(en) Dennis Enning et Julia Garrelfs, « Corrosion of iron by sulfate-reducing bacteria : New views of an old problem », Applied and Environmental Microbiology, vol. 80, no 4, , p. 1226-1236 (DOI10.1128/AEM.02848-13, lire en ligne)
S'il s'agissait de dépôts atmosphériques dus à la pollution, la localisation de ces croûtes serait plus continue et ces dépôts seraient partiellement lessivés par les eaux de ruissellement. Cf Philippe Bromblet, Mémento sur les altérations de la pierre, CICRP, (lire en ligne), p. 10
(en) Kamila Myszka et Katarzyna Czaczyk, « Bacterial Biofilms on Food Contact Surfaces - a Review », Polish Journal of Food and Nutrition Sciences, vol. 61, no 3, (DOI10.2478/v10222-011-0018-4, lire en ligne, consulté le )
doi.org
dx.doi.org
Le rôle des biofilms dans l'altération joue sur plusieurs niveaux : mécanique (désagrégation rendant la surface rocheuse poudreuse), chimique (catalyse acide). De plus, cette matière organique favorise la rétention d'eau (hydrolyse, dissolution). Cf. (en) A. A. Gorbushina & W. J. Broughton, « Microbiology of the atmosphere-rock interface: how biological interactions and physical stresses modulate a sophisticated microbial ecosystem », Annual Review of Microbiology, vol. 63, no 1, , p. 431-450 (DOI10.1146/annurev.micro.091208.073349).
(en) Hilary Lappin-Scott, Sara Burton & Paul Stoodley, « Revealing a world of biofilms — the pioneering research of Bill Costerton », Nature Reviews Microbiology, vol. 12, , p. 781–787 (DOI10.1038/nrmicro3343).
(en) J W Costerton, K J Cheng, G G Geesey, T I Ladd, J C Nickel, M Dasgupta, T J Marrie, « Bacterial biofilms in nature and disease », Annu Rev Microbiol, vol. 41, , p. 435-464 (DOI10.1146/annurev.mi.41.100187.002251).
(en) Samuel S. Wu et Dale Kaiser, « Genetic and functional evidence that Type IV pili are required for social gliding motility in Myxococcus xanthus », Molecular Microbiology, vol. 18, no 3, , p. 547–558 (ISSN1365-2958, DOI10.1111/j.1365-2958.1995.mmi_18030547.x, lire en ligne, consulté le )
(en) Rolf Bos, Henny C. van der Mei et Henk J. Busscher, « Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions – its mechanisms and methods for study », FEMS Microbiology Reviews, vol. 23, , p. 179-230 (ISSN1574-6976, PMID10234844, DOI10.1111/j.1574-6976.1999.tb00396.x, lire en ligne, consulté le )
Paul Stoodley, John D. Boyle, Dirk DeBeer et Hilary M. Lappin‐Scott, « Evolving perspectives of biofilm structure », Biofouling, vol. 14, , p. 75-90 (ISSN0892-7014, DOI10.1080/08927019909378398, lire en ligne, consulté le )
(en) Kamila Myszka et Katarzyna Czaczyk, « Bacterial Biofilms on Food Contact Surfaces - a Review », Polish Journal of Food and Nutrition Sciences, vol. 61, no 3, (DOI10.2478/v10222-011-0018-4, lire en ligne, consulté le )
(en) David J Stickler, « Bacterial biofilms in patients with indwelling urinary catheters », Nature Clinical Practice Urology, vol. 5, , p. 598-608 (DOI10.1038/ncpuro1231)
(en) Dennis Enning et Julia Garrelfs, « Corrosion of iron by sulfate-reducing bacteria : New views of an old problem », Applied and Environmental Microbiology, vol. 80, no 4, , p. 1226-1236 (DOI10.1128/AEM.02848-13, lire en ligne)
eawag.ch
Michael Döring et Urs Uehlinger, « Les biofilms du Tagliamento » (l'un des derniers fleuves sauvages européens, en Italie), Eawag News 60f/juillet 2006, 3 p.
