Метагеноміка (Ukrainian Wikipedia)

Analysis of information sources in references of the Wikipedia article "Метагеноміка" in Ukrainian language version.

refsWebsite

Global rank Ukrainian rank

108nih.gov

4^th place

5^th place

106doi.org

2^nd place

4^th place

99worldcat.org

5^th place

9^th place

20frontiersin.org

4,679^th place

904^th place

19sciencedirect.com

149^th place

211^th place

13nature.com

234^th place

157^th place

9springer.com

274^th place

202^nd place

9biomedcentral.com

2,747^th place

1,160^th place

8mdpi.com

2,912^th place

535^th place

3intechopen.com

low place

7,616^th place

2tandfonline.com

507^th place

1,141^st place

2plos.org

2,112^th place

1,541^st place

2oup.com

485^th place

750^th place

2asm.org

3,555^th place

1,874^th place

1microbiologyresearch.org

low place

1acs.org

1,248^th place

900^th place

1sagepub.com

731^st place

796^th place

1iop.org

1,725^th place

874^th place

1wjgnet.com

low place

1hindawi.com

6,828^th place

4,204^th place

1wiley.com

222^nd place

164^th place

1accesswater.org

low place

accesswater.org

Annavajhala, Medini; Fanyin-Martin, Ato; Taher, Edris; Elk, Michael; Kapoor, Vikram; Santo-Domingo, Jorge; Chandran, Kartik (1 січня 2017). Metagenomics of Anaerobic Food Waste Fermentation. Proceedings of the Water Environment Federation (англ.). Т. 2017, № 7. с. 4041—4047. doi:10.2175/193864717822156181. ISSN 1938-6478. Процитовано 20 грудня 2023.

acs.org

pubs.acs.org

Liu, Chao; Huang, Haining; Duan, Xu; Chen, Yinguang (2 листопада 2021). Integrated Metagenomic and Metaproteomic Analyses Unravel Ammonia Toxicity to Active Methanogens and Syntrophs, Enzyme Synthesis, and Key Enzymes in Anaerobic Digestion. Environmental Science & Technology (англ.). Т. 55, № 21. с. 14817—14827. doi:10.1021/acs.est.1c00797. ISSN 0013-936X. Процитовано 20 грудня 2023.

asm.org

journals.asm.org

Porcellato, Davide; Pierce, Emily C.; Dinh, Cong B.; Portik, Daniel; Hall, Richard; Ashby, Meredith; Dutton, Rachel J. (23 лютого 2023). Cotter, Paul D. (ред.). Longitudinal, Multi-Platform Metagenomics Yields a High-Quality Genomic Catalog and Guides an In Vitro Model for Cheese Communities. mSystems (англ.). Т. 8, № 1. doi:10.1128/msystems.00701-22. ISSN 2379-5077. PMC 9948695. PMID 36622155. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Malli Mohan, Ganesh Babu; Parker, Ceth W.; Urbaniak, Camilla; Singh, Nitin K.; Hood, Anthony; Minich, Jeremiah J.; Knight, Rob; Rucker, Michelle; Venkateswaran, Kasthuri (25 серпня 2020). Sangwan, Naseer (ред.). Microbiome and Metagenome Analyses of a Closed Habitat during Human Occupation. mSystems (англ.). Т. 5, № 4. doi:10.1128/mSystems.00367-20. ISSN 2379-5077. PMC 7394354. PMID 32723791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)

biomedcentral.com

microbiomejournal.biomedcentral.com

Vidulin, Vedrana; Šmuc, Tomislav; Džeroski, Sašo; Supek, Fran (2018-12). The evolutionary signal in metagenome phyletic profiles predicts many gene functions. Microbiome (англ.). Т. 6, № 1. doi:10.1186/s40168-018-0506-4. ISSN 2049-2618. PMC 6040064. PMID 29991352. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Be, Nicholas A.; Avila-Herrera, Aram; Allen, Jonathan E.; Singh, Nitin; Checinska Sielaff, Aleksandra; Jaing, Crystal; Venkateswaran, Kasthuri (2017-12). Whole metagenome profiles of particulates collected from the International Space Station. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0292-4. ISSN 2049-2618. PMC 5514531. PMID 28716113. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Schwendner, Petra; Mahnert, Alexander; Koskinen, Kaisa; Moissl-Eichinger, Christine; Barczyk, Simon; Wirth, Reinhard; Berg, Gabriele; Rettberg, Petra (2017-12). Preparing for the crewed Mars journey: microbiota dynamics in the confined Mars500 habitat during simulated Mars flight and landing. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0345-8. ISSN 2049-2618. PMC 5627443. PMID 28974259. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

bmcmicrobiol.biomedcentral.com

Shao, Li; Liao, Jie; Qian, Jingyang; Chen, Wenbin; Fan, Xiaohui (2021-12). MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiology (англ.). Т. 21, № 1. doi:10.1186/s12866-021-02321-z. ISSN 1471-2180. PMC 8485520. PMID 34592929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Feng, Gang; Xie, Tian; Wang, Xin; Bai, Jiuyuan; Tang, Lin; Zhao, Hai; Wei, Wei; Wang, Maolin; Zhao, Yun (2018-12). Metagenomic analysis of microbial community and function involved in cd-contaminated soil. BMC Microbiology (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s12866-018-1152-5. ISSN 1471-2180. PMC 5812035. PMID 29439665. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

biologydirect.biomedcentral.com

Kawulok, Jolanta; Kawulok, Michal; Deorowicz, Sebastian (2019-12). Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint. Biology Direct (англ.). Т. 14, № 1. doi:10.1186/s13062-019-0251-z. ISSN 1745-6150. PMC 6854650. PMID 31722729. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

environmentalmicrobiome.biomedcentral.com

Schiml, Valerie C.; Delogu, Francesco; Kumar, Praveen; Kunath, Benoit; Batut, Bérénice; Mehta, Subina; Johnson, James E.; Grüning, Björn; Pope, Phillip B. (7 липня 2023). Integrative meta-omics in Galaxy and beyond. Environmental Microbiome (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s40793-023-00514-9. ISSN 2524-6372. PMC 10329324. PMID 37420292. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

bmcmedresmethodol.biomedcentral.com

Alshawaqfeh, Mustafa; Rababah, Salahelden; Hayajneh, Abdullah; Gharaibeh, Ammar; Serpedin, Erchin (28 грудня 2022). MetaAnalyst: a user-friendly tool for metagenomic biomarker detection and phenotype classification. BMC Medical Research Methodology (англ.). Т. 22, № 1. doi:10.1186/s12874-022-01812-5. ISSN 1471-2288. PMC 9795700. PMID 36577938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

genomemedicine.biomedcentral.com

Miller, Ruth R; Montoya, Vincent; Gardy, Jennifer L; Patrick, David M; Tang, Patrick (2013). Metagenomics for pathogen detection in public health. Genome Medicine (англ.). Т. 5, № 9. с. 81. doi:10.1186/gm485. ISSN 1756-994X. PMC 3978900. PMID 24050114. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

