Millar, David P. Fluorescence studies of DNA and RNA structure and dynamics // Current Opinion in Structural Biology. — 1996. — Т. 6. — С. 322-326. — DOI:10.1016/S0959-440X(96)80050-9.
Royer, C. A. Probing Protein Folding and Conformational Transitions with Fluorescence // Chemical Reviews. — 2006. — Т. 106, вип. 5. — С. 1769-1784. — DOI:10.1021/cr0404390.
Schepartz, A.; Gonzalez, R. L. Molecular imaging: sine labore nihil // Current Opinion in Chemical Biology. — 2011. — Т. 15. — С. 749–751. — DOI:10.1016/j.cbpa.2011.11.001.
Drummen, G. P. C. Fluorescent Probes and Fluorescence (Microscopy) Techniques — Illuminating Biological and Biomedical Research // Molecules. — 2012. — Т. 17. — С. 14067-14090. — DOI:10.3390/molecules171214067.
O'Haver, T. C. Development of luminescence spectrometry as an analytical tool // Journal of Chemical Education. — 1978. — Т. 55, вип. 7. — С. 423—428. — DOI:10.1021/ed055p423.
Rao, J.; Dragulescu-Andrasi, A.; Yao, H. Fluorescence imaging in vivo: recent advances // Current Opinion in Biotechnology. — 2007. — Т. 18. — С. 17–25. — DOI:10.1016/j.copbio.2007.01.003.
Hilderbrand, S. A.; Weissleder, R. Near-infrared fluorescence: application to in vivo molecular imaging // Current Opinion in Chemical Biology. — 2010. — Т. 14. — С. 71–79. — DOI:10.1016/j.cbpa.2009.09.029.
Kobayashi, H., Ogawa, M., Alford, R., Choyke, P. L., & Urano, Y. New Strategies for Fluorescent Probe Design in Medical Diagnostic Imaging // Chemical Reviews. — 2010. — Т. 110, вип. 5. — С. 2620-2640. — DOI:10.1021/cr900263j.
Alander, J. T., Kaartinen, I., Laakso, A., Patila, T., Spillmann, T., Tuchin, V. V., Venermo, M., Valisuo, P. A Review of Indocyanine Green Fluorescent Imaging in Surgery. // International Journal of Biomedical Imaging. — 2012. — DOI:10.1155/2012/940585. — 940585.
Udenfriend, S. Development of the spectrophotofluorometer and its commercialization // Protein Science. — 1995. — Т. 4, вип. 3. — С. 542-551. — DOI:10.1002/pro.5560040321.
Weiss, S. Measuring conformational dynamics of biomolecules by single molecule fluorescence spectroscopy // Nature Structural Biology. — 2000. — Т. 7, вип. 9. — С. 724—729. — DOI:10.1038/78941.
Selvin, P. R. The renaissance of fluorescence resonance energy transfer // Nature Structural Biology. — 2000. — Т. 7, вип. 9. — С. 730-734. — DOI:10.1038/78948.
Klostermeier, D., Millar, D. P. Time-resolved fluorescence resonance energy transfer: A versatile tool for the analysis of nucleic acids // Biopolymers. — 2002. — Т. 61, вип. 3. — С. 159–179. — DOI:10.1002/bip.10146.
Ambrose, W. P., Goodwin, P. M., Jett, J. H., Van Orden, A., Werner, J. H., & Keller, R. A. Single Molecule Fluorescence Spectroscopy at Ambient Temperature // Chemical Reviews. — 1999. — Т. 99, вип. 10. — С. 2929-2956. — DOI:10.1021/cr980132z.
Tinnefeld, P., & Sauer, M. Branching Out of Single-Molecule Fluorescence Spectroscopy: Challenges for Chemistry and Influence on Biology. // Angewandte Chemie International Edition. — 2005. — Т. 44. — С. 2642–2671. — DOI:10.1002/anie.200300647.
Haran, G. Single-molecule fluorescence spectroscopy of biomolecular folding // Journal of Physics: Condensed Matter. — 2003. — Т. 15. — С. 1292-1313. — DOI:10.1088/0953-8984/15/32/201.
