10.1016/S0969-2126(97)00260-8. PMID 9309224.
Shindyalov IN, Bourne PE. (1998). "Protein structure alignment by incremental combinatorial extension (CE) of the optimal path". Protein Eng. Cilt 11. ss. 739-47. doi:10.1093/protein/11.9.739. PMID 9796821. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Newberg LA (2008). "Significance of gapped sequence alignments". J Comput Biolo. Cilt 15. 1187-1194. doi:10.1089/cmb.2008.0125. PMID 18973434.
Eddy SR (2008). "A probabilistic model of local sequence alignment that simplifies statistical significance estimation". PLoS Comput Biol. Cilt 4. ss. e1000069. doi:10.1371/journal.pcbi.1000069. PMID 18516236.
Newberg LA, Lawrence CE (2009). "Exact Calculation of Distributions on Integers, with Application to Sequence Alignment". J Comput Biolo. 16 (1). 1-18. doi:10.1089/cmb.2008.0137. PMID 19119992.
Kim N, Lee C (2008). "Bioinformatics detection of alternative splicing". Methods Mol. Biol. Cilt 452. ss. 179-97. doi:10.1007/978-1-60327-159-2_9. PMID 18566765.
Li JB, Levanon EY, Yoon JK; ve diğerleri. (Mayıs 2009). "Genome-wide identification of human RNA editing sites by parallel DNA capturing and sequencing". Science. 324 (5931). ss. 1210-3. doi:10.1126/science.1170995. PMID 19478186.
Blazewicz J, Bryja M, Figlerowicz M; ve diğerleri. (Haziran 2009). "Whole genome assembly from 454 sequencing output via modified DNA graph concept". Comput Biol Chem. 33 (3). ss. 224-30. doi:10.1016/j.compbiolchem.2009.04.005. PMID 19477687.
Duran C, Appleby N, Vardy M, Imelfort M, Edwards D, Batley J (Mayıs 2009). "Single nucleotide polymorphism discovery in barley using autoSNPdb". Plant Biotechnol. J. 7 (4). ss. 326-33. doi:10.1111/j.1467-7652.2009.00407.x. PMID 19386041.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O (1999). "BAliBASE: a benchmark alignment database for the evaluation of multiple alignment programs". Bioinformatics. Cilt 15. ss. 87-8. doi:10.1093/bioinformatics/15.1.87. PMID 10068696. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O. (1999). "A comprehensive comparison of multiple sequence alignment programs". Nucleic Acids Res. Cilt 27. ss. 2682-90. doi:10.1093/nar/27.13.2682. PMID 10373585. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

oxfordjournals.org

nar.oxfordjournals.org

Schneider TD, Stephens RM (1990). "Sequence logos: a new way to display consensus sequences". Nucleic Acids Res. Cilt 18. ss. 6097-6100. doi:10.1093/nar/18.20.6097. PMC 332411 $2. PMID 2172928. 12 Mayıs 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. (1994). "CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice". Nucleic Acids Res. Cilt 22. ss. 4673-80. doi:10.1093/nar/22.22.4673. PMC 308517 $2. PMID 7984417.
Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, Higgins DG, Thompson JD. (2003). "Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs". Nucleic Acids Res. Cilt 31. ss. 3497-500. doi:10.1093/nar/gkg500. PMID 12824352. 27 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O. (1999). "A comprehensive comparison of multiple sequence alignment programs". Nucleic Acids Res. Cilt 27. ss. 2682-90. doi:10.1093/nar/27.13.2682. PMID 10373585. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

bioinformatics.oxfordjournals.org

Brudno M, Malde S, Poliakov A, Do CB, Couronne O, Dubchak I, Batzoglou S (2003). "Glocal alignment: finding rearrangements during alignment". Bioinformatics. Cilt 19 Suppl 1. ss. i54-62. doi:10.1093/bioinformatics/btg1005. PMID 12855437. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Hirosawa M, Totoki Y, Hoshida M, Ishikawa M. (1995). "Comprehensive study on iterative algorithms of multiple sequence alignment". Comput Appl Biosci. Cilt 11. ss. 13-8. doi:10.1093/bioinformatics/11.1.13. PMID 7796270. 21 Şubat 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Karplus K, Barrett C, Hughey R. (1998). "Hidden Markov models for detecting remote protein homologies". Bioinformatics. 14 (10). ss. 846-856. doi:10.1093/bioinformatics/14.10.846. PMID 9927713. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O (1999). "BAliBASE: a benchmark alignment database for the evaluation of multiple alignment programs". Bioinformatics. Cilt 15. ss. 87-8. doi:10.1093/bioinformatics/15.1.87. PMID 10068696. 13 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

peds.oxfordjournals.org

Shindyalov IN, Bourne PE. (1998). "Protein structure alignment by incremental combinatorial extension (CE) of the optimal path". Protein Eng. Cilt 11. ss. 739-47. doi:10.1093/protein/11.9.739. PMID 9796821. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