doi.org

Chiu, Charles Y.; Miller, Steven A. (2019-06). Clinical metagenomics. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 6. с. 341—355. doi:10.1038/s41576-019-0113-7. ISSN 1471-0064. PMC 6858796. PMID 30918369. Процитовано 11 червня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Slavov, Svetoslav Nanev (2022-11). Viral Metagenomics for Identification of Emerging Viruses in Transfusion Medicine. Viruses (англ.). Т. 14, № 11. с. 2448. doi:10.3390/v14112448. ISSN 1999-4915. PMC 9699440. PMID 36366546. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pérez-Cobas, Ana Elena; Gomez-Valero, Laura; Buchrieser, Carmen (2020). Metagenomic approaches in microbial ecology: an update on whole-genome and marker gene sequencing analyses. Microbial Genomics. Т. 6, № 8. с. e000409. doi:10.1099/mgen.0.000409. ISSN 2057-5858. PMC 7641418. PMID 32706331. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Taş, Neslihan; de Jong, Anniek EE; Li, Yaoming; Trubl, Gareth; Xue, Yaxin; Dove, Nicholas C (1 лютого 2021). Metagenomic tools in microbial ecology research. Current Opinion in Biotechnology. Т. 67. с. 184—191. doi:10.1016/j.copbio.2021.01.019. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
Vecherskii, M. V.; Semenov, M. V.; Lisenkova, A. A.; Stepankov, A. A. (2021-12). Metagenomics: A New Direction in Ecology. Biology Bulletin (англ.). Т. 48, № S3. с. S107—S117. doi:10.1134/S1062359022010150. ISSN 1062-3590. Процитовано 20 грудня 2023.
Prayogo, Fitra Adi; Budiharjo, Anto; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti; Wijanarka, Wijanarka; Suprihadi, Agung; Nurhayati, Nurhayati (4 серпня 2020). Metagenomic applications in exploration and development of novel enzymes from nature: a review. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. Т. 18, № 1. с. 39. doi:10.1186/s43141-020-00043-9. ISSN 2090-5920. PMC 7403272. PMID 32749574. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
d’Humières, Camille; Salmona, Maud; Dellière, Sarah; Leo, Stefano; Rodriguez, Christophe; Angebault, Cécile; Alanio, Alexandre; Fourati, Slim; Lazarevic, Vladimir (2021-09). The Potential Role of Clinical Metagenomics in Infectious Diseases: Therapeutic Perspectives. Drugs (англ.). Т. 81, № 13. с. 1453—1466. doi:10.1007/s40265-021-01572-4. ISSN 0012-6667. PMC 8323086. PMID 34328626. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
N. Sabale, Shrinivas; P. Suryawanshi, Padmaja; P.U., Krishnaraj (25 березня 2020). N. Hozzein, Wael (ред.). Soil Metagenomics: Concepts and Applications. Metagenomics - Basics, Methods and Applications (англ.). IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.88958. ISBN 978-1-83880-055-0.
Kaushik, Prashant; Singh Sandhu, Opinder; Singh Brar, Navjot; Kumar, Vivek; Singh Malhi, Gurdeep; Kesh, Hari; Saini, Ishan (28 липня 2021). Radhakrishnan, Ramalingam (ред.). Soil Metagenomics: Prospects and Challenges. Mycorrhizal Fungi - Utilization in Agriculture and Industry (англ.). IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.93306. ISBN 978-1-83881-940-8.
Nowrotek, Monika; Jałowiecki, Łukasz; Harnisz, Monika; Płaza, Grażyna Anna (2019-06). Culturomics and metagenomics: In understanding of environmental resistome. Frontiers of Environmental Science & Engineering (англ.). Т. 13, № 3. doi:10.1007/s11783-019-1121-8. ISSN 2095-2201. Процитовано 20 грудня 2023.
Kawulok, Jolanta; Kawulok, Michal; Deorowicz, Sebastian (2019-12). Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint. Biology Direct (англ.). Т. 14, № 1. doi:10.1186/s13062-019-0251-z. ISSN 1745-6150. PMC 6854650. PMID 31722729. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhang, Lu; Chen, FengXin; Zeng, Zhan; Xu, Mengjiao; Sun, Fangfang; Yang, Liu; Bi, Xiaoyue; Lin, Yanjie; Gao, YuanJiao (2021). Advances in Metagenomics and Its Application in Environmental Microorganisms. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.766364. ISSN 1664-302X. PMC 8719654. PMID 34975791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Davis, Benjamin C.; Brown, Connor; Gupta, Suraj; Calarco, Jeannette; Liguori, Krista; Milligan, Erin; Harwood, Valerie J.; Pruden, Amy; Keenum, Ishi (2 жовтня 2023). Recommendations for the use of metagenomics for routine monitoring of antibiotic resistance in wastewater and impacted aquatic environments. Critical Reviews in Environmental Science and Technology (англ.). Т. 53, № 19. с. 1731—1756. doi:10.1080/10643389.2023.2181620. ISSN 1064-3389. Процитовано 20 грудня 2023.
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Breitwieser, Florian P; Lu, Jennifer; Salzberg, Steven L (19 липня 2019). A review of methods and databases for metagenomic classification and assembly. Briefings in Bioinformatics (англ.). Т. 20, № 4. с. 1125—1136. doi:10.1093/bib/bbx120. ISSN 1467-5463. PMC 6781581. PMID 29028872. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Shao, Li; Liao, Jie; Qian, Jingyang; Chen, Wenbin; Fan, Xiaohui (2021-12). MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiology (англ.). Т. 21, № 1. doi:10.1186/s12866-021-02321-z. ISSN 1471-2180. PMC 8485520. PMID 34592929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Dapeng (2023). Mitra, Suparna (ред.). Metagenomics Databases for Bacteria. Metagenomic Data Analysis (англ.). New York, NY: Springer US. с. 55—67. doi:10.1007/978-1-0716-3072-3_3. ISBN 978-1-0716-3072-3.
Wang, Yanan; Hu, Yongfei; Gao, George Fu (1 березня 2020). Combining metagenomics and metatranscriptomics to study human, animal and environmental resistomes. Medicine in Microecology. Т. 3. с. 100014. doi:10.1016/j.medmic.2020.100014. ISSN 2590-0978. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yanan; Hu, Yongfei; Liu, Fei; Cao, Jian; Lv, Na; Zhu, Baoli; Zhang, Gaiping; Gao, George Fu (1 травня 2020). Integrated metagenomic and metatranscriptomic profiling reveals differentially expressed resistomes in human, chicken, and pig gut microbiomes. Environment International. Т. 138. с. 105649. doi:10.1016/j.envint.2020.105649. ISSN 0160-4120. Процитовано 20 грудня 2023.
Saenz, Carmen; Nigro, Eleonora; Gunalan, Vithiagaran; Arumugam, Manimozhiyan (2022). MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.846922. ISSN 2673-7647. PMC 9580859. PMID 36304282. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhao, Ming; Zhang, Dong-lian; Su, Xiao-qin; Duan, Shuang-mei; Wan, Jin-qiong; Yuan, Wen-xia; Liu, Ben-ying; Ma, Yan; Pan, Ying-hong (14 травня 2015). An Integrated Metagenomics/Metaproteomics Investigation of the Microbial Communities and Enzymes in Solid-state Fermentation of Pu-erh tea. Scientific Reports (англ.). Т. 5, № 1. с. 10117. doi:10.1038/srep10117. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Liu, Chao; Huang, Haining; Duan, Xu; Chen, Yinguang (2 листопада 2021). Integrated Metagenomic and Metaproteomic Analyses Unravel Ammonia Toxicity to Active Methanogens and Syntrophs, Enzyme Synthesis, and Key Enzymes in Anaerobic Digestion. Environmental Science & Technology (англ.). Т. 55, № 21. с. 14817—14827. doi:10.1021/acs.est.1c00797. ISSN 0013-936X. Процитовано 20 грудня 2023.
Shi, Yanmei; Tyson, Gene W.; Eppley, John M.; DeLong, Edward F. (2011-06). Integrated metatranscriptomic and metagenomic analyses of stratified microbial assemblages in the open ocean. The ISME Journal (англ.). Т. 5, № 6. с. 999—1013. doi:10.1038/ismej.2010.189. ISSN 1751-7370. Процитовано 20 грудня 2023.
Aguiar-Pulido, Vanessa; Huang, Wenrui; Suarez-Ulloa, Victoria; Cickovski, Trevor; Mathee, Kalai; Narasimhan, Giri (2016-01). Metagenomics, Metatranscriptomics, and Metabolomics Approaches for Microbiome Analysis: Supplementary Issue: Bioinformatics Methods and Applications for Big Metagenomics Data. Evolutionary Bioinformatics (англ.). Т. 12s1. с. EBO.S36436. doi:10.4137/EBO.S36436. ISSN 1176-9343. PMC 4869604. PMID 27199545. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Herold, Malte; Martínez Arbas, Susana; Narayanasamy, Shaman; Sheik, Abdul R.; Kleine-Borgmann, Luise A. K.; Lebrun, Laura A.; Kunath, Benoît J.; Roume, Hugo; Bessarab, Irina (19 жовтня 2020). Integration of time-series meta-omics data reveals how microbial ecosystems respond to disturbance. Nature Communications (англ.). Т. 11, № 1. с. 5281. doi:10.1038/s41467-020-19006-2. ISSN 2041-1723. Процитовано 20 грудня 2023.
Schiml, Valerie C.; Delogu, Francesco; Kumar, Praveen; Kunath, Benoit; Batut, Bérénice; Mehta, Subina; Johnson, James E.; Grüning, Björn; Pope, Phillip B. (7 липня 2023). Integrative meta-omics in Galaxy and beyond. Environmental Microbiome (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s40793-023-00514-9. ISSN 2524-6372. PMC 10329324. PMID 37420292. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Kodikara, Saritha; Ellul, Susan; Lê Cao, Kim-Anh (14 липня 2022). Statistical challenges in longitudinal microbiome data analysis. Briefings in Bioinformatics. Т. 23, № 4. doi:10.1093/bib/bbac273. ISSN 1467-5463. PMC 9294433. PMID 35830875. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Luo, Dan; Liu, Wenwei; Chen, Tian; An, Lingling (2022-07). A Distribution-Free Model for Longitudinal Metagenomic Count Data. Genes (англ.). Т. 13, № 7. с. 1183. doi:10.3390/genes13071183. ISSN 2073-4425. PMC 9316307. PMID 35885966. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Porcellato, Davide; Pierce, Emily C.; Dinh, Cong B.; Portik, Daniel; Hall, Richard; Ashby, Meredith; Dutton, Rachel J. (23 лютого 2023). Cotter, Paul D. (ред.). Longitudinal, Multi-Platform Metagenomics Yields a High-Quality Genomic Catalog and Guides an In Vitro Model for Cheese Communities. mSystems (англ.). Т. 8, № 1. doi:10.1128/msystems.00701-22. ISSN 2379-5077. PMC 9948695. PMID 36622155. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Feng, Gang; Xie, Tian; Wang, Xin; Bai, Jiuyuan; Tang, Lin; Zhao, Hai; Wei, Wei; Wang, Maolin; Zhao, Yun (2018-12). Metagenomic analysis of microbial community and function involved in cd-contaminated soil. BMC Microbiology (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s12866-018-1152-5. ISSN 1471-2180. PMC 5812035. PMID 29439665. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Effendi, Y; Pambudi, A.; Sasaerila, Y.; WijiHastuti, R. S. (1 грудня 2019). Metagenomic analysis of diversity and composition of soil bacteria under intercropping system Hevea brasiliensis and Canna indica. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. Т. 391, № 1. с. 012023. doi:10.1088/1755-1315/391/1/012023. ISSN 1755-1307. Процитовано 20 грудня 2023.
Chen, Huaihai; Ma, Kayan; Lu, Caiyan; Fu, Qi; Qiu, Yingbo; Zhao, Jiayi; Huang, Yu; Yang, Yuchun; Schadt, Christopher W. (2022). Functional Redundancy in Soil Microbial Community Based on Metagenomics Across the Globe. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.878978. ISSN 1664-302X. PMC 9108720. PMID 35586865. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Singh, Nidhi; Singh, Veer; Rai, Sachchida Nand; Vamanu, Emanuel; Singh, Mohan P. (2022-12). Metagenomic Analysis of Garden Soil-Derived Microbial Consortia and Unveiling Their Metabolic Potential in Mitigating Toxic Hexavalent Chromium. Life (англ.). Т. 12, № 12. с. 2094. doi:10.3390/life12122094. ISSN 2075-1729. PMC 9781466. PMID 36556458. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhao, Aiwen; Lu, Yuntao; Li, Qi; Li, Tao; Zhao, Jindong (2023). Metagenomics reveals the diversity and role of surface-water microbes in biogeochemical cycles in lakes at different terrain ladders. Frontiers in Environmental Science. Т. 11. doi:10.3389/fenvs.2023.1121775. ISSN 2296-665X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Lewin, Anna; Wentzel, Alexander; Valla, Svein (1 червня 2013). Metagenomics of microbial life in extreme temperature environments. Current Opinion in Biotechnology. Т. 24, № 3. с. 516—525. doi:10.1016/j.copbio.2012.10.012. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
Cowan, DA; Ramond, J-B; Makhalanyane, TP; De Maayer, P (1 червня 2015). Metagenomics of extreme environments. Current Opinion in Microbiology. Т. 25. с. 97—102. doi:10.1016/j.mib.2015.05.005. ISSN 1369-5274. Процитовано 20 грудня 2023.
M. Shuikan, Ahmed; M. Alshuwaykan, Rakan; A. Arif, Ibrahim (3 травня 2023). Najjari, Afef (ред.). The Role of Metagenomic Approaches in the Analysis of Microbial Community in Extreme Environment. Life in Extreme Environments - Diversity, Adaptability and Valuable Resources of Bioactive Molecules (англ.). IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.108050. ISBN 978-1-80356-818-8.
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nam, Nguyen Nhat; Do, Hoang Dang Khoa; Loan Trinh, Kieu The; Lee, Nae Yoon (2023-01). Metagenomics: An Effective Approach for Exploring Microbial Diversity and Functions. Foods (англ.). Т. 12, № 11. с. 2140. doi:10.3390/foods12112140. ISSN 2304-8158. PMC 10252221. PMID 37297385. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Ghosh, Shreya; Das, Alok Prasad (29 травня 2018). Metagenomic insights into the microbial diversity in manganese-contaminated mine tailings and their role in biogeochemical cycling of manganese. Scientific Reports (англ.). Т. 8, № 1. с. 8257. doi:10.1038/s41598-018-26311-w. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Xue, Chun-Xu; Lin, Heyu; Zhu, Xiao-Yu; Liu, Jiwen; Zhang, Yunhui; Rowley, Gary; Todd, Jonathan D.; Li, Meng; Zhang, Xiao-Hua (2 серпня 2021). DiTing: A Pipeline to Infer and Compare Biogeochemical Pathways From Metagenomic and Metatranscriptomic Data. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.698286. ISSN 1664-302X. PMC 8367434. PMID 34408730. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Wei-Lin; Xu, Shao-Yan; Ren, Zhi-Gang; Tao, Liang; Jiang, Jian-Wen; Zheng, Shu-Sen (21 січня 2015). Application of metagenomics in the human gut microbiome. World Journal of Gastroenterology (англ.). Т. 21, № 3. с. 803—814. doi:10.3748/wjg.v21.i3.803. PMC 4299332. PMID 25624713. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malla, Muneer Ahmad; Dubey, Anamika; Kumar, Ashwani; Yadav, Shweta; Hashem, Abeer; Abd_Allah, Elsayed Fathi (2019). Exploring the Human Microbiome: The Potential Future Role of Next-Generation Sequencing in Disease Diagnosis and Treatment. Frontiers in Immunology. Т. 9. doi:10.3389/fimmu.2018.02868. ISSN 1664-3224. PMC 6330296. PMID 30666248. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Szóstak, Natalia; Szymanek, Agata; Havránek, Jan; Tomela, Katarzyna; Rakoczy, Magdalena; Samelak-Czajka, Anna; Schmidt, Marcin; Figlerowicz, Marek; Majta, Jan (19 травня 2022). The standardisation of the approach to metagenomic human gut analysis: from sample collection to microbiome profiling. Scientific Reports (англ.). Т. 12, № 1. с. 8470. doi:10.1038/s41598-022-12037-3. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Puig-Castellví, Francesc; Pacheco-Tapia, Romina; Deslande, Maxime; Jia, Manyi; Andrikopoulos, Petros; Chechi, Kanta; Bonnefond, Amélie; Froguel, Philippe; Dumas, Marc-Emmanuel (1 жовтня 2023). Advances in the integration of metabolomics and metagenomics for human gut microbiome and their clinical applications. TrAC Trends in Analytical Chemistry. Т. 167. с. 117248. doi:10.1016/j.trac.2023.117248. ISSN 0165-9936. Процитовано 20 грудня 2023.
Segata, Nicola; Izard, Jacques; Waldron, Levi; Gevers, Dirk; Miropolsky, Larisa; Garrett, Wendy S.; Huttenhower, Curtis (24 червня 2011). Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biology. Т. 12, № 6. с. R60. doi:10.1186/gb-2011-12-6-r60. ISSN 1474-760X. PMC 3218848. PMID 21702898. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wu, Honglong; Cai, Lihua; Li, Dongfang; Wang, Xinying; Zhao, Shancen; Zou, Fuhao; Zhou, Ke (11 січня 2018). Metagenomics Biomarkers Selected for Prediction of Three Different Diseases in Chinese Population. BioMed Research International (англ.). Т. 2018. с. e2936257. doi:10.1155/2018/2936257. ISSN 2314-6133. PMC 5820663. PMID 29568746. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Qian, Yiwei; Yang, Xiaodong; Xu, Shaoqing; Huang, Pei; Li, Binyin; Du, Juanjuan; He, Yixi; Su, Binghua; Xu, Li-Ming (1 серпня 2020). Gut metagenomics-derived genes as potential biomarkers of Parkinson’s disease. Brain. Т. 143, № 8. с. 2474—2489. doi:10.1093/brain/awaa201. ISSN 0006-8950. Процитовано 20 грудня 2023.
Alshawaqfeh, Mustafa; Rababah, Salahelden; Hayajneh, Abdullah; Gharaibeh, Ammar; Serpedin, Erchin (28 грудня 2022). MetaAnalyst: a user-friendly tool for metagenomic biomarker detection and phenotype classification. BMC Medical Research Methodology (англ.). Т. 22, № 1. doi:10.1186/s12874-022-01812-5. ISSN 1471-2288. PMC 9795700. PMID 36577938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Fadiji, Ayomide Emmanuel; Babalola, Olubukola Oluranti (1 березня 2020). Metagenomics methods for the study of plant-associated microbial communities: A review. Journal of Microbiological Methods. Т. 170. с. 105860. doi:10.1016/j.mimet.2020.105860. ISSN 0167-7012. Процитовано 20 грудня 2023.
Nwachukwu, Blessing Chidinma; Babalola, Olubukola Oluranti (2022). Metagenomics: A Tool for Exploring Key Microbiome With the Potentials for Improving Sustainable Agriculture. Frontiers in Sustainable Food Systems. Т. 6. doi:10.3389/fsufs.2022.886987. ISSN 2571-581X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Iquebal, Mir Asif; Jagannadham, Jaisri; Jaiswal, Sarika; Prabha, Ratna; Rai, Anil; Kumar, Dinesh (2022). Potential Use of Microbial Community Genomes in Various Dimensions of Agriculture Productivity and Its Management: A Review. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.708335. ISSN 1664-302X. PMC 9152772. PMID 35655999. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Molefe, Rebaona R.; Amoo, Adenike E.; Babalola, Olubukola O. (2023-07). Communication between plant roots and the soil microbiome; involvement in plant growth and development. Symbiosis (англ.). Т. 90, № 3. с. 231—239. doi:10.1007/s13199-023-00941-9. ISSN 0334-5114. Процитовано 20 грудня 2023.