Tomohiro Kuwae, Peter G. Beninger, Priscilla Decottignies, Kimberley J. Mathot, Dieta R. Lund, Robert W. Elner. (2008) Biofilm grazing in a higher vertebrate : the westerne sandpiper, Calidris Mauri ; Ecology 89:3, 599-606 ; En ligne 2008-03-01 (résumé)
fondationbiodiversite.fr
P. Salvin (Univ. Des Antilles et de la Guyane), Présentation du projet BAGAM : Biofilms Amazonien issus de la biodiversité Guyanaise pour Applications en pile Microbiennes – AAP FRB 2009
free.fr
aflimno.free.fr
Aurélie Villeneuve, [ Effets conjoints de facteurs physiques (lumière et vitesse du courant) et chimiques (pesticides) sur la structure et la composition du périphyton : une approche multi-échelles] ; Thèse soutenue le 18 décembre 2008 (codirection Irstea-Inra), résumé. Le pesticide testé était le diuron
(en) Samuel S. Wu et Dale Kaiser, « Genetic and functional evidence that Type IV pili are required for social gliding motility in Myxococcus xanthus », Molecular Microbiology, vol. 18, no 3, , p. 547–558 (ISSN1365-2958, DOI10.1111/j.1365-2958.1995.mmi_18030547.x, lire en ligne, consulté le )
(en) Rolf Bos, Henny C. van der Mei et Henk J. Busscher, « Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions – its mechanisms and methods for study », FEMS Microbiology Reviews, vol. 23, , p. 179-230 (ISSN1574-6976, PMID10234844, DOI10.1111/j.1574-6976.1999.tb00396.x, lire en ligne, consulté le )
Paul Stoodley, John D. Boyle, Dirk DeBeer et Hilary M. Lappin‐Scott, « Evolving perspectives of biofilm structure », Biofouling, vol. 14, , p. 75-90 (ISSN0892-7014, DOI10.1080/08927019909378398, lire en ligne, consulté le )
nature.com
News du journal Nature (2017), Biofilms call out to each other from a distance ; Bacterial communities coordinate activities to boost growth when nutrients run low. (résumé), 06 avril 2017, consultée le 15 avril 2017
Monmeyran, A., Thomen, P., Jonquière, H., Sureau, F., Li, C., Plamont, M. A., ... & Henry, N. (2018). The inducible chemical-genetic fluorescent marker FAST outperforms classical fluorescent proteins in the quantitative reporting of bacterial biofilm dynamics. Scientific reports, 8(1), 10336.
Uhlich GA, Cooke PH, Solomon EB. ; Analyses of the red-dry-rough phenotype of an Escherichia coli O157:H7 strain and its role in biofilm formation and resistance to antibacterial agents. ; Appl Environ Microbiol. 2006 Apr;72(4):2564-72. (Résumé)
(en) Uhlich GA, Cooke PH, Solomon EB « Analyses of the red-dry-rough phenotype of an Escherichia coli O157:H7 strain and its role in biofilm formation and resistance to antibacterial agents »Appl Environ Microbiol. 2006 Apr;72(4):2564-72. . (Résumé)
illustration en microscopie confocale à balayage laser (PLoS One. 2011 Jan 18;6(1):e16177., in The spatial architecture of Bacillus subtilis biofilms deciphered using a surface-associated model and in situ imaging déjà cité)
(en) Rolf Bos, Henny C. van der Mei et Henk J. Busscher, « Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions – its mechanisms and methods for study », FEMS Microbiology Reviews, vol. 23, , p. 179-230 (ISSN1574-6976, PMID10234844, DOI10.1111/j.1574-6976.1999.tb00396.x, lire en ligne, consulté le )
(en) Rolf Bos, Henny C. van der Mei et Henk J. Busscher, « Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions – its mechanisms and methods for study », FEMS Microbiology Reviews, vol. 23, , p. 179-230 (ISSN1574-6976, PMID10234844, DOI10.1111/j.1574-6976.1999.tb00396.x, lire en ligne, consulté le )
thèse intitulée « Microbial activity on wood in streams: Exploring abiotic and biotic factors affecting the structure and function of wood biofilms » (extrait)
Jintao Liu & al. (2017) Coupling between distant biofilms and emergence of nutrient time-sharing ; Science, le 6 avril 2017 DOI: 10.1126/science.aah4204 (résumé)
Maria Dittrich, Philipp Kurz & Bernhard Wehrli, [The role of autotrophic picocyanobacteria in calcite precipitation in an oligotrophic lake] ; Geomicrobiology Journal, Volume 21, Issue 1, 2004 ; p. 45 à 53 ; DOI:10.1080/01490450490253455(résumé)
Caroline Pandin et Romain Briandet, « Les biofilms, une alternative aux traitements chimiques des cultures », The conversation, (lire en ligne, consulté le ).
Gall JC (1990) Les voiles microbiens. Leur contribution à la fossilisation des organismes au corps mou. Lethaia, 23(1), 21-28 (résumé).
(en) Samuel S. Wu et Dale Kaiser, « Genetic and functional evidence that Type IV pili are required for social gliding motility in Myxococcus xanthus », Molecular Microbiology, vol. 18, no 3, , p. 547–558 (ISSN1365-2958, DOI10.1111/j.1365-2958.1995.mmi_18030547.x, lire en ligne, consulté le )