Ha, T. Single-molecule fluorescence methods for the study of nucleic acids // Current Opinion in Structural Biology. — 2001. — Т. 11. — С. 287–292. — DOI:10.1016/S0959-440X(00)00204-9.
Michalet, X., Weiss, S., & Jäger, M. Single-Molecule Fluorescence Studies of Protein Folding and Conformational Dynamics // Chemical Reviews. — 2006. — Т. 106, вип. 5. — С. 1785-1813. — DOI:10.1021/cr0404343.
Hohlbein, J., Gryte, K., Heilemann, M., & Kapanidis, A. N. Surfing on a new wave of single-molecule fluorescence methods // Physical Biology. — 2010. — Т. 7, вип. 3. — С. 031001. — DOI:10.1088/1478-3975/7/3/031001.
Moerner, W. E.; Fromm, D. P. Methods of single-molecule fluorescence spectroscopy and microscopy // Review of Scientific Instruments. — 2003. — Т. 74. — С. 3597—3619. — DOI:10.1063/1.1589587.
Persson, F., Barkefors, I., & Elf, J. Single molecule methods with applications in living cells // Current Opinion in Biotechnology. — 2013. — Т. 24, вип. 4. — С. 737–744. — DOI:10.1016/j.copbio.2013.03.013.
Delehanty, J. B., Bradburne, C. E., Susumu, K., Boeneman, K., Mei, B. C., Farrell, D., Blanco-Canosa, J. B., Dawson, P. E., Mattoussi, H., & Medintz, I. L. Spatiotemporal Multicolor Labeling of Individual Cells Using Peptide-Functionalized Quantum Dots and Mixed Delivery Techniques // Journal of the American Chemical Society. — 2011. — Т. 133, вип. 27. — С. 10482-10489. — DOI:10.1021/ja200555z.
Ko, S.-K.; Chen, X.; Yoon, J.; Shin, I. Zebrafish as a good vertebrate model for molecular imaging using fluorescent probes // Chemical Society Reviews. — 2011. — Т. 40, вип. 5. — С. 2120-2130. — DOI:10.1039/c0cs00118j.
Bo Huang. Super-resolution optical microscopy: multiple choices // Current Opinion in Chemical Biology. — 2010. — Т. 14, вип. 1. — С. 10–14. — DOI:10.1016/j.cbpa.2009.10.013.
Lothar Schermelleh, Rainer Heintzmann, Heinrich Leonhardt. A guide to super-resolution fluorescence microscopy // The Journal of Cell Biology. — 2010. — Т. 190, вип. 2. — С. 165. — DOI:10.1083/jcb.201002018.
Crespo-Hernandez, C. E.; Cohen, B.; Hare, P. M.; Kohler, B. Ultrafast Excited-State Dynamics in Nucleic Acids // Chemical Reviews. — 2004. — Т. 104, вип. 4. — С. 1977-2020. — DOI:10.1021/cr0206770.
Waggoner, A. Fluorescent labels for proteomics and genomics // Current Opinion in Chemical Biology. — 2006. — Т. 10, вип. 1. — С. 62—66. — DOI:10.1016/j.cbpa.2006.01.005.
Lavis, L. D. Histochemistry: Live and in Color // Journal of Histochemistry & Cytochemistry. — 2011. — Т. 59, вип. 2. — С. 139—145. — DOI:10.1369/0022155410395760.
Lavis, L. D.; Raines, R. T. Bright Ideas for Chemical Biology // ACS Chemical Biology. — 2008. — Т. 3, вип. 3. — С. 142-155. — DOI:10.1021/cb700248m.
Zheng, H.; Zhan, X.-Q.; Bian, Q.-N.; Zhang, X.-J. Advances in modifying fluorescein and rhodamine fluorophores as fluorescent chemosensors // Chemical Communications. — 2012. — Т. 49. — С. 429-447. — DOI:10.1039/c2cc35997a.