Nadarajah, Kalaivani; Abdul Rahman, Nur Sabrina Natasha (2023-01). The Microbial Connection to Sustainable Agriculture. Plants (англ.). Т. 12, № 12. с. 2307. doi:10.3390/plants12122307. ISSN 2223-7747. PMC 10303550. PMID 37375932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Billington, Craig; Kingsbury, Joanne M.; Rivas, Lucia (1 березня 2022). Metagenomics Approaches for Improving Food Safety: A Review. Journal of Food Protection. Т. 85, № 3. с. 448—464. doi:10.4315/JFP-21-301. ISSN 0362-028X. Процитовано 20 грудня 2023.
Srinivas, Meghana; O’Sullivan, Orla; Cotter, Paul D.; Sinderen, Douwe van; Kenny, John G. (2022-01). The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods. Foods (англ.). Т. 11, № 20. с. 3297. doi:10.3390/foods11203297. ISSN 2304-8158. PMC 9601669. PMID 37431045. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Berini, Francesca; Casciello, Carmine; Marcone, Giorgia Letizia; Marinelli, Flavia (15 листопада 2017). Metagenomics: novel enzymes from non-culturable microbes. FEMS Microbiology Letters (англ.). Т. 364, № 21. doi:10.1093/femsle/fnx211. ISSN 1574-6968. Процитовано 20 грудня 2023.
Patel, Tithi; Chaudhari, Hiral G.; Prajapati, Vimalkumar; Patel, Swati; Mehta, Vaibhavkumar; Soni, Niti (2022). A brief account on enzyme mining using metagenomic approach. Frontiers in Systems Biology. Т. 2. doi:10.3389/fsysb.2022.1046230. ISSN 2674-0702. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
de Abreu, Vinicius A. C.; Perdigão, José; Almeida, Sintia (2021). Metagenomic Approaches to Analyze Antimicrobial Resistance: An Overview. Frontiers in Genetics. Т. 11. doi:10.3389/fgene.2020.575592. ISSN 1664-8021. PMC 7848172. PMID 33537056. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pillay, Stephanie; Calderón-Franco, David; Urhan, Aysun; Abeel, Thomas (2 грудня 2022). Metagenomic-based surveillance systems for antibiotic resistance in non-clinical settings. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.1066995. ISSN 1664-302X. PMC 9755710. PMID 36532424. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hidalgo, Kelly J.; Sierra-Garcia, Isabel N.; Dellagnezze, Bruna M.; de Oliveira, Valéria Maia (2020). Metagenomic Insights Into the Mechanisms for Biodegradation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in the Oil Supply Chain. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.561506. ISSN 1664-302X. PMC 7530279. PMID 33072021. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hauptfeld, Ernestina; Pelkmans, Jordi; Huisman, Terry T.; Anocic, Armin; Snoek, Basten L.; von Meijenfeldt, F. A. Bastiaan; Gerritse, Jan; van Leeuwen, Johan; Leurink, Gert (1 серпня 2022). A metagenomic portrait of the microbial community responsible for two decades of bioremediation of poly-contaminated groundwater. Water Research. Т. 221. с. 118767. doi:10.1016/j.watres.2022.118767. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Offiong, Nnanake-Abasi O.; Edet, John B.; Shaibu, Solomon E.; Akan, Nyaknno E.; Atakpa, Edidiong O.; Sanganyado, Edmond; Okop, Imeh J.; Benson, Nsikak U.; Okoh, Anthony (2023). Metagenomics: an emerging tool for the chemistry of environmental remediation. Frontiers in Environmental Chemistry. Т. 4. doi:10.3389/fenvc.2023.1052697. ISSN 2673-4486. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Breed, Martin F.; Harrison, Peter A.; Blyth, Colette; Byrne, Margaret; Gaget, Virginie; Gellie, Nicholas J. C.; Groom, Scott V. C.; Hodgson, Riley; Mills, Jacob G. (2019-10). The potential of genomics for restoring ecosystems and biodiversity. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 10. с. 615—628. doi:10.1038/s41576-019-0152-0. ISSN 1471-0064. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Hongling; Hart, Darren J.; An, Yingfeng (2019-09). Functional Metagenomic Technologies for the Discovery of Novel Enzymes for Biomass Degradation and Biofuel Production. BioEnergy Research (англ.). Т. 12, № 3. с. 457—470. doi:10.1007/s12155-019-10005-w. ISSN 1939-1234. Процитовано 20 грудня 2023.
Pabbathi, Ninian Prem Prashanth; Velidandi, Aditya; Tavarna, Tanvi; Gupta, Shreyash; Raj, Ram Sarvesh; Gandam, Pradeep Kumar; Baadhe, Rama Raju (2023-01). Role of metagenomics in prospecting novel endoglucanases, accentuating functional metagenomics approach in second-generation biofuel production: a review. Biomass Conversion and Biorefinery (англ.). Т. 13, № 2. с. 1371—1398. doi:10.1007/s13399-020-01186-y. ISSN 2190-6815. PMC 7790359. PMID 33437563. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Sartaj, Km; Patel, Alok; Matsakas, Leonidas; Prasad, Ramasare (2022-11). Unravelling Metagenomics Approach for Microbial Biofuel Production. Genes (англ.). Т. 13, № 11. с. 1942. doi:10.3390/genes13111942. ISSN 2073-4425. PMC 9689425. PMID 36360179. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wu, Yicheng; Zhou, Zhuoyi; Fu, Haiyan; Zhang, Peng; Zheng, Yue (10 листопада 2022). Metagenomic analysis of microbial community and gene function of anodic biofilm for nonylphenol removal in microbial fuel cells. Journal of Cleaner Production. Т. 374. с. 133895. doi:10.1016/j.jclepro.2022.133895. ISSN 0959-6526. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yifei; Li, Dongpeng; Song, Xinshan; Cao, Xin; Xu, Zhongshuo; Huang, Wei; Wang, Yuhui; Wang, Zhiwei; Sand, Wolfgang (1 травня 2022). Intensifying anoxic ammonium removal by manganese ores and granular active carbon fillings in constructed wetland-microbial fuel cells: Metagenomics reveals functional genes and microbial mechanisms. Bioresource Technology. Т. 352. с. 127114. doi:10.1016/j.biortech.2022.127114. ISSN 0960-8524. Процитовано 20 грудня 2023.
Jahanshahi, Donya Afshar; Ariaeenejad, Shohreh; Kavousi, Kaveh (25 вересня 2023). A metagenomic catalog for exploring the plastizymes landscape covering taxa, genes, and proteins. Scientific Reports (англ.). Т. 13, № 1. с. 16029. doi:10.1038/s41598-023-43042-9. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhou, Lei; Sang, Shilei; Li, Jiajie; Li, Yusen; Wang, Dapeng; Gan, Lihong; Zhao, Zelong; Wang, Jun (15 серпня 2023). From waste to resource: Metagenomics uncovers the molecular ecological resources for plastic degradation in estuaries of South China. Water Research. Т. 242. с. 120270. doi:10.1016/j.watres.2023.120270. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Rosso, Gretchen E.; Muday, Jeffrey A.; Curran, James F. (2018-03). Tools for Metagenomic Analysis at Wastewater Treatment Plants: Application to a Foaming Episode: Rosso et al. Water Environment Research (англ.). Т. 90, № 3. с. 258—268. doi:10.2175/106143017X15054988926352. ISSN 1061-4303. Процитовано 20 грудня 2023.
Chen, Geng; Bai, Rui; Zhang, Yiqing; Zhao, Biyi; Xiao, Yong (10 лютого 2022). Application of metagenomics to biological wastewater treatment. Science of The Total Environment. Т. 807. с. 150737. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.150737. ISSN 0048-9697. Процитовано 20 грудня 2023.
Annavajhala, Medini; Fanyin-Martin, Ato; Taher, Edris; Elk, Michael; Kapoor, Vikram; Santo-Domingo, Jorge; Chandran, Kartik (1 січня 2017). Metagenomics of Anaerobic Food Waste Fermentation. Proceedings of the Water Environment Federation (англ.). Т. 2017, № 7. с. 4041—4047. doi:10.2175/193864717822156181. ISSN 1938-6478. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhang, Jingxin; Mao, Liwei; Zhang, Le; Loh, Kai-Chee; Dai, Yanjun; Tong, Yen Wah (12 вересня 2017). Metagenomic insight into the microbial networks and metabolic mechanism in anaerobic digesters for food waste by incorporating activated carbon. Scientific Reports (англ.). Т. 7, № 1. с. 11293. doi:10.1038/s41598-017-11826-5. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Thakur, Karnika; Chownk, Manisha; Kumar, Varun; Purohit, Anjali; Vashisht, Alokika; Kumar, Vinod; Yadav, Sudesh Kumar (2020-03). Bioprospecting potential of microbial communities in solid waste landfills for novel enzymes through metagenomic approach. World Journal of Microbiology and Biotechnology (англ.). Т. 36, № 3. doi:10.1007/s11274-020-02812-7. ISSN 0959-3993. Процитовано 20 грудня 2023.
Deng, Chunfang; Zhao, Renxin; Qiu, Zhiguang; Li, Bing; Zhang, Tong; Guo, Feng; Mu, Rong; Wu, Yang; Qiao, Xuejiao (10 квітня 2022). Genome-centric metagenomics provides new insights into the microbial community and metabolic potential of landfill leachate microbiota. Science of The Total Environment. Т. 816. с. 151635. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.151635. ISSN 0048-9697. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhang, Siying; Liang, Chengyu; Xiao, Mengyao; Chui, Chunmeng; Wang, Na; Ji, Yuji; Wang, Zhi; Shi, Jiping; Liu, Li (1 жовтня 2023). Metagenomic characterization of the enhanced performance of multicomponent synergistic thermophilic anaerobic co-digestion of food waste utilizing kitchen waste or garden waste as co-substrate. Water Research. Т. 244. с. 120457. doi:10.1016/j.watres.2023.120457. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Toulza, Eve; Blanc-Mathieu, Romain; Gourbière, Sébastien; Piganeau, Gwenael (1 січня 2012). Piganeau, Gwenaël (ред.). Chapter Ten - Environmental and Evolutionary Genomics of Microbial Algae: Power and Challenges of Metagenomics. Advances in Botanical Research. Т. 64. Academic Press. с. 383—427. doi:10.1016/b978-0-12-391499-6.00010-4.
Vidulin, Vedrana; Šmuc, Tomislav; Džeroski, Sašo; Supek, Fran (2018-12). The evolutionary signal in metagenome phyletic profiles predicts many gene functions. Microbiome (англ.). Т. 6, № 1. doi:10.1186/s40168-018-0506-4. ISSN 2049-2618. PMC 6040064. PMID 29991352. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Czech, Lucas; Stamatakis, Alexandros; Dunthorn, Micah; Barbera, Pierre (2022). Metagenomic Analysis Using Phylogenetic Placement—A Review of the First Decade. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.871393. ISSN 2673-7647. PMC 9580882. PMID 36304302. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Madrigal-Trejo, David; Sánchez-Pérez, Jazmín; Espinosa-Asuar, Laura; Valdivia-Anistro, Jorge A.; Eguiarte, Luis E.; Souza, Valeria (2023-11). A Metagenomic Time-Series Approach to Assess the Ecological Stability of Microbial Mats in a Seasonally Fluctuating Environment. Microbial Ecology (англ.). Т. 86, № 4. с. 2252—2270. doi:10.1007/s00248-023-02231-9. ISSN 0095-3628. PMC 10640475. PMID 37393557. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Picot, Aurore; Shibasaki, Shota; Meacock, Oliver J; Mitri, Sara (1 жовтня 2023). Microbial interactions in theory and practice: when are measurements compatible with models?. Current Opinion in Microbiology. Т. 75. с. 102354. doi:10.1016/j.mib.2023.102354. ISSN 1369-5274. Процитовано 20 грудня 2023.
Delogu, Francesco; Kunath, Benoit J.; Queirós, Pedro M.; Halder, Rashi; Lebrun, Laura A.; Pope, Phillip B.; May, Patrick; Widder, Stefanie; Muller, Emilie E. L. (13 листопада 2023). Forecasting the dynamics of a complex microbial community using integrated meta-omics. Nature Ecology & Evolution (англ.). с. 1—13. doi:10.1038/s41559-023-02241-3. ISSN 2397-334X. Процитовано 20 грудня 2023.
Miller, Ruth R; Montoya, Vincent; Gardy, Jennifer L; Patrick, David M; Tang, Patrick (2013). Metagenomics for pathogen detection in public health. Genome Medicine (англ.). Т. 5, № 9. с. 81. doi:10.1186/gm485. ISSN 1756-994X. PMC 3978900. PMID 24050114. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Ko, Karrie K. K.; Chng, Kern Rei; Nagarajan, Niranjan (2022-04). Metagenomics-enabled microbial surveillance. Nature Microbiology (англ.). Т. 7, № 4. с. 486—496. doi:10.1038/s41564-022-01089-w. ISSN 2058-5276. Процитовано 20 грудня 2023.
Doestzada, Marwah; Vila, Arnau Vich; Zhernakova, Alexandra; Koonen, Debby P. Y.; Weersma, Rinse K.; Touw, Daan J.; Kuipers, Folkert; Wijmenga, Cisca; Fu, Jingyuan (28 квітня 2018). Pharmacomicrobiomics: a novel route towards personalized medicine?. Protein & Cell. Т. 9, № 5. с. 432—445. doi:10.1007/s13238-018-0547-2. ISSN 1674-800X. PMC 5960471. PMID 29705929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Zhao, Qing; Chen, Yao; Huang, Weihua; Zhou, Honghao; Zhang, Wei (9 жовтня 2023). Drug-microbiota interactions: an emerging priority for precision medicine. Signal Transduction and Targeted Therapy (англ.). Т. 8, № 1. с. 1—27. doi:10.1038/s41392-023-01619-w. ISSN 2059-3635. Процитовано 20 грудня 2023.
Cai, Jingwei; Auster, Alexis; Cho, Sungjoon; Lai, Zijuan (1 жовтня 2023). Dissecting the human gut microbiome to better decipher drug liability: A once-forgotten organ takes center stage. Journal of Advanced Research. Т. 52. с. 171—201. doi:10.1016/j.jare.2023.07.002. ISSN 2090-1232. PMC 10555929. PMID 37419381. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Nar Singh Chauhan and Suneel Kumar (2023). Microbiome Therapeutics. Elsevier. doi:10.1016/c2021-0-01533-9. ISBN 978-0-323-99336-4.
Nigam, Manisha; Panwar, Abhaya Shikhar; Singh, Rahul Kunwar (2022). Orchestrating the fecal microbiota transplantation: Current technological advancements and potential biomedical application. Frontiers in Medical Technology. Т. 4. doi:10.3389/fmedt.2022.961569. ISSN 2673-3129. PMC 9535080. PMID 36212607. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Xiaoli; Zhao, Jingwen; Feng, Yuanhang; Feng, Zelin; Ye, Yulin; Liu, Limin; Kang, Guangbo; Cao, Xiaocang (2022). Evolutionary Insights Into Microbiota Transplantation in Inflammatory Bowel Disease. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fcimb.2022.916543. ISSN 2235-2988. PMC 9257068. PMID 35811664. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Yang, Ruixue; Chen, Zhenzhen; Cai, Jun (1 грудня 2023). Fecal microbiota transplantation: Emerging applications in autoimmune diseases. Journal of Autoimmunity. Т. 141. с. 103038. doi:10.1016/j.jaut.2023.103038. ISSN 0896-8411. Процитовано 20 грудня 2023.
Quaranta, Gianluca; Guarnaccia, Alessandra; Fancello, Giovanni; Agrillo, Chiara; Iannarelli, Federica; Sanguinetti, Maurizio; Masucci, Luca (2022-12). Fecal Microbiota Transplantation and Other Gut Microbiota Manipulation Strategies. Microorganisms (англ.). Т. 10, № 12. с. 2424. doi:10.3390/microorganisms10122424. ISSN 2076-2607. PMC 9781458. PMID 36557677. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Gebrayel, Prisca; Nicco, Carole; Al Khodor, Souhaila; Bilinski, Jaroslaw; Caselli, Elisabetta; Comelli, Elena M.; Egert, Markus; Giaroni, Cristina; Karpinski, Tomasz M. (7 березня 2022). Microbiota medicine: towards clinical revolution. Journal of Translational Medicine. Т. 20, № 1. с. 111. doi:10.1186/s12967-022-03296-9. ISSN 1479-5876. PMC 8900094. PMID 35255932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Fekete, Emily Ef; Figeys, Daniel; Zhang, Xu (31 грудня 2023). Microbiota-directed biotherapeutics: considerations for quality and functional assessment. Gut Microbes (англ.). Т. 15, № 1. doi:10.1080/19490976.2023.2186671. ISSN 1949-0976. PMC 10012963. PMID 36896938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
McDonagh, Francesca; Cormican, Martin; Morris, Dearbháile; Burke, Liam; Singh, Nitin Kumar; Venkateswaran, Kasthuri; Miliotis, Georgios (2023-07). Medical Astro-Microbiology: Current Role and Future Challenges. Journal of the Indian Institute of Science (англ.). Т. 103, № 3. с. 771—796. doi:10.1007/s41745-023-00360-1. ISSN 0970-4140. PMC 10082442. PMID 37362850. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Be, Nicholas A.; Avila-Herrera, Aram; Allen, Jonathan E.; Singh, Nitin; Checinska Sielaff, Aleksandra; Jaing, Crystal; Venkateswaran, Kasthuri (2017-12). Whole metagenome profiles of particulates collected from the International Space Station. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0292-4. ISSN 2049-2618. PMC 5514531. PMID 28716113. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Schwendner, Petra; Mahnert, Alexander; Koskinen, Kaisa; Moissl-Eichinger, Christine; Barczyk, Simon; Wirth, Reinhard; Berg, Gabriele; Rettberg, Petra (2017-12). Preparing for the crewed Mars journey: microbiota dynamics in the confined Mars500 habitat during simulated Mars flight and landing. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0345-8. ISSN 2049-2618. PMC 5627443. PMID 28974259. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mora, Maximilian; Wink, Lisa; Kögler, Ines; Mahnert, Alexander; Rettberg, Petra; Schwendner, Petra; Demets, René; Cockell, Charles; Alekhova, Tatiana (5 вересня 2019). Space Station conditions are selective but do not alter microbial characteristics relevant to human health. Nature Communications (англ.). Т. 10, № 1. с. 3990. doi:10.1038/s41467-019-11682-z. ISSN 2041-1723. Процитовано 20 грудня 2023.
Malli Mohan, Ganesh Babu; Parker, Ceth W.; Urbaniak, Camilla; Singh, Nitin K.; Hood, Anthony; Minich, Jeremiah J.; Knight, Rob; Rucker, Michelle; Venkateswaran, Kasthuri (25 серпня 2020). Sangwan, Naseer (ред.). Microbiome and Metagenome Analyses of a Closed Habitat during Human Occupation. mSystems (англ.). Т. 5, № 4. doi:10.1128/mSystems.00367-20. ISSN 2379-5077. PMC 7394354. PMID 32723791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Mhatre, Snehit; Wood, Jason M.; Sielaff, Aleksandra Checinska; Mora, Maximilian; Duller, Stefanie; Singh, Nitin Kumar; Karouia, Fathi; Moissl-Eichinger, Christine; Venkateswaran, Kasthuri (2020). Assessing the Risk of Transfer of Microorganisms at the International Space Station Due to Cargo Delivery by Commercial Resupply Vehicles. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.566412. ISSN 1664-302X. PMC 7677455. PMID 33240227. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mahnert, Alexander; Verseux, Cyprien; Schwendner, Petra; Koskinen, Kaisa; Kumpitsch, Christina; Blohs, Marcus; Wink, Lisa; Brunner, Daniela; Goessler, Theodora (24 січня 2021). Microbiome dynamics during the HI-SEAS IV mission, and implications for future crewed missions beyond Earth. Microbiome. Т. 9, № 1. с. 27. doi:10.1186/s40168-020-00959-x. ISSN 2049-2618. PMC 7831191. PMID 33487169. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Doré, Joel; Ortega Ugalde, Sandra (2023). Human-microbes symbiosis in health and disease, on earth and beyond planetary boundaries. Frontiers in Astronomy and Space Sciences. Т. 10. doi:10.3389/fspas.2023.1180522. ISSN 2296-987X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