pnas.org

Lipman DJ, Altschul SF, Kececioglu JD (1989). "A tool for multiple sequence alignment". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 86. ss. 4412-5. doi:10.1073/pnas.86.12.4412. PMID 2734293. 10 Eylül 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Zhang Y, Skolnick J. (2005). "The protein structure prediction problem could be solved using the current PDB library". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 102. ss. 1029-34. doi:10.1073/pnas.0407152101. PMID 15653774. 8 Mart 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

proteinscience.org

Taylor WR, Flores TP, Orengo CA. (1994). "Multiple protein structure alignment". Protein Sci. Cilt 3. ss. 1858-70. doi:10.1002/pro.5560031025. PMID 7849601. ^{[ölü/kırık bağlantı]}

repec.org

econpapers.repec.org

Prinzie A., D. Van den Poel (2006). "Incorporating sequential information into traditional classification models by using an element/position-sensitive SAM". Decision Support Systems. 42 (2). ss. 508-526. doi:10.1016/j.dss.2005.02.004. 10 Mart 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010. See also Prinzie and Van den Poel's paper Prinzie, A (2007). "Predicting home-appliance acquisition sequences: Markov/Markov for Discrimination and survival analysis for modeling sequential information in NPTB models". Decision Support Systems. 44 (1). ss. 28-45. doi:10.1016/j.dss.2007.02.008. 10 Ekim 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.

sciencemag.org

Holm L, Sander C (1996). "Mapping the protein universe". Science. Cilt 273. ss. 595-603. doi:10.1126/science.273.5275.595. PMID 8662544.

ualberta.ca

cs.ualberta.ca

Kondrak, Grzegorz (2002). "Algorithms for Language Reconstruction" (PDF). University of Toronto, Ontario. 26 Mart 2009 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2007.

web.archive.org

"Ng PC, Henikoff S. Predicting deleterious amino acid substitutions. Genome Res. 2001 May;11(5):863-74". 26 Eylül 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Schneider TD, Stephens RM (1990). "Sequence logos: a new way to display consensus sequences". Nucleic Acids Res. Cilt 18. ss. 6097-6100. doi:10.1093/nar/18.20.6097. PMC 332411 $2. PMID 2172928. 12 Mayıs 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Lipman DJ, Altschul SF, Kececioglu JD (1989). "A tool for multiple sequence alignment". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 86. ss. 4412-5. doi:10.1073/pnas.86.12.4412. PMID 2734293. 10 Eylül 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Higgins DG, Sharp PM (1988). "CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer". Gene. 73 (1). ss. 237-44. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. PMID 3243435. 14 Şubat 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, Higgins DG, Thompson JD. (2003). "Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs". Nucleic Acids Res. Cilt 31. ss. 3497-500. doi:10.1093/nar/gkg500. PMID 12824352. 27 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Notredame C, Higgins DG, Heringa J. (2000). "T-Coffee: A novel method for fast and accurate multiple sequence alignment". J Mol Biol. 302 (1). ss. 205-17. doi:10.1006/jmbi.2000.4042. PMID 10964570. 17 Ekim 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Hirosawa M, Totoki Y, Hoshida M, Ishikawa M. (1995). "Comprehensive study on iterative algorithms of multiple sequence alignment". Comput Appl Biosci. Cilt 11. ss. 13-8. doi:10.1093/bioinformatics/11.1.13. PMID 7796270. 21 Şubat 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Zhang Y, Skolnick J. (2005). "The protein structure prediction problem could be solved using the current PDB library". Proc Natl Acad Sci USA. Cilt 102. ss. 1029-34. doi:10.1073/pnas.0407152101. PMID 15653774. 8 Mart 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Shindyalov IN, Bourne PE. (1998). "Protein structure alignment by incremental combinatorial extension (CE) of the optimal path". Protein Eng. Cilt 11. ss. 739-47. doi:10.1093/protein/11.9.739. PMID 9796821. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Barzilay R, Lee L. (2002). "Bootstrapping Lexical Choice via Multiple-Sequence Alignment" (PDF). Proceedings of the Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing (EMNLP). Cilt 10. ss. 164-171. doi:10.3115/1118693.1118715. 6 Ocak 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Kondrak, Grzegorz (2002). "Algorithms for Language Reconstruction" (PDF). University of Toronto, Ontario. 26 Mart 2009 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2007.
Prinzie A., D. Van den Poel (2006). "Incorporating sequential information into traditional classification models by using an element/position-sensitive SAM". Decision Support Systems. 42 (2). ss. 508-526. doi:10.1016/j.dss.2005.02.004. 10 Mart 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010. See also Prinzie and Van den Poel's paper Prinzie, A (2007). "Predicting home-appliance acquisition sequences: Markov/Markov for Discrimination and survival analysis for modeling sequential information in NPTB models". Decision Support Systems. 44 (1). ss. 28-45. doi:10.1016/j.dss.2007.02.008. 10 Ekim 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.
Thompson JD, Plewniak F, Poch O. (1999). "A comprehensive comparison of multiple sequence alignment programs". Nucleic Acids Res. Cilt 27. ss. 2682-90. doi:10.1093/nar/27.13.2682. PMID 10373585. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ağustos 2010.