Beija, M.; Afonso, C. A. M.; Martinho, J. M. G. Synthesis and applications of Rhodamine derivatives as fluorescent probes // Chemical Society Reviews. — 2009. — Т. 38, вип. 8. — С. 2410-2433. — DOI:10.1039/B901612K.
Tatikolov, A. S. Polymethine dyes as spectral-fluorescent probes for biomacromolecules // Journal of Photochemistry and Photobiology C: Photochemistry Reviews. — 2012. — Т. 13, вип. 1. — С. 55–90. — DOI:10.1016/j.jphotochemrev.2011.11.001.
Beverina, L.; Salice, P. Squaraine Compounds: Tailored Design and Synthesis towards a Variety of Material Science Applications // European Journal of Organic Chemistry. — 2010. — С. 1207-1225. — DOI:10.1002/ejoc.200901297.
Chen, X.; Pradhan, T.; Wang, F.; Kim, J. S.; Yoon, J. Fluorescent Chemosensors Based on Spiroring-Opening of Xanthenes and Related Derivatives // Chemical Reviews. — 2012. — Т. 112. — С. 1910–1956. — DOI:10.1021/cr200201z.
Yuan, L.; Lin, W.; Zheng, K.; He, L.; Huang, W. Far-red to near infrared analyte-responsive fluorescent probes based on organic fluorophore platforms for fluorescence imaging // Chemical Society Reviews. — 2013. — Т. 42. — С. 622-661. — DOI:10.1039/C2CS35313J.
Grimm, J. B.; Heckman, L. M.; Lavis, L. D.; May, C. M. The Chemistry of Small-Molecule Fluorogenic Probes // Progress in Molecular Biology and Translational Science. — 2013. — Т. 113. — С. 1-13. — DOI:10.1016/B978-0-12-386932-6.00001-6.
Wysocki, L. M.; Lavis, L. D. Advances in the chemistry of small molecule fluorescent probes // Current Opinion in Chemical Biology. — 2011. — Т. 15, вип. 6. — С. 752—759. — DOI:10.1016/j.cbpa.2011.10.013.
Sun, Y.-Q.; Liu, J.; Lv, X.; Liu, Y.; Zhao, Y.; Guo, W. Rhodamine-Inspired Far-Red to Near-Infrared Dyes and Their Application as Fluorescence Probes // Angewandte Chemie International Edition. — 2012. — Т. 51, вип. 31. — С. 7634–7636. — DOI:10.1002/anie.201202264.
Finney, N. S. Combinatorial discovery of fluorophores and fluorescent probes // Current Opinion in Chemical Biology. — 2006. — Т. 10, вип. 3. — С. 238-245. — DOI:10.1016/j.cbpa.2006.04.025.
Bünzli, J.-C. G. Lanthanide Luminescence for Biomedical Analyses and Imaging // Chemical Reviews. — Т. 110. — С. 2729–2755. — DOI:10.1021/cr900362e.
Ormö M, Cubitt A, Kallio K, Gross L, Tsien R, Remington S. Crystal structure of the Aequorea victoria green fluorescent protein // Science. — 1996. — Т. 273. — С. 1392–1395. — DOI:10.1126/science.273.5280.1392.
Yang F, Moss L, Phillips G. The molecular structure of green fluorescent protein // Nature Biotechnology. — 1996. — Т. 14, вип. 10. — С. 1246–1251. — DOI:10.1038/nbt1096-1246.
Zimmer, M. Green Fluorescent Protein (GFP): Applications, Structure, and Related Photophysical Behavior // Chemical Reviews. — 2002. — Т. 102, вип. 3. — С. 759-782. — DOI:10.1021/cr010142r.
Beat Ludin, Andrew Matus. GFP illuminates the cytoskeleton // Trends in Cell Biology. — 1998. — Т. 8, вип. 2. — С. 72–77. — DOI:10.1016/S0962-8924(98)80015-9.
Tsien, R. Y. Building and breeding molecules to spy on cells and tumors // FEBS Letters. — 2005. — Т. 579, вип. 4. — С. 927-932. — DOI:10.1016/j.febslet.2004.11.025.