frontiersin.org

Zhang, Lu; Chen, FengXin; Zeng, Zhan; Xu, Mengjiao; Sun, Fangfang; Yang, Liu; Bi, Xiaoyue; Lin, Yanjie; Gao, YuanJiao (2021). Advances in Metagenomics and Its Application in Environmental Microorganisms. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.766364. ISSN 1664-302X. PMC 8719654. PMID 34975791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Saenz, Carmen; Nigro, Eleonora; Gunalan, Vithiagaran; Arumugam, Manimozhiyan (2022). MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.846922. ISSN 2673-7647. PMC 9580859. PMID 36304282. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Chen, Huaihai; Ma, Kayan; Lu, Caiyan; Fu, Qi; Qiu, Yingbo; Zhao, Jiayi; Huang, Yu; Yang, Yuchun; Schadt, Christopher W. (2022). Functional Redundancy in Soil Microbial Community Based on Metagenomics Across the Globe. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.878978. ISSN 1664-302X. PMC 9108720. PMID 35586865. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhao, Aiwen; Lu, Yuntao; Li, Qi; Li, Tao; Zhao, Jindong (2023). Metagenomics reveals the diversity and role of surface-water microbes in biogeochemical cycles in lakes at different terrain ladders. Frontiers in Environmental Science. Т. 11. doi:10.3389/fenvs.2023.1121775. ISSN 2296-665X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xue, Chun-Xu; Lin, Heyu; Zhu, Xiao-Yu; Liu, Jiwen; Zhang, Yunhui; Rowley, Gary; Todd, Jonathan D.; Li, Meng; Zhang, Xiao-Hua (2 серпня 2021). DiTing: A Pipeline to Infer and Compare Biogeochemical Pathways From Metagenomic and Metatranscriptomic Data. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.698286. ISSN 1664-302X. PMC 8367434. PMID 34408730. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malla, Muneer Ahmad; Dubey, Anamika; Kumar, Ashwani; Yadav, Shweta; Hashem, Abeer; Abd_Allah, Elsayed Fathi (2019). Exploring the Human Microbiome: The Potential Future Role of Next-Generation Sequencing in Disease Diagnosis and Treatment. Frontiers in Immunology. Т. 9. doi:10.3389/fimmu.2018.02868. ISSN 1664-3224. PMC 6330296. PMID 30666248. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nwachukwu, Blessing Chidinma; Babalola, Olubukola Oluranti (2022). Metagenomics: A Tool for Exploring Key Microbiome With the Potentials for Improving Sustainable Agriculture. Frontiers in Sustainable Food Systems. Т. 6. doi:10.3389/fsufs.2022.886987. ISSN 2571-581X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Iquebal, Mir Asif; Jagannadham, Jaisri; Jaiswal, Sarika; Prabha, Ratna; Rai, Anil; Kumar, Dinesh (2022). Potential Use of Microbial Community Genomes in Various Dimensions of Agriculture Productivity and Its Management: A Review. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.708335. ISSN 1664-302X. PMC 9152772. PMID 35655999. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Patel, Tithi; Chaudhari, Hiral G.; Prajapati, Vimalkumar; Patel, Swati; Mehta, Vaibhavkumar; Soni, Niti (2022). A brief account on enzyme mining using metagenomic approach. Frontiers in Systems Biology. Т. 2. doi:10.3389/fsysb.2022.1046230. ISSN 2674-0702. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
de Abreu, Vinicius A. C.; Perdigão, José; Almeida, Sintia (2021). Metagenomic Approaches to Analyze Antimicrobial Resistance: An Overview. Frontiers in Genetics. Т. 11. doi:10.3389/fgene.2020.575592. ISSN 1664-8021. PMC 7848172. PMID 33537056. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pillay, Stephanie; Calderón-Franco, David; Urhan, Aysun; Abeel, Thomas (2 грудня 2022). Metagenomic-based surveillance systems for antibiotic resistance in non-clinical settings. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.1066995. ISSN 1664-302X. PMC 9755710. PMID 36532424. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hidalgo, Kelly J.; Sierra-Garcia, Isabel N.; Dellagnezze, Bruna M.; de Oliveira, Valéria Maia (2020). Metagenomic Insights Into the Mechanisms for Biodegradation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in the Oil Supply Chain. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.561506. ISSN 1664-302X. PMC 7530279. PMID 33072021. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Offiong, Nnanake-Abasi O.; Edet, John B.; Shaibu, Solomon E.; Akan, Nyaknno E.; Atakpa, Edidiong O.; Sanganyado, Edmond; Okop, Imeh J.; Benson, Nsikak U.; Okoh, Anthony (2023). Metagenomics: an emerging tool for the chemistry of environmental remediation. Frontiers in Environmental Chemistry. Т. 4. doi:10.3389/fenvc.2023.1052697. ISSN 2673-4486. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Czech, Lucas; Stamatakis, Alexandros; Dunthorn, Micah; Barbera, Pierre (2022). Metagenomic Analysis Using Phylogenetic Placement—A Review of the First Decade. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.871393. ISSN 2673-7647. PMC 9580882. PMID 36304302. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nigam, Manisha; Panwar, Abhaya Shikhar; Singh, Rahul Kunwar (2022). Orchestrating the fecal microbiota transplantation: Current technological advancements and potential biomedical application. Frontiers in Medical Technology. Т. 4. doi:10.3389/fmedt.2022.961569. ISSN 2673-3129. PMC 9535080. PMID 36212607. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Xiaoli; Zhao, Jingwen; Feng, Yuanhang; Feng, Zelin; Ye, Yulin; Liu, Limin; Kang, Guangbo; Cao, Xiaocang (2022). Evolutionary Insights Into Microbiota Transplantation in Inflammatory Bowel Disease. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fcimb.2022.916543. ISSN 2235-2988. PMC 9257068. PMID 35811664. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mhatre, Snehit; Wood, Jason M.; Sielaff, Aleksandra Checinska; Mora, Maximilian; Duller, Stefanie; Singh, Nitin Kumar; Karouia, Fathi; Moissl-Eichinger, Christine; Venkateswaran, Kasthuri (2020). Assessing the Risk of Transfer of Microorganisms at the International Space Station Due to Cargo Delivery by Commercial Resupply Vehicles. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.566412. ISSN 1664-302X. PMC 7677455. PMID 33240227. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Doré, Joel; Ortega Ugalde, Sandra (2023). Human-microbes symbiosis in health and disease, on earth and beyond planetary boundaries. Frontiers in Astronomy and Space Sciences. Т. 10. doi:10.3389/fspas.2023.1180522. ISSN 2296-987X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

hindawi.com

Wu, Honglong; Cai, Lihua; Li, Dongfang; Wang, Xinying; Zhao, Shancen; Zou, Fuhao; Zhou, Ke (11 січня 2018). Metagenomics Biomarkers Selected for Prediction of Three Different Diseases in Chinese Population. BioMed Research International (англ.). Т. 2018. с. e2936257. doi:10.1155/2018/2936257. ISSN 2314-6133. PMC 5820663. PMID 29568746. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

intechopen.com

N. Sabale, Shrinivas; P. Suryawanshi, Padmaja; P.U., Krishnaraj (25 березня 2020). N. Hozzein, Wael (ред.). Soil Metagenomics: Concepts and Applications. Metagenomics - Basics, Methods and Applications (англ.). IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.88958. ISBN 978-1-83880-055-0.
Kaushik, Prashant; Singh Sandhu, Opinder; Singh Brar, Navjot; Kumar, Vivek; Singh Malhi, Gurdeep; Kesh, Hari; Saini, Ishan (28 липня 2021). Radhakrishnan, Ramalingam (ред.). Soil Metagenomics: Prospects and Challenges. Mycorrhizal Fungi - Utilization in Agriculture and Industry (англ.). IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.93306. ISBN 978-1-83881-940-8.
M. Shuikan, Ahmed; M. Alshuwaykan, Rakan; A. Arif, Ibrahim (3 травня 2023). Najjari, Afef (ред.). The Role of Metagenomic Approaches in the Analysis of Microbial Community in Extreme Environment. Life in Extreme Environments - Diversity, Adaptability and Valuable Resources of Bioactive Molecules (англ.). IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.108050. ISBN 978-1-80356-818-8.

iop.org

iopscience.iop.org

Effendi, Y; Pambudi, A.; Sasaerila, Y.; WijiHastuti, R. S. (1 грудня 2019). Metagenomic analysis of diversity and composition of soil bacteria under intercropping system Hevea brasiliensis and Canna indica. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. Т. 391, № 1. с. 012023. doi:10.1088/1755-1315/391/1/012023. ISSN 1755-1307. Процитовано 20 грудня 2023.

mdpi.com

Slavov, Svetoslav Nanev (2022-11). Viral Metagenomics for Identification of Emerging Viruses in Transfusion Medicine. Viruses (англ.). Т. 14, № 11. с. 2448. doi:10.3390/v14112448. ISSN 1999-4915. PMC 9699440. PMID 36366546. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Luo, Dan; Liu, Wenwei; Chen, Tian; An, Lingling (2022-07). A Distribution-Free Model for Longitudinal Metagenomic Count Data. Genes (англ.). Т. 13, № 7. с. 1183. doi:10.3390/genes13071183. ISSN 2073-4425. PMC 9316307. PMID 35885966. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Singh, Nidhi; Singh, Veer; Rai, Sachchida Nand; Vamanu, Emanuel; Singh, Mohan P. (2022-12). Metagenomic Analysis of Garden Soil-Derived Microbial Consortia and Unveiling Their Metabolic Potential in Mitigating Toxic Hexavalent Chromium. Life (англ.). Т. 12, № 12. с. 2094. doi:10.3390/life12122094. ISSN 2075-1729. PMC 9781466. PMID 36556458. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nam, Nguyen Nhat; Do, Hoang Dang Khoa; Loan Trinh, Kieu The; Lee, Nae Yoon (2023-01). Metagenomics: An Effective Approach for Exploring Microbial Diversity and Functions. Foods (англ.). Т. 12, № 11. с. 2140. doi:10.3390/foods12112140. ISSN 2304-8158. PMC 10252221. PMID 37297385. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nadarajah, Kalaivani; Abdul Rahman, Nur Sabrina Natasha (2023-01). The Microbial Connection to Sustainable Agriculture. Plants (англ.). Т. 12, № 12. с. 2307. doi:10.3390/plants12122307. ISSN 2223-7747. PMC 10303550. PMID 37375932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Srinivas, Meghana; O’Sullivan, Orla; Cotter, Paul D.; Sinderen, Douwe van; Kenny, John G. (2022-01). The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods. Foods (англ.). Т. 11, № 20. с. 3297. doi:10.3390/foods11203297. ISSN 2304-8158. PMC 9601669. PMID 37431045. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Sartaj, Km; Patel, Alok; Matsakas, Leonidas; Prasad, Ramasare (2022-11). Unravelling Metagenomics Approach for Microbial Biofuel Production. Genes (англ.). Т. 13, № 11. с. 1942. doi:10.3390/genes13111942. ISSN 2073-4425. PMC 9689425. PMID 36360179. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Quaranta, Gianluca; Guarnaccia, Alessandra; Fancello, Giovanni; Agrillo, Chiara; Iannarelli, Federica; Sanguinetti, Maurizio; Masucci, Luca (2022-12). Fecal Microbiota Transplantation and Other Gut Microbiota Manipulation Strategies. Microorganisms (англ.). Т. 10, № 12. с. 2424. doi:10.3390/microorganisms10122424. ISSN 2076-2607. PMC 9781458. PMID 36557677. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

microbiologyresearch.org

Pérez-Cobas, Ana Elena; Gomez-Valero, Laura; Buchrieser, Carmen (2020). Metagenomic approaches in microbial ecology: an update on whole-genome and marker gene sequencing analyses. Microbial Genomics. Т. 6, № 8. с. e000409. doi:10.1099/mgen.0.000409. ISSN 2057-5858. PMC 7641418. PMID 32706331. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)

nature.com

Chiu, Charles Y.; Miller, Steven A. (2019-06). Clinical metagenomics. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 6. с. 341—355. doi:10.1038/s41576-019-0113-7. ISSN 1471-0064. PMC 6858796. PMID 30918369. Процитовано 11 червня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Zhao, Ming; Zhang, Dong-lian; Su, Xiao-qin; Duan, Shuang-mei; Wan, Jin-qiong; Yuan, Wen-xia; Liu, Ben-ying; Ma, Yan; Pan, Ying-hong (14 травня 2015). An Integrated Metagenomics/Metaproteomics Investigation of the Microbial Communities and Enzymes in Solid-state Fermentation of Pu-erh tea. Scientific Reports (англ.). Т. 5, № 1. с. 10117. doi:10.1038/srep10117. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Shi, Yanmei; Tyson, Gene W.; Eppley, John M.; DeLong, Edward F. (2011-06). Integrated metatranscriptomic and metagenomic analyses of stratified microbial assemblages in the open ocean. The ISME Journal (англ.). Т. 5, № 6. с. 999—1013. doi:10.1038/ismej.2010.189. ISSN 1751-7370. Процитовано 20 грудня 2023.
Herold, Malte; Martínez Arbas, Susana; Narayanasamy, Shaman; Sheik, Abdul R.; Kleine-Borgmann, Luise A. K.; Lebrun, Laura A.; Kunath, Benoît J.; Roume, Hugo; Bessarab, Irina (19 жовтня 2020). Integration of time-series meta-omics data reveals how microbial ecosystems respond to disturbance. Nature Communications (англ.). Т. 11, № 1. с. 5281. doi:10.1038/s41467-020-19006-2. ISSN 2041-1723. Процитовано 20 грудня 2023.
Ghosh, Shreya; Das, Alok Prasad (29 травня 2018). Metagenomic insights into the microbial diversity in manganese-contaminated mine tailings and their role in biogeochemical cycling of manganese. Scientific Reports (англ.). Т. 8, № 1. с. 8257. doi:10.1038/s41598-018-26311-w. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Szóstak, Natalia; Szymanek, Agata; Havránek, Jan; Tomela, Katarzyna; Rakoczy, Magdalena; Samelak-Czajka, Anna; Schmidt, Marcin; Figlerowicz, Marek; Majta, Jan (19 травня 2022). The standardisation of the approach to metagenomic human gut analysis: from sample collection to microbiome profiling. Scientific Reports (англ.). Т. 12, № 1. с. 8470. doi:10.1038/s41598-022-12037-3. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Breed, Martin F.; Harrison, Peter A.; Blyth, Colette; Byrne, Margaret; Gaget, Virginie; Gellie, Nicholas J. C.; Groom, Scott V. C.; Hodgson, Riley; Mills, Jacob G. (2019-10). The potential of genomics for restoring ecosystems and biodiversity. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 10. с. 615—628. doi:10.1038/s41576-019-0152-0. ISSN 1471-0064. Процитовано 20 грудня 2023.
Jahanshahi, Donya Afshar; Ariaeenejad, Shohreh; Kavousi, Kaveh (25 вересня 2023). A metagenomic catalog for exploring the plastizymes landscape covering taxa, genes, and proteins. Scientific Reports (англ.). Т. 13, № 1. с. 16029. doi:10.1038/s41598-023-43042-9. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhang, Jingxin; Mao, Liwei; Zhang, Le; Loh, Kai-Chee; Dai, Yanjun; Tong, Yen Wah (12 вересня 2017). Metagenomic insight into the microbial networks and metabolic mechanism in anaerobic digesters for food waste by incorporating activated carbon. Scientific Reports (англ.). Т. 7, № 1. с. 11293. doi:10.1038/s41598-017-11826-5. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Delogu, Francesco; Kunath, Benoit J.; Queirós, Pedro M.; Halder, Rashi; Lebrun, Laura A.; Pope, Phillip B.; May, Patrick; Widder, Stefanie; Muller, Emilie E. L. (13 листопада 2023). Forecasting the dynamics of a complex microbial community using integrated meta-omics. Nature Ecology & Evolution (англ.). с. 1—13. doi:10.1038/s41559-023-02241-3. ISSN 2397-334X. Процитовано 20 грудня 2023.
Ko, Karrie K. K.; Chng, Kern Rei; Nagarajan, Niranjan (2022-04). Metagenomics-enabled microbial surveillance. Nature Microbiology (англ.). Т. 7, № 4. с. 486—496. doi:10.1038/s41564-022-01089-w. ISSN 2058-5276. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhao, Qing; Chen, Yao; Huang, Weihua; Zhou, Honghao; Zhang, Wei (9 жовтня 2023). Drug-microbiota interactions: an emerging priority for precision medicine. Signal Transduction and Targeted Therapy (англ.). Т. 8, № 1. с. 1—27. doi:10.1038/s41392-023-01619-w. ISSN 2059-3635. Процитовано 20 грудня 2023.
Mora, Maximilian; Wink, Lisa; Kögler, Ines; Mahnert, Alexander; Rettberg, Petra; Schwendner, Petra; Demets, René; Cockell, Charles; Alekhova, Tatiana (5 вересня 2019). Space Station conditions are selective but do not alter microbial characteristics relevant to human health. Nature Communications (англ.). Т. 10, № 1. с. 3990. doi:10.1038/s41467-019-11682-z. ISSN 2041-1723. Процитовано 20 грудня 2023.

nih.gov

ncbi.nlm.nih.gov

Chiu, Charles Y.; Miller, Steven A. (2019-06). Clinical metagenomics. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 6. с. 341—355. doi:10.1038/s41576-019-0113-7. ISSN 1471-0064. PMC 6858796. PMID 30918369. Процитовано 11 червня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Slavov, Svetoslav Nanev (2022-11). Viral Metagenomics for Identification of Emerging Viruses in Transfusion Medicine. Viruses (англ.). Т. 14, № 11. с. 2448. doi:10.3390/v14112448. ISSN 1999-4915. PMC 9699440. PMID 36366546. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pérez-Cobas, Ana Elena; Gomez-Valero, Laura; Buchrieser, Carmen (2020). Metagenomic approaches in microbial ecology: an update on whole-genome and marker gene sequencing analyses. Microbial Genomics. Т. 6, № 8. с. e000409. doi:10.1099/mgen.0.000409. ISSN 2057-5858. PMC 7641418. PMID 32706331. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Prayogo, Fitra Adi; Budiharjo, Anto; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti; Wijanarka, Wijanarka; Suprihadi, Agung; Nurhayati, Nurhayati (4 серпня 2020). Metagenomic applications in exploration and development of novel enzymes from nature: a review. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. Т. 18, № 1. с. 39. doi:10.1186/s43141-020-00043-9. ISSN 2090-5920. PMC 7403272. PMID 32749574. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
d’Humières, Camille; Salmona, Maud; Dellière, Sarah; Leo, Stefano; Rodriguez, Christophe; Angebault, Cécile; Alanio, Alexandre; Fourati, Slim; Lazarevic, Vladimir (2021-09). The Potential Role of Clinical Metagenomics in Infectious Diseases: Therapeutic Perspectives. Drugs (англ.). Т. 81, № 13. с. 1453—1466. doi:10.1007/s40265-021-01572-4. ISSN 0012-6667. PMC 8323086. PMID 34328626. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Kawulok, Jolanta; Kawulok, Michal; Deorowicz, Sebastian (2019-12). Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint. Biology Direct (англ.). Т. 14, № 1. doi:10.1186/s13062-019-0251-z. ISSN 1745-6150. PMC 6854650. PMID 31722729. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhang, Lu; Chen, FengXin; Zeng, Zhan; Xu, Mengjiao; Sun, Fangfang; Yang, Liu; Bi, Xiaoyue; Lin, Yanjie; Gao, YuanJiao (2021). Advances in Metagenomics and Its Application in Environmental Microorganisms. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.766364. ISSN 1664-302X. PMC 8719654. PMID 34975791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Breitwieser, Florian P; Lu, Jennifer; Salzberg, Steven L (19 липня 2019). A review of methods and databases for metagenomic classification and assembly. Briefings in Bioinformatics (англ.). Т. 20, № 4. с. 1125—1136. doi:10.1093/bib/bbx120. ISSN 1467-5463. PMC 6781581. PMID 29028872. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Shao, Li; Liao, Jie; Qian, Jingyang; Chen, Wenbin; Fan, Xiaohui (2021-12). MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiology (англ.). Т. 21, № 1. doi:10.1186/s12866-021-02321-z. ISSN 1471-2180. PMC 8485520. PMID 34592929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Saenz, Carmen; Nigro, Eleonora; Gunalan, Vithiagaran; Arumugam, Manimozhiyan (2022). MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.846922. ISSN 2673-7647. PMC 9580859. PMID 36304282. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Aguiar-Pulido, Vanessa; Huang, Wenrui; Suarez-Ulloa, Victoria; Cickovski, Trevor; Mathee, Kalai; Narasimhan, Giri (2016-01). Metagenomics, Metatranscriptomics, and Metabolomics Approaches for Microbiome Analysis: Supplementary Issue: Bioinformatics Methods and Applications for Big Metagenomics Data. Evolutionary Bioinformatics (англ.). Т. 12s1. с. EBO.S36436. doi:10.4137/EBO.S36436. ISSN 1176-9343. PMC 4869604. PMID 27199545. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Schiml, Valerie C.; Delogu, Francesco; Kumar, Praveen; Kunath, Benoit; Batut, Bérénice; Mehta, Subina; Johnson, James E.; Grüning, Björn; Pope, Phillip B. (7 липня 2023). Integrative meta-omics in Galaxy and beyond. Environmental Microbiome (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s40793-023-00514-9. ISSN 2524-6372. PMC 10329324. PMID 37420292. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Kodikara, Saritha; Ellul, Susan; Lê Cao, Kim-Anh (14 липня 2022). Statistical challenges in longitudinal microbiome data analysis. Briefings in Bioinformatics. Т. 23, № 4. doi:10.1093/bib/bbac273. ISSN 1467-5463. PMC 9294433. PMID 35830875. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Luo, Dan; Liu, Wenwei; Chen, Tian; An, Lingling (2022-07). A Distribution-Free Model for Longitudinal Metagenomic Count Data. Genes (англ.). Т. 13, № 7. с. 1183. doi:10.3390/genes13071183. ISSN 2073-4425. PMC 9316307. PMID 35885966. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Porcellato, Davide; Pierce, Emily C.; Dinh, Cong B.; Portik, Daniel; Hall, Richard; Ashby, Meredith; Dutton, Rachel J. (23 лютого 2023). Cotter, Paul D. (ред.). Longitudinal, Multi-Platform Metagenomics Yields a High-Quality Genomic Catalog and Guides an In Vitro Model for Cheese Communities. mSystems (англ.). Т. 8, № 1. doi:10.1128/msystems.00701-22. ISSN 2379-5077. PMC 9948695. PMID 36622155. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Feng, Gang; Xie, Tian; Wang, Xin; Bai, Jiuyuan; Tang, Lin; Zhao, Hai; Wei, Wei; Wang, Maolin; Zhao, Yun (2018-12). Metagenomic analysis of microbial community and function involved in cd-contaminated soil. BMC Microbiology (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s12866-018-1152-5. ISSN 1471-2180. PMC 5812035. PMID 29439665. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Chen, Huaihai; Ma, Kayan; Lu, Caiyan; Fu, Qi; Qiu, Yingbo; Zhao, Jiayi; Huang, Yu; Yang, Yuchun; Schadt, Christopher W. (2022). Functional Redundancy in Soil Microbial Community Based on Metagenomics Across the Globe. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.878978. ISSN 1664-302X. PMC 9108720. PMID 35586865. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Singh, Nidhi; Singh, Veer; Rai, Sachchida Nand; Vamanu, Emanuel; Singh, Mohan P. (2022-12). Metagenomic Analysis of Garden Soil-Derived Microbial Consortia and Unveiling Their Metabolic Potential in Mitigating Toxic Hexavalent Chromium. Life (англ.). Т. 12, № 12. с. 2094. doi:10.3390/life12122094. ISSN 2075-1729. PMC 9781466. PMID 36556458. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nam, Nguyen Nhat; Do, Hoang Dang Khoa; Loan Trinh, Kieu The; Lee, Nae Yoon (2023-01). Metagenomics: An Effective Approach for Exploring Microbial Diversity and Functions. Foods (англ.). Т. 12, № 11. с. 2140. doi:10.3390/foods12112140. ISSN 2304-8158. PMC 10252221. PMID 37297385. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xue, Chun-Xu; Lin, Heyu; Zhu, Xiao-Yu; Liu, Jiwen; Zhang, Yunhui; Rowley, Gary; Todd, Jonathan D.; Li, Meng; Zhang, Xiao-Hua (2 серпня 2021). DiTing: A Pipeline to Infer and Compare Biogeochemical Pathways From Metagenomic and Metatranscriptomic Data. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.698286. ISSN 1664-302X. PMC 8367434. PMID 34408730. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Wei-Lin; Xu, Shao-Yan; Ren, Zhi-Gang; Tao, Liang; Jiang, Jian-Wen; Zheng, Shu-Sen (21 січня 2015). Application of metagenomics in the human gut microbiome. World Journal of Gastroenterology (англ.). Т. 21, № 3. с. 803—814. doi:10.3748/wjg.v21.i3.803. PMC 4299332. PMID 25624713. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malla, Muneer Ahmad; Dubey, Anamika; Kumar, Ashwani; Yadav, Shweta; Hashem, Abeer; Abd_Allah, Elsayed Fathi (2019). Exploring the Human Microbiome: The Potential Future Role of Next-Generation Sequencing in Disease Diagnosis and Treatment. Frontiers in Immunology. Т. 9. doi:10.3389/fimmu.2018.02868. ISSN 1664-3224. PMC 6330296. PMID 30666248. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Segata, Nicola; Izard, Jacques; Waldron, Levi; Gevers, Dirk; Miropolsky, Larisa; Garrett, Wendy S.; Huttenhower, Curtis (24 червня 2011). Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biology. Т. 12, № 6. с. R60. doi:10.1186/gb-2011-12-6-r60. ISSN 1474-760X. PMC 3218848. PMID 21702898. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wu, Honglong; Cai, Lihua; Li, Dongfang; Wang, Xinying; Zhao, Shancen; Zou, Fuhao; Zhou, Ke (11 січня 2018). Metagenomics Biomarkers Selected for Prediction of Three Different Diseases in Chinese Population. BioMed Research International (англ.). Т. 2018. с. e2936257. doi:10.1155/2018/2936257. ISSN 2314-6133. PMC 5820663. PMID 29568746. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Alshawaqfeh, Mustafa; Rababah, Salahelden; Hayajneh, Abdullah; Gharaibeh, Ammar; Serpedin, Erchin (28 грудня 2022). MetaAnalyst: a user-friendly tool for metagenomic biomarker detection and phenotype classification. BMC Medical Research Methodology (англ.). Т. 22, № 1. doi:10.1186/s12874-022-01812-5. ISSN 1471-2288. PMC 9795700. PMID 36577938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Iquebal, Mir Asif; Jagannadham, Jaisri; Jaiswal, Sarika; Prabha, Ratna; Rai, Anil; Kumar, Dinesh (2022). Potential Use of Microbial Community Genomes in Various Dimensions of Agriculture Productivity and Its Management: A Review. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.708335. ISSN 1664-302X. PMC 9152772. PMID 35655999. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nadarajah, Kalaivani; Abdul Rahman, Nur Sabrina Natasha (2023-01). The Microbial Connection to Sustainable Agriculture. Plants (англ.). Т. 12, № 12. с. 2307. doi:10.3390/plants12122307. ISSN 2223-7747. PMC 10303550. PMID 37375932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Srinivas, Meghana; O’Sullivan, Orla; Cotter, Paul D.; Sinderen, Douwe van; Kenny, John G. (2022-01). The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods. Foods (англ.). Т. 11, № 20. с. 3297. doi:10.3390/foods11203297. ISSN 2304-8158. PMC 9601669. PMID 37431045. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
de Abreu, Vinicius A. C.; Perdigão, José; Almeida, Sintia (2021). Metagenomic Approaches to Analyze Antimicrobial Resistance: An Overview. Frontiers in Genetics. Т. 11. doi:10.3389/fgene.2020.575592. ISSN 1664-8021. PMC 7848172. PMID 33537056. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pillay, Stephanie; Calderón-Franco, David; Urhan, Aysun; Abeel, Thomas (2 грудня 2022). Metagenomic-based surveillance systems for antibiotic resistance in non-clinical settings. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.1066995. ISSN 1664-302X. PMC 9755710. PMID 36532424. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hidalgo, Kelly J.; Sierra-Garcia, Isabel N.; Dellagnezze, Bruna M.; de Oliveira, Valéria Maia (2020). Metagenomic Insights Into the Mechanisms for Biodegradation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in the Oil Supply Chain. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.561506. ISSN 1664-302X. PMC 7530279. PMID 33072021. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pabbathi, Ninian Prem Prashanth; Velidandi, Aditya; Tavarna, Tanvi; Gupta, Shreyash; Raj, Ram Sarvesh; Gandam, Pradeep Kumar; Baadhe, Rama Raju (2023-01). Role of metagenomics in prospecting novel endoglucanases, accentuating functional metagenomics approach in second-generation biofuel production: a review. Biomass Conversion and Biorefinery (англ.). Т. 13, № 2. с. 1371—1398. doi:10.1007/s13399-020-01186-y. ISSN 2190-6815. PMC 7790359. PMID 33437563. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Sartaj, Km; Patel, Alok; Matsakas, Leonidas; Prasad, Ramasare (2022-11). Unravelling Metagenomics Approach for Microbial Biofuel Production. Genes (англ.). Т. 13, № 11. с. 1942. doi:10.3390/genes13111942. ISSN 2073-4425. PMC 9689425. PMID 36360179. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Vidulin, Vedrana; Šmuc, Tomislav; Džeroski, Sašo; Supek, Fran (2018-12). The evolutionary signal in metagenome phyletic profiles predicts many gene functions. Microbiome (англ.). Т. 6, № 1. doi:10.1186/s40168-018-0506-4. ISSN 2049-2618. PMC 6040064. PMID 29991352. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Czech, Lucas; Stamatakis, Alexandros; Dunthorn, Micah; Barbera, Pierre (2022). Metagenomic Analysis Using Phylogenetic Placement—A Review of the First Decade. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.871393. ISSN 2673-7647. PMC 9580882. PMID 36304302. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Madrigal-Trejo, David; Sánchez-Pérez, Jazmín; Espinosa-Asuar, Laura; Valdivia-Anistro, Jorge A.; Eguiarte, Luis E.; Souza, Valeria (2023-11). A Metagenomic Time-Series Approach to Assess the Ecological Stability of Microbial Mats in a Seasonally Fluctuating Environment. Microbial Ecology (англ.). Т. 86, № 4. с. 2252—2270. doi:10.1007/s00248-023-02231-9. ISSN 0095-3628. PMC 10640475. PMID 37393557. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Miller, Ruth R; Montoya, Vincent; Gardy, Jennifer L; Patrick, David M; Tang, Patrick (2013). Metagenomics for pathogen detection in public health. Genome Medicine (англ.). Т. 5, № 9. с. 81. doi:10.1186/gm485. ISSN 1756-994X. PMC 3978900. PMID 24050114. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Doestzada, Marwah; Vila, Arnau Vich; Zhernakova, Alexandra; Koonen, Debby P. Y.; Weersma, Rinse K.; Touw, Daan J.; Kuipers, Folkert; Wijmenga, Cisca; Fu, Jingyuan (28 квітня 2018). Pharmacomicrobiomics: a novel route towards personalized medicine?. Protein & Cell. Т. 9, № 5. с. 432—445. doi:10.1007/s13238-018-0547-2. ISSN 1674-800X. PMC 5960471. PMID 29705929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Cai, Jingwei; Auster, Alexis; Cho, Sungjoon; Lai, Zijuan (1 жовтня 2023). Dissecting the human gut microbiome to better decipher drug liability: A once-forgotten organ takes center stage. Journal of Advanced Research. Т. 52. с. 171—201. doi:10.1016/j.jare.2023.07.002. ISSN 2090-1232. PMC 10555929. PMID 37419381. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Nigam, Manisha; Panwar, Abhaya Shikhar; Singh, Rahul Kunwar (2022). Orchestrating the fecal microbiota transplantation: Current technological advancements and potential biomedical application. Frontiers in Medical Technology. Т. 4. doi:10.3389/fmedt.2022.961569. ISSN 2673-3129. PMC 9535080. PMID 36212607. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Xiaoli; Zhao, Jingwen; Feng, Yuanhang; Feng, Zelin; Ye, Yulin; Liu, Limin; Kang, Guangbo; Cao, Xiaocang (2022). Evolutionary Insights Into Microbiota Transplantation in Inflammatory Bowel Disease. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fcimb.2022.916543. ISSN 2235-2988. PMC 9257068. PMID 35811664. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Quaranta, Gianluca; Guarnaccia, Alessandra; Fancello, Giovanni; Agrillo, Chiara; Iannarelli, Federica; Sanguinetti, Maurizio; Masucci, Luca (2022-12). Fecal Microbiota Transplantation and Other Gut Microbiota Manipulation Strategies. Microorganisms (англ.). Т. 10, № 12. с. 2424. doi:10.3390/microorganisms10122424. ISSN 2076-2607. PMC 9781458. PMID 36557677. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Gebrayel, Prisca; Nicco, Carole; Al Khodor, Souhaila; Bilinski, Jaroslaw; Caselli, Elisabetta; Comelli, Elena M.; Egert, Markus; Giaroni, Cristina; Karpinski, Tomasz M. (7 березня 2022). Microbiota medicine: towards clinical revolution. Journal of Translational Medicine. Т. 20, № 1. с. 111. doi:10.1186/s12967-022-03296-9. ISSN 1479-5876. PMC 8900094. PMID 35255932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Fekete, Emily Ef; Figeys, Daniel; Zhang, Xu (31 грудня 2023). Microbiota-directed biotherapeutics: considerations for quality and functional assessment. Gut Microbes (англ.). Т. 15, № 1. doi:10.1080/19490976.2023.2186671. ISSN 1949-0976. PMC 10012963. PMID 36896938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
McDonagh, Francesca; Cormican, Martin; Morris, Dearbháile; Burke, Liam; Singh, Nitin Kumar; Venkateswaran, Kasthuri; Miliotis, Georgios (2023-07). Medical Astro-Microbiology: Current Role and Future Challenges. Journal of the Indian Institute of Science (англ.). Т. 103, № 3. с. 771—796. doi:10.1007/s41745-023-00360-1. ISSN 0970-4140. PMC 10082442. PMID 37362850. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Be, Nicholas A.; Avila-Herrera, Aram; Allen, Jonathan E.; Singh, Nitin; Checinska Sielaff, Aleksandra; Jaing, Crystal; Venkateswaran, Kasthuri (2017-12). Whole metagenome profiles of particulates collected from the International Space Station. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0292-4. ISSN 2049-2618. PMC 5514531. PMID 28716113. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Schwendner, Petra; Mahnert, Alexander; Koskinen, Kaisa; Moissl-Eichinger, Christine; Barczyk, Simon; Wirth, Reinhard; Berg, Gabriele; Rettberg, Petra (2017-12). Preparing for the crewed Mars journey: microbiota dynamics in the confined Mars500 habitat during simulated Mars flight and landing. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0345-8. ISSN 2049-2618. PMC 5627443. PMID 28974259. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malli Mohan, Ganesh Babu; Parker, Ceth W.; Urbaniak, Camilla; Singh, Nitin K.; Hood, Anthony; Minich, Jeremiah J.; Knight, Rob; Rucker, Michelle; Venkateswaran, Kasthuri (25 серпня 2020). Sangwan, Naseer (ред.). Microbiome and Metagenome Analyses of a Closed Habitat during Human Occupation. mSystems (англ.). Т. 5, № 4. doi:10.1128/mSystems.00367-20. ISSN 2379-5077. PMC 7394354. PMID 32723791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Mhatre, Snehit; Wood, Jason M.; Sielaff, Aleksandra Checinska; Mora, Maximilian; Duller, Stefanie; Singh, Nitin Kumar; Karouia, Fathi; Moissl-Eichinger, Christine; Venkateswaran, Kasthuri (2020). Assessing the Risk of Transfer of Microorganisms at the International Space Station Due to Cargo Delivery by Commercial Resupply Vehicles. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.566412. ISSN 1664-302X. PMC 7677455. PMID 33240227. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mahnert, Alexander; Verseux, Cyprien; Schwendner, Petra; Koskinen, Kaisa; Kumpitsch, Christina; Blohs, Marcus; Wink, Lisa; Brunner, Daniela; Goessler, Theodora (24 січня 2021). Microbiome dynamics during the HI-SEAS IV mission, and implications for future crewed missions beyond Earth. Microbiome. Т. 9, № 1. с. 27. doi:10.1186/s40168-020-00959-x. ISSN 2049-2618. PMC 7831191. PMID 33487169. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