Stepanenko, O. V.; Stepanenko, O. V.; Shcherbakova, D. M.; Kuznetsova, I. M.; Turoverov, К. К.; Verkhusha, V. V. Modern f luorescent proteins: from chromophore formation to novel intracellular applications // BioTechniques. — 2011. — Т. 51. — С. 313—327. — DOI:10.2144/000113765.
Zhou, X. X.; Lin, M. Z. Photoswitchable fluorescent proteins: ten years of colorful chemistry and exciting applications // Current Opinion in Chemical Biology. — 2013. — Т. 17, вип. 4. — С. 682-690. — DOI:10.1016/j.cbpa.2013.05.031.
Ohba, Y., Fujioka, Y., Nakada, S., Tsuda, M., & May, C. M. Fluorescent Protein-Based Biosensors and Their Clinical Applications. // Progress in Molecular Biology and Translational Science. — 2013. — Т. 113. — С. 313-348. — DOI:10.1016/B978-0-12-386932-6.00008-9.
VanEngelenburg, S. B.; Palmer, A. E.,. Fluorescent biosensors of protein function // Current Opinion in Chemical Biology. — 2008. — Т. 12. — С. 60–65. — DOI:10.1016/j.cbpa.2008.01.020.
Tiwari, D. K.; Nagai, T. Smart fluorescent proteins: Innovation for barrier-free superresolution imaging in living cells // Development, Growth & Differentiation. — 2013. — Т. 55, вип. 4. — С. 491-507. — DOI:10.1111/dgd.12064.
Jyoti K. Jaiswal, Sanford M. Simon. Potentials and pitfalls of fluorescent quantum dots for biological imaging // Trends in Cell Biology. — 2004. — Т. 14, вип. 9 (4 червня). — С. 497–504. — DOI:10.1016/j.tcb.2004.07.012.
Vivero-Escoto, J. L., Huxford-Phillips, R. C., & Lin, W. Silica-based nanoprobes for biomedical imaging and theranostic applications. // Chem. Soc. Rev.. — 2012. — Т. 41 (4 червня). — С. 2673–2685. — DOI:10.1039/c2cs15229k.
Wu, C.; Chiu, D. T. Highly Fluorescent Semiconducting Polymer Dots for Biology and Medicine // Angewandte Chemie International Edition. — 2013. — Т. 52 (4 червня). — С. 3086-3109. — DOI:10.1002/anie.201205133.
Han, B., & Wang, E. DNA-templated fluorescent silver nanoclusters // Analytical and Bioanalytical Chemistry. — 2012. — Т. 402, вип. 1 (4 червня). — С. 129-138. — DOI:10.1007/s00216-011-5307-6.
Shiang, Y.-C.; Huang, C.-C.; Chen, W.-Y.; Chen, P.-C.; Chang, H.-T. Fluorescent gold and silver nanoclusters for the analysis of biopolymers and cell imaging // Journal of Materials Chemistry. — 2012. — Т. 22. — С. 12972–12982. — DOI:10.1039/c2jm30563a.
Lemke, E. A.; Schultz, C. Principles for designing fluorescent sensors and reporters // Nature Chemical Biology. — 2011. — Т. 7. — С. 480–483. — DOI:10.1038/nchembio.620.
J. C. Simpson, B. Joggerst, V. Laketa, F. Verissimo, C. Cetin, H. Erfle, M. G. Bexiga, V. R. Singan, J.-K. Hériché, B. Neumann, A. Mateos, J. Blake, S. Bechtel, V. Benes,
S. Wiemann, J. Ellenberg, R. Pepperkok. Genome-wide RNAi screening identifies human proteins with a regulatory function in the early secretory pathway // Nature Cell Biology. — 2012. — Т. 14 (4 червня). — С. 764–774. — DOI:10.1038/ncb2510.
Susan M. Gasser. Visualizing Chromatin Dynamics in Interphase Nuclei // Science. — 2002. — Т. 2002, вип. 296 (4 червня). — С. 1412-1416. — DOI:10.1126/science.1067703.