Chiu, Charles Y.; Miller, Steven A. (2019-06). Clinical metagenomics. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 6. с. 341—355. doi:10.1038/s41576-019-0113-7. ISSN 1471-0064. PMC 6858796. PMID 30918369. Процитовано 11 червня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Slavov, Svetoslav Nanev (2022-11). Viral Metagenomics for Identification of Emerging Viruses in Transfusion Medicine. Viruses (англ.). Т. 14, № 11. с. 2448. doi:10.3390/v14112448. ISSN 1999-4915. PMC 9699440. PMID 36366546. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pérez-Cobas, Ana Elena; Gomez-Valero, Laura; Buchrieser, Carmen (2020). Metagenomic approaches in microbial ecology: an update on whole-genome and marker gene sequencing analyses. Microbial Genomics. Т. 6, № 8. с. e000409. doi:10.1099/mgen.0.000409. ISSN 2057-5858. PMC 7641418. PMID 32706331. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Prayogo, Fitra Adi; Budiharjo, Anto; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti; Wijanarka, Wijanarka; Suprihadi, Agung; Nurhayati, Nurhayati (4 серпня 2020). Metagenomic applications in exploration and development of novel enzymes from nature: a review. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. Т. 18, № 1. с. 39. doi:10.1186/s43141-020-00043-9. ISSN 2090-5920. PMC 7403272. PMID 32749574. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
d’Humières, Camille; Salmona, Maud; Dellière, Sarah; Leo, Stefano; Rodriguez, Christophe; Angebault, Cécile; Alanio, Alexandre; Fourati, Slim; Lazarevic, Vladimir (2021-09). The Potential Role of Clinical Metagenomics in Infectious Diseases: Therapeutic Perspectives. Drugs (англ.). Т. 81, № 13. с. 1453—1466. doi:10.1007/s40265-021-01572-4. ISSN 0012-6667. PMC 8323086. PMID 34328626. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Kawulok, Jolanta; Kawulok, Michal; Deorowicz, Sebastian (2019-12). Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint. Biology Direct (англ.). Т. 14, № 1. doi:10.1186/s13062-019-0251-z. ISSN 1745-6150. PMC 6854650. PMID 31722729. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhang, Lu; Chen, FengXin; Zeng, Zhan; Xu, Mengjiao; Sun, Fangfang; Yang, Liu; Bi, Xiaoyue; Lin, Yanjie; Gao, YuanJiao (2021). Advances in Metagenomics and Its Application in Environmental Microorganisms. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.766364. ISSN 1664-302X. PMC 8719654. PMID 34975791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Breitwieser, Florian P; Lu, Jennifer; Salzberg, Steven L (19 липня 2019). A review of methods and databases for metagenomic classification and assembly. Briefings in Bioinformatics (англ.). Т. 20, № 4. с. 1125—1136. doi:10.1093/bib/bbx120. ISSN 1467-5463. PMC 6781581. PMID 29028872. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Shao, Li; Liao, Jie; Qian, Jingyang; Chen, Wenbin; Fan, Xiaohui (2021-12). MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiology (англ.). Т. 21, № 1. doi:10.1186/s12866-021-02321-z. ISSN 1471-2180. PMC 8485520. PMID 34592929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Saenz, Carmen; Nigro, Eleonora; Gunalan, Vithiagaran; Arumugam, Manimozhiyan (2022). MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.846922. ISSN 2673-7647. PMC 9580859. PMID 36304282. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Aguiar-Pulido, Vanessa; Huang, Wenrui; Suarez-Ulloa, Victoria; Cickovski, Trevor; Mathee, Kalai; Narasimhan, Giri (2016-01). Metagenomics, Metatranscriptomics, and Metabolomics Approaches for Microbiome Analysis: Supplementary Issue: Bioinformatics Methods and Applications for Big Metagenomics Data. Evolutionary Bioinformatics (англ.). Т. 12s1. с. EBO.S36436. doi:10.4137/EBO.S36436. ISSN 1176-9343. PMC 4869604. PMID 27199545. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Schiml, Valerie C.; Delogu, Francesco; Kumar, Praveen; Kunath, Benoit; Batut, Bérénice; Mehta, Subina; Johnson, James E.; Grüning, Björn; Pope, Phillip B. (7 липня 2023). Integrative meta-omics in Galaxy and beyond. Environmental Microbiome (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s40793-023-00514-9. ISSN 2524-6372. PMC 10329324. PMID 37420292. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Kodikara, Saritha; Ellul, Susan; Lê Cao, Kim-Anh (14 липня 2022). Statistical challenges in longitudinal microbiome data analysis. Briefings in Bioinformatics. Т. 23, № 4. doi:10.1093/bib/bbac273. ISSN 1467-5463. PMC 9294433. PMID 35830875. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Luo, Dan; Liu, Wenwei; Chen, Tian; An, Lingling (2022-07). A Distribution-Free Model for Longitudinal Metagenomic Count Data. Genes (англ.). Т. 13, № 7. с. 1183. doi:10.3390/genes13071183. ISSN 2073-4425. PMC 9316307. PMID 35885966. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Porcellato, Davide; Pierce, Emily C.; Dinh, Cong B.; Portik, Daniel; Hall, Richard; Ashby, Meredith; Dutton, Rachel J. (23 лютого 2023). Cotter, Paul D. (ред.). Longitudinal, Multi-Platform Metagenomics Yields a High-Quality Genomic Catalog and Guides an In Vitro Model for Cheese Communities. mSystems (англ.). Т. 8, № 1. doi:10.1128/msystems.00701-22. ISSN 2379-5077. PMC 9948695. PMID 36622155. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Feng, Gang; Xie, Tian; Wang, Xin; Bai, Jiuyuan; Tang, Lin; Zhao, Hai; Wei, Wei; Wang, Maolin; Zhao, Yun (2018-12). Metagenomic analysis of microbial community and function involved in cd-contaminated soil. BMC Microbiology (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s12866-018-1152-5. ISSN 1471-2180. PMC 5812035. PMID 29439665. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Chen, Huaihai; Ma, Kayan; Lu, Caiyan; Fu, Qi; Qiu, Yingbo; Zhao, Jiayi; Huang, Yu; Yang, Yuchun; Schadt, Christopher W. (2022). Functional Redundancy in Soil Microbial Community Based on Metagenomics Across the Globe. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.878978. ISSN 1664-302X. PMC 9108720. PMID 35586865. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Singh, Nidhi; Singh, Veer; Rai, Sachchida Nand; Vamanu, Emanuel; Singh, Mohan P. (2022-12). Metagenomic Analysis of Garden Soil-Derived Microbial Consortia and Unveiling Their Metabolic Potential in Mitigating Toxic Hexavalent Chromium. Life (англ.). Т. 12, № 12. с. 2094. doi:10.3390/life12122094. ISSN 2075-1729. PMC 9781466. PMID 36556458. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nam, Nguyen Nhat; Do, Hoang Dang Khoa; Loan Trinh, Kieu The; Lee, Nae Yoon (2023-01). Metagenomics: An Effective Approach for Exploring Microbial Diversity and Functions. Foods (англ.). Т. 12, № 11. с. 2140. doi:10.3390/foods12112140. ISSN 2304-8158. PMC 10252221. PMID 37297385. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xue, Chun-Xu; Lin, Heyu; Zhu, Xiao-Yu; Liu, Jiwen; Zhang, Yunhui; Rowley, Gary; Todd, Jonathan D.; Li, Meng; Zhang, Xiao-Hua (2 серпня 2021). DiTing: A Pipeline to Infer and Compare Biogeochemical Pathways From Metagenomic and Metatranscriptomic Data. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.698286. ISSN 1664-302X. PMC 8367434. PMID 34408730. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Wei-Lin; Xu, Shao-Yan; Ren, Zhi-Gang; Tao, Liang; Jiang, Jian-Wen; Zheng, Shu-Sen (21 січня 2015). Application of metagenomics in the human gut microbiome. World Journal of Gastroenterology (англ.). Т. 21, № 3. с. 803—814. doi:10.3748/wjg.v21.i3.803. PMC 4299332. PMID 25624713. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malla, Muneer Ahmad; Dubey, Anamika; Kumar, Ashwani; Yadav, Shweta; Hashem, Abeer; Abd_Allah, Elsayed Fathi (2019). Exploring the Human Microbiome: The Potential Future Role of Next-Generation Sequencing in Disease Diagnosis and Treatment. Frontiers in Immunology. Т. 9. doi:10.3389/fimmu.2018.02868. ISSN 1664-3224. PMC 6330296. PMID 30666248. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Segata, Nicola; Izard, Jacques; Waldron, Levi; Gevers, Dirk; Miropolsky, Larisa; Garrett, Wendy S.; Huttenhower, Curtis (24 червня 2011). Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biology. Т. 12, № 6. с. R60. doi:10.1186/gb-2011-12-6-r60. ISSN 1474-760X. PMC 3218848. PMID 21702898. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wu, Honglong; Cai, Lihua; Li, Dongfang; Wang, Xinying; Zhao, Shancen; Zou, Fuhao; Zhou, Ke (11 січня 2018). Metagenomics Biomarkers Selected for Prediction of Three Different Diseases in Chinese Population. BioMed Research International (англ.). Т. 2018. с. e2936257. doi:10.1155/2018/2936257. ISSN 2314-6133. PMC 5820663. PMID 29568746. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Alshawaqfeh, Mustafa; Rababah, Salahelden; Hayajneh, Abdullah; Gharaibeh, Ammar; Serpedin, Erchin (28 грудня 2022). MetaAnalyst: a user-friendly tool for metagenomic biomarker detection and phenotype classification. BMC Medical Research Methodology (англ.). Т. 22, № 1. doi:10.1186/s12874-022-01812-5. ISSN 1471-2288. PMC 9795700. PMID 36577938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Iquebal, Mir Asif; Jagannadham, Jaisri; Jaiswal, Sarika; Prabha, Ratna; Rai, Anil; Kumar, Dinesh (2022). Potential Use of Microbial Community Genomes in Various Dimensions of Agriculture Productivity and Its Management: A Review. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.708335. ISSN 1664-302X. PMC 9152772. PMID 35655999. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nadarajah, Kalaivani; Abdul Rahman, Nur Sabrina Natasha (2023-01). The Microbial Connection to Sustainable Agriculture. Plants (англ.). Т. 12, № 12. с. 2307. doi:10.3390/plants12122307. ISSN 2223-7747. PMC 10303550. PMID 37375932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Srinivas, Meghana; O’Sullivan, Orla; Cotter, Paul D.; Sinderen, Douwe van; Kenny, John G. (2022-01). The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods. Foods (англ.). Т. 11, № 20. с. 3297. doi:10.3390/foods11203297. ISSN 2304-8158. PMC 9601669. PMID 37431045. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
de Abreu, Vinicius A. C.; Perdigão, José; Almeida, Sintia (2021). Metagenomic Approaches to Analyze Antimicrobial Resistance: An Overview. Frontiers in Genetics. Т. 11. doi:10.3389/fgene.2020.575592. ISSN 1664-8021. PMC 7848172. PMID 33537056. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pillay, Stephanie; Calderón-Franco, David; Urhan, Aysun; Abeel, Thomas (2 грудня 2022). Metagenomic-based surveillance systems for antibiotic resistance in non-clinical settings. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.1066995. ISSN 1664-302X. PMC 9755710. PMID 36532424. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hidalgo, Kelly J.; Sierra-Garcia, Isabel N.; Dellagnezze, Bruna M.; de Oliveira, Valéria Maia (2020). Metagenomic Insights Into the Mechanisms for Biodegradation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in the Oil Supply Chain. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.561506. ISSN 1664-302X. PMC 7530279. PMID 33072021. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pabbathi, Ninian Prem Prashanth; Velidandi, Aditya; Tavarna, Tanvi; Gupta, Shreyash; Raj, Ram Sarvesh; Gandam, Pradeep Kumar; Baadhe, Rama Raju (2023-01). Role of metagenomics in prospecting novel endoglucanases, accentuating functional metagenomics approach in second-generation biofuel production: a review. Biomass Conversion and Biorefinery (англ.). Т. 13, № 2. с. 1371—1398. doi:10.1007/s13399-020-01186-y. ISSN 2190-6815. PMC 7790359. PMID 33437563. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Sartaj, Km; Patel, Alok; Matsakas, Leonidas; Prasad, Ramasare (2022-11). Unravelling Metagenomics Approach for Microbial Biofuel Production. Genes (англ.). Т. 13, № 11. с. 1942. doi:10.3390/genes13111942. ISSN 2073-4425. PMC 9689425. PMID 36360179. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Vidulin, Vedrana; Šmuc, Tomislav; Džeroski, Sašo; Supek, Fran (2018-12). The evolutionary signal in metagenome phyletic profiles predicts many gene functions. Microbiome (англ.). Т. 6, № 1. doi:10.1186/s40168-018-0506-4. ISSN 2049-2618. PMC 6040064. PMID 29991352. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Czech, Lucas; Stamatakis, Alexandros; Dunthorn, Micah; Barbera, Pierre (2022). Metagenomic Analysis Using Phylogenetic Placement—A Review of the First Decade. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.871393. ISSN 2673-7647. PMC 9580882. PMID 36304302. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Madrigal-Trejo, David; Sánchez-Pérez, Jazmín; Espinosa-Asuar, Laura; Valdivia-Anistro, Jorge A.; Eguiarte, Luis E.; Souza, Valeria (2023-11). A Metagenomic Time-Series Approach to Assess the Ecological Stability of Microbial Mats in a Seasonally Fluctuating Environment. Microbial Ecology (англ.). Т. 86, № 4. с. 2252—2270. doi:10.1007/s00248-023-02231-9. ISSN 0095-3628. PMC 10640475. PMID 37393557. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Miller, Ruth R; Montoya, Vincent; Gardy, Jennifer L; Patrick, David M; Tang, Patrick (2013). Metagenomics for pathogen detection in public health. Genome Medicine (англ.). Т. 5, № 9. с. 81. doi:10.1186/gm485. ISSN 1756-994X. PMC 3978900. PMID 24050114. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Doestzada, Marwah; Vila, Arnau Vich; Zhernakova, Alexandra; Koonen, Debby P. Y.; Weersma, Rinse K.; Touw, Daan J.; Kuipers, Folkert; Wijmenga, Cisca; Fu, Jingyuan (28 квітня 2018). Pharmacomicrobiomics: a novel route towards personalized medicine?. Protein & Cell. Т. 9, № 5. с. 432—445. doi:10.1007/s13238-018-0547-2. ISSN 1674-800X. PMC 5960471. PMID 29705929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Cai, Jingwei; Auster, Alexis; Cho, Sungjoon; Lai, Zijuan (1 жовтня 2023). Dissecting the human gut microbiome to better decipher drug liability: A once-forgotten organ takes center stage. Journal of Advanced Research. Т. 52. с. 171—201. doi:10.1016/j.jare.2023.07.002. ISSN 2090-1232. PMC 10555929. PMID 37419381. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Nigam, Manisha; Panwar, Abhaya Shikhar; Singh, Rahul Kunwar (2022). Orchestrating the fecal microbiota transplantation: Current technological advancements and potential biomedical application. Frontiers in Medical Technology. Т. 4. doi:10.3389/fmedt.2022.961569. ISSN 2673-3129. PMC 9535080. PMID 36212607. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Xiaoli; Zhao, Jingwen; Feng, Yuanhang; Feng, Zelin; Ye, Yulin; Liu, Limin; Kang, Guangbo; Cao, Xiaocang (2022). Evolutionary Insights Into Microbiota Transplantation in Inflammatory Bowel Disease. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fcimb.2022.916543. ISSN 2235-2988. PMC 9257068. PMID 35811664. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Quaranta, Gianluca; Guarnaccia, Alessandra; Fancello, Giovanni; Agrillo, Chiara; Iannarelli, Federica; Sanguinetti, Maurizio; Masucci, Luca (2022-12). Fecal Microbiota Transplantation and Other Gut Microbiota Manipulation Strategies. Microorganisms (англ.). Т. 10, № 12. с. 2424. doi:10.3390/microorganisms10122424. ISSN 2076-2607. PMC 9781458. PMID 36557677. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Gebrayel, Prisca; Nicco, Carole; Al Khodor, Souhaila; Bilinski, Jaroslaw; Caselli, Elisabetta; Comelli, Elena M.; Egert, Markus; Giaroni, Cristina; Karpinski, Tomasz M. (7 березня 2022). Microbiota medicine: towards clinical revolution. Journal of Translational Medicine. Т. 20, № 1. с. 111. doi:10.1186/s12967-022-03296-9. ISSN 1479-5876. PMC 8900094. PMID 35255932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Fekete, Emily Ef; Figeys, Daniel; Zhang, Xu (31 грудня 2023). Microbiota-directed biotherapeutics: considerations for quality and functional assessment. Gut Microbes (англ.). Т. 15, № 1. doi:10.1080/19490976.2023.2186671. ISSN 1949-0976. PMC 10012963. PMID 36896938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
McDonagh, Francesca; Cormican, Martin; Morris, Dearbháile; Burke, Liam; Singh, Nitin Kumar; Venkateswaran, Kasthuri; Miliotis, Georgios (2023-07). Medical Astro-Microbiology: Current Role and Future Challenges. Journal of the Indian Institute of Science (англ.). Т. 103, № 3. с. 771—796. doi:10.1007/s41745-023-00360-1. ISSN 0970-4140. PMC 10082442. PMID 37362850. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Be, Nicholas A.; Avila-Herrera, Aram; Allen, Jonathan E.; Singh, Nitin; Checinska Sielaff, Aleksandra; Jaing, Crystal; Venkateswaran, Kasthuri (2017-12). Whole metagenome profiles of particulates collected from the International Space Station. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0292-4. ISSN 2049-2618. PMC 5514531. PMID 28716113. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Schwendner, Petra; Mahnert, Alexander; Koskinen, Kaisa; Moissl-Eichinger, Christine; Barczyk, Simon; Wirth, Reinhard; Berg, Gabriele; Rettberg, Petra (2017-12). Preparing for the crewed Mars journey: microbiota dynamics in the confined Mars500 habitat during simulated Mars flight and landing. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0345-8. ISSN 2049-2618. PMC 5627443. PMID 28974259. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malli Mohan, Ganesh Babu; Parker, Ceth W.; Urbaniak, Camilla; Singh, Nitin K.; Hood, Anthony; Minich, Jeremiah J.; Knight, Rob; Rucker, Michelle; Venkateswaran, Kasthuri (25 серпня 2020). Sangwan, Naseer (ред.). Microbiome and Metagenome Analyses of a Closed Habitat during Human Occupation. mSystems (англ.). Т. 5, № 4. doi:10.1128/mSystems.00367-20. ISSN 2379-5077. PMC 7394354. PMID 32723791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Mhatre, Snehit; Wood, Jason M.; Sielaff, Aleksandra Checinska; Mora, Maximilian; Duller, Stefanie; Singh, Nitin Kumar; Karouia, Fathi; Moissl-Eichinger, Christine; Venkateswaran, Kasthuri (2020). Assessing the Risk of Transfer of Microorganisms at the International Space Station Due to Cargo Delivery by Commercial Resupply Vehicles. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.566412. ISSN 1664-302X. PMC 7677455. PMID 33240227. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mahnert, Alexander; Verseux, Cyprien; Schwendner, Petra; Koskinen, Kaisa; Kumpitsch, Christina; Blohs, Marcus; Wink, Lisa; Brunner, Daniela; Goessler, Theodora (24 січня 2021). Microbiome dynamics during the HI-SEAS IV mission, and implications for future crewed missions beyond Earth. Microbiome. Т. 9, № 1. с. 27. doi:10.1186/s40168-020-00959-x. ISSN 2049-2618. PMC 7831191. PMID 33487169. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

oup.com

academic.oup.com

Breitwieser, Florian P; Lu, Jennifer; Salzberg, Steven L (19 липня 2019). A review of methods and databases for metagenomic classification and assembly. Briefings in Bioinformatics (англ.). Т. 20, № 4. с. 1125—1136. doi:10.1093/bib/bbx120. ISSN 1467-5463. PMC 6781581. PMID 29028872. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Berini, Francesca; Casciello, Carmine; Marcone, Giorgia Letizia; Marinelli, Flavia (15 листопада 2017). Metagenomics: novel enzymes from non-culturable microbes. FEMS Microbiology Letters (англ.). Т. 364, № 21. doi:10.1093/femsle/fnx211. ISSN 1574-6968. Процитовано 20 грудня 2023.

plos.org

journals.plos.org

Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

sagepub.com

journals.sagepub.com

Aguiar-Pulido, Vanessa; Huang, Wenrui; Suarez-Ulloa, Victoria; Cickovski, Trevor; Mathee, Kalai; Narasimhan, Giri (2016-01). Metagenomics, Metatranscriptomics, and Metabolomics Approaches for Microbiome Analysis: Supplementary Issue: Bioinformatics Methods and Applications for Big Metagenomics Data. Evolutionary Bioinformatics (англ.). Т. 12s1. с. EBO.S36436. doi:10.4137/EBO.S36436. ISSN 1176-9343. PMC 4869604. PMID 27199545. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)

sciencedirect.com

Taş, Neslihan; de Jong, Anniek EE; Li, Yaoming; Trubl, Gareth; Xue, Yaxin; Dove, Nicholas C (1 лютого 2021). Metagenomic tools in microbial ecology research. Current Opinion in Biotechnology. Т. 67. с. 184—191. doi:10.1016/j.copbio.2021.01.019. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yanan; Hu, Yongfei; Gao, George Fu (1 березня 2020). Combining metagenomics and metatranscriptomics to study human, animal and environmental resistomes. Medicine in Microecology. Т. 3. с. 100014. doi:10.1016/j.medmic.2020.100014. ISSN 2590-0978. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yanan; Hu, Yongfei; Liu, Fei; Cao, Jian; Lv, Na; Zhu, Baoli; Zhang, Gaiping; Gao, George Fu (1 травня 2020). Integrated metagenomic and metatranscriptomic profiling reveals differentially expressed resistomes in human, chicken, and pig gut microbiomes. Environment International. Т. 138. с. 105649. doi:10.1016/j.envint.2020.105649. ISSN 0160-4120. Процитовано 20 грудня 2023.
Lewin, Anna; Wentzel, Alexander; Valla, Svein (1 червня 2013). Metagenomics of microbial life in extreme temperature environments. Current Opinion in Biotechnology. Т. 24, № 3. с. 516—525. doi:10.1016/j.copbio.2012.10.012. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
Cowan, DA; Ramond, J-B; Makhalanyane, TP; De Maayer, P (1 червня 2015). Metagenomics of extreme environments. Current Opinion in Microbiology. Т. 25. с. 97—102. doi:10.1016/j.mib.2015.05.005. ISSN 1369-5274. Процитовано 20 грудня 2023.
Puig-Castellví, Francesc; Pacheco-Tapia, Romina; Deslande, Maxime; Jia, Manyi; Andrikopoulos, Petros; Chechi, Kanta; Bonnefond, Amélie; Froguel, Philippe; Dumas, Marc-Emmanuel (1 жовтня 2023). Advances in the integration of metabolomics and metagenomics for human gut microbiome and their clinical applications. TrAC Trends in Analytical Chemistry. Т. 167. с. 117248. doi:10.1016/j.trac.2023.117248. ISSN 0165-9936. Процитовано 20 грудня 2023.
Fadiji, Ayomide Emmanuel; Babalola, Olubukola Oluranti (1 березня 2020). Metagenomics methods for the study of plant-associated microbial communities: A review. Journal of Microbiological Methods. Т. 170. с. 105860. doi:10.1016/j.mimet.2020.105860. ISSN 0167-7012. Процитовано 20 грудня 2023.
Billington, Craig; Kingsbury, Joanne M.; Rivas, Lucia (1 березня 2022). Metagenomics Approaches for Improving Food Safety: A Review. Journal of Food Protection. Т. 85, № 3. с. 448—464. doi:10.4315/JFP-21-301. ISSN 0362-028X. Процитовано 20 грудня 2023.
Hauptfeld, Ernestina; Pelkmans, Jordi; Huisman, Terry T.; Anocic, Armin; Snoek, Basten L.; von Meijenfeldt, F. A. Bastiaan; Gerritse, Jan; van Leeuwen, Johan; Leurink, Gert (1 серпня 2022). A metagenomic portrait of the microbial community responsible for two decades of bioremediation of poly-contaminated groundwater. Water Research. Т. 221. с. 118767. doi:10.1016/j.watres.2022.118767. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Wu, Yicheng; Zhou, Zhuoyi; Fu, Haiyan; Zhang, Peng; Zheng, Yue (10 листопада 2022). Metagenomic analysis of microbial community and gene function of anodic biofilm for nonylphenol removal in microbial fuel cells. Journal of Cleaner Production. Т. 374. с. 133895. doi:10.1016/j.jclepro.2022.133895. ISSN 0959-6526. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yifei; Li, Dongpeng; Song, Xinshan; Cao, Xin; Xu, Zhongshuo; Huang, Wei; Wang, Yuhui; Wang, Zhiwei; Sand, Wolfgang (1 травня 2022). Intensifying anoxic ammonium removal by manganese ores and granular active carbon fillings in constructed wetland-microbial fuel cells: Metagenomics reveals functional genes and microbial mechanisms. Bioresource Technology. Т. 352. с. 127114. doi:10.1016/j.biortech.2022.127114. ISSN 0960-8524. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhou, Lei; Sang, Shilei; Li, Jiajie; Li, Yusen; Wang, Dapeng; Gan, Lihong; Zhao, Zelong; Wang, Jun (15 серпня 2023). From waste to resource: Metagenomics uncovers the molecular ecological resources for plastic degradation in estuaries of South China. Water Research. Т. 242. с. 120270. doi:10.1016/j.watres.2023.120270. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Chen, Geng; Bai, Rui; Zhang, Yiqing; Zhao, Biyi; Xiao, Yong (10 лютого 2022). Application of metagenomics to biological wastewater treatment. Science of The Total Environment. Т. 807. с. 150737. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.150737. ISSN 0048-9697. Процитовано 20 грудня 2023.
Deng, Chunfang; Zhao, Renxin; Qiu, Zhiguang; Li, Bing; Zhang, Tong; Guo, Feng; Mu, Rong; Wu, Yang; Qiao, Xuejiao (10 квітня 2022). Genome-centric metagenomics provides new insights into the microbial community and metabolic potential of landfill leachate microbiota. Science of The Total Environment. Т. 816. с. 151635. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.151635. ISSN 0048-9697. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhang, Siying; Liang, Chengyu; Xiao, Mengyao; Chui, Chunmeng; Wang, Na; Ji, Yuji; Wang, Zhi; Shi, Jiping; Liu, Li (1 жовтня 2023). Metagenomic characterization of the enhanced performance of multicomponent synergistic thermophilic anaerobic co-digestion of food waste utilizing kitchen waste or garden waste as co-substrate. Water Research. Т. 244. с. 120457. doi:10.1016/j.watres.2023.120457. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Toulza, Eve; Blanc-Mathieu, Romain; Gourbière, Sébastien; Piganeau, Gwenael (1 січня 2012). Piganeau, Gwenaël (ред.). Chapter Ten - Environmental and Evolutionary Genomics of Microbial Algae: Power and Challenges of Metagenomics. Advances in Botanical Research. Т. 64. Academic Press. с. 383—427. doi:10.1016/b978-0-12-391499-6.00010-4.
Picot, Aurore; Shibasaki, Shota; Meacock, Oliver J; Mitri, Sara (1 жовтня 2023). Microbial interactions in theory and practice: when are measurements compatible with models?. Current Opinion in Microbiology. Т. 75. с. 102354. doi:10.1016/j.mib.2023.102354. ISSN 1369-5274. Процитовано 20 грудня 2023.
Cai, Jingwei; Auster, Alexis; Cho, Sungjoon; Lai, Zijuan (1 жовтня 2023). Dissecting the human gut microbiome to better decipher drug liability: A once-forgotten organ takes center stage. Journal of Advanced Research. Т. 52. с. 171—201. doi:10.1016/j.jare.2023.07.002. ISSN 2090-1232. PMC 10555929. PMID 37419381. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Yang, Ruixue; Chen, Zhenzhen; Cai, Jun (1 грудня 2023). Fecal microbiota transplantation: Emerging applications in autoimmune diseases. Journal of Autoimmunity. Т. 141. с. 103038. doi:10.1016/j.jaut.2023.103038. ISSN 0896-8411. Процитовано 20 грудня 2023.

springer.com

link.springer.com

Vecherskii, M. V.; Semenov, M. V.; Lisenkova, A. A.; Stepankov, A. A. (2021-12). Metagenomics: A New Direction in Ecology. Biology Bulletin (англ.). Т. 48, № S3. с. S107—S117. doi:10.1134/S1062359022010150. ISSN 1062-3590. Процитовано 20 грудня 2023.
d’Humières, Camille; Salmona, Maud; Dellière, Sarah; Leo, Stefano; Rodriguez, Christophe; Angebault, Cécile; Alanio, Alexandre; Fourati, Slim; Lazarevic, Vladimir (2021-09). The Potential Role of Clinical Metagenomics in Infectious Diseases: Therapeutic Perspectives. Drugs (англ.). Т. 81, № 13. с. 1453—1466. doi:10.1007/s40265-021-01572-4. ISSN 0012-6667. PMC 8323086. PMID 34328626. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Nowrotek, Monika; Jałowiecki, Łukasz; Harnisz, Monika; Płaza, Grażyna Anna (2019-06). Culturomics and metagenomics: In understanding of environmental resistome. Frontiers of Environmental Science & Engineering (англ.). Т. 13, № 3. doi:10.1007/s11783-019-1121-8. ISSN 2095-2201. Процитовано 20 грудня 2023.
Molefe, Rebaona R.; Amoo, Adenike E.; Babalola, Olubukola O. (2023-07). Communication between plant roots and the soil microbiome; involvement in plant growth and development. Symbiosis (англ.). Т. 90, № 3. с. 231—239. doi:10.1007/s13199-023-00941-9. ISSN 0334-5114. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Hongling; Hart, Darren J.; An, Yingfeng (2019-09). Functional Metagenomic Technologies for the Discovery of Novel Enzymes for Biomass Degradation and Biofuel Production. BioEnergy Research (англ.). Т. 12, № 3. с. 457—470. doi:10.1007/s12155-019-10005-w. ISSN 1939-1234. Процитовано 20 грудня 2023.
Pabbathi, Ninian Prem Prashanth; Velidandi, Aditya; Tavarna, Tanvi; Gupta, Shreyash; Raj, Ram Sarvesh; Gandam, Pradeep Kumar; Baadhe, Rama Raju (2023-01). Role of metagenomics in prospecting novel endoglucanases, accentuating functional metagenomics approach in second-generation biofuel production: a review. Biomass Conversion and Biorefinery (англ.). Т. 13, № 2. с. 1371—1398. doi:10.1007/s13399-020-01186-y. ISSN 2190-6815. PMC 7790359. PMID 33437563. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Thakur, Karnika; Chownk, Manisha; Kumar, Varun; Purohit, Anjali; Vashisht, Alokika; Kumar, Vinod; Yadav, Sudesh Kumar (2020-03). Bioprospecting potential of microbial communities in solid waste landfills for novel enzymes through metagenomic approach. World Journal of Microbiology and Biotechnology (англ.). Т. 36, № 3. doi:10.1007/s11274-020-02812-7. ISSN 0959-3993. Процитовано 20 грудня 2023.
Madrigal-Trejo, David; Sánchez-Pérez, Jazmín; Espinosa-Asuar, Laura; Valdivia-Anistro, Jorge A.; Eguiarte, Luis E.; Souza, Valeria (2023-11). A Metagenomic Time-Series Approach to Assess the Ecological Stability of Microbial Mats in a Seasonally Fluctuating Environment. Microbial Ecology (англ.). Т. 86, № 4. с. 2252—2270. doi:10.1007/s00248-023-02231-9. ISSN 0095-3628. PMC 10640475. PMID 37393557. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
McDonagh, Francesca; Cormican, Martin; Morris, Dearbháile; Burke, Liam; Singh, Nitin Kumar; Venkateswaran, Kasthuri; Miliotis, Georgios (2023-07). Medical Astro-Microbiology: Current Role and Future Challenges. Journal of the Indian Institute of Science (англ.). Т. 103, № 3. с. 771—796. doi:10.1007/s41745-023-00360-1. ISSN 0970-4140. PMC 10082442. PMID 37362850. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)

tandfonline.com

Davis, Benjamin C.; Brown, Connor; Gupta, Suraj; Calarco, Jeannette; Liguori, Krista; Milligan, Erin; Harwood, Valerie J.; Pruden, Amy; Keenum, Ishi (2 жовтня 2023). Recommendations for the use of metagenomics for routine monitoring of antibiotic resistance in wastewater and impacted aquatic environments. Critical Reviews in Environmental Science and Technology (англ.). Т. 53, № 19. с. 1731—1756. doi:10.1080/10643389.2023.2181620. ISSN 1064-3389. Процитовано 20 грудня 2023.
Fekete, Emily Ef; Figeys, Daniel; Zhang, Xu (31 грудня 2023). Microbiota-directed biotherapeutics: considerations for quality and functional assessment. Gut Microbes (англ.). Т. 15, № 1. doi:10.1080/19490976.2023.2186671. ISSN 1949-0976. PMC 10012963. PMID 36896938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)

wiley.com

onlinelibrary.wiley.com

Rosso, Gretchen E.; Muday, Jeffrey A.; Curran, James F. (2018-03). Tools for Metagenomic Analysis at Wastewater Treatment Plants: Application to a Foaming Episode: Rosso et al. Water Environment Research (англ.). Т. 90, № 3. с. 258—268. doi:10.2175/106143017X15054988926352. ISSN 1061-4303. Процитовано 20 грудня 2023.