Nathalie Daigle, Jan Ellenberg. λN-GFP: an RNA reporter system for live-cell imaging // Nature Methods. — 2007. — Т. 4, вип. 8 (4 червня). — С. 633-636. — DOI:10.1038/NMETH1065.
Johnson, I. Fluorescent probes for living cells // The Histochemical Journal. — 1998. — Т. 30, вип. 3. — С. 123-140. — DOI:10.1023/a:1003287101868.
Liu, Z.; He, W.; Guo, Z. Metal coordination in photoluminescent sensing // Chemical Society Reviews. — 2013. — Т. 42, вип. 4. — С. 1568-1600. — DOI:10.1039/c2cs35363f.
de Silva, A. P., Gunaratne, H. Q. N., Gunnlaugsson, T., Huxley, A. J. M., McCoy, C. P., Rademacher, J. T., & Rice, T. E. Signaling Recognition Events with Fluorescent Sensors and Switches // Chemical Reviews. — 1997. — Т. 97, вип. 5. — С. 1515-1566. — DOI:10.1021/cr960386p.
Chan, J.; Dodani, S. C.; Chang, C. J. Reaction-based small-molecule fuorescent probes for chemoselective bioimaging // Nature Chemistry. — 2012. — Т. 4. — С. 973-984. — DOI:10.1038/NCHEM.1500.
Demchenko, A. P.; Mély, Y.; Duportail, G.; Klymchenko, A. S. Monitoring Biophysical Properties of Lipid Membranes by Environment-Sensitive Fluorescent Probes // Biophysical Journal. — 2009. — Т. 96, вип. 9. — С. 3461-3470. — DOI:10.1016/j.bpj.2009.02.012.
Haidekker, M. A.; Theodorakis, E. A. Molecular rotors—fluorescent biosensors for viscosity and flow // Organic & Biomolecular Chemistry. — 2007. — Т. 5. — С. 1669–1678. — DOI:10.1039/b618415d.
Johnsson, N.; Johnsson, K. Chemical Tools for Biomolecular Imaging // ACS Chemical Biology. — 2007. — Т. 2, вип. 1. — С. 31-38. — DOI:10.1021/cb6003977.
Terai, T.; Nagano, T. Fluorescent probes for bioimaging applications // Current Opinion in Chemical Biology. — 2008. — Т. 12, вип. 515–521. — DOI:10.1016/j.cbpa.2008.08.007.
Franca, L. T. C., Carrilho, E., & Kist, T. B. L. A review of DNA sequencing techniques // Quarterly Reviews of Biophysics. — 2002. — Т. 35, вип. 02. — С. 169-200. — DOI:10.1017/S0033583502003797.
Ju, J.; Kim, D. H.; Bi, L.; Meng, Q.; Bai, X.; Li, Z.; Li, X.; Marma, M. S.; Shi, S.; Wu, J.; Edwards, J. R.; Romu, A.; Turro, N. J. Four-color DNA sequencing by synthesis using cleavable fluorescent nucleotide reversible terminators // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2006. — Т. 103, вип. 52. — С. 19635-19640. — DOI:10.1073/pnas.0609513103.
Tyagi, S.; Kramer, F. R. Molecular Beacons: Probes that Fluoresce upon Hybridization // Nature Biotechnology. — Т. 14, вип. 3. — С. 303-308. — DOI:10.1038/nbt0396-303.
Guo, J.; Ju, J.; Turro, N.,. Fluorescent hybridization probes for nucleic acid detection. // Analytical and Bioanalytical Chemistry. — 2011. — Т. 402, вип. 10. — С. 3115-3125. — DOI:10.1007/s00216-011-5526-x.
Juskowiak, B. Nucleic acid-based fluorescent probes and their analytical potential // Analytical and Bioanalytical Chemistry. — Т. 399, вип. 9. — С. 3157-3176. — DOI:10.1007/s00216-010-4304-5.