wjgnet.com

Wang, Wei-Lin; Xu, Shao-Yan; Ren, Zhi-Gang; Tao, Liang; Jiang, Jian-Wen; Zheng, Shu-Sen (21 січня 2015). Application of metagenomics in the human gut microbiome. World Journal of Gastroenterology (англ.). Т. 21, № 3. с. 803—814. doi:10.3748/wjg.v21.i3.803. PMC 4299332. PMID 25624713. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

worldcat.org

Chiu, Charles Y.; Miller, Steven A. (2019-06). Clinical metagenomics. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 6. с. 341—355. doi:10.1038/s41576-019-0113-7. ISSN 1471-0064. PMC 6858796. PMID 30918369. Процитовано 11 червня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Slavov, Svetoslav Nanev (2022-11). Viral Metagenomics for Identification of Emerging Viruses in Transfusion Medicine. Viruses (англ.). Т. 14, № 11. с. 2448. doi:10.3390/v14112448. ISSN 1999-4915. PMC 9699440. PMID 36366546. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pérez-Cobas, Ana Elena; Gomez-Valero, Laura; Buchrieser, Carmen (2020). Metagenomic approaches in microbial ecology: an update on whole-genome and marker gene sequencing analyses. Microbial Genomics. Т. 6, № 8. с. e000409. doi:10.1099/mgen.0.000409. ISSN 2057-5858. PMC 7641418. PMID 32706331. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Taş, Neslihan; de Jong, Anniek EE; Li, Yaoming; Trubl, Gareth; Xue, Yaxin; Dove, Nicholas C (1 лютого 2021). Metagenomic tools in microbial ecology research. Current Opinion in Biotechnology. Т. 67. с. 184—191. doi:10.1016/j.copbio.2021.01.019. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
Vecherskii, M. V.; Semenov, M. V.; Lisenkova, A. A.; Stepankov, A. A. (2021-12). Metagenomics: A New Direction in Ecology. Biology Bulletin (англ.). Т. 48, № S3. с. S107—S117. doi:10.1134/S1062359022010150. ISSN 1062-3590. Процитовано 20 грудня 2023.
Prayogo, Fitra Adi; Budiharjo, Anto; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti; Wijanarka, Wijanarka; Suprihadi, Agung; Nurhayati, Nurhayati (4 серпня 2020). Metagenomic applications in exploration and development of novel enzymes from nature: a review. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. Т. 18, № 1. с. 39. doi:10.1186/s43141-020-00043-9. ISSN 2090-5920. PMC 7403272. PMID 32749574. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
d’Humières, Camille; Salmona, Maud; Dellière, Sarah; Leo, Stefano; Rodriguez, Christophe; Angebault, Cécile; Alanio, Alexandre; Fourati, Slim; Lazarevic, Vladimir (2021-09). The Potential Role of Clinical Metagenomics in Infectious Diseases: Therapeutic Perspectives. Drugs (англ.). Т. 81, № 13. с. 1453—1466. doi:10.1007/s40265-021-01572-4. ISSN 0012-6667. PMC 8323086. PMID 34328626. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Nowrotek, Monika; Jałowiecki, Łukasz; Harnisz, Monika; Płaza, Grażyna Anna (2019-06). Culturomics and metagenomics: In understanding of environmental resistome. Frontiers of Environmental Science & Engineering (англ.). Т. 13, № 3. doi:10.1007/s11783-019-1121-8. ISSN 2095-2201. Процитовано 20 грудня 2023.
Kawulok, Jolanta; Kawulok, Michal; Deorowicz, Sebastian (2019-12). Environmental metagenome classification for constructing a microbiome fingerprint. Biology Direct (англ.). Т. 14, № 1. doi:10.1186/s13062-019-0251-z. ISSN 1745-6150. PMC 6854650. PMID 31722729. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhang, Lu; Chen, FengXin; Zeng, Zhan; Xu, Mengjiao; Sun, Fangfang; Yang, Liu; Bi, Xiaoyue; Lin, Yanjie; Gao, YuanJiao (2021). Advances in Metagenomics and Its Application in Environmental Microorganisms. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.766364. ISSN 1664-302X. PMC 8719654. PMID 34975791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Davis, Benjamin C.; Brown, Connor; Gupta, Suraj; Calarco, Jeannette; Liguori, Krista; Milligan, Erin; Harwood, Valerie J.; Pruden, Amy; Keenum, Ishi (2 жовтня 2023). Recommendations for the use of metagenomics for routine monitoring of antibiotic resistance in wastewater and impacted aquatic environments. Critical Reviews in Environmental Science and Technology (англ.). Т. 53, № 19. с. 1731—1756. doi:10.1080/10643389.2023.2181620. ISSN 1064-3389. Процитовано 20 грудня 2023.
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Xu, Ruijie; Rajeev, Sreekumari; Salvador, Liliana C. M. (7 квіт. 2023 р.). The selection of software and database for metagenomics sequence analysis impacts the outcome of microbial profiling and pathogen detection. PLOS ONE (англ.). Т. 18, № 4. с. e0284031. doi:10.1371/journal.pone.0284031. ISSN 1932-6203. PMC 10081788. PMID 37027361. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Breitwieser, Florian P; Lu, Jennifer; Salzberg, Steven L (19 липня 2019). A review of methods and databases for metagenomic classification and assembly. Briefings in Bioinformatics (англ.). Т. 20, № 4. с. 1125—1136. doi:10.1093/bib/bbx120. ISSN 1467-5463. PMC 6781581. PMID 29028872. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Shao, Li; Liao, Jie; Qian, Jingyang; Chen, Wenbin; Fan, Xiaohui (2021-12). MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiology (англ.). Т. 21, № 1. doi:10.1186/s12866-021-02321-z. ISSN 1471-2180. PMC 8485520. PMID 34592929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Yanan; Hu, Yongfei; Gao, George Fu (1 березня 2020). Combining metagenomics and metatranscriptomics to study human, animal and environmental resistomes. Medicine in Microecology. Т. 3. с. 100014. doi:10.1016/j.medmic.2020.100014. ISSN 2590-0978. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yanan; Hu, Yongfei; Liu, Fei; Cao, Jian; Lv, Na; Zhu, Baoli; Zhang, Gaiping; Gao, George Fu (1 травня 2020). Integrated metagenomic and metatranscriptomic profiling reveals differentially expressed resistomes in human, chicken, and pig gut microbiomes. Environment International. Т. 138. с. 105649. doi:10.1016/j.envint.2020.105649. ISSN 0160-4120. Процитовано 20 грудня 2023.
Saenz, Carmen; Nigro, Eleonora; Gunalan, Vithiagaran; Arumugam, Manimozhiyan (2022). MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.846922. ISSN 2673-7647. PMC 9580859. PMID 36304282. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhao, Ming; Zhang, Dong-lian; Su, Xiao-qin; Duan, Shuang-mei; Wan, Jin-qiong; Yuan, Wen-xia; Liu, Ben-ying; Ma, Yan; Pan, Ying-hong (14 травня 2015). An Integrated Metagenomics/Metaproteomics Investigation of the Microbial Communities and Enzymes in Solid-state Fermentation of Pu-erh tea. Scientific Reports (англ.). Т. 5, № 1. с. 10117. doi:10.1038/srep10117. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Liu, Chao; Huang, Haining; Duan, Xu; Chen, Yinguang (2 листопада 2021). Integrated Metagenomic and Metaproteomic Analyses Unravel Ammonia Toxicity to Active Methanogens and Syntrophs, Enzyme Synthesis, and Key Enzymes in Anaerobic Digestion. Environmental Science & Technology (англ.). Т. 55, № 21. с. 14817—14827. doi:10.1021/acs.est.1c00797. ISSN 0013-936X. Процитовано 20 грудня 2023.
Shi, Yanmei; Tyson, Gene W.; Eppley, John M.; DeLong, Edward F. (2011-06). Integrated metatranscriptomic and metagenomic analyses of stratified microbial assemblages in the open ocean. The ISME Journal (англ.). Т. 5, № 6. с. 999—1013. doi:10.1038/ismej.2010.189. ISSN 1751-7370. Процитовано 20 грудня 2023.
Aguiar-Pulido, Vanessa; Huang, Wenrui; Suarez-Ulloa, Victoria; Cickovski, Trevor; Mathee, Kalai; Narasimhan, Giri (2016-01). Metagenomics, Metatranscriptomics, and Metabolomics Approaches for Microbiome Analysis: Supplementary Issue: Bioinformatics Methods and Applications for Big Metagenomics Data. Evolutionary Bioinformatics (англ.). Т. 12s1. с. EBO.S36436. doi:10.4137/EBO.S36436. ISSN 1176-9343. PMC 4869604. PMID 27199545. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Herold, Malte; Martínez Arbas, Susana; Narayanasamy, Shaman; Sheik, Abdul R.; Kleine-Borgmann, Luise A. K.; Lebrun, Laura A.; Kunath, Benoît J.; Roume, Hugo; Bessarab, Irina (19 жовтня 2020). Integration of time-series meta-omics data reveals how microbial ecosystems respond to disturbance. Nature Communications (англ.). Т. 11, № 1. с. 5281. doi:10.1038/s41467-020-19006-2. ISSN 2041-1723. Процитовано 20 грудня 2023.
Schiml, Valerie C.; Delogu, Francesco; Kumar, Praveen; Kunath, Benoit; Batut, Bérénice; Mehta, Subina; Johnson, James E.; Grüning, Björn; Pope, Phillip B. (7 липня 2023). Integrative meta-omics in Galaxy and beyond. Environmental Microbiome (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s40793-023-00514-9. ISSN 2524-6372. PMC 10329324. PMID 37420292. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Kodikara, Saritha; Ellul, Susan; Lê Cao, Kim-Anh (14 липня 2022). Statistical challenges in longitudinal microbiome data analysis. Briefings in Bioinformatics. Т. 23, № 4. doi:10.1093/bib/bbac273. ISSN 1467-5463. PMC 9294433. PMID 35830875. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Luo, Dan; Liu, Wenwei; Chen, Tian; An, Lingling (2022-07). A Distribution-Free Model for Longitudinal Metagenomic Count Data. Genes (англ.). Т. 13, № 7. с. 1183. doi:10.3390/genes13071183. ISSN 2073-4425. PMC 9316307. PMID 35885966. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Porcellato, Davide; Pierce, Emily C.; Dinh, Cong B.; Portik, Daniel; Hall, Richard; Ashby, Meredith; Dutton, Rachel J. (23 лютого 2023). Cotter, Paul D. (ред.). Longitudinal, Multi-Platform Metagenomics Yields a High-Quality Genomic Catalog and Guides an In Vitro Model for Cheese Communities. mSystems (англ.). Т. 8, № 1. doi:10.1128/msystems.00701-22. ISSN 2379-5077. PMC 9948695. PMID 36622155. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Feng, Gang; Xie, Tian; Wang, Xin; Bai, Jiuyuan; Tang, Lin; Zhao, Hai; Wei, Wei; Wang, Maolin; Zhao, Yun (2018-12). Metagenomic analysis of microbial community and function involved in cd-contaminated soil. BMC Microbiology (англ.). Т. 18, № 1. doi:10.1186/s12866-018-1152-5. ISSN 1471-2180. PMC 5812035. PMID 29439665. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Effendi, Y; Pambudi, A.; Sasaerila, Y.; WijiHastuti, R. S. (1 грудня 2019). Metagenomic analysis of diversity and composition of soil bacteria under intercropping system Hevea brasiliensis and Canna indica. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. Т. 391, № 1. с. 012023. doi:10.1088/1755-1315/391/1/012023. ISSN 1755-1307. Процитовано 20 грудня 2023.
Chen, Huaihai; Ma, Kayan; Lu, Caiyan; Fu, Qi; Qiu, Yingbo; Zhao, Jiayi; Huang, Yu; Yang, Yuchun; Schadt, Christopher W. (2022). Functional Redundancy in Soil Microbial Community Based on Metagenomics Across the Globe. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.878978. ISSN 1664-302X. PMC 9108720. PMID 35586865. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Singh, Nidhi; Singh, Veer; Rai, Sachchida Nand; Vamanu, Emanuel; Singh, Mohan P. (2022-12). Metagenomic Analysis of Garden Soil-Derived Microbial Consortia and Unveiling Their Metabolic Potential in Mitigating Toxic Hexavalent Chromium. Life (англ.). Т. 12, № 12. с. 2094. doi:10.3390/life12122094. ISSN 2075-1729. PMC 9781466. PMID 36556458. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Zhao, Aiwen; Lu, Yuntao; Li, Qi; Li, Tao; Zhao, Jindong (2023). Metagenomics reveals the diversity and role of surface-water microbes in biogeochemical cycles in lakes at different terrain ladders. Frontiers in Environmental Science. Т. 11. doi:10.3389/fenvs.2023.1121775. ISSN 2296-665X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Lewin, Anna; Wentzel, Alexander; Valla, Svein (1 червня 2013). Metagenomics of microbial life in extreme temperature environments. Current Opinion in Biotechnology. Т. 24, № 3. с. 516—525. doi:10.1016/j.copbio.2012.10.012. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
Cowan, DA; Ramond, J-B; Makhalanyane, TP; De Maayer, P (1 червня 2015). Metagenomics of extreme environments. Current Opinion in Microbiology. Т. 25. с. 97—102. doi:10.1016/j.mib.2015.05.005. ISSN 1369-5274. Процитовано 20 грудня 2023.
Azli, Bahiyah; Razak, Mohd Nasharudin; Omar, Abdul Rahman; Mohd Zain, Nor Azimah; Abdul Razak, Fatimah; Nurulfiza, I. (2022). Metagenomics Insights Into the Microbial Diversity and Microbiome Network Analysis on the Heterogeneity of Influent to Effluent Water. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.779196. ISSN 1664-302X. PMC 9048743. PMID 35495647. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Nam, Nguyen Nhat; Do, Hoang Dang Khoa; Loan Trinh, Kieu The; Lee, Nae Yoon (2023-01). Metagenomics: An Effective Approach for Exploring Microbial Diversity and Functions. Foods (англ.). Т. 12, № 11. с. 2140. doi:10.3390/foods12112140. ISSN 2304-8158. PMC 10252221. PMID 37297385. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Ghosh, Shreya; Das, Alok Prasad (29 травня 2018). Metagenomic insights into the microbial diversity in manganese-contaminated mine tailings and their role in biogeochemical cycling of manganese. Scientific Reports (англ.). Т. 8, № 1. с. 8257. doi:10.1038/s41598-018-26311-w. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Xue, Chun-Xu; Lin, Heyu; Zhu, Xiao-Yu; Liu, Jiwen; Zhang, Yunhui; Rowley, Gary; Todd, Jonathan D.; Li, Meng; Zhang, Xiao-Hua (2 серпня 2021). DiTing: A Pipeline to Infer and Compare Biogeochemical Pathways From Metagenomic and Metatranscriptomic Data. Frontiers in Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fmicb.2021.698286. ISSN 1664-302X. PMC 8367434. PMID 34408730. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Malla, Muneer Ahmad; Dubey, Anamika; Kumar, Ashwani; Yadav, Shweta; Hashem, Abeer; Abd_Allah, Elsayed Fathi (2019). Exploring the Human Microbiome: The Potential Future Role of Next-Generation Sequencing in Disease Diagnosis and Treatment. Frontiers in Immunology. Т. 9. doi:10.3389/fimmu.2018.02868. ISSN 1664-3224. PMC 6330296. PMID 30666248. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Szóstak, Natalia; Szymanek, Agata; Havránek, Jan; Tomela, Katarzyna; Rakoczy, Magdalena; Samelak-Czajka, Anna; Schmidt, Marcin; Figlerowicz, Marek; Majta, Jan (19 травня 2022). The standardisation of the approach to metagenomic human gut analysis: from sample collection to microbiome profiling. Scientific Reports (англ.). Т. 12, № 1. с. 8470. doi:10.1038/s41598-022-12037-3. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Puig-Castellví, Francesc; Pacheco-Tapia, Romina; Deslande, Maxime; Jia, Manyi; Andrikopoulos, Petros; Chechi, Kanta; Bonnefond, Amélie; Froguel, Philippe; Dumas, Marc-Emmanuel (1 жовтня 2023). Advances in the integration of metabolomics and metagenomics for human gut microbiome and their clinical applications. TrAC Trends in Analytical Chemistry. Т. 167. с. 117248. doi:10.1016/j.trac.2023.117248. ISSN 0165-9936. Процитовано 20 грудня 2023.
Segata, Nicola; Izard, Jacques; Waldron, Levi; Gevers, Dirk; Miropolsky, Larisa; Garrett, Wendy S.; Huttenhower, Curtis (24 червня 2011). Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biology. Т. 12, № 6. с. R60. doi:10.1186/gb-2011-12-6-r60. ISSN 1474-760X. PMC 3218848. PMID 21702898. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wu, Honglong; Cai, Lihua; Li, Dongfang; Wang, Xinying; Zhao, Shancen; Zou, Fuhao; Zhou, Ke (11 січня 2018). Metagenomics Biomarkers Selected for Prediction of Three Different Diseases in Chinese Population. BioMed Research International (англ.). Т. 2018. с. e2936257. doi:10.1155/2018/2936257. ISSN 2314-6133. PMC 5820663. PMID 29568746. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Qian, Yiwei; Yang, Xiaodong; Xu, Shaoqing; Huang, Pei; Li, Binyin; Du, Juanjuan; He, Yixi; Su, Binghua; Xu, Li-Ming (1 серпня 2020). Gut metagenomics-derived genes as potential biomarkers of Parkinson’s disease. Brain. Т. 143, № 8. с. 2474—2489. doi:10.1093/brain/awaa201. ISSN 0006-8950. Процитовано 20 грудня 2023.
Alshawaqfeh, Mustafa; Rababah, Salahelden; Hayajneh, Abdullah; Gharaibeh, Ammar; Serpedin, Erchin (28 грудня 2022). MetaAnalyst: a user-friendly tool for metagenomic biomarker detection and phenotype classification. BMC Medical Research Methodology (англ.). Т. 22, № 1. doi:10.1186/s12874-022-01812-5. ISSN 1471-2288. PMC 9795700. PMID 36577938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Fadiji, Ayomide Emmanuel; Babalola, Olubukola Oluranti (1 березня 2020). Metagenomics methods for the study of plant-associated microbial communities: A review. Journal of Microbiological Methods. Т. 170. с. 105860. doi:10.1016/j.mimet.2020.105860. ISSN 0167-7012. Процитовано 20 грудня 2023.
Nwachukwu, Blessing Chidinma; Babalola, Olubukola Oluranti (2022). Metagenomics: A Tool for Exploring Key Microbiome With the Potentials for Improving Sustainable Agriculture. Frontiers in Sustainable Food Systems. Т. 6. doi:10.3389/fsufs.2022.886987. ISSN 2571-581X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Iquebal, Mir Asif; Jagannadham, Jaisri; Jaiswal, Sarika; Prabha, Ratna; Rai, Anil; Kumar, Dinesh (2022). Potential Use of Microbial Community Genomes in Various Dimensions of Agriculture Productivity and Its Management: A Review. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.708335. ISSN 1664-302X. PMC 9152772. PMID 35655999. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Molefe, Rebaona R.; Amoo, Adenike E.; Babalola, Olubukola O. (2023-07). Communication between plant roots and the soil microbiome; involvement in plant growth and development. Symbiosis (англ.). Т. 90, № 3. с. 231—239. doi:10.1007/s13199-023-00941-9. ISSN 0334-5114. Процитовано 20 грудня 2023.
Nadarajah, Kalaivani; Abdul Rahman, Nur Sabrina Natasha (2023-01). The Microbial Connection to Sustainable Agriculture. Plants (англ.). Т. 12, № 12. с. 2307. doi:10.3390/plants12122307. ISSN 2223-7747. PMC 10303550. PMID 37375932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Billington, Craig; Kingsbury, Joanne M.; Rivas, Lucia (1 березня 2022). Metagenomics Approaches for Improving Food Safety: A Review. Journal of Food Protection. Т. 85, № 3. с. 448—464. doi:10.4315/JFP-21-301. ISSN 0362-028X. Процитовано 20 грудня 2023.
Srinivas, Meghana; O’Sullivan, Orla; Cotter, Paul D.; Sinderen, Douwe van; Kenny, John G. (2022-01). The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods. Foods (англ.). Т. 11, № 20. с. 3297. doi:10.3390/foods11203297. ISSN 2304-8158. PMC 9601669. PMID 37431045. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Berini, Francesca; Casciello, Carmine; Marcone, Giorgia Letizia; Marinelli, Flavia (15 листопада 2017). Metagenomics: novel enzymes from non-culturable microbes. FEMS Microbiology Letters (англ.). Т. 364, № 21. doi:10.1093/femsle/fnx211. ISSN 1574-6968. Процитовано 20 грудня 2023.
Patel, Tithi; Chaudhari, Hiral G.; Prajapati, Vimalkumar; Patel, Swati; Mehta, Vaibhavkumar; Soni, Niti (2022). A brief account on enzyme mining using metagenomic approach. Frontiers in Systems Biology. Т. 2. doi:10.3389/fsysb.2022.1046230. ISSN 2674-0702. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
de Abreu, Vinicius A. C.; Perdigão, José; Almeida, Sintia (2021). Metagenomic Approaches to Analyze Antimicrobial Resistance: An Overview. Frontiers in Genetics. Т. 11. doi:10.3389/fgene.2020.575592. ISSN 1664-8021. PMC 7848172. PMID 33537056. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Pillay, Stephanie; Calderón-Franco, David; Urhan, Aysun; Abeel, Thomas (2 грудня 2022). Metagenomic-based surveillance systems for antibiotic resistance in non-clinical settings. Frontiers in Microbiology. Т. 13. doi:10.3389/fmicb.2022.1066995. ISSN 1664-302X. PMC 9755710. PMID 36532424. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hidalgo, Kelly J.; Sierra-Garcia, Isabel N.; Dellagnezze, Bruna M.; de Oliveira, Valéria Maia (2020). Metagenomic Insights Into the Mechanisms for Biodegradation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in the Oil Supply Chain. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.561506. ISSN 1664-302X. PMC 7530279. PMID 33072021. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Hauptfeld, Ernestina; Pelkmans, Jordi; Huisman, Terry T.; Anocic, Armin; Snoek, Basten L.; von Meijenfeldt, F. A. Bastiaan; Gerritse, Jan; van Leeuwen, Johan; Leurink, Gert (1 серпня 2022). A metagenomic portrait of the microbial community responsible for two decades of bioremediation of poly-contaminated groundwater. Water Research. Т. 221. с. 118767. doi:10.1016/j.watres.2022.118767. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Offiong, Nnanake-Abasi O.; Edet, John B.; Shaibu, Solomon E.; Akan, Nyaknno E.; Atakpa, Edidiong O.; Sanganyado, Edmond; Okop, Imeh J.; Benson, Nsikak U.; Okoh, Anthony (2023). Metagenomics: an emerging tool for the chemistry of environmental remediation. Frontiers in Environmental Chemistry. Т. 4. doi:10.3389/fenvc.2023.1052697. ISSN 2673-4486. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Breed, Martin F.; Harrison, Peter A.; Blyth, Colette; Byrne, Margaret; Gaget, Virginie; Gellie, Nicholas J. C.; Groom, Scott V. C.; Hodgson, Riley; Mills, Jacob G. (2019-10). The potential of genomics for restoring ecosystems and biodiversity. Nature Reviews Genetics (англ.). Т. 20, № 10. с. 615—628. doi:10.1038/s41576-019-0152-0. ISSN 1471-0064. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Hongling; Hart, Darren J.; An, Yingfeng (2019-09). Functional Metagenomic Technologies for the Discovery of Novel Enzymes for Biomass Degradation and Biofuel Production. BioEnergy Research (англ.). Т. 12, № 3. с. 457—470. doi:10.1007/s12155-019-10005-w. ISSN 1939-1234. Процитовано 20 грудня 2023.
Pabbathi, Ninian Prem Prashanth; Velidandi, Aditya; Tavarna, Tanvi; Gupta, Shreyash; Raj, Ram Sarvesh; Gandam, Pradeep Kumar; Baadhe, Rama Raju (2023-01). Role of metagenomics in prospecting novel endoglucanases, accentuating functional metagenomics approach in second-generation biofuel production: a review. Biomass Conversion and Biorefinery (англ.). Т. 13, № 2. с. 1371—1398. doi:10.1007/s13399-020-01186-y. ISSN 2190-6815. PMC 7790359. PMID 33437563. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Sartaj, Km; Patel, Alok; Matsakas, Leonidas; Prasad, Ramasare (2022-11). Unravelling Metagenomics Approach for Microbial Biofuel Production. Genes (англ.). Т. 13, № 11. с. 1942. doi:10.3390/genes13111942. ISSN 2073-4425. PMC 9689425. PMID 36360179. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wu, Yicheng; Zhou, Zhuoyi; Fu, Haiyan; Zhang, Peng; Zheng, Yue (10 листопада 2022). Metagenomic analysis of microbial community and gene function of anodic biofilm for nonylphenol removal in microbial fuel cells. Journal of Cleaner Production. Т. 374. с. 133895. doi:10.1016/j.jclepro.2022.133895. ISSN 0959-6526. Процитовано 20 грудня 2023.
Wang, Yifei; Li, Dongpeng; Song, Xinshan; Cao, Xin; Xu, Zhongshuo; Huang, Wei; Wang, Yuhui; Wang, Zhiwei; Sand, Wolfgang (1 травня 2022). Intensifying anoxic ammonium removal by manganese ores and granular active carbon fillings in constructed wetland-microbial fuel cells: Metagenomics reveals functional genes and microbial mechanisms. Bioresource Technology. Т. 352. с. 127114. doi:10.1016/j.biortech.2022.127114. ISSN 0960-8524. Процитовано 20 грудня 2023.
Jahanshahi, Donya Afshar; Ariaeenejad, Shohreh; Kavousi, Kaveh (25 вересня 2023). A metagenomic catalog for exploring the plastizymes landscape covering taxa, genes, and proteins. Scientific Reports (англ.). Т. 13, № 1. с. 16029. doi:10.1038/s41598-023-43042-9. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhou, Lei; Sang, Shilei; Li, Jiajie; Li, Yusen; Wang, Dapeng; Gan, Lihong; Zhao, Zelong; Wang, Jun (15 серпня 2023). From waste to resource: Metagenomics uncovers the molecular ecological resources for plastic degradation in estuaries of South China. Water Research. Т. 242. с. 120270. doi:10.1016/j.watres.2023.120270. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Rosso, Gretchen E.; Muday, Jeffrey A.; Curran, James F. (2018-03). Tools for Metagenomic Analysis at Wastewater Treatment Plants: Application to a Foaming Episode: Rosso et al. Water Environment Research (англ.). Т. 90, № 3. с. 258—268. doi:10.2175/106143017X15054988926352. ISSN 1061-4303. Процитовано 20 грудня 2023.
Chen, Geng; Bai, Rui; Zhang, Yiqing; Zhao, Biyi; Xiao, Yong (10 лютого 2022). Application of metagenomics to biological wastewater treatment. Science of The Total Environment. Т. 807. с. 150737. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.150737. ISSN 0048-9697. Процитовано 20 грудня 2023.
Annavajhala, Medini; Fanyin-Martin, Ato; Taher, Edris; Elk, Michael; Kapoor, Vikram; Santo-Domingo, Jorge; Chandran, Kartik (1 січня 2017). Metagenomics of Anaerobic Food Waste Fermentation. Proceedings of the Water Environment Federation (англ.). Т. 2017, № 7. с. 4041—4047. doi:10.2175/193864717822156181. ISSN 1938-6478. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhang, Jingxin; Mao, Liwei; Zhang, Le; Loh, Kai-Chee; Dai, Yanjun; Tong, Yen Wah (12 вересня 2017). Metagenomic insight into the microbial networks and metabolic mechanism in anaerobic digesters for food waste by incorporating activated carbon. Scientific Reports (англ.). Т. 7, № 1. с. 11293. doi:10.1038/s41598-017-11826-5. ISSN 2045-2322. Процитовано 20 грудня 2023.
Thakur, Karnika; Chownk, Manisha; Kumar, Varun; Purohit, Anjali; Vashisht, Alokika; Kumar, Vinod; Yadav, Sudesh Kumar (2020-03). Bioprospecting potential of microbial communities in solid waste landfills for novel enzymes through metagenomic approach. World Journal of Microbiology and Biotechnology (англ.). Т. 36, № 3. doi:10.1007/s11274-020-02812-7. ISSN 0959-3993. Процитовано 20 грудня 2023.
Deng, Chunfang; Zhao, Renxin; Qiu, Zhiguang; Li, Bing; Zhang, Tong; Guo, Feng; Mu, Rong; Wu, Yang; Qiao, Xuejiao (10 квітня 2022). Genome-centric metagenomics provides new insights into the microbial community and metabolic potential of landfill leachate microbiota. Science of The Total Environment. Т. 816. с. 151635. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.151635. ISSN 0048-9697. Процитовано 20 грудня 2023.
Zhang, Siying; Liang, Chengyu; Xiao, Mengyao; Chui, Chunmeng; Wang, Na; Ji, Yuji; Wang, Zhi; Shi, Jiping; Liu, Li (1 жовтня 2023). Metagenomic characterization of the enhanced performance of multicomponent synergistic thermophilic anaerobic co-digestion of food waste utilizing kitchen waste or garden waste as co-substrate. Water Research. Т. 244. с. 120457. doi:10.1016/j.watres.2023.120457. ISSN 0043-1354. Процитовано 20 грудня 2023.
Vidulin, Vedrana; Šmuc, Tomislav; Džeroski, Sašo; Supek, Fran (2018-12). The evolutionary signal in metagenome phyletic profiles predicts many gene functions. Microbiome (англ.). Т. 6, № 1. doi:10.1186/s40168-018-0506-4. ISSN 2049-2618. PMC 6040064. PMID 29991352. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Czech, Lucas; Stamatakis, Alexandros; Dunthorn, Micah; Barbera, Pierre (2022). Metagenomic Analysis Using Phylogenetic Placement—A Review of the First Decade. Frontiers in Bioinformatics. Т. 2. doi:10.3389/fbinf.2022.871393. ISSN 2673-7647. PMC 9580882. PMID 36304302. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Madrigal-Trejo, David; Sánchez-Pérez, Jazmín; Espinosa-Asuar, Laura; Valdivia-Anistro, Jorge A.; Eguiarte, Luis E.; Souza, Valeria (2023-11). A Metagenomic Time-Series Approach to Assess the Ecological Stability of Microbial Mats in a Seasonally Fluctuating Environment. Microbial Ecology (англ.). Т. 86, № 4. с. 2252—2270. doi:10.1007/s00248-023-02231-9. ISSN 0095-3628. PMC 10640475. PMID 37393557. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Picot, Aurore; Shibasaki, Shota; Meacock, Oliver J; Mitri, Sara (1 жовтня 2023). Microbial interactions in theory and practice: when are measurements compatible with models?. Current Opinion in Microbiology. Т. 75. с. 102354. doi:10.1016/j.mib.2023.102354. ISSN 1369-5274. Процитовано 20 грудня 2023.
Delogu, Francesco; Kunath, Benoit J.; Queirós, Pedro M.; Halder, Rashi; Lebrun, Laura A.; Pope, Phillip B.; May, Patrick; Widder, Stefanie; Muller, Emilie E. L. (13 листопада 2023). Forecasting the dynamics of a complex microbial community using integrated meta-omics. Nature Ecology & Evolution (англ.). с. 1—13. doi:10.1038/s41559-023-02241-3. ISSN 2397-334X. Процитовано 20 грудня 2023.
Miller, Ruth R; Montoya, Vincent; Gardy, Jennifer L; Patrick, David M; Tang, Patrick (2013). Metagenomics for pathogen detection in public health. Genome Medicine (англ.). Т. 5, № 9. с. 81. doi:10.1186/gm485. ISSN 1756-994X. PMC 3978900. PMID 24050114. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Ko, Karrie K. K.; Chng, Kern Rei; Nagarajan, Niranjan (2022-04). Metagenomics-enabled microbial surveillance. Nature Microbiology (англ.). Т. 7, № 4. с. 486—496. doi:10.1038/s41564-022-01089-w. ISSN 2058-5276. Процитовано 20 грудня 2023.
Doestzada, Marwah; Vila, Arnau Vich; Zhernakova, Alexandra; Koonen, Debby P. Y.; Weersma, Rinse K.; Touw, Daan J.; Kuipers, Folkert; Wijmenga, Cisca; Fu, Jingyuan (28 квітня 2018). Pharmacomicrobiomics: a novel route towards personalized medicine?. Protein & Cell. Т. 9, № 5. с. 432—445. doi:10.1007/s13238-018-0547-2. ISSN 1674-800X. PMC 5960471. PMID 29705929. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Zhao, Qing; Chen, Yao; Huang, Weihua; Zhou, Honghao; Zhang, Wei (9 жовтня 2023). Drug-microbiota interactions: an emerging priority for precision medicine. Signal Transduction and Targeted Therapy (англ.). Т. 8, № 1. с. 1—27. doi:10.1038/s41392-023-01619-w. ISSN 2059-3635. Процитовано 20 грудня 2023.
Cai, Jingwei; Auster, Alexis; Cho, Sungjoon; Lai, Zijuan (1 жовтня 2023). Dissecting the human gut microbiome to better decipher drug liability: A once-forgotten organ takes center stage. Journal of Advanced Research. Т. 52. с. 171—201. doi:10.1016/j.jare.2023.07.002. ISSN 2090-1232. PMC 10555929. PMID 37419381. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Nigam, Manisha; Panwar, Abhaya Shikhar; Singh, Rahul Kunwar (2022). Orchestrating the fecal microbiota transplantation: Current technological advancements and potential biomedical application. Frontiers in Medical Technology. Т. 4. doi:10.3389/fmedt.2022.961569. ISSN 2673-3129. PMC 9535080. PMID 36212607. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Wang, Xiaoli; Zhao, Jingwen; Feng, Yuanhang; Feng, Zelin; Ye, Yulin; Liu, Limin; Kang, Guangbo; Cao, Xiaocang (2022). Evolutionary Insights Into Microbiota Transplantation in Inflammatory Bowel Disease. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Т. 12. doi:10.3389/fcimb.2022.916543. ISSN 2235-2988. PMC 9257068. PMID 35811664. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Yang, Ruixue; Chen, Zhenzhen; Cai, Jun (1 грудня 2023). Fecal microbiota transplantation: Emerging applications in autoimmune diseases. Journal of Autoimmunity. Т. 141. с. 103038. doi:10.1016/j.jaut.2023.103038. ISSN 0896-8411. Процитовано 20 грудня 2023.
Quaranta, Gianluca; Guarnaccia, Alessandra; Fancello, Giovanni; Agrillo, Chiara; Iannarelli, Federica; Sanguinetti, Maurizio; Masucci, Luca (2022-12). Fecal Microbiota Transplantation and Other Gut Microbiota Manipulation Strategies. Microorganisms (англ.). Т. 10, № 12. с. 2424. doi:10.3390/microorganisms10122424. ISSN 2076-2607. PMC 9781458. PMID 36557677. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Gebrayel, Prisca; Nicco, Carole; Al Khodor, Souhaila; Bilinski, Jaroslaw; Caselli, Elisabetta; Comelli, Elena M.; Egert, Markus; Giaroni, Cristina; Karpinski, Tomasz M. (7 березня 2022). Microbiota medicine: towards clinical revolution. Journal of Translational Medicine. Т. 20, № 1. с. 111. doi:10.1186/s12967-022-03296-9. ISSN 1479-5876. PMC 8900094. PMID 35255932. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Fekete, Emily Ef; Figeys, Daniel; Zhang, Xu (31 грудня 2023). Microbiota-directed biotherapeutics: considerations for quality and functional assessment. Gut Microbes (англ.). Т. 15, № 1. doi:10.1080/19490976.2023.2186671. ISSN 1949-0976. PMC 10012963. PMID 36896938. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
McDonagh, Francesca; Cormican, Martin; Morris, Dearbháile; Burke, Liam; Singh, Nitin Kumar; Venkateswaran, Kasthuri; Miliotis, Georgios (2023-07). Medical Astro-Microbiology: Current Role and Future Challenges. Journal of the Indian Institute of Science (англ.). Т. 103, № 3. с. 771—796. doi:10.1007/s41745-023-00360-1. ISSN 0970-4140. PMC 10082442. PMID 37362850. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Be, Nicholas A.; Avila-Herrera, Aram; Allen, Jonathan E.; Singh, Nitin; Checinska Sielaff, Aleksandra; Jaing, Crystal; Venkateswaran, Kasthuri (2017-12). Whole metagenome profiles of particulates collected from the International Space Station. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0292-4. ISSN 2049-2618. PMC 5514531. PMID 28716113. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Schwendner, Petra; Mahnert, Alexander; Koskinen, Kaisa; Moissl-Eichinger, Christine; Barczyk, Simon; Wirth, Reinhard; Berg, Gabriele; Rettberg, Petra (2017-12). Preparing for the crewed Mars journey: microbiota dynamics in the confined Mars500 habitat during simulated Mars flight and landing. Microbiome (англ.). Т. 5, № 1. doi:10.1186/s40168-017-0345-8. ISSN 2049-2618. PMC 5627443. PMID 28974259. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mora, Maximilian; Wink, Lisa; Kögler, Ines; Mahnert, Alexander; Rettberg, Petra; Schwendner, Petra; Demets, René; Cockell, Charles; Alekhova, Tatiana (5 вересня 2019). Space Station conditions are selective but do not alter microbial characteristics relevant to human health. Nature Communications (англ.). Т. 10, № 1. с. 3990. doi:10.1038/s41467-019-11682-z. ISSN 2041-1723. Процитовано 20 грудня 2023.
Malli Mohan, Ganesh Babu; Parker, Ceth W.; Urbaniak, Camilla; Singh, Nitin K.; Hood, Anthony; Minich, Jeremiah J.; Knight, Rob; Rucker, Michelle; Venkateswaran, Kasthuri (25 серпня 2020). Sangwan, Naseer (ред.). Microbiome and Metagenome Analyses of a Closed Habitat during Human Occupation. mSystems (англ.). Т. 5, № 4. doi:10.1128/mSystems.00367-20. ISSN 2379-5077. PMC 7394354. PMID 32723791. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Mhatre, Snehit; Wood, Jason M.; Sielaff, Aleksandra Checinska; Mora, Maximilian; Duller, Stefanie; Singh, Nitin Kumar; Karouia, Fathi; Moissl-Eichinger, Christine; Venkateswaran, Kasthuri (2020). Assessing the Risk of Transfer of Microorganisms at the International Space Station Due to Cargo Delivery by Commercial Resupply Vehicles. Frontiers in Microbiology. Т. 11. doi:10.3389/fmicb.2020.566412. ISSN 1664-302X. PMC 7677455. PMID 33240227. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Mahnert, Alexander; Verseux, Cyprien; Schwendner, Petra; Koskinen, Kaisa; Kumpitsch, Christina; Blohs, Marcus; Wink, Lisa; Brunner, Daniela; Goessler, Theodora (24 січня 2021). Microbiome dynamics during the HI-SEAS IV mission, and implications for future crewed missions beyond Earth. Microbiome. Т. 9, № 1. с. 27. doi:10.1186/s40168-020-00959-x. ISSN 2049-2618. PMC 7831191. PMID 33487169. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Doré, Joel; Ortega Ugalde, Sandra (2023). Human-microbes symbiosis in health and disease, on earth and beyond planetary boundaries. Frontiers in Astronomy and Space Sciences. Т. 10. doi:10.3389/fspas.2023.1180522. ISSN 2296-987X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)