Tyagi S, Bratu DP, Kramer FR. Multicolor molecular beacons for allele discrimination // Nature Biotechnology. — 1998. — Т. 16. — С. 49—53. — DOI:10.1038/nbt0198-49.
Silverman, A. P.; Kool, E. T. Quenched probes for highly specific detection of cellular RNAs // Trends in Biotechnology. — 2005. — Т. 23, вип. 5. — С. 225-230. — DOI:10.1016/j.tibtech.2005.03.007.
Tyagi, S. Imaging intracellular RNA distribution and dynamics in living cells // Nature Methods. — 2009. — Т. 6, вип. 5. — С. 331-338. — DOI:10.1038/nmeth.1321.
Wang, K.; Huang, J.; Yang, X.; He, X.; Liu, J. Recent advances in fluorescent nucleic acid probes for living cell studies // Analyst. — 2013. — Т. 138. — С. 62–71. — DOI:10.1039/c2an35254k.
Sassolas, A.; Leca-Bouvier, B. D.; Blum, L. J. DNA Biosensors and Microarrays // Chemical Reviews. — 2008. — Т. 108. — С. 109−139. — DOI:10.1021/cr0684467.
Pirrung, M. C. Spatially Addressable Combinatorial Libraries // Chemical Reviews. — 1997. — Т. 97, вип. 2. — С. 473-488. — DOI:10.1021/cr960013o.
Kapuscinski, J. DAPI: a DNA-Specific Fluorescent Probe // Biotechnic & Histochemistry. — 1995. — Т. 70, вип. 5. — С. 220-233. — DOI:10.3109/10520299509108199.
Yarmoluk, S. M.; Kovalska, V. B.; Losytskyy, M. Y. Symmetric cyanine dyes for detecting nucleic acids // Biotechnic & Histochemistry. — 2008. — Т. 83. — С. 131-145. — DOI:10.1080/10520290802383684.
Vummidi, B. R.; Alzeer, J.; Luedtke, N. W. Fluorescent Probes for G-Quadruplex Structures // ChemBioChem. — 2013. — Т. 14, вип. 5. — С. 540-558. — DOI:10.1002/cbic.201200612.
Neto, B. A. D.; Correa, J. R.; Silva, R. G.,. Selective mitochondrial staining with small fluorescent probes: importance, design, synthesis, challenges and trends for new markers. // RSC Advances. — 2013. — Т. 3. — С. 5291-5301. — DOI:10.1039/c2ra21995f.
Wahlfors, J.; Loimas, S.; Pasanen, T.; Hakkarainen, T. Green fluorescent protein (GFP) fusion constructs in gene therapy research // Histochemistry and Cell Biology. — 2001. — Т. 115. — С. 59-65. — DOI:10.1007/s004180000219.
Zhang, J.; Campbell, R. E.; Ting, A. Y.; Tsien, R. Y. Creating new fluorescent probes for cell biology // Nature Reviews Molecular Cell Biology. — 2002. — Т. 3, вип. 12. — С. 906-918. — DOI:10.1038/nrm976.
Lichtman, J. W.; Conchello, J.-A. Fluorescence microscopy // Nature Methods. — 2005. — Т. 2, вип. 12. — С. 910-919. — DOI:10.1038/nmeth817.
Bo Huang, Hazen Babcock, Xiaowei Zhuang. Breaking the Diffraction Barrier: Super-Resolution Imaging of Cells // Cell. — 2010. — Т. 143. — С. 1047-1058. — DOI:10.1016/j.cell.2010.12.002.
Hell, S. W. Far-Field Optical Nanoscopy // Science. — 2007. — Т. 316. — С. 1153-1158. — DOI:10.1126/science.1137395.
Maxam, A. M.; Gilbert, W. A new method for sequencing DNA // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1977. — Т. 74, вип. 2. — С. 560-564. Архівовано з джерела 25 квітня 2015.
Maxam, A. M.; Gilbert, W. A new method for sequencing DNA // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1977. — Т. 74, вип. 2. — С. 560-564. Архівовано з джерела 25 квітня 2015.
